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缺氧誘導因子

一月 09, 2023

缺氧誘導因子（Hypoxia-inducible factors，HIFs）是一種在細胞環境中的轉錄因子，因氧含量而產生不同反應的，主要是在氧氣減少或缺氧[1] 的情況下活化。

缺氧誘導因子-1,α亞基 (hypoxia-inducible factor 1, alpha subunit)
識別
符號 HIF1A
Entrez 3091
HUGO 4910
OMIM 603348
RefSeq NM_001530
UniProt Q16665
其他資料
基因座 14 q21-q24
芳香烴受體核轉 (aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator)
識別
符號 ARNT
替換符號 HIF1B, bHLHe2
Entrez 405
HUGO 700
OMIM 126110
RefSeq NM_001668
UniProt P27540
其他資料
基因座 1 q21
内皮PAS域蛋白-1 (endothelial PAS domain protein 1)
識別
符號 EPAS1
替換符號 HIF2A, MOP2, PASD2, HLF
Entrez 2034
HUGO 3374
OMIM 603349
RefSeq NM_001430
UniProt Q99814
其他資料
基因座 2 p21-p16
芳香烴受體核轉-2 (aryl-hydrocarbon receptor nuclear translocator 2)
識別
符號 ARNT2
替換符號 HIF2B, KIAA0307, bHLHe1
Entrez 9915
HUGO 16876
OMIM 606036
RefSeq NM_014862
UniProt Q9HBZ2
其他資料
基因座 1 q24
缺氧誘導因子-3,α亞基(hypoxia-inducible factor 3, alpha subunit)
識別
符號 HIF3A
Entrez 64344
HUGO 15825
OMIM 609976
RefSeq NM_152794
UniProt Q9Y2N7
其他資料
基因座 19 q13

結構

缺氧大部分需要氧氣呼吸的物種，都擁有保守序列HIF-1。其轉錄都有嚴格的調控機制。HIF-1是由一個α亞基和一個β亞基組成的異源蛋白二聚體，而β亞基是一種芳香烃受体核转位子（英语：Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator）（ARNT） [2][3]。 HIF-1屬於鹼性螺旋-環-螺旋（bHLH）家族中的PER-ARNT-SIM（PAS）亞科。 α亞基和β亞基的結構類似，且都包含下列結構域[4][5][6]：

  • N-末端 - 一個bHLH結構域，能和DNA結合。
  • 中間區域 - Per-ARNT-Sim (PAS)結構域，有利於形成異源蛋白二聚體。
  • C-末端 - 一個能與转录辅调节因子（英语：Transcription coregulator）結合的蛋白質，促使轉錄共調節。
缺氧誘導因子-1
 
HIF-1a-pVHL-ElonginB-ElonginC 複合體 的結構之一。[7]
鑑定
標誌HIF-1
PfamPF11413
現有可用的蛋白結構：
Pfam結構 / ECOD
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum（英语：PDBsum）結構概要
HIF-1α的C末端激活域
 
缺氧誘導因子-1,α亞基 的結構之一 .[8]
鑑定
標誌HIF-1a_CTAD
PfamPF08778
InterPro（英语：InterPro）IPR014887
SCOP（英语：Structural Classification of Proteins）1l3e / SUPFAM
現有可用的蛋白結構：
Pfam結構 / ECOD
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum（英语：PDBsum）結構概要
PDB1h2k, 1h2l, 1l3e, 1l8c

成員

下列為人類的 HIF 家族:

成員 基因 蛋白
HIF-1α 缺氧誘導因子-1,α亞基
HIF-1β 芳香烴受體核轉
HIF-2α 内皮PAS域蛋白-1
HIF-2β 芳基烴受體核轉-2
HIF-3α 缺氧誘導因子-3,α亞基
HIF-3β 芳基烴受體核轉-3

作用

在細胞中，HIF信號級聯反應會受到缺氧狀態的影響。在缺氧狀態下，通常會讓細胞持續的細胞分化。然而，缺氧狀態促進了血管新生，對於胚胎中的血管系統與癌症腫瘤來說非常重要。 傷口處的缺氧狀態，也促進了角質細胞的移動與上皮組織的修護[9]。

在普遍情況下，HIF是發育的重要關鍵。在哺乳動物中，若缺少了HIF-1的基因，將導致胎兒死亡。HIF-1已經被證實，對於軟骨細胞的存亡有重大的影響，他能使軟骨細胞適應在骨骼間生長板的缺氧環境。缺氧誘導因子在人類的代謝調節[10]中，屬於一個核心角色。

