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域 (生物)

十二月 15, 2023

在生物分類學中，域（英語：domain、empire、拉丁語：regio）或總界（superkingdom）是美國生物學家卡爾·沃斯1990年设计的三域系統中最高的分類單元，該系統中，生命之樹（英语：Tree of life (biology)）包含細菌、古菌與真核生物等三個域，其中前兩者為原核生物，不具有細胞核；後者則具有細胞核和内膜系统包裹的细胞器[參⁠ 1]。

生物分類法上八個主要的分類單元，生物被分成三個域，並進一步被劃分成其他分類單元。本圖沒有顯示較小的中間分類單元。

三域生物特色 编辑

主条目：三域系統
 细菌古菌真核生物产水菌属热袍菌属噬胞菌属拟杆菌属浮霉菌属蓝菌门变形菌门螺旋菌革兰氏阳性菌绿丝状菌热网菌属热变形菌属热球菌属甲烷球菌属甲烷杆菌属甲烷八叠球菌属适盐菌属内变形虫属黏液菌动物真菌植物纤毛虫鞭毛虫毛滴虫目微孢子虫门双滴虫目
基於16S 核糖體RNA序列的系統發生樹，顯示了可明顯區別的三支：細菌、古菌和真核生物

古菌 编辑

主条目：古菌

古菌屬於單細胞原核生物，外形類似細菌，但部分分子序列與代謝途徑與真核生物較相近，其細胞膜為醚酯（英语：Ether lipid）所組成，不同於另兩域生物細胞膜主要成分為酯類[參⁠ 2]。早期發現的古菌多為嗜極生物，後來漸發現古菌普遍存在各種環境中[參⁠ 3]。

細菌 编辑

主条目：細菌

細菌也屬於單細胞原核生物，其細胞膜為酯類組成，廣泛分布於不同環境中，外形、營養方式與生長環境都有很高的多樣性。細菌的大小一般為0.5-5微米，少數特例如纳米比亚嗜硫珠菌[參⁠ 4]與費氏刺骨魚菌（英语：Epulopiscium fishelsoni）可大至0.5毫米而能以肉眼觀察[參⁠ 5]，而小型者如黴漿菌僅有約0.3微米，與大型的病毒大小相仿[參⁠ 6]，甚至還有更小的超微細菌（英语：Ultramicrobacteria）[參⁠ 7]。

真核生物 编辑

主条目：真核生物

真核生物具有細胞核以及多種膜結構組成的內膜系統，包括動物、植物、真菌等[參⁠ 8]。2005年，國際原生生物學家協會（英语：International Society of Protistologists）將真核生物分為六个超类群（supergroups），包括後鞭毛生物、古蟲界、變形蟲界、囊泡藻界、有孔蟲界與原始色素體生物[參⁠ 9][參⁠ 10]，但隨即有學者質疑囊泡藻界並非單系群，並有後續研究將其拆分[參⁠ 11][參⁠ 12]。近年來持續有許多真核生物的分類理論被提出[參⁠ 13][參⁠ 14]。

分類 编辑

2002年，英國生物學家湯瑪斯·卡弗利爾-史密斯提出了新壁總域的概念，即古菌與真核生物共同組成一演化支，為細菌中放線菌門的姊妹群[參⁠ 15]。後續分子種系發生學的研究亦支持古菌與真核生物的親緣關係較與細菌的親緣關係近[參⁠ 16]。

其他分類系統 编辑

 
三域系統（上）與泉古菌假说（英语：Eocyte hypothesis）（下）

除了三域系統外，其他較常用的分類系統還包括：

參考資料 编辑

    參:

  1. ^ Woese C, Kandler O, Wheelis M. Towards a natural system of organisms: proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya.. Proc Natl Acad Sci USA. 1990, 87 (12): 4576–9 [11 February 2010]. Bibcode:1990PNAS...87.4576W. PMC 54159  . PMID 2112744. doi:10.1073/pnas.87.12.4576. （原始内容于2008-06-27）. 
  2. ^ De Rosa M, Gambacorta A, Gliozzi A. Structure, biosynthesis, and physicochemical properties of archaebacterial lipids. Microbiological Reviews. March 1986, 50 (1): 70–80 [2019-07-13]. PMC 373054  . PMID 3083222. （原始内容于2019-10-16）. 
  3. ^ DeLong EF. Everything in moderation: archaea as 'non-extremophiles'. Current Opinion in Genetics & Development. December 1998, 8 (6): 649–54. PMID 9914204. doi:10.1016/S0959-437X(98)80032-4. 
  4. ^ Schulz HN, Jorgensen BB. Big bacteria. Annual Review of Microbiology. 2001, 55: 105–37. PMID 11544351. doi:10.1146/annurev.micro.55.1.105. 
  5. ^ Williams C. Who are you calling simple?. New Scientist. 2011, 211 (2821): 38–41. doi:10.1016/S0262-4079(11)61709-0. 
  6. ^ Robertson J, Gomersall M, Gill P. Mycoplasma hominis: growth, reproduction, and isolation of small viable cells. Journal of Bacteriology. November 1975, 124 (2): 1007–18. PMC 235991  . PMID 1102522. 
  7. ^ Velimirov B. Nanobacteria, Ultramicrobacteria and Starvation Forms: A Search for the Smallest Metabolizing Bacterium. Microbes and Environments. 2001, 16 (2): 67–77. doi:10.1264/jsme2.2001.67. 
  8. ^ Woese C, Kandler O, Wheelis M. Towards a natural system of organisms: proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya.. Proc Natl Acad Sci USA. 1990, 87 (12): 4576–9 [11 February 2010]. Bibcode:1990PNAS...87.4576W. PMC 54159  . PMID 2112744. doi:10.1073/pnas.87.12.4576. （原始内容于2008-06-27）. 
  9. ^ Adl SM, Simpson AGB, Farmer MA, Andersen RA, Anderson OR, Barta JR, et al. The new higher-level classification of eukaryotes with emphasis on the taxonomy of protists. Journal of Eukaryotic Microbiology. 2005, 52 (5): 399–451. PMID 16248873. doi:10.1111/j.1550-7408.2005.00053.x. 
  10. ^ Holt, Jack R. and Carlos A. Iudica, (2010) "Taxa of Life." Retrieved 09-03-2011.
  11. ^ Harper, J. T.; Waanders, E. & Keeling, P. J. (PDF). Nt. J. System. Evol. Microbiol. 2005, 55 (Pt 1): 487–496 [2019-07-13]. PMID 15653923. doi:10.1099/ijs.0.63216-0. （原始内容 (PDF)存档于2011-05-11）. 
  12. ^ Parfrey, Laura W.; Barbero, Erika; Lasser, Elyse; Dunthorn, Micah; Bhattacharya, Debashish; Patterson, David J. & Katz, Laura A. Evaluating support for the current classification of eukaryotic diversity. PLoS Genetics. 2006, 2 (12): e220. PMC 1713255  . PMID 17194223. doi:10.1371/journal.pgen.0020220. 
  13. ^ Burki, Fabien; Shalchian-Tabrizi, Kamran; Minge, Marianne; Skjæveland, Åsmund; Nikolaev, Sergey I.; Jakobsen, Kjetill S. & Pawlowski, Jan. Butler, Geraldine , 编. Phylogenomics reshuffles the eukaryotic supergroups. PLoS ONE. 2007, 2 (8): e790. Bibcode:2007PLoSO...2..790B. PMC 1949142  . PMID 17726520. doi:10.1371/journal.pone.0000790. 
  14. ^ Kim, E.; Graham, L. E. & Redfield, Rosemary Jeanne. Redfield, Rosemary Jeanne , 编. EEF2 analysis challenges the monophyly of Archaeplastida and Chromalveolata. PLoS ONE. 2008, 3 (7): e2621. Bibcode:2008PLoSO...3.2621K. PMC 2440802  . PMID 18612431. doi:10.1371/journal.pone.0002621. 
  15. ^ Cavalier-Smith T. The phagotrophic origin of eukaryotes and phylogenetic classification of Protozoa. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. March 2002, 52 (Pt 2): 297–354 [2013-07-13]. PMID 11931142. （原始内容于2017-07-29）. 
  16. ^ Ciccarelli FD, Doerks T, von Mering C, Creevey CJ, Snel B, Bork P. (PDF). Science. 2006, 311 (5765): 1283–7 [2019-07-13]. Bibcode:2006Sci...311.1283C. PMID 16513982. doi:10.1126/science.1123061. （原始内容 (PDF)存档于2016-03-04）. 
  17. ^ Mayr, Ernst. Two empires or three?. Proc Natl Acad Sci USA. 1998, 95 (17): 9720–9723 [5 September 2011]. Bibcode:1998PNAS...95.9720 请检查|bibcode=值 (帮助). PMC 33883  . PMID 9707542. doi:10.1073/pnas.95.17.9720. （原始内容于2019-06-13）. 
  18. ^ Cavalier-Smith, T. Only six kingdoms of life (PDF). Proc. R. Soc. Lond. B. 2004, 271 (1545): 1251–62 [2010-04-29]. PMC 1691724  . PMID 15306349. doi:10.1098/rspb.2004.2705. （原始内容 (PDF)于2011-01-10）. 
  19. ^ Archibald, John M. The eocyte hypothesis and the origin of eukaryotic cells. PNAS. 23 December 2008, 105 (51): 20049–20050. Bibcode:2008PNAS..10520049A. PMC 2629348  . PMID 19091952. doi:10.1073/pnas.0811118106. 
  20. ^ Lake, James A.; Henderson, Eric; Oakes, Melanie; Clark, Michael W. Eocytes: A new ribosome structure indicates a kingdom with a close relationship to eukaryotes. PNAS. June 1984, 81 (12): 3786–3790. Bibcode:1984PNAS...81.3786L. PMC 345305  . PMID 6587394. doi:10.1073/pnas.81.12.3786. 
  21. ^ Nasir, Arshan; Kim, Kyung Mo; and Caetano-Anolles, Gustavo, "Giant viruses coexisted with the cellular ancestors and represent a distinct supergroup along with superkingdoms Archaea, Bacteria and Eukarya." BMC Evol Biol. 2012; 12: 156. Published online 2012 August 24. doi: 10.1186/1471-2148-12-156
  22. ^ Luketa S. New views on the megaclassification of life (PDF). Protistology. 2012, 7 (4): 218–237 [2019-07-13]. （原始内容 (PDF)于2015-04-02）. 
  23. ^ 中國大百科全書 生物學分冊

