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国际化合物标识

国际化合物标识InChI,英語:International Chemical Identifier)是由国际纯粹与应用化学联合会国家标准技术研究所联合制定的,用以唯一标识化合物IUPAC名称的字符串。

InChI
開發者InChI Trust
首次发布2005年4月15日 (2005-04-15)[1][2]
操作系统Microsoft Windows类Unix系统
系統平台IA-32 and x86-64
文件大小4.3 MB
语言英語
许可协议IUPAC / InChI Trust Licence
网站[失效連結]

例子

1 CH3—CH2—OH

乙醇
InChI=1/C2H6O/c1-2-3/h3H,2H2,1H3
2  
维生素C
InChI=1/C6H8O6/c7-1-2(8)5-3(9)4(10)6(11)12-5/h2,5,7-10H,1H2/t2-,5+/m0/s1

国际化合物标识分为六个层,每个层之间以“/”分隔,并在开头以一个小写字母标明层的性质:

  1. 主层:以“1”表示
  2. 电荷层:以“q”表示
  3. 立体化学层:以“t”,“m”,“s”表示
  4. 异构体层(Isotopic layer):以“i”表示
  5. 固定氢原子(Fixed-H layer):以“f”表示
  6. 再连接层(Reconnected Layer):以“r”表示

其中主层是必不可少的,其他的层是可以省略的。

子层

每个层都可以分成若干子层(sub-layer),比如主层可以分成以下三个子层:

  1. 分子式子层(没有前缀)
  2. 原子连接子层(以字母c开始)
  3. 氢原子层(以字母h开始)

InChIKey

InChIKey是InChI的雜湊函式,其长度为固定的27字符,适用于在数据库或网际网路中进行检索。其无法被直接解读为InChI明文。

举例

维生素C的InChI为例:

1/C6H8O6 /c7-1-2(8)5-3(9)4(10)6(11)12-5 /h2,5,7-10H,1H2 /t2-,5+/m0/s1
化学式层 原子连接层 氢原子层 立体化学层

该物质的InChIKey则为CIWBSHSKHKDKBQ-JLAZNSOCSA-N

註釋

  1. ^ . IUPAC. [2012-12-05]. (原始内容存档于2012-05-27). 
  2. ^ Heller, Stephen; McNaught, Alan; Stein, Stephen; Tchekhovskoi, Dmitrii; Pletnev, Igor. InChI - the worldwide chemical structure identifier standard. Journal of Cheminformatics (Springer Nature). 2013, 5 (1): 7. ISSN 1758-2946. doi:10.1186/1758-2946-5-7. 

参见

外部連結

文檔和演示文稿

  • InChI Trust site(页面存档备份,存于互联网档案馆
  • IUPAC InChI site(页面存档备份,存于互联网档案馆
  • Unofficial InChI FAQ(页面存档备份,存于互联网档案馆
  • InChI Technical ManualPDF (335 KB)
  • [1](页面存档备份,存于互联网档案馆
  • Description of the canonicalization algorithm(页面存档备份,存于互联网档案馆
  • Googling for InChIs(页面存档备份,存于互联网档案馆) a presentation to the W3C.
  • The Semantic Chemical Web: GoogleInChI and other Mashups(页面存档备份,存于互联网档案馆), Google Tech Talk by Peter Murray-Rust, 13 Sept 2006
  • IUPAC InChI(页面存档备份,存于互联网档案馆), Google Tech Talk by Steve Heller and Steve Stein, 2 November 2006
  • InChI final version 1.02 and explanation of Standard InChI, January 2009

軟件和服務

  • NCI/CADD Chemical Identifier Resolver(页面存档备份,存于互联网档案馆) Generates and resolves InChI/InChIKeys and many other chemical identifiers
  • ChemSpider InChI resolver(页面存档备份,存于互联网档案馆
  • (generates InChI from interactive chemical and searches Google for any pages with embedded InChIs). Requires Javascript enabled on browser
  • ChemSketch(页面存档备份,存于互联网档案馆), free chemical structure drawing package that includes input and output in InCHI format
  • PubChem online molecule editor(页面存档备份,存于互联网档案馆) that supports SMILES/SMARTS and InChI
  • ChemSpider Services(页面存档备份,存于互联网档案馆) that allows generation of InChI and conversion of InChI to structure (also SMILES and generation of other properties)
  • from ChemAxon, implementation to draw structures (or open other file formats) and output to InChI file format
  • BKchem(页面存档备份,存于互联网档案馆) implements its own InChI parser and uses the IUPAC implementation to generate InChI strings
  • CompoundSearch(页面存档备份,存于互联网档案馆) implements an InChI and InChI Key search of spectral libraries
  • JNI-InChI(页面存档备份,存于互联网档案馆) Java library that wraps the InChI library
  • the Chemistry Development Kit uses JNI-InChI to generate InChIs, can convert InChIs into structures, and generate tautomers based on the InChI algorithms
  • Bioclipse generates InChI and InChIKeys for drawn structures or opened files