機制

HIF中α亞基上的脯氨酸殘會透過HIF脯氨酰羥化酶羥基化，而使其能被 VHL E3泛素連接酶辨識並泛素化，之後透過蛋白酶體[11]使其被快速降解。這只會發生在含氧量正常的條件。但在缺氧條件下，HIF脯氨酰羥化酶會被抑制，因為它利用氧作為輔助基質[12]。

在琥珀酸去氫酶複合物中，電子轉移的抑制是因為SDHB或SDHD基因的突變，其會導致琥珀的積聚，進而抑制HIF脯氨酰羥化酶的活性，穩定HIF-1,α，這被稱為偽組織缺氧。

HIF-1，當持續在缺氧條件下，正向調節多種基因以能再低含氧量的情況下生存。 HIF-1能調節的酵素包括糖解作用酶，使其能以不耗氧的方式合成三磷酸腺苷；還有血管內皮生長因子（VEGF），能促進血管新生。HIF-1的觸發，是藉由HIF-反應元件（HREs）結合到了啟動子上的NCGTG序列。


已有實驗證明，肌A激酶錨定蛋白（mAKAP）組成的E3泛素連接酶能作用於HIF-1，影響其穩定性與定位，使其移動至細胞核中。 當 mAKAP 耗盡或因其他因素干擾 mAKAP 定位在細胞核(心肌細胞)周圍區域時，會影響了HIF的穩定性，與其他和缺氧相關基因的轉錄活性。因此，將對氧氣敏感的信號物件“區域化”，可能影響缺氧時反應的進行。[13]

在過去，與缺氧環境下HIF的調控機制資訊相較而言，含氧量正常時透過NF-κB介入的HIF調控機制和功能訊，尚處於不明確的狀況。同樣的，HIF-1α亞基的穩定性，在非缺氧環境下，其運作機制也是未知的。但近期指出，NF-κB（NF-κB）是HIF-1α在正常含氧量下的直接調節因子。以小干擾RNA作用在NF-κB上發現到，其會影響HIF-1α mRNA 的表現程度，因此證實了NF-κB能HIF-1α的表現。最後，當進行腫瘤壞死因子-α(TNAα)治療時，NF-κB被大量誘導表現，HIF-1α表現程度也受到影響[14]。HIF-1和HIF-2具有不同的生理作用。HIF-2用於調節成人體內的紅血球生成素。[15]

治療相關

貧血

最近，多種作用為選擇性的HIF脯氨酰羥化酶的抑制劑已經被開發了。[16] 其中最引人注目的包括FibroGen公司的化合物FG-2216和FG-4592[17][18]，是兩個以口服方式治療[貧血]的藥物。[19]藉由抑制HIF脯氨酰羥化酶，使HIF-2α在腎的穩定性增加，這導致紅血球生成素的生產的[20]。這兩種藥物對II期臨床試驗已經成功了，但這些都在2007年5月暫停了，因為有試驗參發生暴發性肝炎死亡。不過，目前還不清楚肝炎死亡是否是由FG-2216所引起的。在2008年年初，因美國FDA的審查和批准，解除臨床試驗的暫停。 [21]

炎症和癌症

在其它情況中，並接續上面的治療主題。最近的研究表明，在常氧狀態下誘導HIF表現，可能造成含有慢性炎性成分的疾病。且已經表明，慢性炎症是自我延續的，並且是因為微環境的異常，而導致轉錄因子被異常活化的結果。發生在細胞中，生長因子、趨化因子、細胞因子和活性氧平衡的改變，反過提供生長的需要，造成癌症發生與轉移。 最近發表的研究結果包含了許多病症，其中有NF-κB和HIF-1的失調，也有類風濕關節炎和癌症。因此，了解NF-κB和HIF兩著之間的關係，將大大提高藥物開發的發展。[14]

HIF的活性涉及到了血管新生，也造成腫瘤的生長，所以HIF的抑制劑，如異硫氰酸苯乙酯（Phenethyl isothiocyanate）和吖啶黃正在接受抗癌作用的測試。[22][23][24][25]

神經內科

研究指出，在老鼠身上使用HIF脯氨酰羥化酶抑制劑，增強海馬體記憶，也增加了紅血球生成素的表現。[26]