相關條目 编辑

十二月 15, 2023
生物, 生物分类学分类阶元域, 种二名法三域系統介於生物和非生物, 無生物, 之間的物體, 不屬於任何一分類界, 病毒細胞生物, 古菌域, 细菌域, 真核域, 真菌界, 原生生物界, 植物界, 动物界在生物分類學中, 英語, domain, empire, 拉丁語, regio, 或總界, superkingdom, 是美國生物學家卡爾, 沃斯1990年设计的三域系統中最高的分類單元, 該系統中, 生命之樹, 英语, tree, life, biology, 包含細菌, 古菌與真核生物等三個域, 其中前兩者為原核生. 生物分类学分类阶元域 界 门 纲 目 科 属 种二名法三域系統介於生物和非生物 無生物 之間的物體 不屬於任何一分類界 病毒細胞生物 古菌域 细菌域 真核域 真菌界 原生生物界 植物界 动物界在生物分類學中 域 英語 domain empire 拉丁語 regio 或總界 superkingdom 是美國生物學家卡爾 沃斯1990年设计的三域系統中最高的分類單元 該系統中 生命之樹 英语 Tree of life biology 包含細菌 古菌與真核生物等三個域 其中前兩者為原核生物 不具有細胞核 後者則具有細胞核和内膜系统包裹的细胞器 參 1 生物分類法上八個主要的分類單元 生物被分成三個域 並進一步被劃分成其他分類單元 本圖沒有顯示較小的中間分類單元 目录 1 三域生物特色 1 1 古菌 1 2 細菌 1 3 真核生物 2 分類 3 其他分類系統 4 參考資料 5 相關條目三域生物特色 编辑主条目 三域系統 nbsp 基於16S 核糖體RNA序列的系統發生樹 顯示了可明顯區別的三支 細菌 古菌和真核生物古菌 编辑 主条目 古菌 古菌屬於單細胞原核生物 外形類似細菌 但部分分子序列與代謝途徑與真核生物較相近 其細胞膜為醚酯 英语 Ether lipid 所組成 不同於另兩域生物細胞膜主要成分為酯類 參 2 早期發現的古菌多為嗜極生物 後來漸發現古菌普遍存在各種環境中 參 3 細菌 编辑 主条目 細菌 細菌也屬於單細胞原核生物 其細胞膜為酯類組成 廣泛分布於不同環境中 外形 營養方式與生長環境都有很高的多樣性 細菌的大小一般為0 5 5微米 少數特例如纳米比亚嗜硫珠菌 參 4 與費氏刺骨魚菌 英语 Epulopiscium fishelsoni 可大至0 5毫米而能以肉眼觀察 參 5 而小型者如黴漿菌僅有約0 3微米 與大型的病毒大小相仿 參 6 甚至還有更小的超微細菌 英语 Ultramicrobacteria 參 7 真核生物 编辑 主条目 真核生物 真核生物具有細胞核以及多種膜結構組成的內膜系統 包括動物 植物 真菌等 參 8 2005年 國際原生生物學家協會 英语 International Society of Protistologists 將真核生物分為六个超类群 supergroups 包括後鞭毛生物 古蟲界 變形蟲界 囊泡藻界 有孔蟲界與原始色素體生物 參 9 參 10 但隨即有學者質疑囊泡藻界並非單系群 並有後續研究將其拆分 參 11 參 12 近年來持續有許多真核生物的分類理論被提出 參 13 參 14 分類 编辑2002年 英國生物學家湯瑪斯 卡弗利爾 史密斯提出了新壁總域的概念 即古菌與真核生物共同組成一演化支 為細菌中放線菌門的姊妹群 參 15 後續分子種系發生學的研究亦支持古菌與真核生物的親緣關係較與細菌的親緣關係近 參 16 其他分類系統 编辑 nbsp 三域系統 上 與泉古菌假说 英语 Eocyte hypothesis 下 除了三域系統外 其他較常用的分類系統還包括 兩域系統 英语 Two empire system 將生物分成原核生物與真核生物兩群 其中原核生物域有真細菌界和古細菌界 真核生物域有原生生物界 菌物界 植物界和動物界 參 17 參 18 泉古菌假说 英语 Eocyte hypothesis 將生物分成兩域 古菌與真核生物共組成一域 由美國生物學家詹姆斯 A 雷克 英语 James A Lake 於1984年提出 參 19 參 20 三域系統中並未包含病毒 2011年 有學者認為核质巨DNA病毒可能是生物分類的第四個域 此觀點進一步在2012年獲得支持 參 21 同年 塞爾維亞生物學家史蒂芬 盧基塔 Stefan Luketa 提出了五域的分類系統 在三域之外加入病毒 無細胞但有核酸的生命體 與普里昂蛋白 無細胞與核酸的生命體 兩域 參 22 在中國大百科全書引用過中國生物學界的另一種三域系統 把病毒等列生物和成立專屬的總界 稱為無細胞結構總界 與多細胞生物 包括動物 植物 真菌 和單細胞生物 包括原生生物和原核生物 各成為一個總界共有三個總界 域 和六個界別 參 23 參考資料 编辑參 Woese C Kandler O Wheelis M Towards a natural system of organisms proposal for the domains Archaea Bacteria and Eucarya Proc Natl Acad Sci USA 1990 87 12 4576 9 11 February 2010 Bibcode 1990PNAS 87 4576W PMC 54159 nbsp PMID 2112744 doi 10 1073 pnas 87 12 4576 原始内容存档于2008 