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维基百科

药物发现

七月 11, 2023

在医学、生物技术和药学领域，药物发现是指一个新的候选药物的发现过程。[1]

药物发现研发流程图

历史上科学家通过鉴定传统药物中的活性成分或意外发现某物质具有疗效从而发现药物，如青霉素的发现。近代，科学家通过细胞或生物体筛选化合物库中的合成小分子、天然产物或其提取物，旨在发现经典药理学中具有理想疗效的物质。人类基因组测序技术使得快速克隆和合成大量纯化蛋白质成为可能。其中某些蛋白质靶标被认为与缓解或治疗疾病有关，被称为反向药理学（Reverse pharmacology）。常规的药物发现研究经历如下几个阶段：先利用化合物库中大量的化合物针对分离的蛋白质生物靶标进行高通量筛选（High throughput screening），然后将筛选出的活性化合物继续在细胞中测试，最后将多轮测试中结果良好的化合物继续进行动物实验，以评价其治疗活性或效力（Efficacy）。[2]

现代药物发现包括以下几个环节：苗头化合物（Hit compound）的筛选与发现、 [3]药物化学研究即从苗头化合物至先导化合物（Hit to Lead）[4]和先导化合物优化（Lead optimization）。其中优化过程涵盖了：增加与靶点的亲和力（提高活性）、增加配体选择性（减少副作用）、提高效力或活性、提高化合物代谢稳定性（以增加生物半衰期 ）和提高药物的口服生物利用度。只要找到某化合物可满足以上所有条件，药物开发过程就可以继续推进，如若开发过程成功结束，将使用开发的新药开展临床试验，以在人体上测试该新药的安全性和有效性。[5]

现代新药发现过程属于资本密集型产业，这些资本涉及制药企业的大量投资以及政府提供的政策补助和贷款担保。尽管药物科技和现代生物理论的不断进步和对药物发现颇有帮助，但迄今为止药物发现仍然是一个漫长、昂贵、困难且低效的过程，发现全新疗效的成功药物的数量很少。[6]2010年统计每个新化学实体的研发费用约为18亿美元。[7]21世纪针对药物的基础研究工作主要由政府和慈善组织资助，而药物的后期开发主要由制药公司或风投资本资助。[8]药品的获准上市前，必须经历几个临床试验阶段，若成功才可通过新药批准程序并上市销售，在美国称为新药申请（New Drug Application，NDA）。

一个可取得商业或公共卫生领域成功的药物发现过程，需要投资家、企业家、学术界、法律专利领域、政府监管领域和市场营销之间的通力协作。[9]'罕见疾病患者人群较少，可预见其治疗药物无法取得商业上丰厚的回报，或在公共健康领域产生巨大影响。因此政府和众多孤儿药资助基金可帮助这些罕见病患者，让其通过各种资助仍可获得良好的药物治疗。[10][11][1][12]

历史

药物在人体中的作用机制，是由药物分子与生物大分子（通常为蛋白质或核酸）的特定相互作用介导的，基于以上观点科学家得出论断：药品中具备的生物活性是由其中的单一化学物质产生的。从此药用植物的粗品提取物被单一纯净的化学物质所替代成为标准药物，这正是药理学时代的开端。例如，鸦片是罂粟的粗品提取物，其具有镇痛活性的单一化学成分是吗啡[13]；而洋地黄中的粗品提取物具有心脏兴奋活性，其有效化学成分是地高辛[14][15]。使用有机化学研究天然产物中活性成分的学科称为天然产物化学，[16][17]有机化学还促成了许多活性天然产物的全合成。[18][19][20]

历史上，无论是粗品提取物还是纯化学物质，均在不明生物靶标的情况下进行生物活性筛选工作。而先鉴定化学物质的结构，并用其验证疗效或相关生物活性，这种方法被称为经典药理学或正向药理学[21]，或称表型药物发现。[22]

后来，科学家针对已知的生理或病理途径，设计且合成了一系列具相关活性的小分子，以避免对化合物库筛选的依赖并取得了巨大的成功。例如：格特魯德·B·埃利恩（Gertrude Elion）和乔治·H·希钦斯在嘌呤代谢方面的工作，[23][24][25]詹姆士·W·布拉克在β受体阻滞剂和西咪替丁方面的工作，[26]以及远藤章在他汀类药物方面的工作。[27]另一个成功范例是大卫杰克（David Jack），他基于已知活性物质开发化合物类似物药物，在葛兰素史克制药中参与或主导开发以下项目：第一个用于哮喘的甾体类吸入剂药物；选择性β2-肾上腺素能激动剂——雷尼替丁（西咪替丁的二代药物），以及曲坦类药物的开发工作。[28][29]

格特鲁德·B·埃利恩与不到50人的小组一起开发嘌呤类似物，发现了首款抗病毒药物和首个辅助人体器官移植的免疫抑制剂——硫唑嘌呤，并开发了首款缓解儿童白血病药物。他一生参与了多个关键的肿瘤药物、抗疟疾药物、抗菌药物和痛风药物的研发项目，并于1988年，获颁诺贝尔生理学或医学奖。[30][31][32]

2020年代，量子位元和量子计算应用于药物发现领域，大幅地节省研发时间。[33]

靶标

靶点或称靶标（Target）在生物学中是指生物体内，能够被其他物质（配体或药物分子）识别或结合的结构。在药学中，靶点是指研究的病理学相关的细胞或其分子结构，开发的药物会与之作用并治疗疾病。[8]然而，在不完全理解靶标信息的情况下，可将靶标区分为新靶标或已知靶标，通常由新药开发公司对靶标进行区分。[8]根据2011年统计，约有435种人类基因组物质被FDA定义为批准药物的治疗药物靶标。[34]

“已知靶标”是指有大量历史文献的支持下，对该靶标如何在正常生理学中发挥作用，以及该靶标如何参与人类病理学均有良好的科学性理解。[2]但已知靶标不意味着药物的作用机制已被完全了解，[2]其科学背景信息已经过大量研究，尤其是靶标的功能性信息。通常“新靶标”不是已知靶标，而是在药物发现中已有大量科学数据和研究资料的靶标。在药物发现工作中，主要研究的靶标类型为蛋白质，例如G蛋白偶联受体（GPCR）和蛋白激酶。[35]

筛选和设计

药物发现通常从确定疾病的靶标开始，然后利用高通量筛选（HTS）和大型化合物库进行筛选，找到能与靶标结合的化合物。例如，如果靶标是新的G蛋白偶联受体，可通过以上方法筛选化合物抑制或激动该受体的活性（参见拮抗剂和激动剂）；而如果靶标是一种蛋白激酶，则需要筛选化合物抑制该激酶的能力。[36]

高通量筛选的另一个作用是测试某化合物对目标靶标的特异性。药物开发者期待找到一种药物分子，其只会影响目标靶标，而不影响体内其他相关靶标。因此，可将某化合物进行多个靶标的筛选，以确认该化合物“命中”目标靶标的同时是否会干扰其他相关靶标，即所谓的脱靶效应，这个过程称为靶标的交叉筛选。[36]交叉筛选的必要性在于：化合物可命中的靶点越多意味着特异性越差，在临床实验中表现出的脱靶毒性的可能性也越大。[36]

早期筛选中通常找不到完美的候选药物，所以第一阶段可排除一些无法继续开发的化合物；若某化合物在几乎所有筛选中均可命中不同靶标，该类化合物被药物开发者定义为“泛分析干扰化合物”，在此阶段该类化合物将从库中被剔除。[37][38][39]在筛选期间，如果发现几种化合物具有类似程度的生物活性，且这些化合物具有某些共同的化学基团或特征，则基团或特征可能属于药效团。基于药效团的研究，药物化学家尝试分析化合物的构效关系（SAR）来优化先导化合物（Lead compound）的各项药物特性：[40][41]

  • 基于所选靶标，增加化合物的活性
  • 减少针对不相关靶标的化合物活性
  • 改善药物分子的类药性或ADME特性

整个筛选过程需要生物实验与化学结构改造经历反复且多次迭代，在此期间，新化学实体的特性在生物实验的结果反馈中不断得到优化，并挑选数据良好的化合物继续开展体外和体内的生物实验测试，最后将体内外实验均良好的候选化合物用于所选疾病的动物模型中，以测试该化合物的体内的有效性和安全性。[40]

与药物吸收相关的物理化学性质包括：电离（pKa）、溶解度和渗透性等。其中渗透性可通过平行人工膜渗透性测定（Parallel artificial membrane permeability assay，PAMPA）或Caco-2细胞测定。[42][43]Caco-2、胃肠道（GIT）和血脑屏障（BBB）等测试具有高度相关性的优点，但PAMPA法与之相比药物损耗低且价格低廉，因此作为早期化合物渗透性的筛选工具而被广泛使用。[44]

一系列参数可用于评估化合物的成药性或类药性（Drug-Like property），[45]如Lipinski五原则。[46][47]这些参数中有些可通过模型预测估算，如用于估算亲脂性的参数有：分配系数（cLogP） 、分子量（Mw）、极性表面积（TPSA）。以及只有通过实验测试才可知的参数，如：效力（或效价）、酶促清除率的其他体外测试项目等。此外如：配体效率（LE）[48]和亲脂效率（LiPE）[49][50]等参数也可参与评估类药性质。[51]

高通量筛选虽常用于新药发现，但并非成功的唯一途径。药物设计还可基于一些具备药物特性的分子进行开发，此类分子可从自然界的动植物中提取的天然产物，也可将已上市的药物进行改造，即开发所谓的Me-too药物。其他还有一些方法，如虚拟高通量筛选。其中所谓的虚拟筛选，是使用计算机生成的蛋白质靶点模型与虚拟化合物库中的化合物进行对接（Docking）操作，以选出可能存在活性的苗头化合物（Hit compound）。[36]

另一种药物发现方法称为药物从头设计，先推测一类化合物可匹配目标酶的活性位点（Active site）。例如，利用虚拟筛选和计算机辅助药物设计识别可与目标蛋白质靶点模型相互作用的新化学实体。[52][53]分子建模[54]和分子动力学模拟对于提高先导化合物的活性和成药性均起到指导作用。[55][56][57]

药物发现模式正发生转变，从昂贵且覆盖化学空间（结构多样性）有限的化合物库中进行高通量筛选，逐渐转变为较小的化合物库（不超过几千种化合物）筛选。这些新的模式包括：基于片段的先导化合物发现（Fragment-based lead discovery, FBDD）[58][59][60][61]和蛋白质导向的动态组合化学（Protein-directed dynamic combinatorial chemistry）。[62][63][64][65][66]以上方法中使用的配体小分子通常体积较小，且与靶蛋白的结合亲和力较HTS中筛选出的化合物更弱。首轮化合物被筛选出后，需要通过有机合成对小分子进行化学修饰，使之成为先导化合物。运用蛋白质X射线晶体学，可鉴定化合物与蛋白质片段形成复合物的三维空间结构，通过该结构可进一步指导先导化合物的修饰与优化。[67][68][69]这些新模式的优点在于：筛选更有效率，且与HTS相比化合物库虽然较小，但通常覆盖的化学空间（Chemical space）很大。

表型筛选（Phenotypic screen）也是药物发现新的起点之一。[70][71]多种动物或细胞模型可供筛选药物，包括：酵母、斑马鱼、蠕虫、永生细胞系、原代细胞系、患者来源的细胞系和完整动物模型。这些筛选旨在寻找可逆转疾病表型的化合物，其表型包括:死亡、蛋白质聚集、突变蛋白质表达或细胞增殖。成功入选的化合物，继续使用更全面的细胞模型或生物体进行筛选。此时当模型的价格或时间成本高昂时,可使用较小的筛选库进行。[72]通常，表型筛选出的化合物虽然具有药效，但其确切作用机制（MOA）却是未知的，后续需要大量的目标逆卷积（Deconvolution）实验来确定其作用机制。化学蛋白质组学（Chemoproteomics）的发展，为药物设计提供了许多策略，以确定此类表型筛选药物与靶标相互作用的机制。[73]

一旦确定先导化合物（Lead compound），即候选化合物具有足够与靶标结合的活性和选择性，也具有良好的类药性。即可挑选其中的一至两个系列化合物用于后续的药物开发。其中最好的化合物被称为先导化合物，另一个则被指定为备选化合物。[74][75][76]

 
药物开发的各个阶段：靶点确认——靶点验证——先导化合物发现——先导化合物优化——临床药物开发。其中各个阶段均可运用计算技术。[77]

源于天然产物的药物

传统意义上，发现药物和具有生物活性的化学物质，是基于研究有机体产生的化合物如何影响其他生物体活动的基础之上。[78]

尽管组合化学（Combinatorial chemistry）已成为先导化合物发现中的关键一环，而天然产物仍然在药物发现中发挥着重要作用。[79]2007年的一份报告报道了1981至2006几年间，开发的974个小分子新化学实体中，63%为天然产物衍生物或天然产物的半合成衍生物。对于某些治疗领域，例如抗菌药物、抗肿瘤药物、抗高血压药物和抗炎药物，天然产物的比例更高。[80]天然产物是现代抗菌药物开发中的新化学结构的重要来源之一。[81]

源于植物的药物

动植物产生的许多次级代谢产物具有潜在的药用治疗性质。这些次级代谢物包含以下活性：结合蛋白质或受体、酶等靶点并改变其生物功能。因此，动植物相关的天然产物常被用作药物发现的起点。[82][83][84][85][3]

历史

西方直至文艺复兴时期，绝大多数使用的西药是植物提取物。[86]基于植物作为药物发现的重要来源，逐渐形成了具有药效潜力的植物信息库。[87]植物不同的部位（如根、叶和花）会产生不同的代谢物和激素，这些知识对于准确识别生物活性和植物药理学属性至关重要。[87][88]鉴于各个国家药品监管机构的监管要求，鉴定天然产物并将其作为新药推向市场会经历严格的审批过程。[89]

茉莉酸

 
茉莉酸甲酯（JA）的化学结构。

茉莉酸（Jasmonate）会影响到细胞内信号的反馈机制。它们通过蛋白酶抑制剂诱导细胞凋亡[90][91]、蛋白质级联（Protein cascade）[90]、具备防御功能，[92]并调节植物对不同生物和非生物胁迫的反应。[92][93]茉莉酸还具有通过释放代谢物诱导膜去极化，以直接作用于线粒体膜的能力。[94]

