fbpx
维基百科

外切體複合物

四月 01, 2023

此条目的主題是一種與RNA代謝有關的蛋白質複合物。关于一種英語名稱同為exosome的囊泡，請見「外吐小體」。

外切体复合物（英語：exosome complex，或PM/Scl complex，上下文意思清楚时，可以直接称為exosome），简称外切酶体、外切体，是一种蛋白质复合物，能够降解各种不同的核糖核酸（RNA）。由于复合物表现为核糖核酸外切酶活性，所以被命名为外切体。外切体复合物只存在于真核细胞和古菌中；而细菌中则对应有组成和结构更为简单的“降解体”复合物来发挥类似的功能。

人源外切体复合物结构的飘带图，图例见#亚基列表。

外切体的核心是一个由六个亚基组成的环状结构，外围的亚基都结合在这一环状结构上。在真核细胞中，这一核心存在于细胞质和细胞核（特别是核仁）等细胞区室中；在不同的区室中，与之结合的蛋白质也不尽相同，从而可以调控外切体的活性以特异性地降解特定区室的RNA底物。外切体的底物包括信使RNA（mRNA）、核糖体RNA（rRNA）以及多种非编码RNA。外切体具有核糖核酸外切酶功能，也就意味着它可以从RNA的一端（3'端）开始降解作用，而不是从特定位点开始剪切RNA。

虽然没有已知疾病与外切体直接相关，但复合物中的多个蛋白亚基是一些特定自體免疫性疾病（特别是“硬化性肌炎”（Scleromyositis））病人自身抗体的靶标，也是治疗癌症的一些抗代谢化学疗法（能够阻断外切体的活性）的靶标。

发现

第一个外切体的发现是来自于对模式生物酿酒酵母的研究：1997年外切体首次在酿酒酵母中被发现，并被鉴定为一种核糖核酸酶。[1]两年之后，研究者发现外切体也存在于人体细胞中，实际上就是多年前发现的存在于特定自體免疫性疾病病人体内的一种被称为“PM/Scl复合物”的自身抗原，具体见#疾病一节。[2]对“PM/Scl复合物”的纯化使得越来越多的人源外切体亚基蛋白被发现，直到最后所有形成这一复合物的组分都得到鉴定。[3][4]2001年，日益增长的基因组数据使得对古菌中外切体蛋白的预测成为可能；[5]但直到2003年，来自古菌的外切体复合物才首次被纯化出来，从而确定了外切体在古菌中的存在。[6]

结构

核心蛋白

 
人源外切体复合物的晶体结构的球形填充图，上下图的视角分别为结构顶部和侧面。图例见#亚基列表。

外切体复合物的核心是一个由六个蛋白亚基所组成的一个环状结构，这六个蛋白质都属于同一类核糖核酸酶（核糖核酸酶PH类似蛋白，含有PH结构域）。[7]在古菌中，这六个蛋白亚基实际上为两种不同的PH类似蛋白（分别为Rrp41和Rrp42）重复出现三次而来。真核生物中的外切体的核心环结构则由六种不同的蛋白质构成；[8][9]在这六个蛋白质中，其中三个与古菌的Rrp41蛋白相似，另外三个则与 Rrp42蛋白相似。[10]

结合在核心环状结构顶部的三个蛋白质都含有S1结构域（一种RNA结合结构域），其中两个蛋白质还含有KH结构域（K-homology domain，同样可以结合RNA）。[7]在真核生物中，含S1结构域的三个蛋白质都各不相同；而在古菌中，这三个蛋白质是相同的或至少其中有两个是相同的。[11]

 
古菌（左图）和真核生物（右图）外切体复合物的亚基组装图。不同的亚基蛋白用不同数字表示，可以看出虽然整体结构相似，但古菌外切体只含有4种亚基，而真核生物外切体则含有9种不同亚基。图例见#亚基列表。

相似的环状结构也存在于核糖核酸酶PH和多核苷酸磷酸化酶（PNPase）中。细菌中的核糖核酸酶PH，参与tRNA的处理，同样可以形成一个由六个相同的核糖核酸酶PH蛋白组成的六元环复合物。[12][13]以多核苷酸磷酸化酶为例，它是一种能够降解磷酸化的RNA的蛋白质，存在于细菌和一些真核生物的叶绿体和线粒体中，它的结构中既含有两个PH结构域又含有一个S1结构域和一个KH结构域；多核苷酸磷酸化酶可以形成同源三聚体复合物，其构象与外切体的环状结构非常相似。[14]因为在结构域组成和结构上的相似性，外切体和这两个复合物被认为在进化上有联系，可能具有共同祖先。[15]外切体的核糖核酸酶PH类似蛋白、核糖核酸酶PH以及多核苷酸磷酸化酶都属于核糖核酸酶PH蛋白家族，为磷酸解核酸外切酶（使用磷酸盐作为亲核攻击分子来从RNA分子的3'端去除核苷酸）。[7]

外围蛋白

除了九个核心蛋白之外，真核生物的外切体中还往往包含两个能够与核心结合的蛋白质。其中之一是Rrp44蛋白，一种水解核糖核酸酶，属于核糖核酸酶R水解核酸外切酶（利用水分子来剪切核苷键）蛋白家族。在酵母中，Rrp44可以和“所有”的外切体复合物结合，并且对于酵母外切体的活性的发挥起着关键作用。[16]值得一提的是，虽然人体中也存在Rrp44的同源蛋白，但目前没有证据显示这一同源蛋白可以与人源外切体复合物结合。[7]

 
酵母外切体亚基Rrp6局部结构的飘带图。α螺旋和β折叠分别用红色和黄色来显示。

第二个常见的结合蛋白质是Rrp6（酵母中）或PM/Scl-100（人体中）。与Rrp44相似，这一蛋白质也是水解核糖核酸外切酶，但它属于核糖核酸酶D蛋白家族。[17]PM/Scl-100蛋白在细胞核中的外切体复合物中最为常见，但也可以参与形成细胞质中的外切体复合物。[18]

调节蛋白

在这两个能够与核心紧密结合的亚基之外，还有许多蛋白质可以与外切体复合物在细胞核内或核外相互作用。这些较松散结合的蛋白质可能可以调控外切体的活性和特异性。在细胞质中，外切体可以与AU富含元素（AU rich element）结合蛋白（如KRSP和TTP，它们可以促进或阻碍mRNA的降解）相互作用；而细胞核中的外切体可以与控制核糖体RNA处理的RNA结合蛋白（如人体中的MPP6以及人和酵母中的Rrp47/C1D）相互结合。[7]

除了单个蛋白质以外，还有一些蛋白质复合物可以与外切体相互作用。其中之一便是细胞质中的Ski复合物，Ski复合物中包含了一个RNA螺旋酶（Ski2）并参与了RNA的降解。[19]在细胞核中，外切体对rRNA和小核仁RNA的降解是在TRAMP复合物（同时具有RNA螺旋酶和多聚腺苷酸化活性）的介导下进行的。[20]

功能

催化作用

 
RNA的3'端水解和磷酸解的反应简图。

如前所述，外切体复合物中的多个蛋白亚基都含有核糖核酸酶结构域。这些结构域都属于3'-5'的核糖核酸外切酶结构域，也就是说含有这些结构域的蛋白质（酶）是从RNA分子的3'端开始对其进行降解。外切体中含有磷酸解的外切酶（核糖核酸酶PH类似蛋白），在真核生物中还含有水解型外切酶（核糖核酸酶R和核糖核酸酶D结构域蛋白）。磷酸解型酶利用无机磷酸根来剪切磷酸双酯键，并生成二磷酸核苷酸；而水解型酶则利用水分子来水解磷酸双酯键，并释放单磷酸核苷酸。

在古菌中，外切体复合物中的Rrp41亚基属于磷酸解的外切酶。核心环中的三个Rrp41亚基负责发挥复合物的酶解活性。[9]在真核生物中，外切体中的核糖核酸酶PH亚基都没有保留催化活性，因此其所组成的核心环没有酶活性。[21]在酵母中，外切体的核糖核酸酶活性主要是由外周蛋白亚基Rrp44（水解型外切酶）来发挥，[22]但这一特定亚基只被发现存在于酵母，目前并没有在人或古菌的外切体复合物中找到其同源蛋白。[21][23]此外，在人和酵母中都存在另一个可以与外切体结合的水解型外切酶（Rrp6），它是人源外切体中的活性来源，对酵母外切体的活性也有贡献。含S1结构域的蛋白亚基原本被认为也具有外切酶活性，但最近的研究结果对这一看法提出质疑，并认为其作用可能只是结合底物以利于外切体对底物的降解。[22]

