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假尿嘧啶核苷

四月 02, 2023

假尿嘧啶核苷（Pseudouridine，簡稱Ψ或Q[1]）或稱5-核糖尿嘧啶（5-ribosyluracil）、假尿苷，是尿苷（U）的一種同分異構物，有別於尿苷中尿嘧啶以碳－氮鍵（C1-N1）與核糖相連，假尿嘧啶核苷中尿嘧啶和核糖是以碳－碳鍵（C1-C5）連接，故其結構較有彈性[2]，比尿苷多出了一個可形成氫鍵的位點，且在RNA中產生的重疊效應高於尿苷[3]。假尿嘧啶核苷最早於1951年發現，為細胞RNA中最常見的修飾，在三域生物中皆有，有A、U、C、G之外的「第五種核苷」之稱[4]。

假尿嘧啶核苷
IUPAC名
5-[(2S,3R,4S,5R)-3,4-Dihydroxy-5-(hydroxymethyl)-oxolan-2-yl]-1H-pyrimidine-2,4-dione
别名 psi-Uridine, 5-Ribosyluracil, beta-D-Pseudouridine, 5-(beta-D-Ribofuranosyl)uracil
识别
CAS号 1445-07-4  
PubChem 15047
ChemSpider 14319
SMILES
InChI
InChIKey PTJWIQPHWPFNBW-GBNDHIKLBY
ChEBI 17802
性质
化学式 C9H12N2O6
摩尔质量 244.20 g/mol g·mol⁻¹
外观 白色粉末
溶解性（水） 易溶於水
若非注明，所有数据均出自标准状态（25 ℃，100 kPa）下。

假尿嘧啶核苷是細胞中最常見的RNA修飾，是轉錄後修飾的機制之一，在轉錄結束後由假尿苷合成酶（PUS）自尿苷轉化而來，此修飾可能影響RNA的結構、功能、位置與半衰期。mRNA、tRNA、rRNA、snRNA與snoRNA中均有發現假尿嘧啶核苷修飾，在tRNA與rRNA中可穩定RNA的結構，與其轉譯的功能相關[2][5][6]；在snRNA中則可促進剪接體對前体信使RNA（英语：pre-mRNA）的切割[7]；在mRNA中的功能仍不清楚，有研究顯示終止密碼子中的假尿嘧啶核苷可能會造成轉譯連讀（translation readthrough）[8]。假尿嘧啶核苷還可能被細胞用作識別自身與外來RNA的機制，即RIG-I和蛋白激酶R（英语：Protein kinase R）等先天免疫蛋白可識別不含有假尿嘧啶核苷的病毒RNA而啟動免疫反應[8]。

釀酒酵母的tRNAAla序列， Ψ即為假尿嘧啶核苷

參考文獻

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  2. ^ 2.0 2.1 Gray, Michael Charette, Michael W. Pseudouridine in RNA: What, Where, How, and Why. IUBMB Life. 2000-05-01, 49 (5): 341–351. ISSN 1521-6543. PMID 10902565. doi:10.1080/152165400410182. 
  3. ^ Zhao BS, He C. Pseudouridine in a new era of RNA modifications.. Cell Res. 2015, 25 (2): 153–4. PMC 4650566  . PMID 25367125. doi:10.1038/cr.2014.143. 
  4. ^ Katherine M. McKenney, Mary Anne T. Rubio, Juan D. Alfonzo. Chapter Two - The Evolution of Substrate Specificity by tRNA Modification Enzymes. 41. 2017: 51-88 [2021-04-23]. doi:10.1016/bs.enz.2017.03.002. （原始内容存档于2021-04-25）. 
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  8. ^ 8.0 8.1 Borchardt EK, Martinez NM, Gilbert WV. Regulation and Function of RNA Pseudouridylation in Human Cells.. Annu Rev Genet. 2020, 54: 309–336. PMC 8007080  . PMID 32870730. doi:10.1146/annurev-genet-112618-043830. 