茉莉酸衍生物（JAD）对于植物细胞的伤口反应和组织再生非常重要。研究表明茉莉酸衍生物对人体表皮层具有抗衰老作用。[95]研究推测其与蛋白多糖（Proteoglycan，PG）和糖胺聚糖（Glycosaminoglycan，GAG）多糖相互发生作用，可帮助重塑细胞外基质的重要成分。[96]茉莉酸衍生物被发现在皮肤修复方面的研究，引发了科学家对于植物激素在药物应用中的研究。[95]

水杨酸盐

 
乙酰水杨酸的化学结构，通常称为阿司匹林。

水杨酸（Salicylic acid，SA）是一种植物激素，最初来源于柳树皮，此后被发现在许多植物物种中存在。尽管科学家仍未完全了解水杨酸在植物中的作用，但可以确定其是植物免疫力的关键化学物质，[97]它参与了植物和动物组织的疾病和免疫反应。水杨酸可结合水杨酸结合蛋白（Salicylic acid binding proteins，SABP），已显示其可对多种动物组织产生影响。[97]分离出的水杨酸化合物，首个发现的药用属性是治疗疼痛和发烧。其次，它还在抑制细胞增殖中发挥积极作用，[90]并具有诱导白血病淋巴细胞凋亡及其他人类癌细胞凋亡的能力。[90]最常见的水杨酸类药物是阿司匹林，也称为乙酰水杨酸，其具有抗炎和解热的作用。[97][98]

源于动物的药物

现代医学中使用的一些药物，其发现过程来源于动物体内，或是基于在动物发现的化合物。例如，抗凝药物水蛭素，及其化学类似物比伐卢定（Bivalirudin）是基于一种（欧洲医蛭）的唾液中的活性物质基础上研发出的药物。[99]用于治疗2型糖尿病药物艾塞那肽（Exenatide），是基于一种毒蜥（美国毒蜥）的唾液中分离的活性物质基础上研发出的药物。 [100]

源于微生物代谢物的药物

微生物为生存会争夺空间和营养。为了适应环境存活，许多微生物会避免与其他微生物竞争，并演化出避免其他微生物增殖的能力，因此抗菌药物的主要研发基础就是微生物。链霉菌分离株（Streptomyces isolate）是非常有价值的抗生素来源，其被称为药用霉菌。另一个通过微生物的防御机制而发现的抗生素的经典例子，是1928年科学家通过被青霉菌污染的细菌培养物中发现了青霉素。

源于海洋无脊椎动物的药物

也可从海洋世界中发现新的生物活性物质。[101]1950年代科学家从海洋无脊椎动物中发现的阿拉伯糖核苷，首次证明核糖和脱氧核糖以外的糖类化合物可衍生出具有生物活性的核苷类化合物。[102]直至2004年，首个海洋动物的衍生药物才获得批准，如锥形蜗牛毒素：齐考诺肽（Ziconotide）也称为 Prialt，可治疗严重的神经性疼痛。其他海洋动物衍生药物目前正在开展对于包括：癌症、抗炎和疼痛等适应症的临床试验。[103]

化学多样性

组合化学可高效地生成大型筛选化合物库，以满足高通量筛选需求。然而经过二十年的组合化学的相关研究和实际运用，有药学家指出：尽管组合化学基于高效合成提供了大量的化合物，但先导化合物或候选药物的数量并未增加。[80]这驱使药学家开始研究与现有药物或天然产物相比，组合化学产出的化合物的结构差异性。

化学信息学定义了化学多样性（Chemical diversity）这个概念，其描述为化合物根据其物理化学特性在化学空间中的分布情况，通常用化学多样性评价组合化学库与天然产物之间的差异。合成化合物库或组合化合物库只可涵盖有限且单一的化学空间，而现有已上市的药物尤其是天然产物，均表现出更强的化学多样性，它们在化学空间中表现的更均匀且广泛地分布。[79]

组合化合物库中与天然产物最显著的区别在于手性中心的数量，一般天然产物中手性中心相较更多。其次天然产物比库中的化合物的结构刚性更强，且在芳香结构的数量上更少。其他的化学差异还包括杂原子的性质如：天然产物中富含氧和氮元素，而合成化合物中更常见硫和卤素元素；以及天然产物中的非芳香族不饱和键数量较高。由于结构刚性和手性均在药物化学中被认为可提高化合物的特异性和药物活性，因此有部分药学家认为，使用天然产物作为潜在的先导化合物分子比组合化学库相较更具优势。[80]

筛选

从天然产物中发现全新的具备生物活性的化学实体有两种主要方法：

第一种被称为天然物料的随机收集和筛选。生物学尤其是植物学的知识，通常被用于识别有药用价值的生物物种。这种方法的有效性建立在全球生物多样性中只有一小部分曾经接受过药物活性测试。此外，生物体能生活在物种丰富且复杂的环境中，势必需要进化出防御机制和竞争机制才能得以生存。药物开发即可运用以上的机制挑选天然产物。[104]

源于动物、植物和微生物的复杂生态系统会产生新颖且具潜在生物活性的化合物，这些化合物值得在药物开发过程中加以利用。成功运用这一策略的范例，是国家癌症研究所在1960年代开始的抗肿瘤药物筛选项目。该项目找到了著名的抗肿瘤药物：紫杉醇。其是从太平洋紫杉树短叶红豆杉中分离并鉴定出化学结构。[104]紫杉醇通过全新的抗肿瘤机制（稳定微管）显示出其高活性，已获准临床用于治疗肺癌、乳腺癌、卵巢癌以及卡波西肉瘤。[105][104][105]在21世纪初，药物卡巴他赛（Cabazitaxel），一种由法国赛诺菲公司研制生产的药物，其基于紫杉醇的衍生出的另一种抗肿瘤类似物，被证明对前列腺癌有效。该药物同样通过阻止微管的形成起药效，体内的微管会在分裂细胞中拉开染色体。[106][107]

其他示例有：喜树碱类药物（Camtothecin）：拓扑替康（Topotecan） 、伊立替康（Irinotecan）、[108]鲁比替康（Rubitecan）和倍罗替康（Belotecan）。 鬼臼毒素类药物：依托泊苷（Etoposide）和替尼泊苷（Teniposide）[109][110]。蒽环类药物：阿克拉霉素（Aclarubicin）、柔红霉素（Daunorubicin）、多柔比星（Doxorubicin）、表柔比星（Epirubicin）、[111][112]伊达比星（Idarubicin）、氨柔比星（Amrubicin）、吡柔比星 （Pirarubicin）、戊柔比星（Valrubicin）、和佐柔比星（Zorubicin）。 以及蒽二酮类药物：米托蒽醌（Mitoxantrone）和匹衫琼（Pixantrone ）。[113][114][115]

第二种方法主要源于民族植物学，即研究植物在社会中的普遍用途以及民族药理学，民族药理学是民族植物学内部的一个领域，专门研究医学用途。[116][117]

青蒿素是一种源自青蒿植物开发的抗疟药，自公元前200年以来青蒿一直用于中药，是一种用于联合治疗多重耐药性恶性疟原虫的药物。[118][119]

结构解析

化学结构解析对于了解药物化学结构，进行构效关系研究，以及避免重复的化学结构研究工作至关重要。药物发现的关键即在于发现新结构，该化学结构能创造新的治疗手段或解决老药的安全性问题。质谱法是一种基于化合物离子化的质荷比，识别化合物分子量或碎片分子量，以推测化合物结构的方法。大多数化合物在自然界中通常以混合物形式存在，[120]因此液相色谱法-质谱联用（LC-MS）通常用于解析混合物中的不同化合物组分的分子量和相关化合物信息。[121]已知化合物的鉴定，可以通过质谱数据库进行比对，数据库还可用于推测未知化合物的结构。确定天然产物化学结构主要运用核磁共振波谱仪进行，核磁图谱可显示结构中单个氢原子、碳原子、氟原子、磷原子或氮原子的信息，以及这些不同原子之间互相的连接关系，从而推测化合物的结构信息。[122][123][124]

新药申请

当一种药物在其整个研究过程中证明其在预计的治疗用途中是安全且有效时，药品研发公司可以向药监部门提交申请，即所谓的新药申请（New drug application，NDA）。[125][126]药监部门会检查并研究药物研发企业递交的NDA相关资料，根据该药物在临床前研究和人体临床实验中的安全性、药物作用的特异性，药物的剂量，药物的有效性等信息，做出是否批准候选药物科通过该申请的决定。通过NDA的药物即可商业化上市并销售。[127]

参见

  • 抗靶标
  • 生物信息学
  • 医学信息学
  • 化学信息学
  • 苗头化合物至先导化合物（英语：Drug discovery hit to lead）
  • 药物代谢
  • 基于碎片的先导化合物发现（英语：Fragment-based drug discovery）
  • 高内涵筛选（英语：High-content screening）
  • 药物基因组学
  • 生药学
  • 生理药代动力学建模
  • 临床前研究（英语：Preclinical development）
  • 临床研究
  • 临床研究分期
  • 动力学组合化学（英语：Dynamic combinatorial chemistry）
  • 质子泵抑制剂的研发（英语：Discovery and development of proton pump inhibitors）
  • 褪黑素受体激动剂的研发（英语：Melatonin receptor agonist#Drug design and development）
  • 核苷和核苷酸逆转录酶抑制剂的研发（英语：Discovery and development of nucleoside and nucleotide reverse-transcriptase inhibitors）
  • Bcr-Abl酪氨酸激酶抑制剂的研发（英语：Bcr-Abl tyrosine-kinase inhibitor#History）
  • 抗雄激素的研发（英语：Discovery and development of antiandrogens）
  • 头孢菌素的研发（英语：Discovery and development of cephalosporins）
  • 逆向代谢药物设计（英语：Retrometabolic drug design）

