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穹窿体

十二月 30, 2023

穹窿体是一种存在于真核细胞中的细胞器，也是一种核糖核蛋白分子。该细胞器的功能尚不明晰。

穹窿体主蛋白
大鼠肝脏细胞中提取的穹窿体复合物。[1]
鑑定
標誌穹窿体
PfamPF01505（旧版）
InterPro（英语：InterPro）IPR002499
PROSITE（英语：PROSITE）PDOC51224
現有可用的蛋白結構：
Pfam結構（旧版） / ECOD
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum（英语：PDBsum）結構概要
PDB2ZUO 2ZV4 2ZV5

通过电子显微镜可观察到穹窿体呈对称的穹窿状，各侧皆具有39褶结构。[1]穹窿体出现在各种真核细胞并表现出高度的保守性。[2]穹窿体一般悬浮于细胞质基质中，但也可以成在参与对抗病原体时成为脂质筏的一部分。[3]

历史 编辑

穹窿体于20世纪80年代被洛杉矶加利福尼亚大学药学院的生物学家Nancy Kedersha及生物化学家Leonard Rome首次发现并成功分离。

形态学研究 编辑

穹窿体与核糖体一样，是大型核糖核蛋白分子（核糖核酸-蛋白质复合物），但穹窿体的相对分子质量约为13MDa，约为核糖体的3倍。

通过不同方式测得的穹窿体的大小有一定差异[4]：

由于穹窿体的主要成分为蛋白质，所以利用传统技术对其进行染色有一定困难。

穹窿体的蛋白质呈对称的桶状，两侧有等量的穹窿体主蛋白（Major Vault Protein，MVP）结合在一个穹窿体少数蛋白（minor vault protein）上。两个总共包含96个穹窿体主蛋白及16个长度约为86–141bp穹窿体RNA（vault RNA，vRNA）的部分[5]结合后，最终形成完整的穹窿体。

功能 编辑

虽然穹窿体仍未被完全了解，但科研人员已发现其功能与核孔复合物的功能之间具有一定联系，这两种不同分子都呈八边形这一事实也支持该观点。[6]已有结论说明穹窿体像核孔复合物一样，是被用于将如mRNA一类的大分子从细胞核中运输到细胞质中。[7]另有观点认为穹窿体在蛋白质生物合成也发挥了一定作用。[8]

与癌症的关联 编辑

在20世纪90年代末，研究人员发现穹窿体（尤其是其中的穹窿体主蛋白）在被诊断出多药耐药（multidrug resistance）的癌症患者的细胞中有过度表达的倾向，所以有观点认为穹窿体会阻断多种化疗手段。[9]虽然上述现象并不能说明是穹窿体数量的增加直接导致癌细胞耐药，但它仍暗示了癌症与穹窿体在某些方面可能存在的关联。该发现为对癌细胞耐药机制的研究及抗癌药物的寻找提供了重要线索。[10]

进化中的保守性 编辑

穹窿体已在哺乳类动物、两栖类动物、鸟类动物及盘基网柄菌（Dictyostelium discoideum）等生物的细胞中发现并分离。[2]同源蛋白家族数据库（Pfam database）已识别出穹窿体在第四双小核草履虫（Paramecium tetraurelia）、动质体、众多脊椎动物、剌胞动物（星海葵）、软体动物、丝盘虫（Trichoplax adhaerens）、扁形虫细粒棘球蚴（Echinococcus granulosus）及领鞭毛虫细胞中的同源物。[11]

虽然穹窿体已被在多种真核细胞中发现，但下列几个真核生物物种不含有组装穹窿体所需的蛋白质：[12]

这4个物种分别是植物、线虫、动物和真菌的模式生物。除了这4个例外，穹窿体在其他物种中的高度相似性喑示着该细胞器在进化过程中的某种重要性。[2]