国际化合物标识, inchi, 英語, international, chemical, identifier, 是由国际纯粹与应用化学联合会和国家标准技术研究所联合制定的, 用以唯一标识化合物iupac名称的字符串, inchi開發者inchi, trust首次发布2005年4月15日, 2005, 操作系统microsoft, windows及类unix系统系統平台ia, 64文件大小4, mb语言英語许可协议iupac, inchi, trust, licence网站, 失效連結, 目录, 例子, 子层, i. 国际化合物标识 InChI 英語 International Chemical Identifier 是由国际纯粹与应用化学联合会和国家标准技术研究所联合制定的 用以唯一标识化合物IUPAC名称的字符串 InChI開發者InChI Trust首次发布2005年4月15日 2005 04 15 1 2 操作系统Microsoft Windows及类Unix系统系統平台IA 32 and x86 64文件大小4 3 MB语言英語许可协议IUPAC InChI Trust Licence网站 失效連結 目录 1 例子 2 层 2 1 子层 3 InChIKey 4 举例 5 註釋 6 参见 7 外部連結 7 1 文檔和演示文稿 7 2 軟件和服務例子 编辑1 CH3 CH2 OH乙醇 InChI 1 C2H6O c1 2 3 h3H 2H2 1H32 维生素C InChI 1 C6H8O6 c7 1 2 8 5 3 9 4 10 6 11 12 5 h2 5 7 10H 1H2 t2 5 m0 s1层 编辑国际化合物标识分为六个层 每个层之间以 分隔 并在开头以一个小写字母标明层的性质 主层 以 1 表示 电荷层 以 q 表示 立体化学层 以 t m s 表示 异构体层 Isotopic layer 以 i 表示 固定氢原子 Fixed H layer 以 f 表示 再连接层 Reconnected Layer 以 r 表示其中主层是必不可少的 其他的层是可以省略的 子层 编辑 每个层都可以分成若干子层 sub layer 比如主层可以分成以下三个子层 分子式子层 没有前缀 原子连接子层 以字母c开始 氢原子层 以字母h开始 InChIKey 编辑InChIKey是InChI的雜湊函式 其长度为固定的27字符 适用于在数据库或网际网路中进行检索 其无法被直接解读为InChI明文 举例 编辑以维生素C的InChI为例 1 C6H8O6 c7 1 2 8 5 3 9 4 10 6 11 12 5 h2 5 7 10H 1H2 t2 5 m0 s1化学式层 原子连接层 氢原子层 立体化学层该物质的InChIKey则为CIWBSHSKHKDKBQ JLAZNSOCSA N 註釋 编辑 IUPAC International Chemical Identifier Project Page IUPAC 2012 12 05 原始内容存档于2012 05 27 Heller Stephen McNaught Alan Stein Stephen Tchekhovskoi Dmitrii Pletnev Igor InChI the worldwide chemical structure identifier standard Journal of Cheminformatics Springer Nature 2013 5 1 7 ISSN 1758 2946 doi 10 1186 1758 2946 5 7 参见 编辑SMILES外部連結 编辑文檔和演示文稿 编辑 InChI Trust site 页面存档备份 存于互联网档案馆 IUPAC InChI site 页面存档备份 存于互联网档案馆 Unofficial InChI FAQ 页面存档备份 存于互联网档案馆 InChI Technical Manual PDF 335 KB 1 页面存档备份 存于互联网档案馆 Description of the canonicalization algorithm 页面存档备份 存于互联网档案馆 Googling for InChIs 页面存档备份 存于互联网档案馆 a presentation to the W3C The Semantic Chemical Web GoogleInChI and other Mashups 页面存档备份 存于互联网档案馆 Google Tech Talk by Peter Murray Rust 13 Sept 2006 IUPAC InChI 页面存档备份 存于互联网档案馆 Google Tech Talk by Steve Heller and Steve Stein 2 November 2006 InChI Release 1 02 InChI final version 1 02 and explanation of Standard InChI January 2009軟件和服務 编辑 NCI CADD Chemical Identifier Resolver 页面存档备份 存于互联网档案馆 Generates and resolves InChI InChIKeys and many other chemical identifiers ChemSpider InChI resolver 页面存档备份 存于互联网档案馆 Search Google for molecules generates InChI from interactive chemical and searches Google for any pages with embedded InChIs Requires Javascript enabled on browser ChemSketch 页面存档备份 存于互联网档案馆 free chemical structure drawing package that includes input and output in InCHI format PubChem online molecule editor 页面存档备份 存于互联网档案馆 that supports SMILES SMARTS and InChI ChemSpider Services 页面存档备份 存于互联网档案馆 that allows generation of InChI and conversion of InChI to structure also SMILES and generation of other properties MarvinSketch from ChemAxon implementation to draw structures or open other file formats and output to InChI file format BKchem 页面存档备份 存于互联网档案馆 implements its own InChI parser and uses the IUPAC implementation to generate InChI strings CompoundSearch 页面存档备份 存于互联网档案馆 implements an InChI and InChI Key search of spectral libraries JNI InChI 页面存档备份 存于互联网档案馆 Java library that wraps the InChI library the Chemistry Development Kit uses JNI InChI to generate InChIs can convert InChIs into structures and generate tautomers based on the InChI algorithms Bioclipse generates InChI and InChIKeys for drawn structures or opened files 取自 https zh wikipedia org w index php title 国际化合物标识 amp oldid 69007132, 维基百科,wiki,书籍,书籍,图书馆,

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