另請參閱

  • HIF-1α

參考文獻

  1. ^ Smith TG, Robbins PA, Ratcliffe PJ. The human side of hypoxia-inducible factor. Br. J. Haematol. May 2008, 141 (3): 325–34. PMC 2408651  . PMID 18410568. doi:10.1111/j.1365-2141.2008.07029.x. 
  2. ^ Wang GL, Jiang BH, Rue EA, Semenza GL. Hypoxia-inducible factor 1 is a basic helix-loop-helix-PAS heterodimer regulated by cellular O2 tension. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. June 1995, 92 (12): 5510–4. PMC 41725  . PMID 7539918. doi:10.1073/pnas.92.12.5510. 
  3. ^ Jiang BH, Rue E, Wang GL, Roe R, Semenza GL. Dimerization, DNA binding, and transactivation properties of hypoxia-inducible factor 1. J. Biol. Chem. July 1996, 271 (30): 17771–8. PMID 8663540. doi:10.1074/jbc.271.30.17771. 
  4. ^ Zhulin IB, Taylor BL, Dixon R. PAS domain S-boxes in Archaea, Bacteria and sensors for oxygen and redox. Trends Biochem. Sci. September 1997, 22 (9): 331–3. PMID 9301332. doi:10.1016/S0968-0004(97)01110-9. 
  5. ^ Ponting CP, Aravind L. PAS: a multifunctional domain family comes to light. Curr. Biol. November 1997, 7 (11): R674–7. PMID 9382818. doi:10.1016/S0960-9822(06)00352-6. 
  6. ^ Yang J, Zhang L, Erbel PJ, Gardner KH, Ding K, Garcia JA, Bruick RK. Functions of the Per/ARNT/Sim domains of the hypoxia-inducible factor. J. Biol. Chem. October 2005, 280 (43): 36047–54. PMID 16129688. doi:10.1074/jbc.M501755200. 
  7. ^ Min JH, Yang H, Ivan M, Gertler F, Kaelin WG, Pavletich NP. Structure of an HIF-1alpha -pVHL complex: hydroxyproline recognition in signaling. Science. June 2002, 296 (5574): 1886–9. PMID 12004076. doi:10.1126/science.1073440. 
  8. ^ Freedman SJ, Sun ZY, Poy F; et al. Structural basis for recruitment of CBP/p300 by hypoxia-inducible factor-1 alpha. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. April 2002, 99 (8): 5367–72. PMC 122775  . PMID 11959990. doi:10.1073/pnas.082117899. 
  9. ^ Benizri E, Ginouvès A, Berra E. The magic of the hypoxia-signaling cascade. Cell. Mol. Life Sci. April 2008, 65 (7-8): 1133–49. PMID 18202826. doi:10.1007/s00018-008-7472-0. 
  10. ^ Formenti F, Constantin-Teodosiu D, Emmanuel Y, Cheeseman J, Dorrington KL, Edwards LM, Humphreys SM, Lappin TR, McMullin MF, McNamara CJ, Mills W, Murphy JA, O'Connor DF, Percy MJ, Ratcliffe PJ, Smith TG, Treacy M, Frayn KN, Greenhaff PL, Karpe F, Clarke K, Robbins PA. Regulation of human metabolism by hypoxia-inducible factor. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. July 2010, 107 (28): 12722–7. PMC 2906567  . PMID 20616028. doi:10.1073/pnas.1002339107. 
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外部連結

