fbpx
维基百科

天冬氨酸蛋白酶

天冬氨酸蛋白酶 (英语:Aspartic protease)是一种催化类型的蛋白酶,它使用一个或多个天冬氨酸残基结合的活化水分子来催化其肽底物。通常,它们在活性位点具有两个高度保守的天冬氨酸,在酸性pH条件下具有最佳活性。几乎所有已知的天冬氨酰蛋白酶都被胃酶抑素抑制。

真核天冬氨酰蛋白酶
二聚体天冬氨酸蛋白酶HIV蛋白酶的结构为白色和灰色,肽底物为黑色,活性位点天冬氨酸侧链为红色。(蛋白質資料庫:1KJF)
鑑定
標誌Asp
PfamPF00026(旧版)
InterPro英语InterProIPR001461
PROSITE英语PROSITEPDOC00128
SCOP英语Structural Classification of Proteins1mpp / SUPFAM
OPM英语Orientations of Proteins in Membranes database家族100
OPM英语Orientations of Proteins in Membranes database蛋白1lyb
膜蛋白數據庫英语Membranome315
現有可用的蛋白結構:
Pfam結構(旧版) / ECOD
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum英语PDBsum結構概要

天冬氨酸内肽酶EC 3.4.23已经表征了脊椎动物真菌逆转录酶病毒的起源。[1]

真核天冬氨酸蛋白酶包括胃蛋白酶组织蛋白酶肾素。它们具有由祖先复制而产生的两域结构。逆转录病毒和反转录转座子蛋白酶(逆转录病毒天冬氨酰蛋白酶)比较小,并且似乎与真核天冬氨酰蛋白酶的单个结构域同源。每个结构域都提供一个催化天冬氨酸残基,在分子的两个叶之间有一个扩展的活性位点裂隙。很久以前,一个叶可能是通过基因复制从另一个进化而来的。在现代酶中,虽然三维结构非常相似,但除了保守的催化位点基序外,氨基酸序列的差异很大。二硫键的存在和位置是天冬氨酸肽酶的其他保守特征。

催化机制

 
提出的天冬氨酰蛋白酶切割肽的机制。

天冬氨酰蛋白酶是一个高度特异性的蛋白酶家族,它们倾向于切割具有疏水残基和β-亚甲基二肽键。与丝氨酸蛋白酶半胱氨酸蛋白酶不同,这些蛋白酶在切割过程中不形成共价中间体。因此,蛋白水解是一步发生的。

尽管已经提出了许多不同的天冬氨酰蛋白酶机制,但最广泛接受的是酸碱机制,其原理是涉及水分子在两个高度保守的天冬氨酸残基之间的配位。天冬氨酸通过提取质子来活化水,使水能够对底物易裂键的羰基碳进行亲核攻击,从而产生通过与第二天冬氨酸氢键稳定的四面体氧阴离子中间体。该中间体的重排导致易裂酰胺质子化,这导致底物肽分裂成两个产物肽。

抑制

胃酶抑素是天冬氨酸蛋白酶的抑制剂。

分类

已知有五个天冬氨酸蛋白酶超家族(氏族),每个都代表相同活性位点和机制的独立进化。每个超家族包含几个具有相似序列的家族MEROPS分类系统按字母顺序命名这些氏族。

  • 氏族AA(例如:胃蛋白酶家族)
  • 氏族AC(例如:信号肽酶II家族)
  • 氏族AD(例如:早老素家族)
  • 氏族AE(例如:GPR内肽酶家族)
  • 氏族AF(例如:Omptin家族)

前肽

A1_前肽
 
分辨率为 1.62 埃的人前胃素的晶体和分子结构
鑑定
標誌A1_Propeptide
PfamPF07966(旧版)
InterPro英语InterProIPR012848
現有可用的蛋白結構:
Pfam結構(旧版) / ECOD
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum英语PDBsum結構概要