 
古菌、酵母和人的外切体复合物的结构简图。标以彩色和星号的亚基在复合物中具有催化活性。图例见#亚基列表。

底物

 
古菌外切体的两个核心亚基（Rrp41和Rrp42）与小RNA分子（红色）结合。

外切体参与降解和处理大量各种不同的RNA底物。在细胞质中，它参与mRNA分子的更新：外切体复合物可以通过与无义介导的降解或无终止降解通路中的蛋白质相互作用来降解被标记需要进行降解的mRNA分子（包含了错误信息的mRNA）。另外，mRNA的正常更新过程也需要外切体参与的降解过程。多个蛋白质可以通过结合到与外切体复合物结合的mRNA的3'端AU富含元素上来使mRNA稳定或不稳定。[24][25][26]在细胞核中，外切体对于多种小核RNA分子的正确处理是必不可少的。[27]核仁是外切体复合物的主要聚集区域。在核仁中，外切体参与了对5.8S核糖体RNA（外切体的第一个被发现的功能）和数种小核RNA的处理。[1][27][28]

虽然大多数的细胞都含有其他可以降解RNA的酶，可以从无论是3'还是5'端对RNA进行降解，但外切体复合物对细胞的存活依然必不可少。如果外切体中的蛋白质的表达被人为（例如通过RNA干扰）降低或停止，细胞就会停止生长并逐渐死亡。外切体复合物的核心蛋白以及两个主要的结合蛋白是细胞中的必要蛋白质。[29]细菌中不含有外切体复合物，相似的功能是由一个更简单的复合物──降解体来执行。[30]

疾病

自體免疫

外切体复合物是获患自體免疫性疾病病人的自身抗体的靶标。这些自身抗体被发现主要存在于患有PM/Scl重叠综合征（英语：PM/Scl overlap syndrome）（一种自體免疫性疾病，同时具有硬皮病和多发性肌炎病征）的病人体内。[31]自身抗体可以用病人的血清通过多种检验方法获得检测。过去最为常用的检测方法是采用双向免疫扩散法（使用小牛胸腺提取物）、免疫荧光（对HEp-2细胞）或免疫共沉淀（来自人体细胞的提取物）。在免疫共沉淀分析中，用抗外切体为阳性的血清，可以沉淀出一系列不同的蛋白质（即外切体复合物中的各个蛋白亚基），在外切体复合物被发现之前，它们被称为“PM/Scl复合物”。[32]用来自病人的血清进行免疫荧光分析，可以看到细胞的核仁被特定染色，表明被自身抗体所是别的抗原可能在核糖体的合成中发挥重要作用。[33]最近，重组的外切体蛋白已经可以被合成并用于在线免疫分析法（line immunoassay）和酶联免疫吸附法（ELISA）中来检测这些自身抗体。[7]

在这些疾病中，抗体主要是直接识别外切体复合物中的两个蛋白亚基，PM/Scl-100（核糖核酸酶D类似蛋白）和PM/Scl-75（核心环中核糖核酸酶PH类似蛋白之一），识别这两个蛋白质的抗体被发现存在于近30%患有PM/Scl重叠综合征的患者体内。[34]除了这两个主要的自身抗体的靶蛋白外，其他的外切体亚基和结合蛋白（如C1D）也可以被病人体内的自身抗体识别。[35][36]检测这些抗体最灵敏的方法是在ELISA中用一段来自PM/Scl-100蛋白上的肽段来代替整个PM/Scl-100蛋白作为抗原。采用这一方法已经在高达55%的PM/Scl重叠综合征病人体内发现相应的自身抗体，但这些抗体在其他只患有硬皮病、多发性肌炎或皮肌炎的病人体内也能被检测到。[37]

由于这些自身抗体主要发现于具有多种不同的自體免疫疾病病征的病人体内，这些病人的临床症状可能会具有很大差异。最常见的症状往往是单个自體免疫疾病所具有的典型症状，如雷诺氏综合征、关节炎、肌炎和硬皮症。[38]对这些病人的治疗与对单个自體免疫疾病的治疗相似，常常使用包括免疫抑制和免疫调控药物。[39]

癌症

目前已发现外切体的活性可以被抗代谢物类药物氟尿嘧啶（fluorouracil）所抑制，而氟尿嘧啶是治疗癌症的化学疗法中使用的一种药物，并且是实体肿瘤治疗中最为成功的药物之一。在用氟尿嘧啶处理过的酵母细胞中，核糖体RNA的加工出现缺陷，这与外切体被分子生物学方法抑制后所观察到的现象一致。核糖体RNA无法正确被加工对于细胞而言是致命的，这也就解释了为什么氟尿嘧啶这类药物的抗代谢影响可以被用于杀死癌细胞。[40]

亚基列表

图例 通用名 结构域 人源 酵母（S. cerevisiae） 古菌 分子量（kD） 人源基因 酵母基因
1 Csl4 S1 RBD hCsl4 Csl4p/Ski4p Csl4 21-32 EXOSC1 YNL232W
2 Rrp4 S1/KH RBD hRrp4 Rrp4p Rrp4 28-39 EXOSC2 YHR069C
3 Rrp40 S1/KH RBD hRrp40 Rrp40p (Rrp4)[註 1] 27-32 EXOSC3 YOL142W
4 Rrp41 RNase PH hRrp41 Rrp41p/Ski6p Rrp41 26-28 EXOSC4 YGR195W
5 Rrp46 RNase PH hRrp46 Rrp46p (Rrp41)[註 1] 25-28 EXOSC5 YGR095C
6 Mtr3 RNase PH hMtr3 Mtr3p (Rrp41)[註 1] 24-37 EXOSC6 YGR158C
7 Rrp42 RNase PH hRrp42 Rrp42p Rrp42 29-32 EXOSC7 YDL111C
8 Rrp43 RNase PH OIP2 Rrp43p (Rrp42)[註 1] 30-44 EXOSC8 YCR035C
9 Rrp45 RNase PH PM/Scl-75 Rrp45p (Rrp42)[註 1] 34-49 EXOSC9 YDR280W
10 Rrp6 RNase D PM/Scl-100 Rrp6p n/a 84-100 EXOSC10 YOR001W
11 Rrp44 RNase R (hDis3)[註 2] Rrp44p/Dis3p n/a 105-113 KIAA1008 YOL021C

参见

注释

  1. ^ 1.0 1.1 1.2 1.3 1.4 在古菌中，有几个外切体亚基会出现多个拷贝以形成完整的外切体复合物。
  2. ^ 虽然酵母蛋白Rrp44是酵母外切体复合物中的一部分，但它在人中的同源蛋白hDis3却并未被发现与人源外切体有联系。