参考文献 编辑

  1. ^ 1.0 1.1 Tanaka H, Kato K, Yamashita E; et al. The structure of rat liver vault at 3.5 angstrom resolution. Science. January 2009, 323 (5912): 384–8. PMID 19150846. doi:10.1126/science.1164975. 
  2. ^ 2.0 2.1 2.2 Kedersha NL, Miquel MC, Bittner D, Rome LH. Vaults. II. Ribonucleoprotein structures are highly conserved among higher and lower eukaryotes.. J Cell Biol. 1990, 110 (4): 895–901. PMC 2116106  . PMID 1691193. doi:10.1083/jcb.110.4.895. 
  3. ^ Tanaka H, Kato K, Yamashita E; et al. The structure of rat liver vault at 3.5 angstrom resolution. Science. January 2009, 323 (5912): 384–8. PMID 19150846. doi:10.1126/science.1164975. 
  4. ^ Kedersha N. L., Heuser J. E., Chugani D. C., Rome L. H. Vaults. III. Vault ribonucleoprotein particles open into flower-like structures with octagonal symmetry. J. Cell Biol. 1991, 112 (2): 225–235. PMC 2288824  . PMID 1988458. doi:10.1083/jcb.112.2.225. 
  5. ^ van Zon A, Mossink MH, Scheper RJ, Sonneveld P, Wiemer EA. The vault complex. Cell. Mol. Life Sci. September 2003, 60 (9): 1828–37. PMID 14523546. doi:10.1007/s00018-003-3030-y. 
  6. ^ Unwin P. N. T., Milligan R. A. A large particle associated with the perimeter of the nuclear pore complex. J. Cell Biol. 1982, 93 (1): 63–75. PMC 2112107  . PMID 7068761. doi:10.1083/jcb.93.1.63. 
  7. ^ Chugani DC, Rome LH, Kedersha NL. Evidence that vault ribonucleoprotein particles localize to the nuclear pore complex. J. Cell. Sci. September 1993, 106: 23–9. PMID 8270627. 
  8. ^ Cannon, Joseph N.; Stanfield, Cindy L; Niles, Mary Jane; Germann, William J. Principles of human physiology 3rd. San Francisco: Pearson/Benjamin Cummings. 2007: 41. ISBN 978-0-8053-8286-0. 
  9. ^ Mossink MH, van Zon A, Scheper RJ, Sonneveld P, Wiemer EA. Vaults: a ribonucleoprotein particle involved in drug resistance?. Oncogene. October 2003, 22 (47): 7458–67. PMID 14576851. doi:10.1038/sj.onc.1206947. 
  10. ^ Kickhoefer VA, Vasu SK, Rome LH. Vaults are the answer, what is the question?. Trends Cell Biol. May 1996, 6 (5): 174–8. PMID 15157468. doi:10.1016/0962-8924(96)10014-3. 
  11. ^ http://pfam.sanger.ac.uk/family/PF01505 （页面存档备份，存于互联网档案馆） 穹窿体主蛋白重复同源蛋白质家族
  12. ^ Rome L, Kedersha N, Chugani D. Unlocking vaults: organelles in search of a function.. Trends Cell Biol. 1991, 1 (2-3): 47–50. PMID 14731565. doi:10.1016/0962-8924(91)90088-Q. 