许多真核天冬氨酸内肽酶(MEROPS肽酶家族A1)是用信号肽和前肽合成的。动物胃蛋白酶样内肽酶前肽形成了一个独特的前肽家族,其中包含约30个残基长的保守基序。在胃蛋白酶原A中,成熟胃蛋白酶序列的前11个残基被前肽的残基取代。前肽含有两个螺旋,可阻断活性位点裂隙,特别是胃蛋白酶中保守的天冬氨酸11残基,在胃蛋白酶中,氢键与前肽中的保守Arg残基结合。这种氢键稳定了前肽构象,并且可能负责在酸性条件下触发胃蛋白酶原转化为胃蛋白酶。

例子

人类

含有该结构域的人类蛋白质

BACE1;BACE2;组织蛋白酶D组织蛋白酶E;NAPSA;PGA5;PGC;肾素

其他生物

参考

  1. ^ Szecsi, P. B. The aspartic proteases. Scandinavian Journal of Clinical and Laboratory Investigation. 1992-01-01, 52 (sup210). ISSN 0036-5513. doi:10.1080/00365519209104650. 

天冬氨酸蛋白酶, 此條目翻譯品質不佳, 2022年9月16日, 翻譯者可能不熟悉中文或原文語言, 也可能使用了機器翻譯, 請協助翻譯本條目或重新編寫, 并注意避免翻译腔的问题, 明顯拙劣的翻譯請改掛, href, template, html, class, redirect, title, template, href, wikipedia, html, class, redirect, title, wikipedia, 提交刪除, 英语, aspartic, protease, 是一种催化类型的蛋白酶, 它使. 此條目翻譯品質不佳 2022年9月16日 翻譯者可能不熟悉中文或原文語言 也可能使用了機器翻譯 請協助翻譯本條目或重新編寫 并注意避免翻译腔的问题 明顯拙劣的翻譯請改掛 a href Template D html class mw redirect title Template D d a a href Wikipedia CSD html G13 class mw redirect title Wikipedia CSD G13 a 提交刪除 天冬氨酸蛋白酶 英语 Aspartic protease 是一种催化类型的蛋白酶 它使用一个或多个天冬氨酸残基结合的活化水分子来催化其肽底物 通常 它们在活性位点具有两个高度保守的天冬氨酸 在酸性pH条件下具有最佳活性 几乎所有已知的天冬氨酰蛋白酶都被胃酶抑素抑制 真核天冬氨酰蛋白酶二聚体天冬氨酸蛋白酶HIV蛋白酶的结构为白色和灰色 肽底物为黑色 活性位点天冬氨酸侧链为红色 蛋白質資料庫 1KJF 鑑定標誌AspPfamPF00026 旧版 InterPro 英语 InterPro IPR001461PROSITE 英语 PROSITE PDOC00128SCOP 英语 Structural Classification of Proteins 1mpp SUPFAMOPM 英语 Orientations of Proteins in Membranes database 家族100OPM 英语 Orientations of Proteins in Membranes database 蛋白1lyb膜蛋白數據庫 英语 Membranome 315現有可用的蛋白結構 Pfam結構 旧版 ECODPDBRCSB PDB PDBe PDBjPDBsum 英语 PDBsum 結構概要天冬氨酸内肽酶EC 3 4 23已经表征了脊椎动物 真菌和逆转录酶病毒的起源 1 真核天冬氨酸蛋白酶包括胃蛋白酶 组织蛋白酶和肾素 它们具有由祖先复制而产生的两域结构 逆转录病毒和反转录转座子蛋白酶 