参考文献

  1. ^ 1.0 1.1 Mitchell, Philip; Petfalski, Elisabeth; Shevchenko, Andrej; Mann, Matthias; Tollervey, David. The Exosome: A Conserved Eukaryotic RNA Processing Complex Containing Multiple 3′→5′ Exoribonucleases. Cell. 1997-11-14, 91 (4). ISSN 0092-8674. PMID 9390555. doi:10.1016/S0092-8674(00)80432-8 （英语）. 
  2. ^ Allmang, Christine; Petfalski, Elisabeth; Podtelejnikov, Alexandre; Mann, Matthias; Tollervey, David; Mitchell, Philip. The yeast exosome and human PM–Scl are related complexes of 3′ → 5′ exonucleases. Genes & Development. 1999-08-15, 13 (16) [2022-08-02]. ISSN 0890-9369. PMC 316947  . PMID 10465791. doi:10.1101/gad.13.16.2148. （原始内容于2022-06-17） （英语）. 
  3. ^ Brouwer, Rick; Allmang, Christine; Raijmakers, Reinout; Aarssen, Yvonne van; Egberts, Wilma Vree; Petfalski, Elisabeth; Venrooij, Walther J. van; Tollervey, David; Pruijn, Ger J. M. Three Novel Components of the Human Exosome *. Journal of Biological Chemistry. 2001-03-02, 276 (9). ISSN 0021-9258. PMID 11110791. doi:10.1074/jbc.M007603200 （英语）. 
  4. ^ Chen, Ching-Yi; Gherzi, Roberto; Ong, Shao-En; Chan, Edward L.; Raijmakers, Reinout; Pruijn, Ger J. M.; Stoecklin, Georg; Moroni, Christoph; Mann, Matthias; Karin, Michael. AU Binding Proteins Recruit the Exosome to Degrade ARE-Containing mRNAs. Cell. 2001-11-16, 107 (4). ISSN 0092-8674. PMID 11719186. doi:10.1016/S0092-8674(01)00578-5 （英语）. 
  5. ^ Koonin, Eugene V.; Wolf, Yuri I.; Aravind, L. Prediction of the Archaeal Exosome and Its Connections with the Proteasome and the Translation and Transcription Machineries by a Comparative-Genomic Approach. Genome Research. 2001-02-01, 11 (2) [2022-08-02]. ISSN 1088-9051. PMC 311015  . PMID 11157787. doi:10.1101/gr.162001. （原始内容于2022-06-15） （英语）. 
  6. ^ Evguenieva‐Hackenberg, Elena; Walter, Pamela; Hochleitner, Elisabeth; Lottspeich, Friedrich; Klug, Gabriele. An exosome‐like complex in Sulfolobus solfataricus. EMBO reports. 2003-09, 4 (9) [2022-08-02]. ISSN 1469-221X. PMC 1326366  . PMID 12947419. doi:10.1038/sj.embor.embor929. （原始内容于2019-04-26） （英语）. 
  7. ^ 7.0 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 Schilders, Geurt; van Dijk, Erwin; Raijmakers, Reinout; Pruijn, Ger J.M. Cell and Molecular Biology of the Exosome: How to Make or Break an RNA. International Review of Cytology 251. Elsevier. 2006: 159–208 [2022-08-02]. ISBN 978-0-12-364655-2. doi:10.1016/s0074-7696(06)51005-8. （原始内容于2019-10-21） （英语）. 
  8. ^ Lorentzen, Esben; Walter, Pamela; Fribourg, Sebastien; Evguenieva-Hackenberg, Elena; Klug, Gabriele; Conti, Elena. The archaeal exosome core is a hexameric ring structure with three catalytic subunits. Nature Structural & Molecular Biology. 2005-07, 12 (7) [2022-08-02]. ISSN 1545-9985. doi:10.1038/nsmb952. （原始内容于2022-06-17） （英语）. 
  9. ^ 9.0 9.1 Shen, Vincent; Kiledjian, Megerditch. A View to a Kill: Structure of the RNA Exosome. Cell. 2006-12-15, 127 (6). ISSN 0092-8674. PMC 1986773  . PMID 17174886. doi:10.1016/j.cell.2006.11.035 （英语）. 
  10. ^ Raijmakers, Reinout; Egberts, Wilma Vree; van Venrooij, Walther J.; Pruijn, Ger J. M. Protein–Protein Interactions between Human Exosome Components Support the Assembly of RNase PH-type Subunits into a Six-membered PNPase-like Ring. Journal of Molecular Biology. 2002-11-01, 323 (4). ISSN 0022-2836. doi:10.1016/S0022-2836(02)00947-6 （英语）. 
  11. ^ Walter, Pamela; Klein, Franziska; Lorentzen, Esben; Ilchmann, Anne; Klug, Gabriele; Evguenieva-Hackenberg, Elena. Characterization of native and reconstituted exosome complexes from the hyperthermophilic archaeon Sulfolobus solfataricus. Molecular Microbiology. 2006-11, 62 (4) [2022-08-02]. ISSN 0950-382X. doi:10.1111/j.1365-2958.2006.05393.x. （原始内容于2022-03-21） （英语）. 
  12. ^ Ishii, Ryohei; Nureki, Osamu; Yokoyama, Shigeyuki. Crystal Structure of the tRNA Processing Enzyme RNase PH from Aquifex aeolicus *. Journal of Biological Chemistry. 2003-08-22, 278 (34). ISSN 0021-9258. PMID 12746447. doi:10.1074/jbc.M300639200 （英语）. 
  13. ^ Harlow, L. S. Crystal structure of the phosphorolytic exoribonuclease RNase PH from Bacillus subtilis and implications for its quaternary structure and tRNA binding. Protein Science. 2004-02-06, 13 (3). ISSN 0961-8368. PMC 2286726  . PMID 14767080. doi:10.1110/ps.03477004 （英语）. 
  14. ^ Symmons, Martyn F.; Jones, George H.; Luisi, Ben F. A Duplicated Fold Is the Structural Basis for Polynucleotide Phosphorylase Catalytic Activity, Processivity, and Regulation. Structure. 2000-11-15, 8 (11) [2022-08-02]. ISSN 0969-2126. PMID 11080643. doi:10.1016/S0969-2126(00)00521-9. （原始内容于2013-06-26） （英语）. 
  15. ^ Lin-Chao, Sue; Chiou, Ni-Ting; Schuster, Gadi. The PNPase, exosome and RNA helicases as the building components of evolutionarily-conserved RNA degradation machines. Journal of Biomedical Science. 2007-07, 14 (4). ISSN 1021-7770. doi:10.1007/s11373-007-9178-y （英语）. 
  16. ^ Schneider, Claudia; Anderson, James T.; Tollervey, David. The Exosome Subunit Rrp44 Plays a Direct Role in RNA Substrate Recognition. Molecular Cell. 2007-07-20, 27 (2). ISSN 1097-2765. PMC 7610968  . PMID 17643380. doi:10.1016/j.molcel.2007.06.006 （英语）. 
  17. ^ Mian, I. Comparative sequence analysis of ribonucleases HII, III, II PH and D. Nucleic Acids Research. 1997-08-15, 25 (16) [2022-08-02]. PMC 146874  . PMID 9241229. doi:10.1093/nar/25.16.3187. （原始内容于2022-06-16）. 
  18. ^ Raijmakers, Reinout; Schilders, Geurt; Pruijn, Ger J. M. The exosome, a molecular machine for controlled RNA degradation in both nucleus and cytoplasm. European Journal of Cell Biology. 2004-01-01, 83 (5). ISSN 0171-9335. doi:10.1078/0171-9335-00385 （英语）. 
  19. ^ Wang, Lingna; Lewis, Marc S.; Johnson, Arlen W. Domain interactions within the Ski2/3/8 complex and between the Ski complex and Ski7p. RNA. 2005-08-01, 11 (8) [2022-08-02]. ISSN 1355-8382. PMC 1370812  . PMID 16043509. doi:10.1261/rna.2060405. （原始内容于2022-06-16） （英语）. 
  20. ^ LaCava, John; Houseley, Jonathan; Saveanu, Cosmin; Petfalski, Elisabeth; Thompson, Elizabeth; Jacquier, Alain; Tollervey, David. RNA Degradation by the Exosome Is Promoted by a Nuclear Polyadenylation Complex. Cell. 2005-06-03, 121 (5). ISSN 0092-8674. PMID 15935758. doi:10.1016/j.cell.2005.04.029 （英语）. 
  21. ^ 21.0 21.1 Liu, Quansheng; Greimann, Jaclyn C.; Lima, Christopher D. Reconstitution, Activities, and Structure of the Eukaryotic RNA Exosome. Cell. 2006-12-15, 127 (6). ISSN 0092-8674. PMID 17174896. doi:10.1016/j.cell.2006.10.037 （英语）. 
  22. ^ 22.0 22.1 Dziembowski, Andrzej; Lorentzen, Esben; Conti, Elena; Séraphin, Bertrand. A single subunit, Dis3, is essentially responsible for yeast exosome core activity. Nature Structural & Molecular Biology. 2007-01, 14 (1) [2022-08-02]. ISSN 1545-9985. doi:10.1038/nsmb1184. （原始内容于2022-06-17） （英语）. 
  23. ^ Lorentzen, Esben; Conti, Elena. Structural Basis of 3′ End RNA Recognition and Exoribonucleolytic Cleavage by an Exosome RNase PH Core. Molecular Cell. 2005-11-11, 20 (3). ISSN 1097-2765. PMID 16285928. doi:10.1016/j.molcel.2005.10.020 （英语）. 
  24. ^ Lejeune, Fabrice; Li, Xiaojie; Maquat, Lynne E. Nonsense-Mediated mRNA Decay in Mammalian Cells Involves Decapping, Deadenylating, and Exonucleolytic Activities. Molecular Cell. 2003-09-01, 12 (3). ISSN 1097-2765. PMID 14527413. doi:10.1016/S1097-2765(03)00349-6 （英语）. 
  25. ^ Wilson, Marenda A; Meaux, Stacie; van Hoof, Ambro. A Genomic Screen in Yeast Reveals Novel Aspects of Nonstop mRNA Metabolism. Genetics. 2007-10-01, 177 (2) [2022-08-02]. ISSN 1943-2631. PMC 2034642  . PMID 17660569. doi:10.1534/genetics.107.073205. （原始内容于2022-07-27） （英语）. 
  26. ^ Lin, Wei-Jye; Duffy, Aaron; Chen, Ching-Yi. Localization of AU-rich Element-containing mRNA in Cytoplasmic Granules Containing Exosome Subunits *. Journal of Biological Chemistry. 2007-07-06, 282 (27). ISSN 0021-9258. PMID 17470429. doi:10.1074/jbc.M702281200 （英语）. 
  27. ^ 27.0 27.1 Allmang, C. Functions of the exosome in rRNA, snoRNA and snRNA synthesis. The EMBO Journal. 1999-10-01, 18 (19). PMC 1171609  . PMID 10508172. doi:10.1093/emboj/18.19.5399. 
  28. ^ Schilders, G. MPP6 is an exosome-associated RNA-binding protein involved in 5.8S rRNA maturation. Nucleic Acids Research. 2005-11-27, 33 (21) [2022-08-02]. ISSN 0305-1048. PMC 1310903  . PMID 16396833. doi:10.1093/nar/gki982. （原始内容于2022-01-21） （英语）. 
  29. ^ van Dijk, Erwin L.; Schilders, Geurt; Pruijn, Ger J.M. Human cell growth requires a functional cytoplasmic exosome, which is involved in various mRNA decay pathways. RNA. 2007-07, 13 (7). ISSN 1355-8382. PMC 1894934  . PMID 17545563. doi:10.1261/rna.575107 （英语）. 
  30. ^ Carpousis, A. J. The Escherichia coli RNA degradosome: structure, function and relationship in other ribonucleolytic multienzyme complexes. Biochemical Society Transactions. 2002-04, 30 (2) [2022-08-02]. ISSN 0300-5127. PMID 12035760. （原始内容于2022-06-15）. 
  31. ^ Pope, Janet E. Scleroderma overlap syndromes. Current Opinion in Rheumatology. 2002-11, 14 (6) [2022-08-02]. ISSN 1040-8711. doi:10.1097/00002281-200211000-00013. （原始内容于2020-11-28） （美国英语）. 
  32. ^ Gelpi, C; Algueró, A; Martinez, M Angeles; Vidal, S; Juarez, C; Rodriguez-Sanchez, J L. Identification of protein components reactive with anti-PM/Scl autoantibodies. Clinical and Experimental Immunology. 2008-06-28, 81 (1). ISSN 1365-2249. PMC 1535032  . PMID 2199097. doi:10.1111/j.1365-2249.1990.tb05291.x （英语）. 
  33. ^ Targoff, Ira N.; Reichlin, Morris. Nucleolar localization of the PM-Scl antigen. Arthritis & Rheumatism. 1985-02, 28 (2) [2022-08-02]. doi:10.1002/art.1780280221. （原始内容于2022-03-21） （英语）. 
  34. ^ Raijmakers, Reinout; Renz, Manfred; Wiemann, Claudia; Egberts, Wilma Vree; Seelig, Hans Peter; van Venrooij, Walther J.; Pruijn, Ger J. M. PM-Scl-75 is the main autoantigen in patients with the polymyositis/scleroderma overlap syndrome. Arthritis & Rheumatism. 2004-02, 50 (2). ISSN 0004-3591. doi:10.1002/art.20056 （英语）. 
  35. ^ Brouwer, Rick; Vree Egberts, Wilma TM; Hengstman, Gerald JD; Raijmakers, Reinout; van Engelen, Baziel GM; Peter Seelig, Hans; Renz, Manfred; Mierau, Rudolf; Genth, Ekkehard; Pruijn, Ger JM; van Venrooij, Walther J. Autoantibodies directed to novel components of the PM/Scl complex, the human exosome. Arthritis Research & Therapy. 2001-11-12, 4 (2) [2022-08-02]. ISSN 1478-6362. PMC 83843  . PMID 11879549. doi:10.1186/ar389. （原始内容于2022-03-21）. 
  36. ^ Schilders, Geurt; Egberts, Wilma Vree; Raijmakers, Reinout; Pruijn, Ger J. M. C1D is a major autoantibody target in patients with the polymyositis–scleroderma overlap syndrome. Arthritis & Rheumatism. 2007-07, 56 (7). doi:10.1002/art.22710 （英语）. 
  37. ^ Mahler, Michael; Raijmakers, Reinout; Dähnrich, Cornelia; Blüthner, Martin; Fritzler, Marvin J. Clinical evaluation of autoantibodies to a novel PM/Scl peptide antigen. Arthritis Research & Therapy. 2005, 7 (3) [2022-08-02]. ISSN 1478-6362. PMC 1174964  . PMID 15899056. doi:10.1186/ar1729. （原始内容于2022-03-21）. 
  38. ^ Mahler, Michael; Raijmakers, Reinout. Novel aspects of autoantibodies to the PM/Scl complex: Clinical, genetic and diagnostic insights. Autoimmunity Reviews. 2007-08-01, 6 (7). ISSN 1568-9972. doi:10.1016/j.autrev.2007.01.013 （英语）. 
  39. ^ Jablonska, S.; Blaszcyk, M. Scleromyositis: a scleroderma/polymyositis overlap syndrome. Clinical Rheumatology. 1998-11, 17 (6). ISSN 0770-3198. doi:10.1007/BF01451281 （英语）. 
  40. ^ Lum, Pek Yee; Armour, Christopher D.; Stepaniants, Sergey B.; Cavet, Guy; Wolf, Maria K.; Butler, J. Scott; Hinshaw, Jerald C.; Garnier, Philippe; Prestwich, Glenn D.; Leonardson, Amy; Garrett-Engele, Philip. Discovering Modes of Action for Therapeutic Compounds Using a Genome-Wide Screen of Yeast Heterozygotes. Cell. 2004-01-09, 116 (1). ISSN 0092-8674. PMID 14718172. doi:10.1016/S0092-8674(03)01035-3 （英语）. 

