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DGCR8

DGCR8全稱為迪喬治症候群關鍵區域8(DiGeorge syndrome critical region 8)是哺乳類的一個蛋白質,在人類基因組中由22號染色體上的DGCR8基因編碼[4]模式生物黑腹果蠅秀麗隱桿線蟲與此同源的基因名為Pasha,意為「Drosha蛋白的夥伴」(partner of Drosha)[5]

DGCR8
已知的結構
PDB直系同源搜索: PDBe RCSB
識別號
别名DGCR8;, C22orf12, DGCRK6, Gy1, pasha, Pasha, DGCR8 microprocessor complex subunit, microprocessor complex subunit
外部IDOMIM:609030 MGI:2151114 HomoloGene:11223 GeneCards:DGCR8
基因位置(人类
染色体22號染色體[1]
基因座22q11.21起始20,080,232 bp[1]
终止20,111,877 bp[1]
RNA表达模式




查阅更多表达数据
直系同源
物種人類小鼠
Entrez
Ensembl
UniProt
mRNA​序列

​NM_001190326
​NM_022720

NM_033324

蛋白序列

NP_001177255
​NP_073557

NP_201581

基因位置​(UCSC)Chr 22: 20.08 – 20.11 Mb无数据
PubMed​查找[2][3]
維基數據
檢視/編輯人類檢視/編輯小鼠

功能 编辑

DGCR8位於細胞核中,參與miRNA前驅物(pri-miRNA)的切割,此蛋白可與Drosha(一種核糖核酸酶Ⅲ)結合,組成微加工複合體英语Microprocessor complex,將由DNA轉錄產生的pri-miRNA切割成長約70nt的pre-miRNA,後者可再由Dicer切割產生成熟的miRNA。DGCR8有一可與RNA結合的結構域,可與pri-miRNA結合以穩定其結構,以利Drosha進行切割[6]。Drosha一般需在與DGCR8結合的情況下才能進行切割[7]

此外DGCR8也參與部分DNA修補的途徑,DGCR8的一個位點被磷酸化後可參與转录偶联修复(transcription coupled nucleotide excision repair,簡稱TC-NER,用於移除嘧啶二聚體紫外線造成的DNA損傷)以及核苷酸切除修復(NER,移除過氧化氫等化學物質造成的DNA氧化損傷)等,且此機制與DGCR8和Drosha結合以及和RNA結合的能力均無關[8]

參考文獻 编辑

  1. ^ 1.0 1.1 1.2 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000128191 - Ensembl, May 2017
  2. ^ Human PubMed Reference:. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine. 
  3. ^ Mouse PubMed Reference:. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine. 
  4. ^ Entrez Gene: DGCR8 DiGeorge syndrome critical region gene 8. (原始内容于2010-12-05). 
  5. ^ Denli AM, Tops BB, Plasterk RH, Ketting RF, Hannon GJ. Processing of primary microRNAs by the Microprocessor complex. Nature. Nov 2004, 432 (7014): 231–5. PMID 15531879. doi:10.1038/nature03049. 
  6. ^ Yeom KH, Lee Y, Han J, Suh MR, Kim VN. Characterization of DGCR8/Pasha, the essential cofactor for Drosha in primary miRNA processing. Nucleic Acids Research. 2006, 34 (16): 4622–9. PMC 1636349 . PMID 16963499. doi:10.1093/nar/gkl458. 
  7. ^ Han J, Lee Y, Yeom KH, Nam JW, Heo I, Rhee JK, Sohn SY, Cho Y, Zhang BT, Kim VN. Molecular basis for the recognition of primary microRNAs by the Drosha-DGCR8 complex. Cell. 2006, 125 (5): 887–901. PMID 16751099. S2CID 453021. doi:10.1016/j.cell.2006.03.043 . 
  8. ^ Calses PC, Dhillon KK, Tucker N, Chi Y, Huang JW, Kawasumi M, Nghiem P, Wang Y, Clurman BE, Jacquemont C, Gafken PR, Sugasawa K, Saijo M, Taniguchi T. DGCR8 Mediates Repair of UV-Induced DNA Damage Independently of RNA Processing. Cell Rep. 2017, 19 (1): 162–174. PMC 5423785 . PMID 28380355. doi:10.1016/j.celrep.2017.03.021. 