逆转录病毒天冬氨酰蛋白酶 比较小 并且似乎与真核天冬氨酰蛋白酶的单个结构域同源 每个结构域都提供一个催化天冬氨酸残基 在分子的两个叶之间有一个扩展的活性位点裂隙 很久以前 一个叶可能是通过基因复制从另一个进化而来的 在现代酶中 虽然三维结构非常相似 但除了保守的催化位点基序外 氨基酸序列的差异很大 二硫键的存在和位置是天冬氨酸肽酶的其他保守特征 目录 1 催化机制 2 抑制 3 分类 4 前肽 5 例子 5 1 人类 5 2 含有该结构域的人类蛋白质 5 3 其他生物 6 参考催化机制 编辑 提出的天冬氨酰蛋白酶切割肽的机制 天冬氨酰蛋白酶是一个高度特异性的蛋白酶家族 它们倾向于切割具有疏水残基和b 亚甲基的二肽键 与丝氨酸蛋白酶或半胱氨酸蛋白酶不同 这些蛋白酶在切割过程中不形成共价中间体 因此 蛋白水解是一步发生的 尽管已经提出了许多不同的天冬氨酰蛋白酶机制 但最广泛接受的是酸碱机制 其原理是涉及水分子在两个高度保守的天冬氨酸残基之间的配位 天冬氨酸通过提取质子来活化水 使水能够对底物易裂键的羰基碳进行亲核攻击 从而产生通过与第二天冬氨酸氢键稳定的四面体氧阴离子中间体 该中间体的重排导致易裂酰胺的质子化 这导致底物肽分裂成两个产物肽 抑制 编辑胃酶抑素是天冬氨酸蛋白酶的抑制剂 分类 编辑已知有五个天冬氨酸蛋白酶超家族 氏族 每个都代表相同活性位点和机制的独立进化 每个超家族包含几个具有相似序列的家族 MEROPS分类系统按字母顺序命名这些氏族 氏族AA 例如 胃蛋白酶家族 氏族AC 例如 信号肽酶II家族 氏族AD 例如 早老素家族 氏族AE 例如 GPR内肽酶家族 氏族AF 例如 Omptin家族 前肽 编辑A1 前肽 分辨率为 1 62 埃的人前胃素的晶体和分子结构鑑定標誌A1 PropeptidePfamPF07966 旧版 InterPro 英语 InterPro IPR012848現有可用的蛋白結構 Pfam結構 旧版 ECODPDBRCSB PDB PDBe PDBjPDBsum 英语 PDBsum 結構概要许多真核天冬氨酸内肽酶 MEROPS肽酶家族A1 是用信号肽和前肽合成的 动物胃蛋白酶样内肽酶前肽形成了一个独特的前肽家族 其中包含约30个残基长的保守基序 在胃蛋白酶原A中 成熟胃蛋白酶序列的前11个残基被前肽的残基取代 前肽含有两个螺旋 可阻断活性位点裂隙 特别是胃蛋白酶中保守的天冬氨酸11残基 在胃蛋白酶中 氢键与前肽中的保守Arg残基结合 这种氢键稳定了前肽构象 并且可能负责在酸性条件下触发胃蛋白酶原转化为胃蛋白酶 例子 编辑人类 编辑 BACE1 BACE2 组织蛋白酶D 组织蛋白酶E 凝乳酶 Napsin A 猪笼草蛋白酶 胃蛋白酶 早老素 肾素含有该结构域的人类蛋白质 编辑 BACE1 BACE2 组织蛋白酶D 组织蛋白酶E NAPSA PGA5 PGC 肾素 其他生物 编辑 HIV 1蛋白酶 治疗艾滋病毒的主要药物靶点 Plasmepsin 在引起疟疾的寄生虫疟原虫中发现的一组天冬氨酰蛋白酶参考 编辑 Szecsi P B The aspartic proteases Scandinavian Journal of Clinical and Laboratory Investigation 1992 01 01 52 sup210 ISSN 0036 5513 doi 10 1080 00365519209104650 取自 https zh wikipedia org w index php title 天冬氨酸蛋白酶 amp oldid 73697473, 维基百科,wiki,书籍,书籍,图书馆,

文章

,阅读,下载,免费,免费下载,mp3,视频,mp4,3gp, jpg,jpeg,gif,png,图片,音乐,歌曲,电影,书籍,游戏,游戏。