延伸阅读

  • Vanacova, Stepanka; Stefl, Richard. The exosome and RNA quality control in the nucleus. EMBO reports. 2007-07, 8 (7). ISSN 1469-221X. PMC 1905902  . PMID 17603538. doi:10.1038/sj.embor.7401005 （英语）. 
  • Houseley, Jonathan; LaCava, John; Tollervey, David. RNA-quality control by the exosome. Nature Reviews Molecular Cell Biology. 2006-07, 7 (7) [2022-08-02]. ISSN 1471-0080. doi:10.1038/nrm1964. （原始内容于2022-06-12） （英语）. 
  • Buttner, Katharina; Wenig, Katja; Hopfner, Karl-Peter. The exosome: a macromolecular cage for controlled RNA degradation. Molecular Microbiology. 2006-09, 61 (6) [2022-08-02]. ISSN 0950-382X. doi:10.1111/j.1365-2958.2006.05331.x. （原始内容于2022-06-07） （英语）. 
  • Lorentzen, Esben; Conti, Elena. The Exosome and the Proteasome: Nano-Compartments for Degradation. Cell. 2006-05-19, 125 (4). ISSN 0092-8674. PMID 16713559. doi:10.1016/j.cell.2006.05.002 （英语）. 
  • Pruijn, Ger J. M. Doughnuts dealing with RNA. Nature Structural & Molecular Biology. 2005-07, 12 (7) [2022-08-02]. ISSN 1545-9985. doi:10.1038/nsmb0705-562. （原始内容于2022-06-07） （英语）. 
  • 王树启; 王金发. 外切体研究进展. 生物化学与生物物理进展. 2002, 29 (1): 10–13. 

