fbpx
维基百科

反转录转座子

反转录转座子(Retrotransposon)是由RNA介导转座的转座子的元件,在结构和复制上与反转录病毒(retrovirus)类似,只是没有病毒感染必需的env基因。它通过转录合成mRNA,再逆转录合成新的元件整合到基因组中完成转座,每转座1次拷贝数就会增加1份,可以增強自己的基因組。因此,它是許多真核生物中数量最大的一类可活动遗传成分。在植物中特别丰富,它们是核DNA的一个主要组成部分。在玉米的基因组49-78%是反转录转座子[1],而在小麦中包含约90%的基因组重复序列和68%的转座子[2]。在哺乳动物中,几乎有一半的基因组(45%至48%)包含转座子或残余转座子。人类基因组有大约42%反转录转座子,而DNA转座子约占2-3%[3]

反转录转座子(左下)生命周期的简化表示

反轉錄轉座子與反座子 (retroposon) 較為相似,然而兩者的主要區別為反轉錄轉座子具有反轉錄酶,而反座子沒有。

反转录转座子的两大类

反转录转座子可以分成两大类:

  • 一类是LTR反转录转座子,包括Tyl-copia类和Ty3-gypsy类转座子,是具有长末端重复序列(long terminal repeats,LTR)的转座子,这也是反转录病毒基因组的特征性结构,这类反转录转座子可以编码反转录酶(Reverse transcriptases)或整合酶(integrases),自主地进行转录,其转座机制同反转录病毒相似,但不能像反转录病毒那样以自由感染的方式进行传播,高等植物中的反转录转座子主要属于Tyl-copia类,分布十分广泛,几乎覆盖了所有高等植物种类。
  • 另一类是非LTR反转录转座子,包括LINE(long interspersed nuclear elements,长散布核元件)类、SINE(Short interspersed nuclear elements,短散布核元件)类、复合SINE转座子类,没有长末端重复序列(non-long terminal repeats,non-LTR),自身也没有转座酶或整合酶的编码能力,需要在细胞内已有的酶系统作用下进行转座。

所有反转录转座子都有一个共同特点,就是在其插入位点上产生短的正向重复序列。

参见

參考

  1. ^ SanMiguel P, Bennetzen JL. Evidence that a recent increase in maize genome size was caused by the massive amplification of intergene retrotranposons (PDF). Annals of Botany. 1998, 82 (Suppl A): 37–44 [2009-07-06]. (原始内容 (PDF)于2009-09-29). 
  2. ^ Li W, Zhang P, Fellers JP, Friebe B, Gill BS. Sequence composition, organization, and evolution of the core Triticeae genome. Plant J. November 2004, 40 (4): 500–11. PMID 15500466. doi:10.1111/j.1365-313X.2004.02228.x. 
  3. ^ Lander ES, Linton LM, Birren B; et al. Initial sequencing and analysis of the human genome. Nature. February 2001, 409 (6822): 860–921 [2009-07-06]. PMID 11237011. doi:10.1038/35057062. (原始内容于2009-08-03). 

反转录转座子, retrotransposon, 是由rna介导转座的转座子的元件, 在结构和复制上与反转录病毒, retrovirus, 类似, 只是没有病毒感染必需的env基因, 它通过转录合成mrna, 再逆转录合成新的元件整合到基因组中完成转座, 每转座1次拷贝数就会增加1份, 可以增強自己的基因組, 因此, 它是許多真核生物中数量最大的一类可活动遗传成分, 在植物中特别丰富, 它们是核dna的一个主要组成部分, 在玉米的基因组49, 而在小麦中包含约90, 的基因组重复序列和68, 的转座子, 在哺乳动物. 反转录转座子 Retrotransposon 是由RNA介导转座的转座子的元件 在结构和复制上与反转录病毒 retrovirus 类似 只是没有病毒感染必需的env基因 它通过转录合成mRNA 再逆转录合成新的元件整合到基因组中完成转座 每转座1次拷贝数就会增加1份 可以增強自己的基因組 因此 它是許多真核生物中数量最大的一类可活动遗传成分 在植物中特别丰富 它们是核DNA的一个主要组成部分 在玉米的基因组49 78 是反转录转座子 1 而在小麦中包含约90 的基因组重复序列和68 的转座子 2 在哺乳动物中 几乎有一半的基因组 45 至48 包含转座子或残余转座子 人类基因组有大约42 反转录转座子 而DNA转座子约占2 3 3 反转录转座子 左下 生命周期的简化表示 反轉錄轉座子與反座子 retroposon 較為相似 然而兩者的主要區別為反轉錄轉座子具有反轉錄酶 而反座子沒有 反转录转座子的两大类 编辑反转录转座子可以分成两大类 一类是LTR反转录转座子 包括Tyl copia类和Ty3 gypsy类转座子 是具有长末端重复序列 long terminal repeats LTR 的转座子 这也是反转录病毒基因组的特征性结构 这类反转录转座子可以编码反转录酶 Reverse transcriptases 或整合酶 integrases 自主地进行转录 其转座机制同反转录病毒相似 但不能像反转录病毒那样以自由感染的方式进行传播 高等植物中的反转录转座子主要属于Tyl copia类 分布十分广泛 几乎覆盖了所有高等植物种类 另一类是非LTR反转录转座子 包括LINE long interspersed nuclear elements 长散布核元件 类 SINE Short interspersed nuclear elements 短散布核元件 类 复合SINE转座子类 没有长末端重复序列 non long terminal repeats non LTR 自身也没有转座酶或整合酶的编码能力 需要在细胞内已有的酶系统作用下进行转座 所有反转录转座子都有一个共同特点 就是在其插入位点上产生短的正向重复序列 参见 编辑转座子 转录 分子生物学的中心法则參考 编辑 SanMiguel P Bennetzen JL Evidence that a recent increase in maize genome size was caused by the massive amplification of intergene retrotranposons PDF Annals of Botany 1998 82 Suppl A 37 44 2009 07 06 原始内容存档 PDF 于2009 09 29 Li W Zhang P Fellers JP Friebe B Gill BS Sequence composition organization and evolution of the core Triticeae genome Plant J November 2004 40 4 500 11 PMID 15500466 doi 10 1111 j 1365 313X 2004 02228 x Lander ES Linton LM Birren B et al Initial sequencing and analysis of the human genome Nature February 2001 409 6822 860 921 2009 07 06 PMID 11237011 doi 10 1038 35057062 原始内容存档于2009 08 03 引文格式1维护 显式使用等标签 link 取自 https zh wikipedia org w index php title 反转录转座子 amp oldid 74185509, 维基百科,wiki,书籍,书籍,图书馆,

文章

,阅读,下载,免费,免费下载,mp3,视频,mp4,3gp, jpg,jpeg,gif,png,图片,音乐,歌曲,电影,书籍,游戏,游戏。