参考文献

  1. ^ 1.0 1.1 The drug development process. US Food and Drug Administration. 4 January 2018 [18 December 2019]. （原始内容于2020-02-22）. 
  2. ^ 2.0 2.1 2.2 The drug development process: Step 1: Discovery and development. US Food and Drug Administration. 4 January 2018 [18 December 2019]. （原始内容于2023-04-03）. 
  3. ^ 3.0 3.1 Helleboid S, Haug C, Lamottke K, et al. The Identification of Naturally Occurring Neoruscogenin as a Bioavailable, Potent, and High-Affinity Agonist of the Nuclear Receptor RORα (NR1F1). Journal of Biomolecular Screening. 2014;19(3):399–406. https://doi.org/10.1177/1087057113497095.
  4. ^ Herrmann, A., Roesner, M., Werner, T. et al. Potent inhibition of HIV replication in primary human cells by novel synthetic polyketides inspired by Aureothin. Sci Rep 10, 1326 (2020). https://doi.org/10.1038/s41598-020-57843-9.
  5. ^ The drug development process: Step 3: Clinical research. US Food and Drug Administration. 4 January 2018 [18 December 2019]. （原始内容于2020-06-20）. 
  6. ^ Anson D, Ma J, He JQ. . Genetic Engineering & Biotechnology News. TechNote 29 (9) (Mary Ann Liebert). 1 May 2009: 34–35 [25 July 2009]. ISSN 1935-472X. OCLC 77706455. （原始内容存档于21 September 2012）. 
  7. ^ Paul SM, Mytelka DS, Dunwiddie CT, Persinger CC, Munos BH, Lindborg SR, Schacht AL. How to improve R&D productivity: the pharmaceutical industry's grand challenge. Nature Reviews. Drug Discovery. March 2010, 9 (3): 203–14. PMID 20168317. S2CID 1299234. doi:10.1038/nrd3078  . 
  8. ^ 8.0 8.1 8.2 Current Model for Financing Drug Development: From Concept Through Approval. Institute of Medicine (US), Forum on Drug Discovery, Development, and Translation, National Academies Press, Washington (DC). 2009 [2023-05-28]. （原始内容于2023-04-08）. 
  9. ^ Warren J. Drug discovery: lessons from evolution. British Journal of Clinical Pharmacology. April 2011, 71 (4): 497–503. PMC 3080636  . PMID 21395642. doi:10.1111/j.1365-2125.2010.03854.x. 
  10. ^ Hadjivasiliou, Andreas, Orphan Drug Report 2014 (PDF), EvaluatePharma, October 2014 [28 June 2015], （原始内容 (PDF)于2015-10-10） 
  11. ^ Rich Daly (5 September 2002). "House Offers Incentives For Development of 'Orphan' Drugs". Congressional Quarterly Daily Monitor
  12. ^ Hall, Anthony K; Carlson, Marilyn R. The current status of orphan drug development in Europe and the US. Intractable and Rare Diseases Research. 2014, 3 (1): 1–7. ISSN 2186-3644. PMC 4204542  . PMID 25343119. doi:10.5582/irdr.3.1. 
  13. ^ Narcotic Drugs Estimated World Requirements for 2008, Statistics for 2006.. New York: United Nations Pubns. 2008: 77 [2016-05-26]. ISBN 9789210481199. （原始内容于2019-06-04）. 
  14. ^ Cartwright, Anthony C. The British Pharmacopoeia, 1864 to 2014: Medicines, International Standards and the State. Routledge. 2016: 183 [2016-12-22]. ISBN 9781317039792. （原始内容于2017-09-08） （英语）. 
  15. ^ Hollman, A. Drugs for atrial fibrillation. Digoxin comes from Digitalis lanata.. BMJ (Clinical research ed.). 1996-04-06, 312 (7035): 912. PMID 8611904. 
  16. ^ Webster's Revised Unabridged Dictionary. Natural product. Free Online Dictionary and C. & G. Merriam Co. 1913 [2023-05-30]. （原始内容于2023-04-28）. A chemical substance produced by a living organism; – a term used commonly in reference to chemical substances found in nature that have distinctive pharmacological effects. Such a substance is considered a natural product even if it can be prepared by total synthesis. 
  17. ^ All natural. Nature Chemical Biology. July 2007, 3 (7): 351. PMID 17576412. doi:10.1038/nchembio0707-351  . The simplest definition for a natural product is a small molecule that is produced by a biological source. 
  18. ^ K. C. Nicolaou; D. Vourloumis; N. Winssinger and P. S. Baran. (PDF). Angewandte Chemie International Edition. 2000, 39 (1): 44–122 [2020-06-25]. PMID 10649349. doi:10.1002/(SICI)1521-3773(20000103)39:1<44::AID-ANIE44>3.0.CO;2-L. （原始内容 (reprint)存档于2017-05-17）. 
  19. ^ Nicolaou, K. C. & Sorensen, E. J. 1996, Classics in Total Synthesis: Targets, Strategies, Methods, New York:John Wiley & Sons, ISBN 978-3-527-29231-8
  20. ^ Nicolaou, K. C. & Snyder, S. A., 2003, Classics in Total Synthesis II: More Targets, Strategies, Methods, New York:John Wiley & Sons, ISBN 978-3-527-30684-8
  21. ^ Takenaka T. Classical vs reverse pharmacology in drug discovery. BJU International. September 2001, 88 (Suppl 2): 7–10; discussion 49–50. PMID 11589663. doi:10.1111/j.1464-410X.2001.00112.x  . 
  22. ^ Lee JA, Uhlik MT, Moxham CM, Tomandl D, Sall DJ. Modern phenotypic drug discovery is a viable, neoclassic pharma strategy. Journal of Medicinal Chemistry. May 2012, 55 (10): 4527–38. PMID 22409666. doi:10.1021/jm201649s. 
  23. ^ Nobel prize winners who contributed to Transplantation - GIN. GIN. 2018-01-27 [2018-11-12]. （原始内容于2018-11-12） （美国英语）. 
  24. ^ Elion GB. The quest for a cure. Annual Review of Pharmacology and Toxicology. 1993, 33: 1–23. PMID 8494337. doi:10.1146/annurev.pa.33.040193.000245. 
  25. ^ Elion GB. The purine path to chemotherapy. Nobel Lecture 1988.. [2023-05-28]. （原始内容于2008-07-24）. 
  26. ^ Black J. Drugs from emasculated hormones: the principles of synoptic antagonism. Nobel Lecture 1988.. [28 February 2014]. （原始内容于2017-10-06）. 
  27. ^ Endo A. The discovery of the statins and their development.. [28 February 2014]. （原始内容于2023-01-31）. 
  28. ^ Sir David Jack. The Daily Telegraph. 17 November 2011 [25 November 2011]. （原始内容于2011-11-25）. 
  29. ^ Sir David Jack. The Herald. 19 November 2011. 
  30. ^ Holloway, M. (1991) Profile: Gertrude Belle Elion – The Satisfaction of Delayed Gratification, Scientific American 265(4), 40-44.
  31. ^ Watts G. Obituary: Sir David Jack. The Lancet. 2012, 379 (9811): 116. S2CID 54305535. doi:10.1016/S0140-6736(12)60053-1  . 
  32. ^ Mary Ellen Avery. Gertrude Belle Elion. 23 January 1918 — 21 February 1999. Biographical Memoirs of Fellows of the Royal Society. 2008-12-12, 54: 161–168 [2018-04-02]. ISSN 0080-4606. doi:10.1098/rsbm.2007.0051. （原始内容于2017-04-01） （英语）. 
  33. ^ Qubit Pharmaceuticals Accelerates Drug Discovery with Hybrid Quantum Computing. HPC Wire. November 30, 2022 [2023-05-28]. （原始内容于2023-02-06）. 
  34. ^ Rask-Andersen M, Almén MS, Schiöth HB. Trends in the exploitation of novel drug targets. Nature Reviews. Drug Discovery. August 2011, 10 (8): 579–90. PMID 21804595. S2CID 3328752. doi:10.1038/nrd3478. 
  35. ^ Jacobson KA. New paradigms in GPCR drug discovery. Biochemical Pharmacology. December 2015, 98 (4): 541–555. PMC 4967540  . PMID 26265138. doi:10.1016/j.bcp.2015.08.085. 
  36. ^ 36.0 36.1 36.2 36.3 Chen, Ya; Kirchmair, Johannes. Cheminformatics in natural product‐based drug discovery. Molecular Informatics. 2020-09-06, 39 (12): 2000171. ISSN 1868-1743. PMC 7757247  . PMID 32725781. doi:10.1002/minf.202000171. 
  37. ^ Baker M. Deceptive curcumin offers cautionary tale for chemists. Nature. 9 January 2017, 541 (7636): 144–145. Bibcode:2017Natur.541..144B. PMID 28079090. doi:10.1038/541144a  . 
  38. ^ Dahlin JL, Walters MA. The essential roles of chemistry in high-throughput screening triage. Future Medicinal Chemistry. July 2014, 6 (11): 1265–90. PMC 4465542  . PMID 25163000. doi:10.4155/fmc.14.60. 
  39. ^ Baell JB, Holloway GA. New substructure filters for removal of pan assay interference compounds (PAINS) from screening libraries and for their exclusion in bioassays. Journal of Medicinal Chemistry. April 2010, 53 (7): 2719–40. CiteSeerX 10.1.1.394.9155  . PMID 20131845. doi:10.1021/jm901137j. 
  40. ^ 40.0 40.1 Hughes, JP; Rees, S; Kalindjian, SB; Philpott, KL. Principles of early drug discovery. British Journal of Pharmacology. March 2011, 162 (6): 1239–1249. PMC 3058157  . PMID 21091654. doi:10.1111/j.1476-5381.2010.01127.x. 
  41. ^ Schneider, Gisbert. Prediction of Drug-Like Properties. Landes Bioscience. 2013 [20 November 2017]. （原始内容于2023-04-17） （英语）. 
  42. ^ Gouriet, F; Saby, L; Delaunay, E; Cammilleri, S; le Dolley, Y; Riberi, A; Casalta, JP; Habib, G; Raoult, D. . The Journal of infection. 2013-07, 67 (1): 88–90 [2019-12-17]. PMID 23523828. doi:10.1016/j.jinf.2013.03.004. （原始内容存档于2019-12-17）. 
  43. ^ Artursson, P; Palm, K; Luthman, K. . Advanced drug delivery reviews. 2001-03-01, 46 (1-3): 27–43 [2019-12-17]. PMID 11259831. doi:10.1016/s0169-409x(00)00128-9. （原始内容存档于2019-12-17）. 
  44. ^ Ottaviani, Giorgio; Martel, Sophie; Carrupt, Pierre-Alain. Parallel Artificial Membrane Permeability Assay: A New Membrane for the Fast Prediction of Passive Human Skin Permeability. Journal of Medicinal Chemistry. 2006, 49 (13): 3948–3954. ISSN 0022-2623. PMID 16789751. doi:10.1021/jm060230+. 
  45. ^ Edward HK, Li D. Druglike Properties: Concepts Structure Design and Methods from ADME to Toxicity Optimization. August 2008. doi:10.1016/C2013-0-18378-X. 
  46. ^ Lipinski CA, Lombardo F, Dominy BW, Feeney PJ. Experimental and computational approaches to estimate solubility and permeability in drug discovery and development settings. Advanced Drug Delivery Reviews. March 2001, 46 (1–3): 3–26. PMID 11259830. doi:10.1016/S0169-409X(00)00129-0. 
  47. ^ Lipinski CA. Lead- and drug-like compounds: the rule-of-five revolution. Drug Discovery Today: Technologies. December 2004, 1 (4): 337–341. PMID 24981612. doi:10.1016/j.ddtec.2004.11.007. 
  48. ^ Hopkins AL, Groom CR, Alex A. Ligand efficiency: a useful metric for lead selection. Drug Discovery Today. May 2004, 9 (10): 430–1. PMID 15109945. doi:10.1016/S1359-6446(04)03069-7. 
  49. ^ Ryckmans T, Edwards MP, Horne VA, Correia AM, Owen DR, Thompson LR, Tran I, Tutt MF, Young T. Rapid assessment of a novel series of selective CB(2) agonists using parallel synthesis protocols: A Lipophilic Efficiency (LipE) analysis. Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters. August 2009, 19 (15): 4406–9. PMID 19500981. doi:10.1016/j.bmcl.2009.05.062. 
  50. ^ Leeson PD, Springthorpe B. The influence of drug-like concepts on decision-making in medicinal chemistry. Nature Reviews. Drug Discovery. November 2007, 6 (11): 881–90. PMID 17971784. S2CID 205476574. doi:10.1038/nrd2445. 
  51. ^ Tetko IV, Bruneau P, Mewes HW, Rohrer DC, Poda GI. (PDF). Drug Discovery Today. August 2006, 11 (15–16): 700–707 [2023-05-02]. PMID 16846797. doi:10.1016/j.drudis.2006.06.013. （原始内容 (pre-print)存档于2013-09-12）. 
  52. ^ Rester U. From virtuality to reality – Virtual screening in lead discovery and lead optimization: a medicinal chemistry perspective. Current Opinion in Drug Discovery & Development. July 2008, 11 (4): 559–68. PMID 18600572. 
  53. ^ Rollinger JM, Stuppner H, Langer T. Natural Compounds as Drugs Volume I. Progress in Drug Research 65. 2008: 211, 213–49. ISBN 978-3-7643-8098-4. PMC 7124045  . PMID 18084917. doi:10.1007/978-3-7643-8117-2_6. 
  54. ^ Barcellos GB, Pauli I, Caceres RA, Timmers LF, Dias R, de Azevedo WF. Molecular modeling as a tool for drug discovery. Current Drug Targets. December 2008, 9 (12): 1084–91. PMID 19128219. doi:10.2174/138945008786949388. 
  55. ^ Durrant JD, McCammon JA. Molecular dynamics simulations and drug discovery. BMC Biology. October 2011, 9: 71. PMC 3203851  . PMID 22035460. doi:10.1186/1741-7007-9-71. 
  56. ^ Borhani DW, Shaw DE. The future of molecular dynamics simulations in drug discovery. Journal of Computer-Aided Molecular Design. January 2012, 26 (1): 15–26. Bibcode:2012JCAMD..26...15B. PMC 3268975  . PMID 22183577. doi:10.1007/s10822-011-9517-y. 
  57. ^ Ciemny M, Kurcinski M, Kamel K, Kolinski A, Alam N, Schueler-Furman O, Kmiecik S. Protein-peptide docking: opportunities and challenges. Drug Discovery Today. May 2018, 23 (8): 1530–1537. PMID 29733895. doi:10.1016/j.drudis.2018.05.006  . 
  58. ^ Erlanson DA, McDowell RS, O'Brien T. Fragment-based drug discovery. Journal of Medicinal Chemistry. July 2004, 47 (14): 3463–82. PMID 15214773. doi:10.1021/jm040031v. 
  59. ^ Folkers G, Jahnke W, Erlanson DA, Mannhold R, Kubinyi H. Fragment-based Approaches in Drug Discovery (Methods and Principles in Medicinal Chemistry). Weinheim: Wiley-VCH. 2006. ISBN 978-3-527-31291-7. 
  60. ^ Erlanson DA. Introduction to fragment-based drug discovery. Topics in Current Chemistry 317. June 2011: 1–32. ISBN 978-3-642-27539-5. PMID 21695633. doi:10.1007/128_2011_180. 
  61. ^ Edward Z, Michael S. Fragment-based drug discovery a practical approach. Wiley. 2008. 
  62. ^ Greaney MF, Bhat VT. Dynamic combinatorial chemistry: in drug discovery, bioinorganic chemistry, and materials sciences. New Jersey: John Wiley & Sons. 2010: 43–82. 
  63. ^ Huang R, Leung IK. Protein-directed dynamic combinatorial chemistry: a guide to protein ligand and inhibitor discovery. Molecules. July 2016, 21 (7): 910. PMC 6273345  . PMID 27438816. doi:10.3390/molecules21070910  . 
  64. ^ Mondal M, Hirsch AK. Dynamic combinatorial chemistry: a tool to facilitate the identification of inhibitors for protein targets. Chemical Society Reviews. April 2015, 44 (8): 2455–88. PMID 25706945. doi:10.1039/c4cs00493k  . 
  65. ^ Herrmann A. Dynamic combinatorial/covalent chemistry: a tool to read, generate and modulate the bioactivity of compounds and compound mixtures. Chemical Society Reviews. March 2014, 43 (6): 1899–933. PMID 24296754. doi:10.1039/c3cs60336a. 
  66. ^ Hochgürtel M, Lehn JM. Fragment-based approaches in drug discovery . Weinheim: Wiley-VCH. 2006: 341–364. ISBN 9783527312917. 
  67. ^ Caliandro R, Belviso DB, Aresta BM, de Candia M, Altomare CD. Protein crystallography and fragment-based drug design. Future Medicinal Chemistry. June 2013, 5 (10): 1121–40. PMID 23795969. doi:10.4155/fmc.13.84. 
  68. ^ Chilingaryan Z, Yin Z, Oakley AJ. Fragment-based screening by protein crystallography: successes and pitfalls. International Journal of Molecular Sciences. October 2012, 13 (10): 12857–79. PMC 3497300  . PMID 23202926. doi:10.3390/ijms131012857  . 
  69. ^ Valade A, Urban D, Beau JM. Two galactosyltransferases' selection of different binders from the same uridine-based dynamic combinatorial library. Journal of Combinatorial Chemistry. Jan–Feb 2007, 9 (1): 1–4. PMID 17206823. doi:10.1021/cc060033w. 