四月 02, 2023
假尿嘧啶核苷, pseudouridine, 簡稱Ψ或q, 或稱5, 核糖尿嘧啶, ribosyluracil, 假尿苷, 是尿苷, 的一種同分異構物, 有別於尿苷中尿嘧啶以碳, 氮鍵, 與核糖相連, 中尿嘧啶和核糖是以碳, 碳鍵, 連接, 故其結構較有彈性, 比尿苷多出了一個可形成氫鍵的位點, 且在rna中產生的重疊效應高於尿苷, 最早於1951年發現, 為細胞rna中最常見的修飾, 在三域生物中皆有, 有a, g之外的, 第五種核苷, 之稱, iupac名5, dihydroxy, hydroxymethyl,. 假尿嘧啶核苷 Pseudouridine 簡稱PS或Q 1 或稱5 核糖尿嘧啶 5 ribosyluracil 假尿苷 是尿苷 U 的一種同分異構物 有別於尿苷中尿嘧啶以碳 氮鍵 C1 N1 與核糖相連 假尿嘧啶核苷中尿嘧啶和核糖是以碳 碳鍵 C1 C5 連接 故其結構較有彈性 2 比尿苷多出了一個可形成氫鍵的位點 且在RNA中產生的重疊效應高於尿苷 3 假尿嘧啶核苷最早於1951年發現 為細胞RNA中最常見的修飾 在三域生物中皆有 有A U C G之外的 第五種核苷 之稱 4 假尿嘧啶核苷IUPAC名5 2S 3R 4S 5R 3 4 Dihydroxy 5 hydroxymethyl oxolan 2 yl 1H pyrimidine 2 4 dione别名 psi Uridine 5 Ribosyluracil beta D Pseudouridine 5 beta D Ribofuranosyl uracil识别CAS号 1445 07 4 PubChem 15047ChemSpider 14319SMILES O C1N C C C O N1 C H 2O C H CO C H O C H 2OInChI 1 C9H12N2O6 c12 2 4 5 13 6 14 7 17 4 3 1 10 9 16 11 8 3 15 h1 4 7 12 14H 2H2 H2 10 11 15 16 t4 5 6 7 m1 s1InChIKey PTJWIQPHWPFNBW GBNDHIKLBYChEBI 17802性质化学式 C9H12N2O6摩尔质量 244 20 g mol g mol 外观 白色粉末溶解性 水 易溶於水若非注明 所有数据均出自标准状态 25 100 kPa 下 假尿嘧啶核苷是細胞中最常見的RNA修飾 是轉錄後修飾的機制之一 在轉錄結束後由假尿苷合成酶 PUS 自尿苷轉化而來 此修飾可能影響RNA的結構 功能 位置與半衰期 mRNA tRNA rRNA snRNA與snoRNA中均有發現假尿嘧啶核苷修飾 在tRNA與rRNA中可穩定RNA的結構 與其轉譯的功能相關 2 5 6 在snRNA中則可促進剪接體對前体信使RNA 英语 pre mRNA 的切割 7 在mRNA中的功能仍不清楚 有研究顯示終止密碼子中的假尿嘧啶核苷可能會造成轉譯連讀 translation readthrough 8 假尿嘧啶核苷還可能被細胞用作識別自身與外來RNA的機制 即RIG I和蛋白激酶R 英语 Protein kinase R 等先天免疫蛋白可識別不含有假尿嘧啶核苷的病毒RNA而啟動免疫反應 8 釀酒酵母的tRNAAla序列 PS 即為假尿嘧啶核苷參考文獻 编辑 Hamma Tomoko Ferre D Amare Adrian R Pseudouridine Synthases Chemistry amp Biology November 2006 13 11 1125 1135 ISSN 1074 5521 PMID 17113994 doi 10 1016 j chembiol 2006 09 009 2 0 2 1 Gray Michael Charette Michael W Pseudouridine in RNA What Where How and Why IUBMB Life 2000 05 01 49 5 341 351 ISSN 1521 6543 PMID 10902565 doi 10 1080 152165400410182 Zhao BS He C Pseudouridine in a new era of RNA modifications Cell Res 2015 25 2 153 4 PMC 4650566 PMID 25367125 doi 10 1038 cr 2014 143 Katherine M McKenney Mary Anne T Rubio Juan D Alfonzo Chapter Two The Evolution of Substrate Specificity by tRNA Modification Enzymes The Enzymes 41 2017 51 88 2021 04 23 doi 10 1016 bs enz 2017 03 002 原始内容存档于2021 04 25 Ge Junhui Yu Yi Tao RNA pseudouridylation new insights into an old modification Trends in Biochemical Sciences April 2013 38 4 210 218 ISSN 0968 0004 PMC 3608706 PMID 23391857 doi 10 1016 j tibs 2013 01 002 Rintala Dempsey Anne C Kothe Ute Eukaryotic stand alone pseudouridine synthases RNA modifying enzymes and emerging regulators of gene expression RNA Biology 2017 01 03 14 9 1185 1196 ISSN 1547 6286 PMC 5699540 PMID 28045575 doi 10 1080 15476286 2016 1276150 Wu Guowei Radwan Mohamed K Xiao Mu Adachi Hironori Fan Jason Yu Yi Tao TheTORsignaling pathway regulates starvation induced pseudouridylation of yeast U2 snRNA RNA 2016 06 07 22 8 1146 1152 ISSN 1355 8382 PMC 4931107 PMID 27268497 doi 10 1261 rna 056796 116 8 0 8 1 Borchardt EK Martinez NM Gilbert WV Regulation and Function of RNA Pseudouridylation in Human Cells Annu Rev Genet 2020 54 309 336 PMC 8007080 PMID 32870730 doi 10 1146 annurev genet 112618 043830 取自 https zh wikipedia org w index php title 假尿嘧啶核苷 amp oldid 71913450, 维基百科，wiki，书籍，书籍，图书馆，

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