外部链接 编辑

参见 编辑

  • 穹窿体主蛋白（英语：Major vault protein）
  • 穹窿体RNA

十二月 30, 2023
穹窿体, 是一种存在于真核细胞中的细胞器, 也是一种核糖核蛋白分子, 该细胞器的功能尚不明晰, 主蛋白大鼠肝脏细胞中提取的复合物, 鑑定標誌pfampf01505, 旧版, interpro, 英语, interpro, ipr002499prosite, 英语, prosite, pdoc51224現有可用的蛋白結構, pfam結構, 旧版, ecodpdbrcsb, pdbe, pdbjpdbsum, 英语, pdbsum, 結構概要pdb2zuo, 2zv4, 2zv5通过电子显微镜可观察到呈对称的穹窿状, . 穹窿体是一种存在于真核细胞中的细胞器 也是一种核糖核蛋白分子 该细胞器的功能尚不明晰 穹窿体主蛋白大鼠肝脏细胞中提取的穹窿体复合物 1 鑑定標誌穹窿体PfamPF01505 旧版 InterPro 英语 InterPro IPR002499PROSITE 英语 PROSITE PDOC51224現有可用的蛋白結構 Pfam結構 旧版 ECODPDBRCSB PDB PDBe PDBjPDBsum 英语 PDBsum 結構概要PDB2ZUO 2ZV4 2ZV5通过电子显微镜可观察到穹窿体呈对称的穹窿状 各侧皆具有39褶结构 1 穹窿体出现在各种真核细胞并表现出高度的保守性 2 穹窿体一般悬浮于细胞质基质中 但也可以成在参与对抗病原体时成为脂质筏的一部分 3 目录 1 历史 2 形态学研究 3 功能 4 与癌症的关联 5 进化中的保守性 6 参考文献 7 外部链接 8 参见历史 编辑穹窿体于20世纪80年代被洛杉矶加利福尼亚大学药学院的生物学家Nancy Kedersha及生物化学家Leonard Rome首次发现并成功分离 形态学研究 编辑穹窿体与核糖体一样 是大型核糖核蛋白分子 核糖核酸 蛋白质复合物 但穹窿体的相对分子质量约为13MDa 约为核糖体的3倍 通过不同方式测得的穹窿体的大小有一定差异 4 利用负染色法测得的大小约为34nm 60nm 利用低温电子显微镜测得的大小约为26nm 49nm 利用扫描隧道电子显微镜测得的大小约为35nm 59nm 由于穹窿体的主要成分为蛋白质 所以利用传统技术对其进行染色有一定困难 穹窿体的蛋白质呈对称的桶状 两侧有等量的穹窿体主蛋白 Major Vault Protein MVP 结合在一个穹窿体少数蛋白 minor vault protein 上 两个总共包含96个穹窿体主蛋白及16个长度约为86 141bp穹窿体RNA vault RNA vRNA 的部分 5 结合后 最终形成完整的穹窿体 功能 编辑虽然穹窿体仍未被完全了解 但科研人员已发现其功能与核孔复合物的功能之间具有一定联系 这两种不同分子都呈八边形这一事实也支持该观点 6 已有结论说明穹窿体像核孔复合物一样 是被用于将如mRNA一类的大分子从细胞核中运输到细胞质中 7 另有观点认为穹窿体在蛋白质生物合成也发挥了一定作用 8 与癌症的关联 编辑在20世纪90年代末 研究人员发现穹窿体 尤其是其中的穹窿体主蛋白 在被诊断出多药耐药 multidrug resistance 的癌症患者的细胞中有过度表达的倾向 所以有观点认为穹窿体会阻断多种化疗手段 9 虽然上述现象并不能说明是穹窿体数量的增加直接导致癌细胞耐药 但它仍暗示了癌症与穹窿体在某些方面可能存在的关联 该发现为对癌细胞耐药机制的研究及抗癌药物的寻找提供了重要线索 10 进化中的保守性 编辑穹窿体已在哺乳类动物 两栖类动物 鸟类动物及盘基网柄菌 Dictyostelium discoideum 等生物的细胞中发现并分离 2 同源蛋白家族数据库 Pfam database 已识别出穹窿体在第四双小核草履虫 Paramecium tetraurelia 动质体 众多脊椎动物 剌胞动物 星海葵 软体动物 丝盘虫 Trichoplax adhaerens 扁形虫细粒棘球蚴 Echinococcus granulosus 及领鞭毛虫细胞中的同源物 11 虽然穹窿体已被在多种真核细胞中发现 但下列几个真核生物物种不含有组装穹窿体所需的蛋白质 12 拟南芥 Arabidopsis thaliana 秀丽隐杆线虫 Caenorhabditis elegans 黑腹果蝇 Drosophila melanogaster 酿酒酵母 Saccharomyces cerevisiae 这4个物种分别是植物 线虫 动物和真菌的模式生物 除了这4个例外 穹窿体在其他物种中的高度相似性喑示着该细胞器在进化过程中的某种重要性 2 参考文献 编辑 1 0 1 1 Tanaka H Kato K Yamashita E et al The structure of rat liver vault at 3 5 angstrom resolution Science January 2009 323 5912 384 8 PMID 19150846 doi 10 1126 science 1164975 引文格式1维护 显式使用等标签 link 2 0 2 1 2 2 Kedersha NL Miquel MC Bittner D Rome LH Vaults II Ribonucleoprotein structures are highly conserved among higher and lower eukaryotes J Cell Biol 1990 110 4 895 901 PMC 2116106 nbsp PMID 1691193 doi 10 1083 jcb 110 4 895 Tanaka H Kato K Yamashita E et al The structure of rat liver vault at 3 5 angstrom resolution Science January 2009 323 5912 384 8 PMID 19150846 doi 10 1126 science 1164975 引文格式1维护 显式使用等标签 link Kedersha N L Heuser J E Chugani D C Rome L H Vaults III Vault ribonucleoprotein particles open into flower like structures with octagonal symmetry J Cell Biol 1991 112 2 225 235 PMC 2288824 nbsp PMID 1988458 doi 10 1083 jcb 112 2 225 van Zon A Mossink MH Scheper RJ Sonneveld P Wiemer EA The vault complex Cell Mol Life Sci September 2003 60 9 1828 37 PMID 14523546 doi 10 1007 s00018 003 3030 y Unwin P N T Milligan R A A large particle associated with the perimeter of the nuclear pore complex J Cell Biol 1982 93 1 63 75 PMC 2112107 nbsp PMID 7068761 doi 10 1083 jcb 93 1 63 Chugani DC Rome LH Kedersha NL Evidence that vault ribonucleoprotein particles localize to the nuclear pore complex J Cell Sci September 1993 106 23 9 PMID 8270627 Cannon Joseph N Stanfield Cindy L Niles Mary Jane Germann William J Principles of human physiology 3rd San Francisco Pearson Benjamin Cummings 2007 41 ISBN 978 0 8053 8286 0 Mossink MH van Zon A Scheper RJ Sonneveld P Wiemer EA Vaults a ribonucleoprotein particle involved in drug resistance Oncogene October 2003 22 47 7458 67 PMID 14576851 doi 10 1038 sj onc 1206947 Kickhoefer VA Vasu SK Rome LH Vaults are the answer what is the question Trends Cell Biol May 1996 6 5 174 8 PMID 15157468 doi 10 1016 0962 8924 96 10014 3 http pfam sanger ac uk family PF01505 页面存档备份 存于互联网档案馆 穹窿体主蛋白重复同源蛋白质家族 Rome L Kedersha N Chugani D Unlocking vaults organelles in search of a function Trends Cell Biol 1991 1 2 3 47 50 PMID 14731565 doi 10 1016 0962 8924 91 90088 Q 外部链接 编辑Vault website UCLA 页面存档备份 存于互联网档案馆 醫學主題詞表 MeSH Vault Ribonucleoprotein Particles Vault RNA的Rfam页面参见 编辑 nbsp 分子与细胞生物学主题 穹窿体主蛋白 英语 Major vault protein 穹窿体RNA 取自 https zh wikipedia org w index php title 穹窿体 amp oldid 78972787, 维基百科，wiki，书籍，书籍，图书馆，

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