dgcr8, 全稱為迪喬治症候群關鍵區域8, digeorge, syndrome, critical, region, 是哺乳類的一個蛋白質, 在人類基因組中由22號染色體上的基因編碼, 模式生物黑腹果蠅與秀麗隱桿線蟲與此同源的基因名為pasha, 意為, drosha蛋白的夥伴, partner, drosha, 已知的結構pdb直系同源搜索, pdbe, rcsbpdbid列表1x47, 2yt4, 3le4, 5b16識別號别名, c22orf12, dgcrk6, pasha, pasha, microp. DGCR8全稱為迪喬治症候群關鍵區域8 DiGeorge syndrome critical region 8 是哺乳類的一個蛋白質 在人類基因組中由22號染色體上的DGCR8基因編碼 4 模式生物黑腹果蠅與秀麗隱桿線蟲與此同源的基因名為Pasha 意為 Drosha蛋白的夥伴 partner of Drosha 5 DGCR8已知的結構PDB直系同源搜索 PDBe RCSBPDBID列表1X47 2YT4 3LE4 5B16識別號别名DGCR8 C22orf12 DGCRK6 Gy1 pasha Pasha DGCR8 microprocessor complex subunit microprocessor complex subunit外部IDOMIM 609030 MGI 2151114 HomoloGene 11223 GeneCards DGCR8基因位置 人类 染色体22號染色體 1 基因座22q11 21起始20 080 232 bp 1 终止20 111 877 bp 1 RNA表达模式查阅更多表达数据基因本體分子功能 primary miRNA binding ribonuclease III activity double stranded RNA binding 血浆蛋白结合 heme binding protein homodimerization activity 金屬離子結合 RNA binding 相同蛋白质结合細胞組分 細胞質 微加工复合体 核仁 细胞核 核质 突触后致密物质生物學過程 regulation of stem cell proliferation primary miRNA processing RNA phosphodiester bond hydrolysis endonucleolytic RNA phosphodiester bond hydrolysis miRNA metabolic processSources Amigo QuickGO直系同源物種人類小鼠Entrez5448794223EnsemblENSG00000128191ENSMUSG00000022718UniProtQ8WYQ5Q9EQM6mRNA 序列 NM 001190326 NM 022720NM 033324蛋白序列NP 001177255 NP 073557NP 201581基因位置 UCSC Chr 22 20 08 20 11 Mb无数据PubMed 查找 2 3 維基數據檢視 編輯人類檢視 編輯小鼠功能 编辑DGCR8位於細胞核中 參與miRNA前驅物 pri miRNA 的切割 此蛋白可與Drosha 一種核糖核酸酶 結合 組成微加工複合體 英语 Microprocessor complex 將由DNA轉錄產生的pri miRNA切割成長約70nt的pre miRNA 後者可再由Dicer切割產生成熟的miRNA DGCR8有一可與RNA結合的結構域 可與pri miRNA結合以穩定其結構 以利Drosha進行切割 6 Drosha一般需在與DGCR8結合的情況下才能進行切割 7 此外DGCR8也參與部分DNA修補的途徑 DGCR8的一個位點被磷酸化後可參與转录偶联修复 transcription coupled nucleotide excision repair 簡稱TC NER 用於移除嘧啶二聚體等紫外線造成的DNA損傷 以及核苷酸切除修復 NER 移除過氧化氫等化學物質造成的DNA氧化損傷 等 且此機制與DGCR8和Drosha結合以及和RNA結合的能力均無關 8 參考文獻 编辑 nbsp 分子与细胞生物学主题 1 0 1 1 1 2 GRCh38 Ensembl release 89 ENSG00000128191 Ensembl May 2017 Human PubMed Reference National Center for Biotechnology Information U S National Library of Medicine Mouse PubMed Reference National Center for Biotechnology Information U S National Library of Medicine Entrez Gene DGCR8 DiGeorge syndrome critical region gene 8 原始内容存档于2010 12 05 Denli AM Tops BB Plasterk RH Ketting RF Hannon GJ Processing of primary microRNAs by the Microprocessor complex Nature Nov 2004 432 7014 231 5 PMID 15531879 doi 10 1038 nature03049 Yeom KH Lee Y Han J Suh MR Kim VN Characterization of DGCR8 Pasha the essential cofactor for Drosha in primary miRNA processing Nucleic Acids Research 2006 34 16 4622 9 PMC 1636349 nbsp PMID 16963499 doi 10 1093 nar gkl458 Han J Lee Y Yeom KH Nam JW Heo I Rhee JK Sohn SY Cho Y Zhang BT Kim VN Molecular basis for the recognition of primary microRNAs by the Drosha DGCR8 complex Cell 2006 125 5 887 901 PMID 16751099 S2CID 453021 doi 10 1016 j cell 2006 03 043 nbsp Calses PC Dhillon KK Tucker N Chi Y Huang JW Kawasumi M Nghiem P Wang Y Clurman BE Jacquemont C Gafken PR Sugasawa K Saijo M Taniguchi T DGCR8 Mediates Repair of UV Induced DNA Damage Independently of RNA Processing Cell Rep 2017 19 1 162 174 PMC 5423785 nbsp PMID 28380355 doi 10 1016 j celrep 2017 03 021 取自 https zh wikipedia org w index php title DGCR8 amp oldid 73522158, 维基百科,wiki,书籍,书籍,图书馆,

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