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Entrez

Entrez全局查詢跨數據庫搜索系統是一個聯合搜尋英语Federated search引擎。它能讓使用者能一次搜尋NCBI網站上的許多不同的健康科學數據庫[1]。該數據庫能快速搜尋蛋白質的一級結構、高級結構,以及相關的參考資料。Entrez系統同時還提供基因的序列信息以及染色體定位。另外,可以從Entrez系統上獲取一些教材。其名稱「Entrez」(源自法語,意思爲「進來吧!」)旨在表現該數據庫歡迎公眾搜尋NLM(國家醫學圖書館)的內容的熱情。

Entrez標誌

數據庫

Entrez會在下列數據庫中進行搜尋:

  • PubMed
  • PMC(PubMed Central免費獲取PubMed上的文章全文)
  • 站點搜尋:NCBI網頁以及FTP
  • 在線圖書
  • 人類孟德爾遺傳學 (OMIM)
  • 核酸序列數據庫 (GenBank)
  • 蛋白質序列數據庫
  • Genome:人全基因組序列以及染色體定位
  • Structure:大分子三維結構
  • Taxonomy: GenBank中生物的分類學
  • SNP:單核苷酸多態性
  • Gene:[2]基因以及相關信息
  • HomoloGene:真核生物同源群
  • PubChem 小分子化學結構
  • PubChem Substance(PCS): 化學物質信息
  • 基因組計劃:基因組計劃信息
  • UniGene:轉錄序列的基因導向簇
  • CDD英语Conserved domain database:保守的蛋白質結構域數據庫
  • PopSet:群體研究資料集(流行病學)
  • GEO Profiles:基因表現以及表現水平的數據
  • GEO DataSets: GEO數據的實驗數據集
  • Sequence read archive(序列讀取存盤):高通量測序數據
  • Cancer Chromosomes(癌症染色體):細胞遺傳學數據庫cytogenetic databases
  • PubChem BioAssay(PubChem生物測定):化學物質的生物活性背景bioactivity screens of chemical substances
  • Probe:序列特異性試劑
  • NLM Catalog: NLM目錄,包括總數達120萬的期刊、圖書、多媒體資料、計算機軟件、電子資源,以及其他一些LocatorPlus上的資源,每週都會更新。

使用

除了直接使用Entrez搜尋全局資料外,NCBI還提供了Entrez的編程工具[3](eUtils)。使用這個工具能得到更精確的結果。

歷史

1991年,Entrez資料庫以CD的形式開始運作。1993年,Entrez建立了因特網上的資料庫。1994年,NCBI建立了網站,Entrez也自然成爲網站的一部分。2001年,Entrez暑假上線。2003年,NCBI開發了Entrez基因數據庫[4]

參考

  1. ^ NCBI Resource Coordinators. Database resources of the National Center for Biotechnology Information. Nucleic Acids Research. 2012, 41 (Database issue): D8–D20. PMC 3531099 . PMID 23193264. doi:10.1093/nar/gks1189. 
  2. ^ Home - Gene - NCBI. [2017-01-25]. (原始内容于2017-01-24). 
  3. ^ Entrez Utilities. [2017-01-25]. (原始内容于2017-01-18). 
  4. ^ Smith, Kent. A Brief History of NCBI’s Formation and Growth. The NCBI Handbook [Internet]. 2nd edition. [3 May 2014]. (原始内容于2019-01-13). 

外部連結

entrez, 全局查詢跨數據庫搜索系統是一個聯合搜尋, 英语, federated, search, 引擎, 它能讓使用者能一次搜尋ncbi網站上的許多不同的健康科學數據庫, 該數據庫能快速搜尋蛋白質的一級結構, 高級結構, 以及相關的參考資料, 系統同時還提供基因的序列信息以及染色體定位, 另外, 可以從系統上獲取一些教材, 其名稱, 源自法語, 意思爲, 進來吧, 旨在表現該數據庫歡迎公眾搜尋nlm, 國家醫學圖書館, 的內容的熱情, 標誌, 目录, 數據庫, 使用, 歷史, 參考, 外部連結數據庫, 编辑會. Entrez全局查詢跨數據庫搜索系統是一個聯合搜尋 英语 Federated search 引擎 它能讓使用者能一次搜尋NCBI網站上的許多不同的健康科學數據庫 1 該數據庫能快速搜尋蛋白質的一級結構 高級結構 以及相關的參考資料 Entrez系統同時還提供基因的序列信息以及染色體定位 另外 可以從Entrez系統上獲取一些教材 其名稱 Entrez 源自法語 意思爲 進來吧 旨在表現該數據庫歡迎公眾搜尋NLM 國家醫學圖書館 的內容的熱情 Entrez標誌 目录 1 數據庫 2 使用 3 歷史 4 參考 5 外部連結數據庫 编辑Entrez會在下列數據庫中進行搜尋 PubMed PMC PubMed Central免費獲取PubMed上的文章全文 站點搜尋 NCBI網頁以及FTP 在線圖書 人類孟德爾遺傳學 OMIM 核酸序列數據庫 GenBank 蛋白質序列數據庫 Genome 人全基因組序列以及染色體定位 Structure 大分子三維結構 Taxonomy GenBank中生物的分類學 SNP 單核苷酸多態性 Gene 2 基因以及相關信息 HomoloGene 真核生物同源群 PubChem 小分子化學結構 PubChem Substance PCS 化學物質信息 基因組計劃 基因組計劃信息 UniGene 轉錄序列的基因導向簇 CDD 英语 Conserved domain database 保守的蛋白質結構域數據庫 PopSet 群體研究資料集 流行病學 GEO Profiles 基因表現以及表現水平的數據 GEO DataSets GEO數據的實驗數據集 Sequence read archive 序列讀取存盤 高通量測序數據 Cancer Chromosomes 癌症染色體 細胞遺傳學數據庫cytogenetic databases PubChem BioAssay PubChem生物測定 化學物質的生物活性背景bioactivity screens of chemical substances Probe 序列特異性試劑 NLM Catalog NLM目錄 包括總數達120萬的期刊 圖書 多媒體資料 計算機軟件 電子資源 以及其他一些LocatorPlus上的資源 每週都會更新 使用 编辑除了直接使用Entrez搜尋全局資料外 NCBI還提供了Entrez的編程工具 3 eUtils 使用這個工具能得到更精確的結果 歷史 编辑1991年 Entrez資料庫以CD的形式開始運作 1993年 Entrez建立了因特網上的資料庫 1994年 NCBI建立了網站 Entrez也自然成爲網站的一部分 2001年 Entrez暑假上線 2003年 NCBI開發了Entrez基因數據庫 4 參考 编辑 NCBI Resource Coordinators Database resources of the National Center for Biotechnology Information Nucleic Acids Research 2012 41 Database issue D8 D20 PMC 3531099 PMID 23193264 doi 10 1093 nar gks1189 Home Gene NCBI 2017 01 25 原始内容存档于2017 01 24 Entrez Utilities 2017 01 25 原始内容存档于2017 01 18 Smith Kent A Brief History of NCBI s Formation and Growth The NCBI Handbook Internet 2nd edition 3 May 2014 原始内容存档于2019 01 13 外部連結 编辑Entrez search engine form 页面存档备份 存于互联网档案馆 Entrez Help 页面存档备份 存于互联网档案馆 取自 https zh wikipedia org w index php title Entrez amp oldid 63309425, 维基百科,wiki,书籍,书籍,图书馆,

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