06 27 De Rosa M Gambacorta A Gliozzi A Structure biosynthesis and physicochemical properties of archaebacterial lipids Microbiological Reviews March 1986 50 1 70 80 2019 07 13 PMC 373054 nbsp PMID 3083222 原始内容存档于2019 10 16 DeLong EF Everything in moderation archaea as non extremophiles Current Opinion in Genetics amp Development December 1998 8 6 649 54 PMID 9914204 doi 10 1016 S0959 437X 98 80032 4 Schulz HN Jorgensen BB Big bacteria Annual Review of Microbiology 2001 55 105 37 PMID 11544351 doi 10 1146 annurev micro 55 1 105 Williams C Who are you calling simple New Scientist 2011 211 2821 38 41 doi 10 1016 S0262 4079 11 61709 0 Robertson J Gomersall M Gill P Mycoplasma hominis growth reproduction and isolation of small viable cells Journal of Bacteriology November 1975 124 2 1007 18 PMC 235991 nbsp PMID 1102522 Velimirov B Nanobacteria Ultramicrobacteria and Starvation Forms A Search for the Smallest Metabolizing Bacterium Microbes and Environments 2001 16 2 67 77 doi 10 1264 jsme2 2001 67 Woese C Kandler O Wheelis M Towards a natural system of organisms proposal for the domains Archaea Bacteria and Eucarya Proc Natl Acad Sci USA 1990 87 12 4576 9 11 February 2010 Bibcode 1990PNAS 87 4576W PMC 54159 nbsp PMID 2112744 doi 10 1073 pnas 87 12 4576 原始内容存档于2008 06 27 Adl SM Simpson AGB Farmer MA Andersen RA Anderson OR Barta JR et al The new higher level classification of eukaryotes with emphasis on the taxonomy of protists Journal of Eukaryotic Microbiology 2005 52 5 399 451 PMID 16248873 doi 10 1111 j 1550 7408 2005 00053 x Holt Jack R and Carlos A Iudica 2010 Taxa of Life Retrieved 09 03 2011 Harper J T Waanders E amp Keeling P J On the monophyly of chromalveolates using a six protein phylogeny of eukaryotes PDF Nt J System Evol Microbiol 2005 55 Pt 1 487 496 2019 07 13 PMID 15653923 doi 10 1099 ijs 0 63216 0 原始内容 PDF 存档于2011 05 11 Parfrey Laura W Barbero Erika Lasser Elyse Dunthorn Micah Bhattacharya Debashish Patterson David J amp Katz Laura A Evaluating support for the current classification of eukaryotic diversity PLoS Genetics 2006 2 12 e220 PMC 1713255 nbsp PMID 17194223 doi 10 1371 journal pgen 0020220 Burki Fabien Shalchian Tabrizi Kamran Minge Marianne Skjaeveland Asmund Nikolaev Sergey I Jakobsen Kjetill S amp Pawlowski Jan Butler Geraldine 编 Phylogenomics