  70. ^ Zheng W, Thorne N, McKew JC. Phenotypic screens as a renewed approach for drug discovery. Drug Discovery Today. November 2013, 18 (21–22): 1067–1073. PMC 4531371  . PMID 23850704. doi:10.1016/j.drudis.2013.07.001. 
  71. ^ Swinney DC, Anthony J. How were new medicines discovered?. Nature Reviews. Drug Discovery. June 2011, 10 (7): 507–519. PMID 21701501. S2CID 19171881. doi:10.1038/nrd3480. 
  72. ^ Brown DG, Wobst HJ. Opportunities and Challenges in Phenotypic Screening for Neurodegenerative Disease Research. Journal of Medicinal Chemistry. March 2020, 63 (5): 1823–1840. PMID 31268707. S2CID 195798523. doi:10.1021/acs.jmedchem.9b00797. 
  73. ^ Moellering RE, Cravatt BF. How chemoproteomics can enable drug discovery and development. Chemistry & Biology. January 2012, 19 (1): 11–22. PMC 3312051  . PMID 22284350. doi:10.1016/j.chembiol.2012.01.001. 
  74. ^ Marshall SF, Burghaus R, Cosson V, Cheung SY, Chenel M, DellaPasqua O, et al. Good Practices in Model-Informed Drug Discovery and Development: Practice, Application, and Documentation. CPT. March 2016, 5 (3): 93–122. PMC 4809625  . PMID 27069774. doi:10.1002/psp4.12049  . 
  75. ^ Marshall S, Madabushi R, Manolis E, Krudys K, Staab A, Dykstra K, Visser SA. Model-Informed Drug Discovery and Development: Current Industry Good Practice and Regulatory Expectations and Future Perspectives. CPT. February 2019, 8 (2): 87–96. PMC 6389350  . PMID 30411538. doi:10.1002/psp4.12372  . 
  76. ^ Van Wijk RC. Model-Informed Drug Discovery and Development Strategy for the Rapid Development of Anti-Tuberculosis Drug Combinations. Applied Sciences. 2020, 10 (2376): 2376. doi:10.3390/app10072376  . 
  77. ^ Balatti, Galo, E.; Barletta, Patricio, G.; Perez, Andres, D.; Giudicessi, Silvana, L.; Martínez‐Ceron, María, C., Inamuddin; Altalhi, Tariq; Cruz, Jorddy N.; Refat, Moamen Salah El‐Deen , 编, Machine Learning Approaches to Improve Prediction of Target‐Drug Interactions, Drug Design Using Machine Learning 1 (Wiley), 2022-10-10: 21–96 [2023-01-27], ISBN 978-1-394-16628-2, doi:10.1002/9781394167258.ch2, （原始内容于2023-01-27） （英语） 
  78. ^ Allelopathy: a physiological process with ecological implications, Springer: 1, 2006, ISBN 978-1-4020-4279-9 
  79. ^ 79.0 79.1 Feher M, Schmidt JM. Property distributions: differences between drugs, natural products, and molecules from combinatorial chemistry. Journal of Chemical Information and Computer Sciences. 2003, 43 (1): 218–27. PMID 12546556. doi:10.1021/ci0200467. 
  80. ^ 80.0 80.1 80.2 Newman DJ, Cragg GM. Natural products as sources of new drugs over the last 25 years. Journal of Natural Products. March 2007, 70 (3): 461–77. PMID 17309302. doi:10.1021/np068054v. 
  81. ^ von Nussbaum F, Brands M, Hinzen B, Weigand S, Häbich D. Antibacterial natural products in medicinal chemistry—exodus or revival?. Angewandte Chemie. August 2006, 45 (31): 5072–129. PMID 16881035. doi:10.1002/anie.200600350. The handling of natural products is cumbersome, requiring nonstandardized workflows and extended timelines. Revisiting natural products with modern chemistry and target-finding tools from biology (reversed genomics) is one option for their revival. 
  82. ^ Li JW, Vederas JC. Drug discovery and natural products: end of an era or an endless frontier?. Science. July 2009, 325 (5937): 161–5. Bibcode:2009Sci...325..161L. PMID 19589993. S2CID 207777087. doi:10.1126/science.1168243. With the current framework of HTS in major pharmaceutical industries and increasing government restrictions on drug approvals, it is possible that the number of new natural product–derived drugs could go to zero. However, this is likely to be temporary, as the potential for new discoveries in the longer term is enormous. 
  83. ^ Harvey AL, Edrada-Ebel R, Quinn RJ. The re-emergence of natural products for drug discovery in the genomics era (PDF). Nature Reviews. Drug Discovery. 2015, 14 (2): 111–29 [2023-05-28]. PMID 25614221. S2CID 12369182. doi:10.1038/nrd4510. hdl:10072/141449  . （原始内容 (PDF)于2023-01-31）. Here, we review strategies for natural product screening that harness the recent technical advances that have reduced [technical barriers to screening natural products in high-throughput assays]. The growing appreciation of functional assays and phenotypic screens may further contribute to a revival of interest in natural products for drug discovery. 
  84. ^ Newman DJ, Cragg GM. Natural Products as Sources of New Drugs from 1981 to 2014. Journal of Natural Products. 2016, 79 (3): 629–61. PMID 26852623. doi:10.1021/acs.jnatprod.5b01055  . ... the utilization of natural products and/or their novel structures, in order to discover and develop the final drug entity, is still alive and well. For example, in the area of cancer, over the time frame from around the 1940s to the end of 2014, of the 175 small molecules approved, 131, or 75%, are other than "S" (synthetic), with 85, or 49%, actually being either natural products or directly derived therefrom. 
  85. ^ Torre BG, Albericio F. The Pharmaceutical Industry in 2016. An Analysis of FDA Drug Approvals from a Perspective of the Molecule Type. Molecules (Basel, Switzerland). 2017, 22 (3): 368. PMC 6155368  . PMID 28264468. doi:10.3390/molecules22030368  . The outputs from 2016 indicate the so-called small molecules are losing ground against biologics, biomolecules, and other molecules inspired [by] natural products 
  86. ^ Sutton D. The Great Naturalists. London: Thames & Hudson, with the Natural History Museum. 2007: 32–37. ISBN 978-0-500-25139-3. 
  87. ^ 87.0 87.1 Ahn K. The worldwide trend of using botanical drugs and strategies for developing global drugs. BMB Reports. March 2017, 50 (3): 111–116. PMC 5422022  . PMID 27998396. doi:10.5483/BMBRep.2017.50.3.221. 
  88. ^ Wink M. Modes of Action of Herbal Medicines and Plant Secondary Metabolites. Medicines. September 2015, 2 (3): 251–286. PMC 5456217  . PMID 28930211. doi:10.3390/medicines2030251  . 
  89. ^ Oishi S, Kimura SI, Noguchi S, Kondo M, Kondo Y, Shimokawa Y, Iwao Y, Itai S. New scale-down methodology from commercial to lab scale to optimize plant-derived soft gel capsule formulations on a commercial scale. International Journal of Pharmaceutics. January 2018, 535 (1–2): 371–378. PMID 29154803. doi:10.1016/j.ijpharm.2017.11.029. 
  90. ^ 90.0 90.1 90.2 90.3 Fingrut O, Flescher E. Plant stress hormones suppress the proliferation and induce apoptosis in human cancer cells. Leukemia. April 2002, 16 (4): 608–16. PMID 11960340. doi:10.1038/sj.leu.2402419   （英语）. 
  91. ^ Zhang M, Zhang MW, Zhang L, Zhang L. Methyl jasmonate and its potential in cancer therapy. Plant Signaling & Behavior. 24 July 2015, 10 (9): e1062199. PMC 4883903  . PMID 26208889. doi:10.1080/15592324.2015.1062199. 
  92. ^ 92.0 92.1 Turner JG, Ellis C, Devoto A. The jasmonate signal pathway. The Plant Cell. 2002, 14 (Suppl): S153–64. PMC 151253  . PMID 12045275. doi:10.1105/tpc.000679. 
  93. ^ Ahmad P, Rasool S, Gul A, Sheikh SA, Akram NA, Ashraf M, Kazi AM, Gucel S. Jasmonates: Multifunctional Roles in Stress Tolerance. Frontiers in Plant Science. 2016, 7: 813. PMC 4908892  . PMID 27379115. doi:10.3389/fpls.2016.00813   （英语）. 
  94. ^ Rotem R, Heyfets A, Fingrut O, Blickstein D, Shaklai M, Flescher E. Jasmonates: novel anticancer agents acting directly and selectively on human cancer cell mitochondria. Cancer Research. March 2005, 65 (5): 1984–93. PMID 15753398. doi:10.1158/0008-5472.CAN-04-3091  . 
  95. ^ 95.0 95.1 Michelet JF, Olive C, Rieux E, Fagot D, Simonetti L, Galey JB, Dalko-Csiba M, Bernard BA, Pereira R. The anti-ageing potential of a new jasmonic acid derivative (LR2412): in vitro evaluation using reconstructed epidermis Episkin™. Experimental Dermatology. May 2012, 21 (5): 398–400. PMID 22509841. doi:10.1111/j.1600-0625.2012.01480.x  . 
  96. ^ Henriet E, Jäger S, Tran C, Bastien P, Michelet JF, Minondo AM, Formanek F, Dalko-Csiba M, Lortat-Jacob H, Breton L, Vivès RR. A jasmonic acid derivative improves skin healing and induces changes in proteoglycan expression and glycosaminoglycan structure. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects. September 2017, 1861 (9): 2250–2260. PMID 28602514. doi:10.1016/j.bbagen.2017.06.006. 
  97. ^ 97.0 97.1 97.2 Klessig DF, Tian M, Choi HW. Multiple Targets of Salicylic Acid and Its Derivatives in Plants and Animals. Frontiers in Immunology. 26 May 2016, 7: 206. PMC 4880560  . PMID 27303403. doi:10.3389/fimmu.2016.00206  . 
  98. ^ Pierpoint WS. Advances in Botanical Research 20. 1994: 163–235. ISBN 978-0-12-809447-1. doi:10.1016/S0065-2296(08)60217-7. 
  99. ^ Taylor T, Campbell CT, Kelly B. A Review of Bivalirudin for Pediatric and Adult Mechanical Circulatory Support. American Journal of Cardiovascular Drugs. July 2021, 21 (4): 395–409. PMC 7654565  . PMID 33174088. doi:10.1007/s40256-020-00450-w. 
  100. ^ Shyangdan DS, Royle P, Clar C, Sharma P, Waugh N, Snaith A. Glucagon-like peptide analogues for type 2 diabetes mellitus. The Cochrane Database of Systematic Reviews. October 2011, 2011 (10): CD006423. PMC 6486297  . PMID 21975753. doi:10.1002/14651858.cd006423.pub2. 
  101. ^ Faulkner DJ, Newman DJ, Cragg GM. Investigations of the marine flora and fauna of the Islands of Palau. Natural Product Reports. February 2004, 21 (1): 50–76 [2023-05-28]. PMID 15039835. doi:10.1039/b300664f. （原始内容于2023-02-05）. 
  102. ^ Holtzapple, M.T. HEMICELLULOSES. 2003: 3060–3071. doi:10.1016/B0-12-227055-X/00589-7. 
  103. ^ Kollár P, Rajchard J, Balounová Z, Pazourek J. Marine natural products: bryostatins in preclinical and clinical studies. Pharmaceutical Biology. February 2014, 52 (2): 237–42. PMID 24033119. doi:10.3109/13880209.2013.804100  . 
  104. ^ 104.0 104.1 104.2 Fischer, Janos; Ganellin, C. Robin. Analogue-based Drug Discovery. John Wiley & Sons. 2006: 512. ISBN 9783527607495. （原始内容于2016-12-21） （英语）. 
  105. ^ 105.0 105.1 Taxol® (NSC 125973). National Cancer Institute:. [14 February 2016]. （原始内容于5 September 2015）. 
  106. ^ Jordan MA, Wilson L. Microtubules as a target for anticancer drugs. Nature Reviews. Cancer. April 2004, 4 (4): 253–65. PMID 15057285. S2CID 10228718. doi:10.1038/nrc1317. 
  107. ^ Darshan MS, Loftus MS, Thadani-Mulero M, Levy BP, Escuin D, Zhou XK, et al. Taxane-induced blockade to nuclear accumulation of the androgen receptor predicts clinical responses in metastatic prostate cancer. Cancer Research. September 2011, 71 (18): 6019–29. PMC 3354631  . PMID 21799031. doi:10.1158/0008-5472.CAN-11-1417. 
  108. ^ Nirmala, M. Joyce, A. Samundeeswari, and P. Deepa Sankar. 2011. "Natural Plant Resources in Anti-Cancer Therapy-A Review." Research in Plant Biology 1 (3): 1–14.. [2023-06-01]. （原始内容于2018-10-19）. 
  109. ^ Osheroff Neil, Eukaryotic Topoisomerase II: characterisation of enzyme turnover, 1986, The Journal of Biological CHemistry, vol. 261, no. 21, pp. 9944-9950
  110. ^ Gordaliza M, García PA, del Corral JM, Castro MA, Gómez-Zurita MA. Podophyllotoxin: distribution, sources, applications and new cytotoxic derivatives. Toxicon. 2004, 44 (4): 441–59. PMID 15302526. doi:10.1016/j.toxicon.2004.05.008. 
  111. ^ daunorubicin hydrochloride. The American Society of Health-System Pharmacists. [8 December 2016]. （原始内容于8 January 2017）. 
  112. ^ Machida, Kodai; Masutan, Mamiko; Imatak, Hiroaki. Protein Synthesis in vitro: Cell-Free Systems Derived from Human Cells. Cell-Free Protein Synthesis. InTech. 2012-10-10. ISBN 978-953-51-0803-0. 
  113. ^ Katzung, Bertram G. Cancer Chemotherapy. Basic and clinical pharmacology 10th. New York: McGraw-Hill Medical Publishing Division. 2006. ISBN 0-07-145153-6. OCLC 157011367. 
  114. ^ Mazerski J, Martelli S, Borowski E. The geometry of intercalation complex of antitumor mitoxantrone and ametantrone with DNA: molecular dynamics simulations. Acta Biochim. Pol. 1998, 45 (1): 1–11. PMID 9701490. 
  115. ^ The Random House Dictionary of the English Language Unabridged Edition, Jess Stein ed. in chief, Random House, New York 1966 p. 489
  116. ^ Acharya, Deepak and Shrivastava Anshu (2008): Indigenous Herbal Medicines: Tribal Formulations and Traditional Herbal Practices, Aavishkar Publishers Distributor, Jaipur, India. ISBN 978-81-7910-252-7. pp 440.
  117. ^ Acharya, Deepak and Shrivastava Anshu: Indigenous Herbal Medicines: Tribal Formulations and Traditional Herbal Practices. Aavishkar Publishers Distributor, Jaipur / India 2008, ISBN 978-81-7910-252-7, p. 440.
  118. ^ 米勒·路易斯（Louis H. Miller）和苏新专（Xin-zhuan Su）. . 《细胞》 (CAMBRIDGE, MA 02139, USA: Cell Press). 2011-09-16, 146 (6): 855–858 [2011-09-26]. ISSN 0092-8674. PMID 21907397. doi:10.1016/j.cell.2011.08.024. （原始内容存档于2011-09-24）. 
  119. ^ . [6 October 2015]. （原始内容存档于2015-11-10）. 
  120. ^ Sparkman, O. David. Mass spectrometry desk reference. Pittsburgh: Global View Pub. 2000. ISBN 0-9660813-2-3. 
  121. ^ Pitt, James J. Principles and Applications of Liquid Chromatography-Mass Spectrometry in Clinical Biochemistry. Clin Biochem Rev. February 2009, 30 (1): 19–34. PMC 2643089  . PMID 19224008. 
  122. ^ Chaimbault, Patrick. The Modern Art of Identification of Natural Substances in Whole Plants. Jacob, Claus; Kirsch, Gilbert; Slusarenko, Alan; Winyard, Paul G.; Burkholz, Torsten (编). Recent Advances in Redox Active Plant and Microbial Products. Springer Netherlands. 2014-01-01: 31–94. ISBN 9789401789523. doi:10.1007/978-94-017-8953-0_3 （英语）. 
  123. ^ . Mark Wainwright Analytical Centre - University of Southern Wales Sydney. 9 December 2011 [9 February 2014]. （原始内容存档于27 January 2014）. 
  124. ^ Shah, N; Sattar, A; Benanti, M; Hollander, S; Cheuck, L. . The Journal of the American Osteopathic Association. January 2006, 106 (1): 23–27. PMID 16428685. （原始内容存档于2013-04-07）. 
  125. ^ The Drug Development Process. U.S. Food and Drug Administration. 4 January 2018 [1 May 2018]. （原始内容于2019-04-23）. 
  126. ^ The Drug Development Process. Step 4: FDA Drug Review. U.S. Food and Drug Administration. 4 January 2018 [1 May 2018]. （原始内容于2019-04-22）. 
  127. ^ The drug development process. Step 4: FDA drug review. US Food and Drug Administration. 4 January 2018 [18 December 2019]. （原始内容于2023-03-31）. 