外部链接

  • （英文）蛋白质数据库中人源外切酶体的结构 （页面存档备份，存于互联网档案馆）
  • （英文）蛋白质数据库中古菌外切酶体的结构 （页面存档备份，存于互联网档案馆）
  • （英文）蛋白质数据库中古菌外切酶体与RNA结合的结构 （页面存档备份，存于互联网档案馆）
  • （英文）蛋白质数据库中酵母外切酶体亚基Rrp6的结构 （页面存档备份，存于互联网档案馆）

四月 01, 2023
外切體複合物, 此条目的主題是一種與rna代謝有關的蛋白質複合物, 关于一種英語名稱同為exosome的囊泡, 請見, 外吐小體, 外切体复合物, 英語, exosome, complex, 或pm, complex, 上下文意思清楚时, 可以直接称為exosome, 简称外切酶体, 外切体, 是一种蛋白质复合物, 能够降解各种不同的核糖核酸, 由于复合物表现为核糖核酸外切酶活性, 所以被命名为外切体, 外切体复合物只存在于真核细胞和古菌中, 而细菌中则对应有组成和结构更为简单的, 降解体, 复合物来发挥类似的功能. 此条目的主題是一種與RNA代謝有關的蛋白質複合物 关于一種英語名稱同為exosome的囊泡 請見 外吐小體 外切体复合物 英語 exosome complex 或PM Scl complex 上下文意思清楚时 可以直接称為exosome 简称外切酶体 外切体 是一种蛋白质复合物 能够降解各种不同的核糖核酸 RNA 由于复合物表现为核糖核酸外切酶活性 所以被命名为外切体 外切体复合物只存在于真核细胞和古菌中 而细菌中则对应有组成和结构更为简单的 降解体 复合物来发挥类似的功能 人源外切体复合物结构的飘带图 图例见 亚基列表 外切体的核心是一个由六个亚基组成的环状结构 外围的亚基都结合在这一环状结构上 在真核细胞中 这一核心存在于细胞质和细胞核 特别是核仁 等细胞区室中 在不同的区室中 与之结合的蛋白质也不尽相同 从而可以调控外切体的活性以特异性地降解特定区室的RNA底物 外切体的底物包括信使RNA mRNA 核糖体RNA rRNA 以及多种非编码RNA 外切体具有核糖核酸外切酶功能 也就意味着它可以从RNA的一端 3 端 开始降解作用 而不是从特定位点开始剪切RNA 虽然没有已知疾病与外切体直接相关 但复合物中的多个蛋白亚基是一些特定自體免疫性疾病 特别是 硬化性肌炎 Scleromyositis 病人自身抗体的靶标 也是治疗癌症的一些抗代谢化学疗法 能够阻断外切体的活性 的靶标 目录 1 发现 2 结构 2 1 核心蛋白 2 2 外围蛋白 2 3 调节蛋白 3 功能 3 1 催化作用 3 2 底物 4 疾病 4 1 自體免疫 4 2 癌症 5 亚基列表 6 参见 7 注释 8 参考文献 9 延伸阅读 10 外部链接发现 编辑第一个外切体的发现是来自于对模式生物酿酒酵母的研究 1997年外切体首次在酿酒酵母中被发现 并被鉴定为一种核糖核酸酶 1 两年之后 研究者发现外切体也存在于人体细胞中 实际上就是多年前发现的存在于特定自體免疫性疾病病人体内的一种被称为 PM Scl复合物 的自身抗原 具体见 疾病一节 2 对 PM Scl复合物 的纯化使得越来越多的人源外切体亚基蛋白被发现 直到最后所有形成这一复合物的组分都得到鉴定 3 4 2001年 日益增长的基因组数据使得对古菌中外切体蛋白的预测成为可能 5 但直到2003年 来自古菌的外切体复合物才首次被纯化出来 从而确定了外切体在古菌中的存在 6 结构 编辑核心蛋白 编辑 人源外切体复合物的晶体结构的球形填充图 上下图的视角分别为结构顶部和侧面 图例见 亚基列表 外切体复合物的核心是一个由六个蛋白亚基所组成的一个环状结构 这六个蛋白质都属于同一类核糖核酸酶 核糖核酸酶PH类似蛋白 含有PH结构域 7 在古菌中 这六个蛋白亚基实际上为两种不同的PH类似蛋白 分别为Rrp41和Rrp42 重复出现三次而来 真核生物中的外切体的核心环结构则由六种不同的蛋白质构成 8 9 在这六个蛋白质中 其中三个与古菌的Rrp41蛋白相似 另外三个则与 Rrp42蛋白相似 10 结合在核心环状结构顶部的三个蛋白质都含有S1结构域 一种RNA结合结构域 其中两个蛋白质还含有KH结构域 K homology domain 同样可以结合RNA 7 在真核生物中 含S1结构域的三个蛋白质都各不相同 而在古菌中 这三个蛋白质是相同的或至少其中有两个是相同的 11 古菌 左图 和真核生物 右图 外切体复合物的亚基组装图 不同的亚基蛋白用不同数字表示 可以看出虽然整体结构相似 但古菌外切体只含有4种亚基 而真核生物外切体则含有9种不同亚基 图例见 亚基列表 相似的环状结构也存在于核糖核酸酶PH和多核苷酸磷酸化酶 PNPase 中 细菌中的核糖核酸酶PH 参与tRNA的处理 同样可以形成一个由六个相同的核糖核酸酶PH蛋白组成的六元环复合物 12 13 以多核苷酸磷酸化酶为例 它是一种能够降解磷酸化的RNA的蛋白质 存在于细菌和一些真核生物的叶绿体和线粒体中 它的结构中既含有两个PH结构域又含有一个S1结构域和一个KH结构域 多核苷酸磷酸化酶可以形成同源三聚体复合物 其构象与外切体的环状结构非常相似 14 因为在结构域组成和结构上的相似性 外切体和这两个复合物被认为在进化上有联系 可能具有共同祖先 15 外切体的核糖核酸酶PH类似蛋白 核糖核酸酶PH以及多核苷酸磷酸化酶都属于核糖核酸酶PH蛋白家族 为磷酸解核酸外切酶 使用磷酸盐作为亲核攻击分子来从RNA分子的3 端去除核苷酸 7 外围蛋白 编辑 除了九个核心蛋白之外 真核生物的外切体中还往往包含两个能够与核心结合的蛋白质 其中之一是Rrp44蛋白 一种水解核糖核酸酶 属于核糖核酸酶R水解核酸外切酶 利用水分子来剪切核苷键 蛋白家族 在酵母中 Rrp44可以和 所有 的外切体复合物结合 并且对于酵母外切体的活性的发挥起着关键作用 16 值得一提的是 虽然人体中也存在Rrp44的同源蛋白 但目前没有证据显示这一同源蛋白可以与人源外切体复合物结合 7 酵母外切体亚基Rrp6局部结构的飘带图 a螺旋和b折叠分别用红色和黄色来显示 第二个常见的结合蛋白质是Rrp6 酵母中 或PM Scl 100 人体中 与Rrp44相似 这一蛋白质也是水解核糖核酸外切酶 但它属于核糖核酸酶D蛋白家族 17 PM Scl 100蛋白在细胞核中的外切体复合物中最为常见 但也可以参与形成细胞质中的外切体复合物 18 调节蛋白 编辑 在这两个能够与核心紧密结合的亚基之外 还有许多蛋白质可以与外切体复合物在细胞核内或核外相互作用 这些较松散结合的蛋白质可能可以调控外切体的活性和特异性 在细胞质中 外切体可以与AU富含元素 AU rich element 结合蛋白 如KRSP和TTP 它们可以促进或阻碍mRNA的降解 相互作用 而细胞核中的外切体可以与控制核糖体RNA处理的RNA结合蛋白 如人体中的MPP6以及人和酵母中的Rrp47 C1D 相互结合 7 除了单个蛋白质以外 还有一些蛋白质复合物可以与外切体相互作用 其中之一便是细胞质中的Ski复合物 Ski复合物中包含了一个RNA螺旋酶 Ski2 并参与了RNA的降解 19 在细胞核中 外切体对rRNA和小核仁RNA的降解是在TRAMP复合物 同时具有RNA螺旋酶和多聚腺苷酸化活性 的介导下进行的 20 功能 编辑催化作用 编辑 RNA的3 端水解和磷酸解的反应简图 如前所述 外切体复合物中的多个蛋白亚基都含有核糖核酸酶结构域 这些结构域都属于3 5 的核糖核酸外切酶结构域 也就是说含有这些结构域的蛋白质 酶 是从RNA分子的3 端开始对其进行降解 外切体中含有磷酸解的外切酶 核糖核酸酶PH类似蛋白 在真核生物中还含有水解型外切酶 核糖核酸酶R和核糖核酸酶D结构域蛋白 磷酸解型酶利用无机磷酸根来剪切磷酸双酯键 并生成二磷酸核苷酸 而水解型酶则利用水分子来水解磷酸双酯键 并释放单磷酸核苷酸 在古菌中 外切体复合物中的Rrp41亚基属于磷酸解的外切酶 核心环中的三个Rrp41亚基负责发挥复合物的酶解活性 9 在真核生物中 外切体中的核糖核酸酶PH亚基都没有保留催化活性 因此其所组成的核心环没有酶活性 21 在酵母中 外切体的核糖核酸酶活性主要是由外周蛋白亚基Rrp44 水解型外切酶 来发挥 22 但这一特定亚基只被发现存在于酵母 目前并没有在人或古菌的外切体复合物中找到其同源蛋白 21 23 此外 在人和酵母中都存在另一个可以与外切体结合的水解型外切酶 Rrp6 它是人源外切体中的活性来源 对酵母外切体的活性也有贡献 含S1结构域的蛋白亚基原本被认为也具有外切酶活性 但最近的研究结果对这一看法提出质疑 并认为其作用可能只是结合底物以利于外切体对底物的降解 22 古菌 酵母和人的外切体复合物的结构简图 标以彩色和星号的亚基在复合物中具有催化活性 图例见 亚基列表 底物 编辑 古菌外切体的两个核心亚基 Rrp41和Rrp42 与小RNA分子 红色 结合 外切体参与降解和处理大量各种不同的RNA底物 在细胞质中 它参与mRNA分子的更新 外切体复合物可以通过与无义介导的降解或无终止降解通路中的蛋白质相互作用来降解被标记需要进行降解的mRNA分子 包含了错误信息的mRNA 另外 mRNA的正常更新过程也需要外切体参与的降解过程 多个蛋白质可以通过结合到与外切体复合物结合的mRNA的3 端AU富含元素上来使mRNA稳定或不稳定 24 25 26 在细胞核中 外切体对于多种小核RNA分子的正确处理是必不可少的 27 核仁是外切体复合物的主要聚集区域 在核仁中 外切体参与了对5 8S核糖体RNA 外切体的第一个被发现的功能 和数种小核RNA的处理 1 27 28 虽然大多数的细胞都含有其他可以降解RNA的酶 可以从无论是3 还是5 端对RNA进行降解 但外切体复合物对细胞的存活依然必不可少 如果外切体中的蛋白质的表达被人为 例如通过RNA干扰 降低或停止 细胞就会停止生长并逐渐死亡 外切体复合物的核心蛋白以及两个主要的结合蛋白是细胞中的必要蛋白质 29 细菌中不含有外切体复合物 相似的功能是由一个更简单的复合物 降解体来执行 30 疾病 编辑自體免疫 编辑 外切体复合物是获患自體免疫性疾病病人的自身抗体的靶标 这些自身抗体被发现主要存在于患有PM Scl重叠综合征 英语 PM Scl overlap syndrome 一种自體免疫性疾病 同时具有硬皮病和多发性肌炎病征 的病人体内 31 自身抗体可以用病人的血清通过多种检验方法获得检测 过去最为常用的检测方法是采用双向免疫扩散法 使用小牛胸腺提取物 免疫荧光 对HEp 2细胞 或免疫共沉淀 来自人体细胞的提取物 在免疫共沉淀分析中 用抗外切体为阳性的血清 可以沉淀出一系列不同的蛋白质 即外切体复合物中的各个蛋白亚基 在外切体复合物被发现之前 它们被称为 PM Scl复合物 32 用来自病人的血清进行免疫荧光分析 