一月 09, 2023
缺氧誘導因子, 此條目需要編修, 以確保文法, 用詞, 语气, 格式, 標點等使用恰当, 2019年10月8日, 請按照校對指引, 幫助编辑這個條目, 幫助, 討論, hypoxia, inducible, factors, hifs, 是一種在細胞環境中的轉錄因子, 因氧含量而產生不同反應的, 主要是在氧氣減少或缺氧, 的情況下活化, α亞基, hypoxia, inducible, factor, alpha, subunit, 識別符號, hif1aentrez, 3091hugo, 4910omim, 60. 此條目需要編修 以確保文法 用詞 语气 格式 標點等使用恰当 2019年10月8日 請按照校對指引 幫助编辑這個條目 幫助 討論 缺氧誘導因子 Hypoxia inducible factors HIFs 是一種在細胞環境中的轉錄因子 因氧含量而產生不同反應的 主要是在氧氣減少或缺氧 1 的情況下活化 缺氧誘導因子 1 a亞基 hypoxia inducible factor 1 alpha subunit 識別符號 HIF1AEntrez 3091HUGO 4910OMIM 603348RefSeq NM 001530UniProt Q16665其他資料基因座 14 q21 q24芳香烴受體核轉 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator 識別符號 ARNT替換符號 HIF1B bHLHe2Entrez 405HUGO 700OMIM 126110RefSeq NM 001668UniProt P27540其他資料基因座 1 q21内皮PAS域蛋白 1 endothelial PAS domain protein 1 識別符號 EPAS1替換符號 HIF2A MOP2 PASD2 HLFEntrez 2034HUGO 3374OMIM 603349RefSeq NM 001430UniProt Q99814其他資料基因座 2 p21 p16芳香烴受體核轉 2 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator 2 識別符號 ARNT2替換符號 HIF2B KIAA0307 bHLHe1Entrez 9915HUGO 16876OMIM 606036RefSeq NM 014862UniProt Q9HBZ2其他資料基因座 1 q24缺氧誘導因子 3 a亞基 hypoxia inducible factor 3 alpha subunit 識別符號 HIF3AEntrez 64344HUGO 15825OMIM 609976RefSeq NM 152794UniProt Q9Y2N7其他資料基因座 19 q13 目录 1 結構 2 成員 3 作用 4 機制 5 治療相關 5 1 貧血 5 2 炎症和癌症 5 3 神經內科 6 另請參閱 7 參考文獻 8 外部連結結構 编辑缺氧大部分需要氧氣呼吸的物種 都擁有保守序列HIF 1 其轉錄都有嚴格的調控機制 HIF 1是由一個a亞基和一個b亞基組成的異源蛋白二聚體 而b亞基是一種芳香烃受体核转位子 英语 Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator ARNT 2 3 HIF 1屬於鹼性螺旋 環 螺旋 bHLH 家族中的PER ARNT SIM PAS 亞科 a亞基和b亞基的結構類似 且都包含下列結構域 4 5 6 N 末端 一個bHLH結構域 能和DNA結合 中間區域 Per ARNT Sim PAS 結構域 有利於形成異源蛋白二聚體 C 末端 一個能與转录辅调节因子 英语 Transcription coregulator 結合的蛋白質 促使轉錄共調節 缺氧誘導因子 1 HIF 1a pVHL ElonginB ElonginC 複合體 的結構之一 7 鑑定標誌HIF 1PfamPF11413現有可用的蛋白結構 Pfam結構 ECODPDBRCSB PDB PDBe PDBjPDBsum 英语 PDBsum 結構概要 HIF 1a的C末端激活域 缺氧誘導因子 1 a亞基 的結構之一 8 鑑定標誌HIF 1a CTADPfamPF08778InterPro 英语 InterPro IPR014887SCOP 英语 Structural Classification of Proteins 1l3e SUPFAM現有可用的蛋白結構 Pfam結構 ECODPDBRCSB PDB PDBe PDBjPDBsum 英语 PDBsum 結構概要PDB1h2k 1h2l 1l3e 1l8c成員 编辑下列為人類的 HIF 家族 成員 基因 蛋白HIF 1a HIF1A 缺氧誘導因子 1 a亞基HIF 1b HIF 1b 芳香烴受體核轉HIF 2a EPAS1 内皮PAS域蛋白 1HIF 2b ARNT2 芳基烴受體核轉 2HIF 3a HIF3A 缺氧誘導因子 3 a亞基HIF 3b ARNTL 芳基烴受體核轉 3作用 编辑在細胞中 HIF信號級聯反應會受到缺氧狀態的影響 在缺氧狀態下 通常會讓細胞持續的細胞分化 然而 缺氧狀態促進了血管新生 