reshuffles the eukaryotic supergroups PLoS ONE 2007 2 8 e790 Bibcode 2007PLoSO 2 790B PMC 1949142 nbsp PMID 17726520 doi 10 1371 journal pone 0000790 Kim E Graham L E amp Redfield Rosemary Jeanne Redfield Rosemary Jeanne 编 EEF2 analysis challenges the monophyly of Archaeplastida and Chromalveolata PLoS ONE 2008 3 7 e2621 Bibcode 2008PLoSO 3 2621K PMC 2440802 nbsp PMID 18612431 doi 10 1371 journal pone 0002621 Cavalier Smith T The phagotrophic origin of eukaryotes and phylogenetic classification of Protozoa Int J Syst Evol Microbiol March 2002 52 Pt 2 297 354 2013 07 13 PMID 11931142 原始内容存档于2017 07 29 Ciccarelli FD Doerks T von Mering C Creevey CJ Snel B Bork P Toward automatic reconstruction of a highly resolved tree of life PDF Science 2006 311 5765 1283 7 2019 07 13 Bibcode 2006Sci 311 1283C PMID 16513982 doi 10 1126 science 1123061 原始内容 PDF 存档于2016 03 04 Mayr Ernst Two empires or three Proc Natl Acad Sci USA 1998 95 17 9720 9723 5 September 2011 Bibcode 1998PNAS 95 9720 请检查 bibcode 值 帮助 PMC 33883 nbsp PMID 9707542 doi 10 1073 pnas 95 17 9720 原始内容存档于2019 06 13 Cavalier Smith T Only six kingdoms of life PDF Proc R Soc Lond B 2004 271 1545 1251 62 2010 04 29 PMC 1691724 nbsp PMID 15306349 doi 10 1098 rspb 2004 2705 原始内容存档 PDF 于2011 01 10 Archibald John M The eocyte hypothesis and the origin of eukaryotic cells PNAS 23 December 2008 105 51 20049 20050 Bibcode 2008PNAS 10520049A PMC 2629348 nbsp PMID 19091952 doi 10 1073 pnas 0811118106 Lake James A Henderson Eric Oakes Melanie Clark Michael W Eocytes A new ribosome structure indicates a kingdom with a close relationship to eukaryotes PNAS June 1984 81 12 3786 3790 Bibcode 1984PNAS 81 3786L PMC 345305 nbsp PMID 6587394 doi 10 1073 pnas 81 12 3786 Nasir Arshan Kim Kyung Mo and Caetano Anolles Gustavo Giant viruses coexisted with the cellular ancestors and represent a distinct supergroup along with superkingdoms Archaea Bacteria and Eukarya BMC Evol Biol 2012 12 156 Published online 2012 August 24 doi 10 1186 1471 2148 12 156 Luketa S New views on the megaclassification of life PDF Protistology 2012 7 4 218 237 2019 07 13 原始内容存档 PDF 于2015 04 02 中國大百科全書 生物學分冊相關條目 编辑生物分類學 親緣關係學 系統分類學 取自 https zh wikipedia org w index php title 域 生物 amp oldid 78664994, 维基百科，wiki，书籍，书籍，图书馆，

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