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逆转录病毒天冬氨酰蛋白酶

逆转录病毒天冬氨酰蛋白酶(英语:Retroviral aspartyl protease或retropepsins)是来自逆转录病毒反转录转座子杆状DNA病毒(植物双链DNA病毒)的单域天冬氨酸蛋白酶。这些蛋白酶通常是较大的DNA聚合酶群特异性抗原的一部分。逆转录病毒蛋白酶与双结构域真核天冬氨酸蛋白酶的单个结构域同源,例如胃蛋白酶组织蛋白酶肾素Pfam PF00026;MEROPS A1)。胃蛋白酶是MEROPS A2,AA家族的成员。(所有已知的成员都是内肽酶

逆转录病毒天冬氨酰蛋白酶
HIV-1蛋白酶二聚体为白色和灰色,肽底物为黑色,活性位点天冬氨酸侧链为红色。 (PDB 1KJF)
鑑定
標誌RVP
PfamPF00077(旧版)
InterPro英语InterProIPR001995
PROSITE英语PROSITEPDOC00128
MEROPSA2
SCOP英语Structural Classification of Proteins1ida / SUPFAM
OPM英语Orientations of Proteins in Membranes database家族100
OPM英语Orientations of Proteins in Membranes database蛋白2q63
膜蛋白數據庫英语Membranome532
現有可用的蛋白結構:
Pfam結構(旧版) / ECOD
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum英语PDBsum結構概要

逆转录病毒天冬氨酰蛋白酶仅作为蛋白二聚体具有活性,因为每个同源二聚体都对应于真核双叶酶的一半。这两部分各贡献一个催化性天冬氨酰残基[1]

逆转录病毒天冬氨酰蛋白酶作为DNA聚合酶多聚蛋白的一部分合成,该多聚蛋白包含天冬氨酰蛋白酶、逆转录酶核糖核酸酶H整合酶。DNA聚合酶多聚蛋白经过特定的酶促切割以产生成熟的蛋白质。

并非所有由DNA聚合酶产生的逆转录病毒天冬氨酰蛋白酶都是严格意义上的逆胃蛋白酶。来自泡沫逆转录病毒亚科的海绵蛋白酶的差异足以产生自己的家族,MEROPS A9。在AA家族中可以找到许多其他示例。

含有该结构域的人类蛋白质

  • DDI1
  • DDI2
  • ERVK6

参考文献

  1. ^ Pettit, Steven C.; Everitt, Lorraine E.; Choudhury, Sumana; Dunn, Ben M.; Kaplan, Andrew H. Initial Cleavage of the Human Immunodeficiency Virus Type 1 GagPol Precursor by Its Activated Protease Occurs by an Intramolecular Mechanism. Journal of Virology. 2004-8, 78 (16) [2022-09-11]. ISSN 0022-538X. PMID 15280456. doi:10.1128/JVI.78.16.8477-8485.2004. (原始内容于2022-09-11). 

参见

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逆转录病毒天冬氨酰蛋白酶, 此條目翻譯品質不佳, 2022年9月11日, 翻譯者可能不熟悉中文或原文語言, 也可能使用了機器翻譯, 請協助翻譯本條目或重新編寫, 并注意避免翻译腔的问题, 明顯拙劣的翻譯請改掛, href, template, html, class, redirect, title, template, href, wikipedia, html, class, redirect, title, wikipedia, 提交刪除, 英语, retroviral, aspartyl, protease. 此條目翻譯品質不佳 2022年9月11日 翻譯者可能不熟悉中文或原文語言 也可能使用了機器翻譯 請協助翻譯本條目或重新編寫 并注意避免翻译腔的问题 明顯拙劣的翻譯請改掛 a href Template D html class mw redirect title Template D d a a href Wikipedia CSD html G13 class mw redirect title Wikipedia CSD G13 a 提交刪除 逆转录病毒天冬氨酰蛋白酶 英语 Retroviral aspartyl protease或retropepsins 是来自逆转录病毒 反转录转座子和杆状DNA病毒 植物双链DNA病毒 的单域天冬氨酸蛋白酶 这些蛋白酶通常是较大的DNA聚合酶或群特异性抗原的一部分 逆转录病毒蛋白酶与双结构域真核天冬氨酸蛋白酶的单个结构域同源 例如胃蛋白酶 组织蛋白酶和肾素 Pfam PF00026 MEROPS A1 胃蛋白酶是MEROPS A2 AA家族的成员 所有已知的成员都是内肽酶 逆转录病毒天冬氨酰蛋白酶HIV 1蛋白酶二聚体为白色和灰色 肽底物为黑色 活性位点天冬氨酸侧链为红色 PDB 1KJF 鑑定標誌RVPPfamPF00077 旧版 InterPro 英语 InterPro IPR001995PROSITE 英语 PROSITE PDOC00128MEROPSA2SCOP 英语 Structural Classification of Proteins 1ida SUPFAMOPM 英语 Orientations of Proteins in Membranes database 家族100OPM 英语 Orientations of Proteins in Membranes database 蛋白2q63膜蛋白數據庫 英语 Membranome 532現有可用的蛋白結構 Pfam結構 旧版 ECODPDBRCSB PDB PDBe PDBjPDBsum 英语 PDBsum 結構概要逆转录病毒天冬氨酰蛋白酶仅作为蛋白二聚体具有活性 因为每个同源二聚体都对应于真核双叶酶的一半 这两部分各贡献一个催化性天冬氨酰残基 1 逆转录病毒天冬氨酰蛋白酶作为DNA聚合酶多聚蛋白的一部分合成 该多聚蛋白包含天冬氨酰蛋白酶 逆转录酶 核糖核酸酶H和整合酶 DNA聚合酶多聚蛋白经过特定的酶促切割以产生成熟的蛋白质 并非所有由DNA聚合酶产生的逆转录病毒天冬氨酰蛋白酶都是严格意义上的逆胃蛋白酶 来自泡沫逆转录病毒亚科的海绵蛋白酶的差异足以产生自己的家族 MEROPS A9 在AA家族中可以找到许多其他示例 含有该结构域的人类蛋白质 编辑DDI1 DDI2 ERVK6参考文献 编辑 Pettit Steven C Everitt Lorraine E Choudhury Sumana Dunn Ben M Kaplan Andrew H Initial Cleavage of the Human Immunodeficiency Virus Type 1 GagPol Precursor by Its Activated Protease Occurs by an Intramolecular Mechanism Journal of Virology 2004 8 78 16 2022 09 11 ISSN 0022 538X PMID 15280456 doi 10 1128 JVI 78 16 8477 8485 2004 原始内容存档于2022 09 11 请检查 date 中的日期值 帮助 参见 编辑HIV 1蛋白酶 生物学主题 此条目包含有源于Pfam以及InterPro的属于公有领域的文本 IPR001995 取自 https zh wikipedia org w index php title 逆转录病毒天冬氨酰蛋白酶 amp oldid 75370196, 维基百科,wiki,书籍,书籍,图书馆,

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