可以看到细胞的核仁被特定染色 表明被自身抗体所是别的抗原可能在核糖体的合成中发挥重要作用 33 最近 重组的外切体蛋白已经可以被合成并用于在线免疫分析法 line immunoassay 和酶联免疫吸附法 ELISA 中来检测这些自身抗体 7 在这些疾病中 抗体主要是直接识别外切体复合物中的两个蛋白亚基 PM Scl 100 核糖核酸酶D类似蛋白 和PM Scl 75 核心环中核糖核酸酶PH类似蛋白之一 识别这两个蛋白质的抗体被发现存在于近30 患有PM Scl重叠综合征的患者体内 34 除了这两个主要的自身抗体的靶蛋白外 其他的外切体亚基和结合蛋白 如C1D 也可以被病人体内的自身抗体识别 35 36 检测这些抗体最灵敏的方法是在ELISA中用一段来自PM Scl 100蛋白上的肽段来代替整个PM Scl 100蛋白作为抗原 采用这一方法已经在高达55 的PM Scl重叠综合征病人体内发现相应的自身抗体 但这些抗体在其他只患有硬皮病 多发性肌炎或皮肌炎的病人体内也能被检测到 37 由于这些自身抗体主要发现于具有多种不同的自體免疫疾病病征的病人体内 这些病人的临床症状可能会具有很大差异 最常见的症状往往是单个自體免疫疾病所具有的典型症状 如雷诺氏综合征 关节炎 肌炎和硬皮症 38 对这些病人的治疗与对单个自體免疫疾病的治疗相似 常常使用包括免疫抑制和免疫调控药物 39 癌症 编辑 目前已发现外切体的活性可以被抗代谢物类药物氟尿嘧啶 fluorouracil 所抑制 而氟尿嘧啶是治疗癌症的化学疗法中使用的一种药物 并且是实体肿瘤治疗中最为成功的药物之一 在用氟尿嘧啶处理过的酵母细胞中 核糖体RNA的加工出现缺陷 这与外切体被分子生物学方法抑制后所观察到的现象一致 核糖体RNA无法正确被加工对于细胞而言是致命的 这也就解释了为什么氟尿嘧啶这类药物的抗代谢影响可以被用于杀死癌细胞 40 亚基列表 编辑图例 通用名 结构域 人源 酵母 S cerevisiae 古菌 分子量 kD 人源基因 酵母基因1 Csl4 S1 RBD hCsl4 Csl4p Ski4p Csl4 21 32 EXOSC1 YNL232W2 Rrp4 S1 KH RBD hRrp4 Rrp4p Rrp4 28 39 EXOSC2 YHR069C3 Rrp40 S1 KH RBD hRrp40 Rrp40p Rrp4 註 1 27 32 EXOSC3 YOL142W4 Rrp41 RNase PH hRrp41 Rrp41p Ski6p Rrp41 26 28 EXOSC4 YGR195W5 Rrp46 RNase PH hRrp46 Rrp46p Rrp41 註 1 25 28 EXOSC5 YGR095C6 Mtr3 RNase PH hMtr3 Mtr3p Rrp41 註 1 24 37 EXOSC6 YGR158C7 Rrp42 RNase PH hRrp42 Rrp42p Rrp42 29 32 EXOSC7 YDL111C8 Rrp43 RNase PH OIP2 Rrp43p Rrp42 註 1 30 44 EXOSC8 YCR035C9 Rrp45 RNase PH PM Scl 75 Rrp45p Rrp42 註 1 34 49 EXOSC9 YDR280W10 Rrp6 RNase D PM Scl 100 Rrp6p n a 84 100 EXOSC10 YOR001W11 Rrp44 RNase R hDis3 註 2 Rrp44p Dis3p n a 105 113 KIAA1008 YOL021C参见 编辑 分子与细胞生物学主题 核糖核酸酶 降解体 蛋白酶体 细胞中降解蛋白质的主要工具 具有环状结构 剪接體 参与RNA加工 具有RNA结合的环状结构 注释 编辑 1 0 1 1 1 2 1 3 1 4 在古菌中 有几个外切体亚基会出现多个拷贝以形成完整的外切体复合物 虽然酵母蛋白Rrp44是酵母外切体复合物中的一部分 但它在人中的同源蛋白hDis3却并未被发现与人源外切体有联系 参考文献 编辑 1 0 1 1 Mitchell Philip Petfalski Elisabeth Shevchenko Andrej Mann Matthias Tollervey David The Exosome A Conserved Eukaryotic RNA Processing Complex Containing Multiple 3 5 Exoribonucleases Cell 1997 11 14 91 4 ISSN 0092 8674 PMID 9390555 doi 10 1016 S0092 8674 00 80432 8 英语 Allmang Christine Petfalski Elisabeth Podtelejnikov Alexandre Mann Matthias Tollervey David Mitchell Philip The yeast exosome and human PM Scl are related complexes of 3 5 exonucleases Genes amp Development 1999 08 15 13 16 2022 08 02 ISSN 0890 9369 PMC 316947 PMID 10465791 doi 10 1101 gad 13 16 2148 原始内容存档于2022 06 17 英语 引文格式1维护 PMC格式 link Brouwer Rick Allmang Christine Raijmakers Reinout Aarssen Yvonne van Egberts Wilma Vree Petfalski Elisabeth Venrooij Walther J van Tollervey David Pruijn Ger J M Three Novel Components of the Human Exosome Journal of Biological Chemistry 2001 03 02 276 9 ISSN 0021 9258 PMID 11110791 doi 10 1074 jbc M007603200 英语 Chen Ching Yi Gherzi Roberto Ong Shao En Chan Edward L Raijmakers Reinout Pruijn Ger J M Stoecklin Georg Moroni Christoph Mann Matthias Karin Michael AU Binding Proteins Recruit the Exosome to Degrade ARE Containing mRNAs Cell 2001 11 16 107 4 ISSN 0092 8674 PMID 11719186 doi 10 1016 S0092 8674 01 00578 5 英语 Koonin Eugene V Wolf Yuri I Aravind L Prediction of the Archaeal Exosome and Its Connections with the Proteasome and the Translation and Transcription Machineries by a Comparative Genomic Approach Genome Research 2001 02 01 11 2 2022 08 02 ISSN 1088 9051 PMC 311015 PMID 11157787 doi 10 1101 gr 162001 原始内容存档于2022 06 15 英语 引文格式1维护 PMC格式 link Evguenieva Hackenberg Elena Walter Pamela Hochleitner Elisabeth Lottspeich Friedrich Klug Gabriele An exosome like complex in Sulfolobus solfataricus EMBO reports 2003 09 4 9 2022 08 02 ISSN 1469 221X PMC 1326366 PMID 12947419 doi 10 1038 sj embor embor929 原始内容存档于2019 04 26 英语 引文格式1维护 PMC格式 link 7 0 7 1 7 2 7 3 7 4 7 5 Schilders Geurt van Dijk Erwin Raijmakers Reinout Pruijn Ger J M Cell and Molecular Biology of the Exosome How to Make or Break an RNA International Review of Cytology 251 Elsevier 2006 159 208 2022 08 02 ISBN 978 0 12 364655 2 doi 10 1016 s0074 7696 06 51005 8 原始内容存档于2019 10 21 英语 Lorentzen Esben Walter Pamela Fribourg Sebastien Evguenieva Hackenberg Elena Klug Gabriele Conti Elena The archaeal exosome core is a hexameric ring structure with three catalytic subunits Nature Structural amp Molecular Biology 2005 07 12 7 2022 08 02 ISSN 1545 9985 doi 10 1038 nsmb952 原始内容存档于2022 06 17 英语 9 0 9 1 Shen Vincent Kiledjian Megerditch A View to a Kill Structure of the RNA Exosome Cell 2006 12 15 127 6 ISSN 0092 8674 PMC 1986773 PMID 17174886 doi 10 1016 j cell 2006 11 035 英语 引文格式1维护 PMC格式 link Raijmakers Reinout Egberts Wilma Vree van Venrooij Walther J Pruijn Ger J M Protein Protein Interactions between Human Exosome Components Support the Assembly of RNase PH type