對於胚胎中的血管系統與癌症腫瘤來說非常重要 傷口處的缺氧狀態 也促進了角質細胞的移動與上皮組織的修護 9 在普遍情況下 HIF是發育的重要關鍵 在哺乳動物中 若缺少了HIF 1的基因 將導致胎兒死亡 HIF 1已經被證實 對於軟骨細胞的存亡有重大的影響 他能使軟骨細胞適應在骨骼間生長板的缺氧環境 缺氧誘導因子在人類的代謝調節 10 中 屬於一個核心角色 機制 编辑HIF中a亞基上的脯氨酸殘會透過HIF脯氨酰羥化酶羥基化 而使其能被 VHL E3泛素連接酶辨識並泛素化 之後透過蛋白酶體 11 使其被快速降解 這只會發生在含氧量正常的條件 但在缺氧條件下 HIF脯氨酰羥化酶會被抑制 因為它利用氧作為輔助基質 12 在琥珀酸去氫酶複合物中 電子轉移的抑制是因為SDHB或SDHD基因的突變 其會導致琥珀的積聚 進而抑制HIF脯氨酰羥化酶的活性 穩定HIF 1 a 這被稱為偽組織缺氧 HIF 1 當持續在缺氧條件下 正向調節多種基因以能再低含氧量的情況下生存 HIF 1能調節的酵素包括糖解作用酶 使其能以不耗氧的方式合成三磷酸腺苷 還有血管內皮生長因子 VEGF 能促進血管新生 HIF 1的觸發 是藉由HIF 反應元件 HREs 結合到了啟動子上的NCGTG序列 已有實驗證明 肌A激酶錨定蛋白 mAKAP 組成的E3泛素連接酶能作用於HIF 1 影響其穩定性與定位 使其移動至細胞核中 當 mAKAP 耗盡或因其他因素干擾 mAKAP 定位在細胞核 心肌細胞 周圍區域時 會影響了HIF的穩定性 與其他和缺氧相關基因的轉錄活性 因此 將對氧氣敏感的信號物件 區域化 可能影響缺氧時反應的進行 13 在過去 與缺氧環境下HIF的調控機制資訊相較而言 含氧量正常時透過NF kB介入的HIF調控機制和功能訊 尚處於不明確的狀況 同樣的 HIF 1a亞基的穩定性 在非缺氧環境下 其運作機制也是未知的 但近期指出 NF kB NF kB 是HIF 1a在正常含氧量下的直接調節因子 以小干擾RNA作用在NF kB上發現到 其會影響HIF 1a mRNA 的表現程度 因此證實了NF kB能HIF 1a的表現 最後 當進行腫瘤壞死因子 a TNAa 治療時 NF kB被大量誘導表現 HIF 1a表現程度也受到影響 14 HIF 1和HIF 2具有不同的生理作用 HIF 2用於調節成人體內的紅血球生成素 15 治療相關 编辑貧血 编辑 最近 多種作用為選擇性的HIF脯氨酰羥化酶的抑制劑已經被開發了 16 其中最引人注目的包括FibroGen公司的化合物FG 2216和FG 4592 17 18 是兩個以口服方式治療 貧血 的藥物 19 藉由抑制HIF脯氨酰羥化酶 使HIF 2a在腎的穩定性增加 這導致紅血球生成素的生產的 20 這兩種藥物對II期臨床試驗已經成功了 但這些都在2007年5月暫停了 因為有試驗參發生暴發性肝炎死亡 不過 目前還不清楚肝炎死亡是否是由FG 2216所引起的 在2008年年初 因美國FDA的審查和批准 解除臨床試驗的暫停 21 炎症和癌症 编辑 在其它情況中 並接續上面的治療主題 最近的研究表明 在常氧狀態下誘導HIF表現 可能造成含有慢性炎性成分的疾病 且已經表明 慢性炎症是自我延續的 並且是因為微環境的異常 而導致轉錄因子被異常活化的結果 發生在細胞中 生長因子 趨化因子 細胞因子和活性氧平衡的改變 反過提供生長的需要 造成癌症發生與轉移 最近發表的研究結果包含了許多病症 其中有NF kB和HIF 1的失調 也有類風濕關節炎和癌症 因此 了解NF kB和HIF兩著之間的關係 將大大提高藥物開發的發展 14 HIF的活性涉及到了血管新生 也造成腫瘤的生長 所以HIF的抑制劑 如異硫氰酸苯乙酯 Phenethyl isothiocyanate 和吖啶黃正在接受抗癌作用的測試 22 23 24 25 神經內科 编辑 研究指出 在老鼠身上使用HIF脯氨酰羥化酶抑制劑 增強海馬體記憶 也增加了紅血球生成素的表現 26 另請參閱 编辑HIF 1a參考文獻 编辑 Smith TG Robbins PA Ratcliffe PJ The human side of hypoxia inducible factor Br J 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inducible factor stabilization leads to lasting improvement of hippocampal memory in healthy mice Behavioural Brain Research 2010 03 17 208 1 80 84 2019 02 12 ISSN 1872 7549 PMID 19900484 doi 10 1016 j bbr 2009 11 010 原始内容存档于2019 07 22 外部連結 编辑醫學主題詞表 MeSH Hypoxia Inducible Factor 1 取自 https zh wikipedia org w index php title 缺氧誘導因子 amp oldid 70814272, 维基百科，wiki，书籍，书籍，图书馆，

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