延伸阅读

  • Gad SC. Drug Discovery Handbook. Hoboken, N.J: Wiley-Interscience/J. Wiley. 2005. ISBN 978-0-471-21384-0. 
  • Madsen U, Krogsgaard-Larsen P, Liljefors T. Textbook of Drug Design and Discovery. Washington, DC: Taylor & Francis. 2002. ISBN 978-0-415-28288-8. 
  • Rasmussen N. Gene Jockeys: Life Science and the rise of Biotech Enterprise. Baltimore: Johns Hopkins University Press. 2014. ISBN 978-1-42141-340-2. 

外部链接

七月 11, 2023
药物发现, 在医学, 生物技术和药学领域, 是指一个新的候选药物的发现过程, 研发流程图历史上科学家通过鉴定传统药物中的活性成分或意外发现某物质具有疗效从而发现药物, 如青霉素的发现, 近代, 科学家通过细胞或生物体筛选化合物库中的合成小分子, 天然产物或其提取物, 旨在发现经典药理学中具有理想疗效的物质, 人类基因组测序技术使得快速克隆和合成大量纯化蛋白质成为可能, 其中某些蛋白质靶标被认为与缓解或治疗疾病有关, 被称为反向药理学, reverse, pharmacology, 常规的研究经历如下几个阶段, 先利. 在医学 生物技术和药学领域 药物发现是指一个新的候选药物的发现过程 1 药物发现研发流程图历史上科学家通过鉴定传统药物中的活性成分或意外发现某物质具有疗效从而发现药物 如青霉素的发现 近代 科学家通过细胞或生物体筛选化合物库中的合成小分子 天然产物或其提取物 旨在发现经典药理学中具有理想疗效的物质 人类基因组测序技术使得快速克隆和合成大量纯化蛋白质成为可能 其中某些蛋白质靶标被认为与缓解或治疗疾病有关 被称为反向药理学 Reverse pharmacology 常规的药物发现研究经历如下几个阶段 先利用化合物库中大量的化合物针对分离的蛋白质生物靶标进行高通量筛选 High throughput screening 然后将筛选出的活性化合物继续在细胞中测试 最后将多轮测试中结果良好的化合物继续进行动物实验 以评价其治疗活性或效力 Efficacy 2 现代药物发现包括以下几个环节 苗头化合物 Hit compound 的筛选与发现 3 药物化学研究即从苗头化合物至先导化合物 Hit to Lead 4 和先导化合物优化 Lead optimization 其中优化过程涵盖了 增加与靶点的亲和力 提高活性 增加配体选择性 减少副作用 提高效力或活性 提高化合物代谢稳定性 以增加生物半衰期 和提高药物的口服生物利用度 只要找到某化合物可满足以上所有条件 药物开发过程就可以继续推进 如若开发过程成功结束 将使用开发的新药开展临床试验 以在人体上测试该新药的安全性和有效性 5 现代新药发现过程属于资本密集型产业 这些资本涉及制药企业的大量投资以及政府提供的政策补助和贷款担保 尽管药物科技和现代生物理论的不断进步和对药物发现颇有帮助 但迄今为止药物发现仍然是一个漫长 昂贵 困难且低效的过程 发现全新疗效的成功药物的数量很少 6 2010年统计每个新化学实体的研发费用约为18亿美元 7 21世纪针对药物的基础研究工作主要由政府和慈善组织资助 而药物的后期开发主要由制药公司或风投资本资助 8 药品的获准上市前 必须经历几个临床试验阶段 若成功才可通过新药批准程序并上市销售 在美国称为新药申请 New Drug Application NDA 一个可取得商业或公共卫生领域成功的药物发现过程 需要投资家 企业家 学术界 法律专利领域 政府监管领域和市场营销之间的通力协作 9 罕见疾病患者人群较少 可预见其治疗药物无法取得商业上丰厚的回报 或在公共健康领域产生巨大影响 因此政府和众多孤儿药资助基金可帮助这些罕见病患者 让其通过各种资助仍可获得良好的药物治疗 10 11 1 12 目录 1 历史 2 靶标 3 筛选和设计 4 源于天然产物的药物 4 1 源于植物的药物 4 1 1 历史 4 1 2 茉莉酸 4 1 3 水杨酸盐 4 2 源于动物的药物 4 3 源于微生物代谢物的药物 4 4 源于海洋无脊椎动物的药物 4 5 化学多样性 4 6 筛选 4 7 结构解析 5 新药申请 6 参见 7 参考文献 8 延伸阅读 9 外部链接历史 编辑药物在人体中的作用机制 是由药物分子与生物大分子 通常为蛋白质或核酸 的特定相互作用介导的 基于以上观点科学家得出论断 药品中具备的生物活性是由其中的单一化学物质产生的 从此药用植物的粗品提取物被单一纯净的化学物质所替代成为标准药物 这正是药理学时代的开端 例如 鸦片是罂粟的粗品提取物 其具有镇痛活性的单一化学成分是吗啡 13 而洋地黄中的粗品提取物具有心脏兴奋活性 其有效化学成分是地高辛 14 15 使用有机化学研究天然产物中活性成分的学科称为天然产物化学 16 17 有机化学还促成了许多活性天然产物的全合成 18 19 20 历史上 无论是粗品提取物还是纯化学物质 均在不明生物靶标的情况下进行生物活性筛选工作 而先鉴定化学物质的结构 并用其验证疗效或相关生物活性 这种方法被称为经典药理学或正向药理学 21 或称表型药物发现 22 后来 科学家针对已知的生理或病理途径 设计且合成了一系列具相关活性的小分子 以避免对化合物库筛选的依赖并取得了巨大的成功 例如 格特魯德 B 埃利恩 Gertrude Elion 和乔治 H 希钦斯在嘌呤代谢方面的工作 23 24 25 詹姆士 W 布拉克在b受体阻滞剂和西咪替丁方面的工作 26 以及远藤章在他汀类药物方面的工作 27 另一个成功范例是大卫杰克 David Jack 他基于已知活性物质开发化合物类似物药物 在葛兰素史克制药中参与或主导开发以下项目 第一个用于哮喘的甾体类吸入剂药物 选择性b2 肾上腺素能激动剂 雷尼替丁 西咪替丁的二代药物 以及曲坦类药物的开发工作 28 29 格特鲁德 B 埃利恩与不到50人的小组一起开发嘌呤类似物 发现了首款抗病毒药物和首个辅助人体器官移植的免疫抑制剂 硫唑嘌呤 并开发了首款缓解儿童白血病药物 他一生参与了多个关键的肿瘤药物 抗疟疾药物 抗菌药物和痛风药物的研发项目 并于1988年 获颁诺贝尔生理学或医学奖 30 31 32 2020年代 量子位元和量子计算应用于药物发现领域 大幅地节省研发时间 33 靶标 编辑靶点或称靶标 Target 在生物学中是指生物体内 能够被其他物质 配体或药物分子 识别或结合的结构 在药学中 靶点是指研究的病理学相关的细胞或其分子结构 开发的药物会与之作用并治疗疾病 8 然而 在不完全理解靶标信息的情况下 可将靶标区分为新靶标或已知靶标 通常由新药开发公司对靶标进行区分 8 根据2011年统计 约有435种人类基因组物质被FDA定义为批准药物的治疗药物靶标 34 已知靶标 是指有大量历史文献的支持下 对该靶标如何在正常生理学中发挥作用 以及该靶标如何参与人类病理学均有良好的科学性理解 2 但已知靶标不意味着药物的作用机制已被完全了解 2 其科学背景信息已经过大量研究 尤其是靶标的功能性信息 通常 新靶标 不是已知靶标 而是在药物发现中已有大量科学数据和研究资料的靶标 在药物发现工作中 主要研究的靶标类型为蛋白质 例如G蛋白偶联受体 GPCR 和蛋白激酶 35 筛选和设计 编辑药物发现通常从确定疾病的靶标开始 然后利用高通量筛选 HTS 和大型化合物库进行筛选 找到能与靶标结合的化合物 例如 如果靶标是新的G蛋白偶联受体 可通过以上方法筛选化合物抑制或激动该受体的活性 参见拮抗剂和激动剂 而如果靶标是一种蛋白激酶 则需要筛选化合物抑制该激酶的能力 36 高通量筛选的另一个作用是测试某化合物对目标靶标的特异性 药物开发者期待找到一种药物分子 其只会影响目标靶标 而不影响体内其他相关靶标 因此 可将某化合物进行多个靶标的筛选 以确认该化合物 命中 目标靶标的同时是否会干扰其他相关靶标 即所谓的脱靶效应 这个过程称为靶标的交叉筛选 36 交叉筛选的必要性在于 化合物可命中的靶点越多意味着特异性越差 在临床实验中表现出的脱靶毒性的可能性也越大 36 早期筛选中通常找不到完美的候选药物 所以第一阶段可排除一些无法继续开发的化合物 若某化合物在几乎所有筛选中均可命中不同靶标 该类化合物被药物开发者定义为 泛分析干扰化合物 在此阶段该类化合物将从库中被剔除 37 38 39 在筛选期间 如果发现几种化合物具有类似程度的生物活性 且这些化合物具有某些共同的化学基团或特征 则基团或特征可能属于药效团 基于药效团的研究 药物化学家尝试分析化合物的构效关系 SAR 来优化先导化合物 Lead compound 的各项药物特性 40 41 基于所选靶标 增加化合物的活性 减少针对不相关靶标的化合物活性 改善药物分子的类药性或ADME特性整个筛选过程需要生物实验与化学结构改造经历反复且多次迭代 在此期间 新化学实体的特性在生物实验的结果反馈中不断得到优化 并挑选数据良好的化合物继续开展体外和体内的生物实验测试 最后将体内外实验均良好的候选化合物用于所选疾病的动物模型中 以测试该化合物的体内的有效性和安全性 40 与药物吸收相关的物理化学性质包括 电离 pKa 溶解度和渗透性等 其中渗透性可通过平行人工膜渗透性测定 Parallel artificial membrane permeability assay PAMPA 或Caco 2细胞测定 42 43 Caco 2 胃肠道 GIT 和血脑屏障 BBB 等测试具有高度相关性的优点 但PAMPA法与之相比药物损耗低且价格低廉 因此作为早期化合物渗透性的筛选工具而被广泛使用 44 一系列参数可用于评估化合物的成药性或类药性 Drug Like property 45 如Lipinski五原则 46 47 这些参数中有些可通过模型预测估算 如用于估算亲脂性的参数有 分配系数 cLogP 分子量 Mw 极性表面积 TPSA 以及只有通过实验测试才可知的参数 如 效力 或效价 酶促清除率的其他体外测试项目等 此外如 配体效率 LE 48 和亲脂效率 LiPE 49 50 等参数也可参与评估类药性质 51 高通量筛选虽常用于新药发现 但并非成功的唯一途径 药物设计还可基于一些具备药物特性的分子进行开发 此类分子可从自然界的动植物中提取的天然产物 也可将已上市的药物进行改造 即开发所谓的Me too药物 其他还有一些方法 如虚拟高通量筛选 其中所谓的虚拟筛选 是使用计算机生成的蛋白质靶点模型与虚拟化合物库中的化合物进行对接 Docking 操作 以选出可能存在活性的苗头化合物 Hit compound 36 另一种药物发现方法称为药物从头设计 先推测一类化合物可匹配目标酶的活性位点 Active site 例如 利用虚拟筛选和计算机辅助药物设计识别可与目标蛋白质靶点模型相互作用的新化学实体 52 53 分子建模 54 和分子动力学模拟对于提高先导化合物的活性和成药性均起到指导作用 55 56 57 药物发现模式正发生转变 从昂贵且覆盖化学空间 结构多样性 有限的化合物库中进行高通量筛选 逐渐转变为较小的化合物库 不超过几千种化合物 筛选 这些新的模式包括 基于片段的先导化合物发现 Fragment based lead discovery FBDD 58 59 60 61 和蛋白质导向的动态组合化学 Protein directed dynamic combinatorial chemistry 62 63 64 65 66 以上方法中使用的配体小分子通常体积较小 且与靶蛋白的结合亲和力较HTS中筛选出的化合物更弱 首轮化合物被筛选出后 需要通过有机合成对小分子进行化学修饰 使之成为先导化合物 运用蛋白质X射线晶体学 可鉴定化合物与蛋白质片段形成复合物的三维空间结构 通过该结构可进一步指导先导化合物的修饰与优化 67 68 69 这些新模式的优点在于 筛选更有效率 且与HTS相比化合物库虽然较小 但通常覆盖的化学空间 Chemical space 很大 表型筛选 Phenotypic screen 也是药物发现新的起点之一 70 71 多种动物或细胞模型可供筛选药物 包括 酵母 斑马鱼 蠕虫 永生细胞系 原代细胞系 患者来源的细胞系和完整动物模型 这些筛选旨在寻找可逆转疾病表型的化合物 其表型包括 死亡 蛋白质聚集 突变蛋白质表达或细胞增殖 成功入选的化合物 继续使用更全面的细胞模型或生物体进行筛选 此时当模型的价格或时间成本高昂时 可使用较小的筛选库进行 72 通常 表型筛选出的化合物虽然具有药效 但其确切作用机制 MOA 却是未知的 后续需要大量的目标逆卷积 Deconvolution 实验来确定其作用机制 化学蛋白质组学 Chemoproteomics 的发展 为药物设计提供了许多策略 以确定此类表型筛选药物与靶标相互作用的机制 73 一旦确定先导化合物 Lead compound 即候选化合物具有足够与靶标结合的活性和选择性 也具有良好的类药性 即可挑选其中的一至两个系列化合物用于后续的药物开发 其中最好的化合物被称为先导化合物 另一个则被指定为备选化合物 74 75 76 药物开发的各个阶段 靶点确认 靶点验证 先导化合物发现 先导化合物优化 临床药物开发 其中各个阶段均可运用计算技术 77 源于天然产物的药物 编辑传统意义上 发现药物和具有生物活性的化学物质 是基于研究有机体产生的化合物如何影响其他生物体活动的基础之上 78 尽管组合化学 Combinatorial chemistry 已成为先导化合物发现中的关键一环 而天然产物仍然在药物发现中发挥着重要作用 79 2007年的一份报告报道了1981至2006几年间 开发的974个小分子新化学实体中 63 为天然产物衍生物或天然产物的半合成衍生物 对于某些治疗领域 例如抗菌药物 抗肿瘤药物 抗高血压药物和抗炎药物 天然产物的比例更高 80 天然产物是现代抗菌药物开发中的新化学结构的重要来源之一 81 源于植物的药物 编辑 动植物产生的许多次级代谢产物具有潜在的药用治疗性质 这些次级代谢物包含以下活性 结合蛋白质或受体 酶等靶点并改变其生物功能 因此 动植物相关的天然产物常被用作药物发现的起点 82 83 84 85 3 历史 编辑 西方直至文艺复兴时期 绝大多数使用的西药是植物提取物 86 基于植物作为药物发现的重要来源 逐渐形成了具有药效潜力的植物信息库 87 植物不同的部位 如根 叶和花 会产生不同的代谢物和激素 这些知识对于准确识别生物活性和植物药理学属性至关重要 87 88 鉴于各个国家药品监管机构的监管要求 鉴定天然产物并将其作为新药推向市场会经历严格的审批过程 89 茉莉酸 编辑 茉莉酸甲酯 JA 的化学结构 茉莉酸 Jasmonate 会影响到细胞内信号的反馈机制 它们通过蛋白酶抑制剂诱导细胞凋亡 90 91 蛋白质级联 Protein cascade 90 具备防御功能 92 并调节植物对不同生物和非生物胁迫的反应 92 93 茉莉酸还具有通过释放代谢物诱导膜去极化 以直接作用于线粒体膜的能力 94 茉莉酸衍生物 JAD 对于植物细胞的伤口反应和组织再生非常重要 研究表明茉莉酸衍生物对人体表皮层具有抗衰老作用 95 研究推测其与蛋白多糖 Proteoglycan PG 和糖胺聚糖 Glycosaminoglycan GAG 多糖相互发生作用 可帮助重塑细胞外基质的重要成分 96 茉莉酸衍生物被发现在皮肤修复方面的研究 引发了科学家对于植物激素在药物应用中的研究 95 水杨酸盐 编辑 乙酰水杨酸的化学结构 通常称为阿司匹林 水杨酸 Salicylic acid SA 是一种植物激素 最初来源于柳树皮 此后被发现在许多植物物种中存在 尽管科学家仍未完全了解水杨酸在植物中的作用 但可以确定其是植物免疫力的关键化学物质 97 它参与了植物和动物组织的疾病和免疫反应 水杨酸可结合水杨酸结合蛋白 Salicylic acid binding proteins SABP 已显示其可对多种动物组织产生影响 97 分离出的水杨酸化合物 首个发现的药用属性是治疗疼痛和发烧 其次 它还在抑制细胞增殖中发挥积极作用 90 并具有诱导白血病淋巴细胞凋亡及其他人类癌细胞凋亡的能力 90 最常见的水杨酸类药物是阿司匹林 也称为乙酰水杨酸 其具有抗炎和解热的作用 97 98 源于动物的药物 编辑 现代医学中使用的一些药物 其发现过程来源于动物体内 或是基于在动物发现的化合物 例如 抗凝药物水蛭素 及其化学类似物比伐卢定 Bivalirudin 是基于一种 欧洲医蛭 的唾液中的活性物质基础上研发出的药物 99 用于治疗2型糖尿病药物艾塞那肽 Exenatide 是基于一种毒蜥 美国毒蜥 的唾液中分离的活性物质基础上研发出的药物 100 源于微生物代谢物的药物 编辑 微生物为生存会争夺空间和营养 为了适应环境存活 许多微生物会避免与其他微生物竞争 并演化出避免其他微生物增殖的能力 因此抗菌药物的主要研发基础就是微生物 链霉菌分离株 Streptomyces isolate 是非常有价值的抗生素来源 其被称为药用霉菌 另一个通过微生物的防御机制而发现的抗生素的经典例子 是1928年科学家通过被青霉菌污染的细菌培养物中发现了青霉素 源于海洋无脊椎动物的药物 编辑 也可从海洋世界中发现新的生物活性物质 101 1950年代科学家从海洋无脊椎动物中发现的阿拉伯糖核苷 首次证明核糖和脱氧核糖以外的糖类化合物可衍生出具有生物活性的核苷类化合物 102 直至2004年 首个海洋动物的衍生药物才获得批准 如锥形蜗牛毒素 齐考诺肽 Ziconotide 也称为 Prialt 可治疗严重的神经性疼痛 其他海洋动物衍生药物目前正在开展对于包括 癌症 抗炎和疼痛等适应症的临床试验 103 化学多样性 编辑 组合化学可高效地生成大型筛选化合物库 以满足高通量筛选需求 然而经过二十年的组合化学的相关研究和实际运用 有药学家指出 尽管组合化学基于高效合成提供了大量的化合物 但先导化合物或候选药物的数量并未增加 80 这驱使药学家开始研究与现有药物或天然产物相比 组合化学产出的化合物的结构差异性 化学信息学定义了化学多样性 Chemical diversity 这个概念 其描述为化合物根据其物理化学特性在化学空间中的分布情况 通常用化学多样性评价组合化学库与天然产物之间的差异 合成化合物库或组合化合物库只可涵盖有限且单一的化学空间 而现有已上市的药物尤其是天然产物 均表现出更强的化学多样性 它们在化学空间中表现的更均匀且广泛地分布 79 组合化合物库中与天然产物最显著的区别在于手性中心的数量 一般天然产物中手性中心相较更多 其次天然产物比库中的化合物的结构刚性更强 且在芳香结构的数量上更少 其他的化学差异还包括杂原子的性质如 天然产物中富含氧和氮元素 而合成化合物中更常见硫和卤素元素 以及天然产物中的非芳香族不饱和键数量较高 由于结构刚性和手性均在药物化学中被认为可提高化合物的特异性和药物活性 因此有部分药学家认为 使用天然产物作为潜在的先导化合物分子比组合化学库相较更具优势 80 筛选 编辑 从天然产物中发现全新的具备生物活性的化学实体有两种主要方法 第一种被称为天然物料的随机收集和筛选 生物学尤其是植物学的知识 通常被用于识别有药用价值的生物物种 这种方法的有效性建立在全球生物多样性中只有一小部分曾经接受过药物活性测试 此外 生物体能生活在物种丰富且复杂的环境中 势必需要进化出防御机制和竞争机制才能得以生存 药物开发即可运用以上的机制挑选天然产物 104 源于动物 植物和微生物的复杂生态系统会产生新颖且具潜在生物活性的化合物 这些化合物值得在药物开发过程中加以利用 成功运用这一策略的范例 是国家癌症研究所在1960年代开始的抗肿瘤药物筛选项目 该项目找到了著名的抗肿瘤药物 紫杉醇 其是从太平洋紫杉树短叶红豆杉中分离并鉴定出化学结构 104 紫杉醇通过全新的抗肿瘤机制 稳定微管 显示出其高活性 已获准临床用于治疗肺癌 乳腺癌 卵巢癌以及卡波西肉瘤 105 104 105 在21世纪初 药物卡巴他赛 Cabazitaxel 一种由法国赛诺菲公司研制生产的药物 其基于紫杉醇的衍生出的另一种抗肿瘤类似物 被证明对前列腺癌有效 该药物同样通过阻止微管的形成起药效 体内的微管会在分裂细胞中拉开染色体 106 107 其他示例有 喜树碱类药物 Camtothecin 拓扑替康 Topotecan 伊立替康 Irinotecan 108 鲁比替康 Rubitecan 和倍罗替康 Belotecan 鬼臼毒素类药物 依托泊苷 Etoposide 和替尼泊苷 Teniposide 109 110 蒽环类药物 阿克拉霉素 Aclarubicin 柔红霉素 Daunorubicin 多柔比星 Doxorubicin 表柔比星 Epirubicin 111 112 伊达比星 Idarubicin 氨柔比星 Amrubicin 吡柔比星 Pirarubicin 戊柔比星 Valrubicin 和佐柔比星 Zorubicin 以及蒽二酮类药物 米托蒽醌 Mitoxantrone 和匹衫琼 Pixantrone 113 114 115 第二种方法主要源于民族植物学 即研究植物在社会中的普遍用途以及民族药理学 民族药理学是民族植物学内部的一个领域 专门研究医学用途 116 117 青蒿素是一种源自青蒿植物开发的抗疟药 自公元前200年以来青蒿一直用于中药 