Subunits into a Six membered PNPase like Ring Journal of Molecular Biology 2002 11 01 323 4 ISSN 0022 2836 doi 10 1016 S0022 2836 02 00947 6 英语 Walter Pamela Klein Franziska Lorentzen Esben Ilchmann Anne Klug Gabriele Evguenieva Hackenberg Elena Characterization of native and reconstituted exosome complexes from the hyperthermophilic archaeon Sulfolobus solfataricus Molecular Microbiology 2006 11 62 4 2022 08 02 ISSN 0950 382X doi 10 1111 j 1365 2958 2006 05393 x 原始内容存档于2022 03 21 英语 Ishii Ryohei Nureki Osamu Yokoyama Shigeyuki Crystal Structure of the tRNA Processing Enzyme RNase PH from Aquifex aeolicus Journal of Biological Chemistry 2003 08 22 278 34 ISSN 0021 9258 PMID 12746447 doi 10 1074 jbc M300639200 英语 Harlow L S Crystal structure of the phosphorolytic exoribonuclease RNase PH from Bacillus subtilis and implications for its quaternary structure and tRNA binding Protein Science 2004 02 06 13 3 ISSN 0961 8368 PMC 2286726 PMID 14767080 doi 10 1110 ps 03477004 英语 引文格式1维护 PMC格式 link Symmons Martyn F Jones George H Luisi Ben F A Duplicated Fold Is the Structural Basis for Polynucleotide Phosphorylase Catalytic Activity Processivity and Regulation Structure 2000 11 15 8 11 2022 08 02 ISSN 0969 2126 PMID 11080643 doi 10 1016 S0969 2126 00 00521 9 原始内容存档于2013 06 26 英语 Lin Chao Sue Chiou Ni Ting Schuster Gadi The PNPase exosome and RNA helicases as the building components of evolutionarily conserved RNA degradation machines Journal of Biomedical Science 2007 07 14 4 ISSN 1021 7770 doi 10 1007 s11373 007 9178 y 英语 Schneider Claudia Anderson James T Tollervey David The Exosome Subunit Rrp44 Plays a Direct Role in RNA Substrate Recognition Molecular Cell 2007 07 20 27 2 ISSN 1097 2765 PMC 7610968 PMID 17643380 doi 10 1016 j molcel 2007 06 006 英语 引文格式1维护 PMC格式 link Mian I Comparative sequence analysis of ribonucleases HII III II PH and D Nucleic Acids Research 1997 08 15 25 16 2022 08 02 PMC 146874 PMID 9241229 doi 10 1093 nar 25 16 3187 原始内容存档于2022 06 16 引文格式1维护 PMC格式 link Raijmakers Reinout Schilders Geurt Pruijn Ger J M The exosome a molecular machine for controlled RNA degradation in both nucleus and cytoplasm European Journal of Cell Biology 2004 01 01 83 5 ISSN 0171 9335 doi 10 1078 0171 9335 00385 英语 Wang Lingna Lewis Marc S Johnson Arlen W Domain interactions within the Ski2 3 8 complex and between the Ski complex and Ski7p RNA 2005 08 01 11 8 2022 08 02 ISSN 1355 8382 PMC 1370812 PMID 16043509 doi 10 1261 rna 2060405 原始内容存档于2022 06 16 英语 引文格式1维护 PMC格式 link LaCava John Houseley Jonathan Saveanu Cosmin Petfalski Elisabeth Thompson Elizabeth Jacquier Alain Tollervey David RNA Degradation by the Exosome Is Promoted by a Nuclear Polyadenylation Complex Cell 2005 06 03 121 5 ISSN 0092 8674 PMID 15935758 doi 10 1016 j cell 2005 04 029 英语 21 0 21 1 Liu Quansheng Greimann Jaclyn C Lima Christopher D Reconstitution Activities and Structure of the Eukaryotic RNA Exosome Cell 2006 12 15 127 6 ISSN 0092 8674 PMID 17174896 doi 10 1016 j cell 2006 10 037 英语 22 0 22 1 Dziembowski Andrzej Lorentzen Esben Conti Elena Seraphin Bertrand A single subunit Dis3 is essentially responsible for yeast exosome core activity Nature Structural amp Molecular Biology 2007 01 14 1 2022 08 02 ISSN 1545 9985 doi 10 1038 nsmb1184 原始内容存档于2022 06 17 英语 Lorentzen Esben Conti Elena Structural Basis of 3 End RNA Recognition and Exoribonucleolytic Cleavage by an Exosome RNase PH Core Molecular Cell 2005 11 11 20 3 ISSN 1097 2765 PMID 16285928 doi 10 1016 j molcel 2005 10 020 英语 Lejeune Fabrice Li Xiaojie Maquat Lynne E Nonsense Mediated mRNA Decay in Mammalian Cells Involves Decapping Deadenylating and Exonucleolytic Activities Molecular Cell 2003 09 01 12 3 ISSN 1097 2765 PMID 14527413 doi 10 1016 S1097 2765 03 00349 6 英语 Wilson Marenda A Meaux Stacie van Hoof Ambro A Genomic Screen in Yeast Reveals Novel Aspects of Nonstop mRNA Metabolism Genetics 2007 10 01 177 2 2022 08 02 ISSN 1943 2631 PMC 2034642 PMID 17660569 doi 10 1534 genetics 107 073205 原始内容存档于2022 07 27 英语 引文格式1维护 PMC格式 link Lin Wei Jye Duffy Aaron Chen Ching Yi Localization of AU rich Element containing mRNA in Cytoplasmic Granules Containing Exosome Subunits Journal of Biological Chemistry 2007 07 06 282 27 ISSN 0021 9258 PMID 17470429 doi 10 1074 jbc M702281200 英语 27 0 27 1 Allmang C Functions of the exosome in rRNA snoRNA and snRNA synthesis The EMBO Journal 1999 10 01 18 19 PMC 1171609 PMID 10508172 doi 10 1093 emboj 18 19 5399 引文格式1维护 PMC格式 link Schilders G MPP6 is an exosome associated RNA binding protein involved in 5 8S rRNA maturation Nucleic Acids Research 2005 11 27 33 21 2022 08 02 