維甲酸誘導基因-I

维甲酸诱导基因-I^[5]（RIG-I，retinoic acid-inducible gene I）是脊椎動物細胞質中的一種模式识别受体（PRR），結構上屬於DExD/H-box（英语：DExD/H box proteins）类RNA解旋酶^[6][7][8]，在人類基因組中由DDX58基因編碼^[9]，其N端有兩個CARD結構域（英语：CARD domain），C端則可與RNA結合，為先天免疫反應中的重要蛋白^[6][7]。

DDX58
已知的結構 PDB 直系同源搜索: PDBe RCSB PDBID列表 2LWD、​2LWE、​2QFB、​2QFD、​2RMJ、​2YKG、​3LRN、​3LRR、​3NCU、​3OG8、​3ZD6、​3ZD7、​4AY2、​4BPB、​4NQK、​4ON9、​4P4H、​5E3H、​5F98、​5F9F、​5F9H
識別號
别名	DDX58；, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 58, RIGI, RLR-1, SGMRT2, RIG-I, DEXD/H-box helicase 58, RIG1
外部ID	OMIM：609631 MGI：2442858 HomoloGene：32215 GeneCards：DDX58
基因位置（人类） 染色体 9號染色體^[1] 基因座 9p21.1 起始 32,455,302 bp^[1] 终止 32,526,208 bp^[1]
基因位置（小鼠） 染色体 小鼠4号染色体^[2] 基因座 4|4 A5 起始 40,203,773 bp^[2] 终止 40,239,828 bp^[2]
RNA表达模式
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基因本體 分子功能 • 核苷酸結合 • helicase activity • 鋅離子結合 • 金屬離子結合 • 血浆蛋白结合 • single-stranded RNA binding • 相同蛋白质结合 • RNA binding • double-stranded RNA binding • double-stranded DNA binding • 水解酶活性 • ATP結合 • nucleic acid binding • 泛素蛋白连接酶结合 細胞組分 • 細胞質 • cell projection • 膜 • 双细胞紧密连接 • 细胞膜 • ruffle membrane • 细胞连接 • actin cytoskeleton • 细胞骨架 • 细胞质基质 生物學過程 • regulation of cell migration • response to exogenous dsRNA • positive regulation of interferon-alpha production • immune system process • response to virus • cytoplasmic pattern recognition receptor signaling pathway in response to virus • positive regulation of gene expression • positive regulation of granulocyte macrophage colony-stimulating factor production • positive regulation of interleukin-8 production • positive regulation of interleukin-6 production • negative regulation of type I interferon production • detection of virus • viral process • 先天免疫系統 • positive regulation of transcription by RNA polymerase II • RIG-I signaling pathway • regulation of type III interferon production • positive regulation of defense response to virus by host • positive regulation of interferon-beta production • protein deubiquitination • positive regulation of response to cytokine stimulus • cellular response to exogenous dsRNA • defense response to virus • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • positive regulation of myeloid dendritic cell cytokine production Sources:Amigo / QuickGO
直系同源
物種	人類	小鼠
Entrez	23586	230073
Ensembl	ENSG00000107201	ENSMUSG00000040296
UniProt	O95786	Q6Q899
mRNA​序列	NM_014314	NM_172689
蛋白序列	NP_055129	NP_766277
基因位置​（UCSC）	Chr 9: 32.46 – 32.53 Mb	Chr 4: 40.2 – 40.24 Mb
PubMed​查找	^[3]	^[4]
維基數據
檢視/編輯人類 檢視/編輯小鼠

RIG-I平時處於不活化狀態，在細胞被西尼羅河病毒、黃熱病毒（英语：Flavivirus）、日本腦炎病毒、A型流感病毒、仙台病毒與冠狀病毒等RNA病毒感染後^[6][10]，RIG-I可與病毒的雙股RNA（dsRNA）結合而被活化，接著即可以CARD結構域和粒線體外膜上的线粒体抗病毒信号蛋白（英语：Mitochondrial antiviral-signaling protein）（MAVS）結合^[7]，啟動第一型干擾素（英语：Interferon type I）（IFN I）途徑的免疫反應^[6]，後者可阻止病毒擴散、造成發炎反應以及協助活化後天免疫^[11]。除識別病毒RNA外，在不同癌細胞中RIG-I還能啟動其他反應，包括促進或抑制腫瘤增殖（因腫瘤類型而異）、活化B細胞、影響細胞分化等^[12]。有些無脊椎動物（牡蠣）也具有和RIG-I與MAVS同源的蛋白，且可能也有抗病毒的免疫功能^[13]

不活化與活化的RIG-I結構示意圖

參考文獻

1. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000107201 - Ensembl, May 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000040296 - Ensembl, May 2017
3. Human PubMed Reference:. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine. 
4. Mouse PubMed Reference:. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine. 
5. 存档副本. [2021-07-06]. （原始内容于2021-07-09）. 
6. Kell AM, Gale M. RIG-I in RNA virus recognition. Virology. May 2015,. 479-480: 110–21. PMC 4424084  . PMID 25749629. doi:10.1016/j.virol.2015.02.017. 
7. Brisse M, Ly H. Comparative Structure and Function Analysis of the RIG-I-Like Receptors: RIG-I and MDA5. Frontiers in Immunology. 2019, 10: 1586. PMC 6652118  . PMID 31379819. doi:10.3389/fimmu.2019.01586 （英语）. 
8. Xu XX, Wan H, Nie L, Shao T, Xiang LX, Shao JZ. RIG-I: a multifunctional protein beyond a pattern recognition receptor. Protein & Cell. March 2018, 9 (3): 246–253. PMC 5829270  . PMID 28593618. doi:10.1007/s13238-017-0431-5. 
9. DDX58 DExD/H-box helicase 58 [Homo sapiens (human)] - Gene - NCBI. www.ncbi.nlm.nih.gov. [2020-02-29]. （原始内容于2021-04-24）. 
10. Solis M, Nakhaei P, Jalalirad M, Lacoste J, Douville R, Arguello M, et al. RIG-I-mediated antiviral signaling is inhibited in HIV-1 infection by a protease-mediated sequestration of RIG-I. Journal of Virology. February 2011, 85 (3): 1224–36. PMC 3020501  . PMID 21084468. doi:10.1128/JVI.01635-10. 
11. Ivashkiv LB, Donlin LT. Regulation of type I interferon responses. Nature Reviews. Immunology. January 2014, 14 (1): 36–49. PMC 4084561  . PMID 24362405. doi:10.1038/nri3581. 
12. Xu XX, Wan H, Nie L, Shao T, Xiang LX, Shao JZ. RIG-I: a multifunctional protein beyond a pattern recognition receptor.. Protein Cell. 2018, 9 (3): 246–253. PMC 5829270  . PMID 28593618. doi:10.1007/s13238-017-0431-5. 
13. Huang B, Zhang L, Du Y, Xu F, Li L, Zhang G. Characterization of the Mollusc RIG-I/MAVS Pathway Reveals an Archaic Antiviral Signalling Framework in Invertebrates.. Sci Rep. 2017, 7 (1): 8217. PMC 5557890  . PMID 28811654. doi:10.1038/s41598-017-08566-x.