是一种用于联合治疗多重耐药性恶性疟原虫的药物 118 119 结构解析 编辑 化学结构解析对于了解药物化学结构 进行构效关系研究 以及避免重复的化学结构研究工作至关重要 药物发现的关键即在于发现新结构 该化学结构能创造新的治疗手段或解决老药的安全性问题 质谱法是一种基于化合物离子化的质荷比 识别化合物分子量或碎片分子量 以推测化合物结构的方法 大多数化合物在自然界中通常以混合物形式存在 120 因此液相色谱法 质谱联用 LC MS 通常用于解析混合物中的不同化合物组分的分子量和相关化合物信息 121 已知化合物的鉴定 可以通过质谱数据库进行比对 数据库还可用于推测未知化合物的结构 确定天然产物化学结构主要运用核磁共振波谱仪进行 核磁图谱可显示结构中单个氢原子 碳原子 氟原子 磷原子或氮原子的信息 以及这些不同原子之间互相的连接关系 从而推测化合物的结构信息 122 123 124 新药申请 编辑当一种药物在其整个研究过程中证明其在预计的治疗用途中是安全且有效时 药品研发公司可以向药监部门提交申请 即所谓的新药申请 New drug application NDA 125 126 药监部门会检查并研究药物研发企业递交的NDA相关资料 根据该药物在临床前研究和人体临床实验中的安全性 药物作用的特异性 药物的剂量 药物的有效性等信息 做出是否批准候选药物科通过该申请的决定 通过NDA的药物即可商业化上市并销售 127 参见 编辑抗靶标 生物信息学 医学信息学 化学信息学 苗头化合物至先导化合物 英语 Drug discovery hit to lead 药物代谢 基于碎片的先导化合物发现 英语 Fragment based drug discovery 高内涵筛选 英语 High content screening 药物基因组学 生药学 生理药代动力学建模 临床前研究 英语 Preclinical development 临床研究 临床研究分期 动力学组合化学 英语 Dynamic combinatorial chemistry 质子泵抑制剂的研发 英语 Discovery and development of proton pump inhibitors 褪黑素受体激动剂的研发 英语 Melatonin receptor agonist Drug design and development 核苷和核苷酸逆转录酶抑制剂的研发 英语 Discovery and development of nucleoside and nucleotide reverse transcriptase inhibitors Bcr Abl酪氨酸激酶抑制剂的研发 英语 Bcr Abl tyrosine kinase inhibitor History 抗雄激素的研发 英语 Discovery and development of antiandrogens 头孢菌素的研发 英语 Discovery and development of cephalosporins 逆向代谢药物设计 英语 Retrometabolic drug design 参考文献 编辑 1 0 1 1 The drug development process US Food and Drug Administration 4 January 2018 18 December 2019 原始内容存档于2020 02 22 2 0 2 1 2 2 The drug development process Step 1 Discovery and development US Food and Drug Administration 4 January 2018 18 December 2019 原始内容存档于2023 04 03 3 0 3 1 Helleboid S Haug C Lamottke K et al The Identification of Naturally Occurring Neoruscogenin as a Bioavailable Potent and High Affinity Agonist of the Nuclear Receptor RORa NR1F1 Journal of Biomolecular Screening 2014 19 3 399 406 https doi org 10 1177 1087057113497095 Herrmann A Roesner M Werner T et al Potent inhibition of HIV replication in primary human cells by novel synthetic polyketides inspired by Aureothin Sci Rep 10 1326 2020 https doi org 10 1038 s41598 020 57843 9 The drug development process Step 3 Clinical research US Food and Drug Administration 4 January 2018 18 December 2019 原始内容存档于2020 06 20 Anson D Ma J He JQ Identifying Cardiotoxic Compounds Genetic Engineering amp Biotechnology News TechNote 29 9 Mary Ann Liebert 1 May 2009 34 35 25 July 2009 ISSN 1935 472X OCLC 77706455 原始内容存档于21 September 2012 Paul SM Mytelka DS Dunwiddie CT Persinger CC Munos BH Lindborg SR Schacht AL How to improve R amp D productivity the pharmaceutical industry s grand challenge Nature Reviews Drug Discovery March 2010 9 3 203 14 PMID 20168317 S2CID 1299234 doi 10 1038 nrd3078 8 0 8 1 8 2 Current Model for Financing Drug Development From Concept Through Approval Institute of Medicine US Forum on Drug Discovery Development and Translation National Academies Press Washington DC 2009 2023 05 28 原始内容存档于2023 04 08 Warren J Drug discovery lessons from evolution British Journal of Clinical Pharmacology April 2011 71 4 497 503 PMC 3080636 PMID 21395642 doi 10 1111 j 1365 2125 2010 03854 x Hadjivasiliou Andreas Orphan Drug Report 2014 PDF EvaluatePharma October 2014 28 June 2015 原始内容存档 PDF 于2015 10 10 Rich Daly 5 September 2002 House Offers Incentives For Development of Orphan Drugs Congressional Quarterly Daily Monitor Hall Anthony K Carlson Marilyn R The current status of orphan drug development in Europe and the US Intractable and Rare Diseases Research 2014 3 1 1 7 ISSN 2186 3644 PMC 4204542 PMID 25343119 doi 10 5582 irdr 3 1 Narcotic Drugs Estimated World Requirements for 2008 Statistics for 2006 New York United Nations Pubns 2008 77 2016 05 26 ISBN 9789210481199 原始内容存档于2019 06 04 Cartwright Anthony C The British Pharmacopoeia 1864 to 2014 Medicines International Standards and the State Routledge 2016 183 2016 12 22 ISBN 9781317039792 原始内容存档于2017 09 08 英语 Hollman A Drugs for atrial fibrillation Digoxin comes from Digitalis lanata BMJ Clinical research ed 1996 04 06 312 7035 912 PMID 8611904 Webster s Revised Unabridged Dictionary Natural product Free Online Dictionary and C amp G Merriam Co 1913 2023 05 30 原始内容存档于2023 04 28 A chemical substance produced by a living organism a term used commonly in reference to chemical substances found in nature that have distinctive pharmacological effects Such a substance is considered a natural product even if it can be prepared by total synthesis All natural Nature Chemical Biology July 2007 3 7 351 PMID 17576412 doi 10 1038 nchembio0707 351 The simplest definition for a natural product is a small molecule that is produced by a biological source K C Nicolaou D Vourloumis N Winssinger and P S Baran The Art and Science of Total Synthesis at the Dawn of the Twenty First Century PDF Angewandte Chemie International Edition 2000 39 1 44 122 2020 06 25 PMID 10649349 doi 10 1002 SICI 1521 3773 20000103 39 1 lt 44 AID ANIE44 gt 3 0 CO 2 L 原始内容 reprint 存档于2017 05 17 Nicolaou K C amp Sorensen E J 1996 Classics in Total Synthesis Targets Strategies Methods New York John Wiley amp Sons ISBN 978 3 527 29231 8 Nicolaou K C amp Snyder S A 2003 Classics in Total Synthesis II More Targets Strategies Methods New York John Wiley amp Sons ISBN 978 3 527 30684 8 Takenaka T Classical vs reverse pharmacology in drug discovery BJU International September 2001 88 Suppl 2 7 10 discussion 49 50 PMID 11589663 doi 10 1111 j 1464 410X 2001 00112 x Lee JA Uhlik MT Moxham CM Tomandl D Sall DJ Modern phenotypic drug discovery is a viable neoclassic pharma strategy Journal of Medicinal Chemistry May 2012 55 10 4527 38 PMID 22409666 doi 10 1021 jm201649s Nobel prize winners who contributed to Transplantation GIN GIN 2018 01 27 2018 11 12 原始内容存档于2018 11 12 美国英语 Elion GB The quest for a cure Annual Review of Pharmacology and Toxicology 1993 33 1 23 PMID 8494337 doi 10 1146 annurev pa 33 040193 000245 Elion GB The purine path to chemotherapy Nobel Lecture 1988 2023 05 28 原始内容存档于2008 07 24 Black J Drugs from emasculated hormones the principles of synoptic antagonism Nobel Lecture 1988 28 February 2014 原始内容存档于2017 10 06 Endo A The discovery of the statins and their development 28 February 2014 原始内容存档于2023 01 31 Sir David Jack The Daily Telegraph 17 November 2011 25 November 2011 原始内容存档于2011 11 25 Sir David Jack The Herald 19 November 2011 Holloway M 1991 Profile Gertrude Belle Elion The Satisfaction of Delayed Gratification Scientific American 265 4 40 44 Watts G Obituary Sir David Jack The Lancet 2012 379 9811 116 S2CID 54305535 doi 10 1016 S0140 6736 12 60053 1 Mary Ellen Avery Gertrude Belle Elion 23 January 1918 21 February 1999 Biographical Memoirs of Fellows of the Royal Society 2008 12 12 54 161 168 2018 04 02 ISSN 0080 4606 doi 10 1098 rsbm 2007 0051 原始内容存档于2017 04 01 英语 Qubit Pharmaceuticals Accelerates Drug Discovery with Hybrid Quantum Computing HPC Wire November 30 2022 2023 05 28 原始内容存档于2023 02 06 Rask Andersen M Almen MS Schioth HB Trends in the exploitation of novel drug targets Nature Reviews Drug Discovery August 2011 10 8 579 90 PMID 21804595 S2CID 3328752 doi 10 1038 nrd3478 Jacobson KA New paradigms in GPCR drug discovery Biochemical Pharmacology December 2015 98 4 541 555 PMC 4967540 PMID 26265138 doi 10 1016 j bcp 2015 08 085 36 0 36 1 36 2 36 3 Chen Ya Kirchmair Johannes Cheminformatics in natural product based drug discovery Molecular Informatics 2020 09 06 39 12 2000171 ISSN 1868 1743 PMC 7757247 PMID 32725781 doi 10 1002 minf 202000171 Baker M Deceptive curcumin offers cautionary tale for chemists Nature 9 January 2017 541 7636 144 145 Bibcode 2017Natur 541 144B PMID 28079090 doi 10 1038 541144a Dahlin JL Walters MA The essential roles of chemistry in high throughput screening triage Future Medicinal Chemistry July 2014 6 11 1265 90 PMC 4465542 PMID 25163000 doi 10 4155 fmc 14 60 Baell JB Holloway GA New substructure filters for removal of pan assay interference compounds PAINS from screening libraries and for their exclusion in bioassays Journal of Medicinal Chemistry April 2010 53 7 2719 40 CiteSeerX 10 1 1 394 9155 PMID 20131845 doi 10 1021 jm901137j 40 0 40 1 Hughes JP Rees S Kalindjian SB Philpott KL Principles of early drug discovery British Journal of Pharmacology March 2011 162 6 1239 1249 PMC 3058157 PMID 21091654 doi 10 1111 j 1476 5381 2010 01127 x Schneider Gisbert Prediction of Drug Like Properties Landes Bioscience 2013 20 November 2017 原始内容存档于2023 04 17 英语 Gouriet F Saby L Delaunay E Cammilleri S le Dolley Y Riberi A Casalta JP Habib G Raoult D Incidental diagnosis of colonic tumor by PET CT in infectious endocarditis The Journal of infection 2013 07 67 1 88 90 2019 12 17 PMID 23523828 doi 10 1016 j jinf 2013 03 004 原始内容存档于2019 12 17 Artursson P Palm K Luthman K Caco 2 monolayers in experimental and theoretical predictions of drug transport Advanced drug delivery reviews 2001 03 01 46 1 3 27 43 2019 12 17 PMID 11259831 doi 10 1016 s0169 409x 00 00128 9 原始内容存档于2019 12 17 Ottaviani Giorgio Martel Sophie Carrupt Pierre Alain Parallel Artificial Membrane Permeability Assay A New Membrane for the Fast Prediction of Passive Human Skin Permeability Journal of Medicinal Chemistry 2006 49 13 3948 3954 ISSN 0022 2623 PMID 16789751 doi 