ISSN 0305 1048 PMC 1310903 PMID 16396833 doi 10 1093 nar gki982 原始内容存档于2022 01 21 英语 引文格式1维护 PMC格式 link van Dijk Erwin L Schilders Geurt Pruijn Ger J M Human cell growth requires a functional cytoplasmic exosome which is involved in various mRNA decay pathways RNA 2007 07 13 7 ISSN 1355 8382 PMC 1894934 PMID 17545563 doi 10 1261 rna 575107 英语 引文格式1维护 PMC格式 link Carpousis A J The Escherichia coli RNA degradosome structure function and relationship in other ribonucleolytic multienzyme complexes Biochemical Society Transactions 2002 04 30 2 2022 08 02 ISSN 0300 5127 PMID 12035760 原始内容存档于2022 06 15 Pope Janet E Scleroderma overlap syndromes Current Opinion in Rheumatology 2002 11 14 6 2022 08 02 ISSN 1040 8711 doi 10 1097 00002281 200211000 00013 原始内容存档于2020 11 28 美国英语 Gelpi C Alguero A Martinez M Angeles Vidal S Juarez C Rodriguez Sanchez J L Identification of protein components reactive with anti PM Scl autoantibodies Clinical and Experimental Immunology 2008 06 28 81 1 ISSN 1365 2249 PMC 1535032 PMID 2199097 doi 10 1111 j 1365 2249 1990 tb05291 x 英语 引文格式1维护 PMC格式 link Targoff Ira N Reichlin Morris Nucleolar localization of the PM Scl antigen Arthritis amp Rheumatism 1985 02 28 2 2022 08 02 doi 10 1002 art 1780280221 原始内容存档于2022 03 21 英语 Raijmakers Reinout Renz Manfred Wiemann Claudia Egberts Wilma Vree Seelig Hans Peter van Venrooij Walther J Pruijn Ger J M PM Scl 75 is the main autoantigen in patients with the polymyositis scleroderma overlap syndrome Arthritis amp Rheumatism 2004 02 50 2 ISSN 0004 3591 doi 10 1002 art 20056 英语 Brouwer Rick Vree Egberts Wilma TM Hengstman Gerald JD Raijmakers Reinout van Engelen Baziel GM Peter Seelig Hans Renz Manfred Mierau Rudolf Genth Ekkehard Pruijn Ger JM van Venrooij Walther J Autoantibodies directed to novel components of the PM Scl complex the human exosome Arthritis Research amp Therapy 2001 11 12 4 2 2022 08 02 ISSN 1478 6362 PMC 83843 PMID 11879549 doi 10 1186 ar389 原始内容存档于2022 03 21 引文格式1维护 PMC格式 link Schilders Geurt Egberts Wilma Vree Raijmakers Reinout Pruijn Ger J M C1D is a major autoantibody target in patients with the polymyositis scleroderma overlap syndrome Arthritis amp Rheumatism 2007 07 56 7 doi 10 1002 art 22710 英语 Mahler Michael Raijmakers Reinout Dahnrich Cornelia Bluthner Martin Fritzler Marvin J Clinical evaluation of autoantibodies to a novel PM Scl peptide antigen Arthritis Research amp Therapy 2005 7 3 2022 08 02 ISSN 1478 6362 PMC 1174964 PMID 15899056 doi 10 1186 ar1729 原始内容存档于2022 03 21 Mahler Michael Raijmakers Reinout Novel aspects of autoantibodies to the PM Scl complex Clinical genetic and diagnostic insights Autoimmunity Reviews 2007 08 01 6 7 ISSN 1568 9972 doi 10 1016 j autrev 2007 01 013 英语 Jablonska S Blaszcyk M Scleromyositis a scleroderma polymyositis overlap syndrome Clinical Rheumatology 1998 11 17 6 ISSN 0770 3198 doi 10 1007 BF01451281 英语 Lum Pek Yee Armour Christopher D Stepaniants Sergey B Cavet Guy Wolf Maria K Butler J Scott Hinshaw Jerald C Garnier Philippe Prestwich Glenn D Leonardson Amy Garrett Engele Philip Discovering Modes of Action for Therapeutic Compounds Using a Genome Wide Screen of Yeast Heterozygotes Cell 2004 01 09 116 1 ISSN 0092 8674 PMID 14718172 doi 10 1016 S0092 8674 03 01035 3 英语 延伸阅读 编辑Vanacova Stepanka Stefl Richard The exosome and RNA quality control in the nucleus EMBO reports 2007 07 8 7 ISSN 1469 221X PMC 1905902 PMID 17603538 doi 10 1038 sj embor 7401005 英语 引文格式1维护 PMC格式 link Houseley Jonathan LaCava John Tollervey David RNA quality control by the exosome Nature Reviews Molecular Cell Biology 2006 07 7 7 2022 08 02 ISSN 1471 0080 doi 10 1038 nrm1964 原始内容存档于2022 06 12 英语 Buttner Katharina Wenig Katja Hopfner Karl Peter The exosome a macromolecular cage for controlled RNA degradation Molecular Microbiology 2006 09 61 6 2022 08 02 ISSN 0950 382X doi 10 1111 j 1365 2958 2006 05331 x 原始内容存档于2022 06 07 英语 Lorentzen Esben Conti Elena The Exosome and the Proteasome Nano Compartments for Degradation Cell 2006 05 19 125 4 ISSN 0092 8674 PMID 16713559 doi 10 1016 j cell 2006 05 002 英语 Pruijn Ger J M Doughnuts dealing with RNA Nature Structural amp Molecular Biology 2005 07 12 7 2022 08 02 ISSN 1545 9985 doi 10 1038 nsmb0705 562 原始内容存档于2022 06 07 英语 王树启 王金发 外切体研究进展 生物化学与生物物理进展 2002 29 1 10 13 外部链接 编辑 英文 蛋白质数据库中人源外切酶体的结构 页面存档备份 存于互联网档案馆 英文 蛋白质数据库中古菌外切酶体的结构 页面存档备份 存于互联网档案馆 英文 蛋白质数据库中古菌外切酶体与RNA结合的结构 页面存档备份 存于互联网档案馆 英文 蛋白质数据库中酵母外切酶体亚基Rrp6的结构 页面存档备份 存于互联网档案馆 取自 https zh wikipedia org w index php title 外切體複合物 amp oldid 76512568, 维基百科，wiki，书籍，书籍，图书馆，

文章

，阅读，下载，免费，免费下载，mp3，视频，mp4，3gp， jpg，jpeg，gif，png，图片，音乐，歌曲，电影，书籍，游戏，游戏。