10 1021 jm060230 Edward HK Li D Druglike Properties Concepts Structure Design and Methods from ADME to Toxicity Optimization August 2008 doi 10 1016 C2013 0 18378 X Lipinski CA Lombardo F Dominy BW Feeney PJ Experimental and computational approaches to estimate solubility and permeability in drug discovery and development settings Advanced Drug Delivery Reviews March 2001 46 1 3 3 26 PMID 11259830 doi 10 1016 S0169 409X 00 00129 0 Lipinski CA Lead and drug like compounds the rule of five revolution Drug Discovery Today Technologies December 2004 1 4 337 341 PMID 24981612 doi 10 1016 j ddtec 2004 11 007 Hopkins AL Groom CR Alex A Ligand efficiency a useful metric for lead selection Drug Discovery Today May 2004 9 10 430 1 PMID 15109945 doi 10 1016 S1359 6446 04 03069 7 Ryckmans T Edwards MP Horne VA Correia AM Owen DR Thompson LR Tran I Tutt MF Young T Rapid assessment of a novel series of selective CB 2 agonists using parallel synthesis protocols A Lipophilic Efficiency LipE analysis Bioorganic amp Medicinal Chemistry Letters August 2009 19 15 4406 9 PMID 19500981 doi 10 1016 j bmcl 2009 05 062 Leeson PD Springthorpe B The influence of drug like concepts on decision making in medicinal chemistry Nature Reviews Drug Discovery November 2007 6 11 881 90 PMID 17971784 S2CID 205476574 doi 10 1038 nrd2445 Tetko IV Bruneau P Mewes HW Rohrer DC Poda GI Can we estimate the accuracy of ADME Tox predictions PDF Drug Discovery Today August 2006 11 15 16 700 707 2023 05 02 PMID 16846797 doi 10 1016 j drudis 2006 06 013 原始内容 pre print 存档于2013 09 12 Rester U From virtuality to reality Virtual screening in lead discovery and lead optimization a medicinal chemistry perspective Current Opinion in Drug Discovery amp Development July 2008 11 4 559 68 PMID 18600572 Rollinger JM Stuppner H Langer T Natural Compounds as Drugs Volume I Progress in Drug Research 65 2008 211 213 49 ISBN 978 3 7643 8098 4 PMC 7124045 PMID 18084917 doi 10 1007 978 3 7643 8117 2 6 Barcellos GB Pauli I Caceres RA Timmers LF Dias R de Azevedo WF Molecular modeling as a tool for drug discovery Current Drug Targets December 2008 9 12 1084 91 PMID 19128219 doi 10 2174 138945008786949388 Durrant JD McCammon JA Molecular dynamics simulations and drug discovery BMC Biology October 2011 9 71 PMC 3203851 PMID 22035460 doi 10 1186 1741 7007 9 71 Borhani DW Shaw DE The future of molecular dynamics simulations in drug discovery Journal of Computer Aided Molecular Design January 2012 26 1 15 26 Bibcode 2012JCAMD 26 15B PMC 3268975 PMID 22183577 doi 10 1007 s10822 011 9517 y Ciemny M Kurcinski M Kamel K Kolinski A Alam N Schueler Furman O Kmiecik S Protein peptide docking opportunities and challenges Drug Discovery Today May 2018 23 8 1530 1537 PMID 29733895 doi 10 1016 j drudis 2018 05 006 Erlanson DA McDowell RS O Brien T Fragment based drug discovery Journal of Medicinal Chemistry July 2004 47 14 3463 82 PMID 15214773 doi 10 1021 jm040031v Folkers G Jahnke W Erlanson DA Mannhold R Kubinyi H Fragment based Approaches in Drug Discovery Methods and Principles in Medicinal Chemistry Weinheim Wiley VCH 2006 ISBN 978 3 527 31291 7 Erlanson DA Introduction to fragment based drug discovery Topics in Current Chemistry 317 June 2011 1 32 ISBN 978 3 642 27539 5 PMID 21695633 doi 10 1007 128 2011 180 Edward Z Michael S Fragment based drug discovery a practical approach Wiley 2008 Greaney MF Bhat VT Dynamic combinatorial chemistry in drug discovery bioinorganic chemistry and materials sciences New Jersey John Wiley amp Sons 2010 43 82 Huang R Leung IK Protein directed dynamic combinatorial chemistry a guide to protein ligand and inhibitor discovery Molecules July 2016 21 7 910 PMC 6273345 PMID 27438816 doi 10 3390 molecules21070910 Mondal M Hirsch AK Dynamic combinatorial chemistry a tool to facilitate the identification of inhibitors for protein targets Chemical Society Reviews April 2015 44 8 2455 88 PMID 25706945 doi 10 1039 c4cs00493k Herrmann A Dynamic combinatorial covalent chemistry a tool to read generate and modulate the bioactivity of compounds and compound mixtures Chemical Society Reviews March 2014 43 6 1899 933 PMID 24296754 doi 10 1039 c3cs60336a Hochgurtel M Lehn JM Fragment based approaches in drug discovery Weinheim Wiley VCH 2006 341 364 ISBN 9783527312917 Caliandro R Belviso DB Aresta BM de Candia M Altomare CD Protein crystallography and fragment based drug design Future Medicinal Chemistry June 2013 5 10 1121 40 PMID 23795969 doi 10 4155 fmc 13 84 Chilingaryan Z Yin Z Oakley AJ Fragment based screening by protein crystallography successes and pitfalls International Journal of Molecular Sciences October 2012 13 10 12857 79 PMC 3497300 PMID 23202926 doi 10 3390 ijms131012857 Valade A Urban D Beau JM Two galactosyltransferases selection of different binders from the same uridine based dynamic combinatorial library Journal of Combinatorial Chemistry Jan Feb 2007 9 1 1 4 PMID 17206823 doi 10 1021 cc060033w Zheng W Thorne N McKew JC Phenotypic screens as a renewed approach for drug discovery Drug Discovery Today November 2013 18 21 22 1067 1073 PMC 4531371 PMID 23850704 doi 10 1016 j drudis 2013 07 001 Swinney DC Anthony J How were new medicines discovered Nature Reviews Drug Discovery June 2011 10 7 507 519 PMID 21701501 S2CID 19171881 doi 10 1038 nrd3480 Brown DG Wobst HJ Opportunities and Challenges in Phenotypic Screening for Neurodegenerative Disease Research Journal of Medicinal Chemistry March 2020 63 5 1823 1840 PMID 31268707 S2CID 195798523 doi 10 1021 acs jmedchem 9b00797 Moellering RE Cravatt BF How chemoproteomics can enable drug discovery and development Chemistry amp Biology January 2012 19 1 11 22 PMC 3312051 PMID 22284350 doi 10 1016 j chembiol 2012 01 001 Marshall SF Burghaus R Cosson V Cheung SY Chenel M DellaPasqua O et al Good Practices in Model Informed Drug Discovery and Development Practice Application and Documentation CPT March 2016 5 3 93 122 PMC 4809625 PMID 27069774 doi 10 1002 psp4 12049 Marshall S Madabushi R Manolis E Krudys K Staab A Dykstra K Visser SA Model Informed Drug Discovery and Development Current Industry Good Practice and Regulatory Expectations and Future Perspectives CPT February 2019 8 2 87 96 PMC 6389350 PMID 30411538 doi 10 1002 psp4 12372 Van Wijk RC Model Informed Drug Discovery and Development Strategy for the Rapid Development of Anti Tuberculosis Drug Combinations Applied Sciences 2020 10 2376 2376 doi 10 3390 app10072376 Balatti Galo E Barletta Patricio G Perez Andres D Giudicessi Silvana L Martinez Ceron Maria C Inamuddin Altalhi Tariq Cruz Jorddy N Refat Moamen Salah El Deen 编 Machine Learning Approaches to Improve Prediction of Target Drug Interactions Drug Design Using Machine Learning 1 Wiley 2022 10 10 21 96 2023 01 27 ISBN 978 1 394 16628 2 doi 10 1002 9781394167258 ch2 原始内容存档于2023 01 27 英语 Allelopathy a physiological process with ecological implications Springer 1 2006 ISBN 978 1 4020 4279 9 79 0 79 1 Feher M Schmidt JM Property distributions differences between drugs natural products and molecules from combinatorial chemistry Journal of Chemical Information and Computer Sciences 2003 43 1 218 27 PMID 12546556 doi 10 1021 ci0200467 80 0 80 1 80 2 Newman DJ Cragg GM Natural products as sources of new drugs over the last 25 years Journal of Natural Products March 2007 70 3 461 77 PMID 17309302 doi 10 1021 np068054v von Nussbaum F Brands M Hinzen B Weigand S Habich D Antibacterial natural products in medicinal chemistry exodus or revival Angewandte Chemie August 2006 45 31 5072 129 PMID 16881035 doi 10 1002 anie 200600350 The handling of natural products is cumbersome requiring nonstandardized workflows and extended timelines Revisiting natural products with modern chemistry and target finding tools from biology reversed genomics is one option for their revival Li JW Vederas JC Drug discovery and natural products end of an era or an endless frontier Science July 2009 325 5937 161 5 Bibcode 2009Sci 325 161L PMID 19589993 S2CID 207777087 doi 10 1126 science 1168243 With the current framework of HTS in major pharmaceutical industries and increasing government restrictions on drug approvals it is possible that the number of new natural product derived drugs could go to zero However this is likely to be temporary as the potential for new discoveries in the longer term is enormous Harvey AL Edrada Ebel R Quinn RJ The re emergence of natural products for drug discovery in the genomics era PDF Nature Reviews Drug Discovery 2015 14 2 111 29 2023 05 28 PMID 25614221 S2CID 12369182 doi 10 1038 nrd4510 hdl 10072 141449 原始内容存档 PDF 于2023 01 31 Here we review strategies for natural product screening that harness the recent technical advances that have reduced technical barriers to screening natural products in high throughput assays The growing appreciation of functional assays and phenotypic screens may further contribute to a revival of interest in natural products for drug discovery Newman DJ Cragg GM Natural Products as Sources of New Drugs from 1981 to 2014 Journal of Natural Products 2016 79 3 629 61 PMID 26852623 doi 10 1021 acs jnatprod 5b01055 the utilization of natural products and or their novel structures in order to discover and develop the final drug entity is still alive and well For example in the area of cancer over the time frame from around the 1940s to the end of 2014 of the 175 small molecules approved 131 or 75 are other than S synthetic with 85 or 49 actually being either natural products or directly derived therefrom Torre BG Albericio F The Pharmaceutical Industry in 2016 An Analysis of FDA Drug Approvals from a Perspective of the Molecule Type Molecules Basel Switzerland 2017 22 3 368 PMC 6155368 PMID 28264468 doi 10 3390 molecules22030368 The outputs from 2016 indicate the so called small molecules are losing ground against biologics biomolecules and other molecules inspired by natural products Sutton D The Great Naturalists London Thames amp Hudson with the Natural History Museum 2007 32 37 ISBN 978 0 500 25139 3 87 0 87 1 Ahn K The worldwide trend of using botanical drugs and strategies for developing global drugs BMB Reports March 2017 50 3 111 116 PMC 5422022 PMID 27998396 doi 10 5483 BMBRep 2017 50 3 221 Wink M Modes of Action of Herbal Medicines and Plant Secondary Metabolites Medicines September 2015 2 3 251 286 PMC 5456217 PMID 28930211 doi 10 3390 medicines2030251 Oishi S Kimura SI Noguchi S Kondo M Kondo Y Shimokawa Y Iwao Y Itai S New scale down methodology from commercial to lab scale to optimize plant derived soft gel capsule formulations on a commercial scale International Journal of Pharmaceutics January 2018 535 1 2 371 378 PMID 29154803 doi 10 1016 j ijpharm 2017 11 029 90 0 90 1 90 2 90 3 Fingrut O Flescher E Plant stress hormones suppress the proliferation and induce apoptosis in human cancer cells Leukemia April 2002 16 4 608 16 PMID 11960340 doi 10 1038 sj leu 2402419 英语 Zhang M Zhang MW Zhang L Zhang L Methyl jasmonate and its potential in cancer therapy Plant Signaling amp Behavior 24 July 2015 10 9 e1062199 PMC 4883903 PMID 26208889 doi 10 1080 15592324 2015 1062199 92 0 92 1 Turner JG Ellis C Devoto A The jasmonate signal pathway The Plant Cell 2002 14 Suppl S153 64 PMC 151253 PMID 12045275 doi 10 1105 tpc 000679 Ahmad P Rasool S Gul A Sheikh SA Akram NA Ashraf M Kazi AM Gucel S Jasmonates Multifunctional Roles in Stress Tolerance Frontiers in Plant Science 2016 7 813 PMC 4908892 PMID 27379115 doi 10 3389 fpls 2016 00813 英语 Rotem R Heyfets A Fingrut O Blickstein D Shaklai M Flescher E Jasmonates novel anticancer agents acting directly and selectively on human cancer cell mitochondria Cancer Research March 2005 65 5 1984 93 PMID 15753398 doi 10 1158 0008 5472 CAN 04 3091 95 0 95 1 Michelet JF Olive C Rieux E Fagot D Simonetti L Galey JB Dalko Csiba M Bernard BA Pereira R The anti ageing potential of a new jasmonic acid derivative LR2412 in vitro evaluation using reconstructed epidermis Episkin Experimental Dermatology May 2012 21 5 398 400 PMID 22509841 doi 10 1111 j 1600 0625 2012 01480 x Henriet E Jager S Tran C Bastien P Michelet JF Minondo AM Formanek F Dalko Csiba M Lortat Jacob H Breton L Vives RR A jasmonic acid derivative improves skin healing and induces changes in proteoglycan expression and glycosaminoglycan structure Biochimica et Biophysica Acta BBA General Subjects September 2017 1861 9 2250 2260 PMID 28602514 doi 10 1016 j bbagen 2017 06 006 97 0 97 1 97 2 Klessig DF Tian M Choi HW Multiple Targets of Salicylic Acid and Its Derivatives in Plants and Animals Frontiers in Immunology 26 May 2016 7 206 PMC 4880560 PMID 27303403 doi 10 3389 fimmu 2016 00206 Pierpoint WS Advances in Botanical Research 20 1994 163 235 ISBN 978 0 12 809447 1 doi 10 1016 S0065 2296 08 60217 7 Taylor T Campbell CT Kelly B A Review of Bivalirudin for Pediatric and Adult Mechanical Circulatory Support American Journal of Cardiovascular Drugs July 2021 21 4 395 409 PMC 7654565 PMID 33174088 doi 10 1007 s40256 020 00450 w Shyangdan DS Royle P Clar C Sharma P Waugh N Snaith A Glucagon like peptide analogues for type 2 diabetes mellitus The Cochrane Database of Systematic Reviews October 2011 2011 10 CD006423 PMC 6486297 PMID 21975753 doi 10 1002 14651858 cd006423 pub2 Faulkner DJ Newman DJ Cragg GM Investigations of the marine flora and fauna of the Islands of Palau Natural Product Reports February 2004 21 1 50 76 2023 05 28 PMID 15039835 doi 10 1039 b300664f 原始内容存档于2023 02 05 Holtzapple M T HEMICELLULOSES 2003 3060 3071 doi 10 1016 B0 12 227055 X 00589 7 Kollar P Rajchard J Balounova Z Pazourek J Marine natural products bryostatins in preclinical and clinical studies Pharmaceutical Biology February 2014 52 2 237 42 PMID 24033119 doi 10 3109 13880209 2013 804100 104 0 104 1 104 2 Fischer Janos Ganellin C Robin Analogue based Drug Discovery John Wiley amp Sons 2006 512 ISBN 9783527607495 原始内容存档于2016 12 21 英语 105 0 105 1 Taxol NSC 125973 National Cancer Institute 14 February 2016 原始内容存档于5 September 2015 Wayback machine Jordan MA Wilson L Microtubules as a target for anticancer drugs Nature Reviews Cancer April 2004 4 4 253 65 PMID 15057285 S2CID 10228718 doi 10 1038 nrc1317 Darshan MS Loftus MS Thadani Mulero M Levy BP Escuin D Zhou XK et al Taxane induced blockade to nuclear accumulation of the androgen receptor predicts clinical responses in metastatic prostate cancer Cancer Research September 2011 71 18 6019 29 PMC 3354631 PMID 21799031 doi 10 1158 0008 5472 CAN 11 1417 Nirmala M Joyce A Samundeeswari and P Deepa Sankar 2011 Natural Plant Resources in Anti Cancer Therapy A Review Research in Plant Biology 1 3 1 14 2023 06 01 原始内容存档于2018 10 19 Osheroff Neil Eukaryotic Topoisomerase II characterisation of enzyme turnover 1986 The Journal of Biological CHemistry vol 261 no 21 pp 9944 9950 Gordaliza M Garcia PA del Corral JM Castro MA Gomez Zurita MA Podophyllotoxin distribution sources applications and new cytotoxic derivatives Toxicon 2004 44 4 441 59 PMID 15302526 doi 10 1016 j toxicon 2004 05 008 daunorubicin hydrochloride The American Society of Health System Pharmacists 8 December 2016 原始内容存档于8 January 2017 Machida Kodai Masutan Mamiko Imatak Hiroaki Protein Synthesis in vitro Cell Free Systems Derived from Human Cells Cell Free Protein Synthesis InTech 2012 10 10 ISBN 978 953 51 0803 0 Katzung Bertram G Cancer Chemotherapy Basic and clinical pharmacology 10th New York McGraw Hill Medical Publishing Division 2006 ISBN 0 07 145153 6 OCLC 157011367 Mazerski J Martelli S Borowski E The geometry of intercalation complex of antitumor mitoxantrone and ametantrone with DNA molecular dynamics simulations Acta Biochim Pol 1998 45 1 1 11 PMID 9701490 The Random House Dictionary of the English Language Unabridged Edition Jess Stein ed in chief Random House New York 1966 p 489 Acharya Deepak and Shrivastava Anshu 2008 Indigenous Herbal Medicines Tribal Formulations and Traditional Herbal Practices Aavishkar Publishers Distributor Jaipur India ISBN 978 81 7910 252 7 pp 440 Acharya Deepak and Shrivastava Anshu Indigenous Herbal Medicines Tribal Formulations and Traditional Herbal Practices Aavishkar Publishers Distributor Jaipur India 2008 ISBN 978 81 7910 252 7 p 440 米勒 路易斯 Louis H Miller 和苏新专 Xin zhuan Su 青蒿素 源自中草药园的发现 细胞 CAMBRIDGE MA 02139 USA Cell Press 2011 09 16 146 6 855 858 2011 09 26 ISSN 0092 8674 PMID 21907397 doi 10 1016 j cell 2011 08 024 原始内容存档于2011 09 24 2015 诺贝尔生理学或医学奖 青蒿素与疟疾 6 October 2015 原始内容存档于2015 11 10 Sparkman O David Mass spectrometry desk reference Pittsburgh Global View Pub 2000 ISBN 0 9660813 2 3 Pitt James J Principles and Applications of Liquid Chromatography Mass Spectrometry in Clinical Biochemistry Clin Biochem Rev February 2009 30 1 19 34 PMC 2643089 PMID 19224008 Chaimbault Patrick The Modern Art of Identification of Natural Substances in Whole Plants Jacob Claus Kirsch Gilbert Slusarenko Alan Winyard Paul G Burkholz Torsten 编 Recent Advances in Redox Active Plant and Microbial Products Springer Netherlands 2014 01 01 31 94 ISBN 9789401789523 doi 10 1007 978 94 017 8953 0 3 英语 Background and Theory Page of Nuclear Magnetic Resonance Facility Mark Wainwright Analytical Centre University of Southern Wales Sydney 9 December 2011 9 February 2014 原始内容存档于27 January 2014 Shah N Sattar A Benanti M Hollander S Cheuck L Magnetic resonance spectroscopy as an imaging tool for cancer a review of the literature The Journal of the American Osteopathic Association January 2006 106 1 23 27 PMID 16428685 原始内容存档于2013 04 07 The Drug Development Process U S Food and Drug Administration 4 January 2018 1 May 2018 原始内容存档于2019 04 23 The Drug Development Process Step 4 FDA Drug Review U S Food and Drug Administration 4 January 2018 1 May 2018 原始内容存档于2019 04 22 The drug development process Step 4 FDA drug review US Food and Drug Administration 4 January 2018 18 December 2019 原始内容存档于2023 03 31 延伸阅读 编辑Gad SC Drug Discovery Handbook Hoboken N J Wiley Interscience J Wiley 2005 ISBN 978 0 471 21384 0 Madsen U Krogsgaard Larsen P Liljefors T Textbook of Drug Design and Discovery Washington DC Taylor amp Francis 2002 ISBN 978 0 415 28288 8 Rasmussen N Gene Jockeys Life Science and the rise of Biotech Enterprise Baltimore Johns Hopkins University Press 2014 ISBN 978 1 42141 340 2 外部链接 编辑开放目录项目中的 Drug Discovery 取自 https zh wikipedia org w index php title 药物发现 amp oldid 77752476, 维基百科，wiki，书籍，书籍，图书馆，

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