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Argonaute

Argonaute蛋白質家族是參與RNA干擾(RNAi)的一系列蛋白質,可與siRNAmiRNApiRNA等小非編碼RNA結合,為RNA誘導沉默複合體(RISC)的重要組成部分,RISC可與和其中小RNA序列互補的mRNA,進而促進其降解或抑制其轉譯,達到基因靜默的效果[1]。此蛋白家族的名稱來自扁船蛸學名Argonauta argo),因發表者認為AGO1基因突變阿拉伯芥外形和其相似而得名[2]

Argonaute蛋白
激烈火球菌英语Pyrococcus furiosus的Argonaute蛋白(PDB 1U04),其中PIWI結構域位於右側,PAZ結構域德语PAZ-Domäne位於左側
鑑定
標誌Argonaute
PfamPF02171(旧版)
InterPro英语InterProIPR003165
PROSITE英语PROSITEPS50822
CDD英语Conserved Domain Databasecd02826
現有可用的蛋白結構:
Pfam結構(旧版) / ECOD
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum英语PDBsum結構概要
Argonaute蛋白Paz結構域德语PAZ-Domäne
鑑定
標誌Paz
PfamPF12212(旧版)
InterPro英语InterProIPR021103
SCOP英语Structural Classification of Proteinsb.34.14.1 / SUPFAM
現有可用的蛋白結構:
Pfam結構(旧版) / ECOD
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum英语PDBsum結構概要

Argonaute蛋白質家族的蛋白從N端C端包含N、L1、PAZ德语PAZ-Domäne、L2、M與PIWI等6個結構域[3],其中PAZ結構域德语PAZ-Domäne可識別小RNA3′端的單股突出鹼基而與之結合;PIWI結構域有內切酶活性,可負責切割目標mRNA,但也有些Argonaute家族蛋白的PIWI在演化過程中喪失了內切酶的功能。人類基因組共編碼8種Argonaute蛋白,其中AGO1-4均可與miRNA結合,但僅AGO2具有內切酶活性[4]。植物的AGO1參與miRNA介導的mRNA降解,其AGO4則不參與mRNA降解,但與siRNA結合後可啟動DNA甲基化表觀遺傳調控而抑制目標基因表現[5]

應用

2016年,河北科技大學韓春雨在《自然-生物技術》期刊發表名為NgAgo英语NgAgo基因編輯技術,使用格氏嗜盐碱杆菌(Natronobacterium gregoryi)的Argonaute蛋白切割DNA,但結果備受質疑,原論文於隔年被期刊撤回[6]。2017年,伊利諾大學厄巴納-香檳分校團隊使用古菌激烈火球菌英语Pyrococcus furiosus的Argonaute蛋白(PfAgo)為人工限制酶,於體外切割DNA[7]

參考文獻

  1. ^ Jonas S, Izaurralde E. Towards a molecular understanding of microRNA-mediated gene silencing. Nature Reviews. Genetics. 2015, 16 (7): 421–433. PMID 26077373. S2CID 24892348. doi:10.1038/nrg3965. 
  2. ^ Bohmert K, Camus I, Bellini C, Bouchez D, Caboche M, Benning C. AGO1 defines a novel locus of Arabidopsis controlling leaf development. The EMBO Journal. January 1998, 17 (1): 170–180. PMC 1170368 . PMID 9427751. doi:10.1093/emboj/17.1.170. 
  3. ^ Hutvagner G, Simard MJ. Argonaute proteins: key players in RNA silencing. Nature Reviews. Molecular Cell Biology. 2008, 9 (1): 22–32. PMID 18073770. S2CID 8822503. doi:10.1038/nrm2321. hdl:10453/15429 . 
  4. ^ Meister G, Landthaler M, Patkaniowska A, Dorsett Y, Teng G, Tuschl T. Human Argonaute2 mediates RNA cleavage targeted by miRNAs and siRNAs. Molecular Cell. 2004, 15 (2): 185–197. PMID 15260970. doi:10.1016/j.molcel.2004.07.007 . 
  5. ^ Meins F, Si-Ammour A, Blevins T. RNA silencing systems and their relevance to plant development. Annual Review of Cell and Developmental Biology. 2005, 21 (1): 297–318. PMID 16212497. doi:10.1146/annurev.cellbio.21.122303.114706. 
  6. ^ Cyranoski D. Authors retract controversial NgAgo gene-editing study. Nature. 2017. doi:10.1038/nature.2017.22412. 
  7. ^ Enghiad B, Zhao H. Programmable DNA-Guided Artificial Restriction Enzymes. ACS Synthetic Biology. May 2017, 6 (5): 752–757. PMID 28165224. S2CID 3833124. doi:10.1021/acssynbio.6b00324. 

argonaute, 蛋白質家族是參與rna干擾, rnai, 的一系列蛋白質, 可與sirna, mirna與pirna等小非編碼rna結合, 為rna誘導沉默複合體, risc, 的重要組成部分, risc可與和其中小rna序列互補的mrna, 進而促進其降解或抑制其轉譯, 達到基因靜默的效果, 此蛋白家族的名稱來自扁船蛸的學名, argonauta, argo, 因發表者認為ago1基因突變的阿拉伯芥外形和其相似而得名, 蛋白激烈火球菌, 英语, pyrococcus, furiosus, 的蛋白, 1u04. Argonaute蛋白質家族是參與RNA干擾 RNAi 的一系列蛋白質 可與siRNA miRNA與piRNA等小非編碼RNA結合 為RNA誘導沉默複合體 RISC 的重要組成部分 RISC可與和其中小RNA序列互補的mRNA 進而促進其降解或抑制其轉譯 達到基因靜默的效果 1 此蛋白家族的名稱來自扁船蛸的學名 Argonauta argo 因發表者認為AGO1基因突變的阿拉伯芥外形和其相似而得名 2 Argonaute蛋白激烈火球菌 英语 Pyrococcus furiosus 的Argonaute蛋白 PDB 1U04 其中PIWI結構域位於右側 PAZ結構域 德语 PAZ Domane 位於左側鑑定標誌ArgonautePfamPF02171 旧版 InterPro 英语 InterPro IPR003165PROSITE 英语 PROSITE PS50822CDD 英语 Conserved Domain Database cd02826現有可用的蛋白結構 Pfam結構 旧版 ECODPDBRCSB PDB PDBe PDBjPDBsum 英语 PDBsum 結構概要Argonaute蛋白Paz結構域 德语 PAZ Domane 鑑定標誌PazPfamPF12212 旧版 InterPro 英语 InterPro IPR021103SCOP 英语 Structural Classification of Proteins b 34 14 1 SUPFAM現有可用的蛋白結構 Pfam結構 旧版 ECODPDBRCSB PDB PDBe PDBjPDBsum 英语 PDBsum 結構概要Argonaute蛋白質家族的蛋白從N端自C端包含N L1 PAZ 德语 PAZ Domane L2 M與PIWI等6個結構域 3 其中PAZ結構域 德语 PAZ Domane 可識別小RNA3 端的單股突出鹼基而與之結合 PIWI結構域有內切酶活性 可負責切割目標mRNA 但也有些Argonaute家族蛋白的PIWI在演化過程中喪失了內切酶的功能 人類基因組共編碼8種Argonaute蛋白 其中AGO1 4均可與miRNA結合 但僅AGO2具有內切酶活性 4 植物的AGO1參與miRNA介導的mRNA降解 其AGO4則不參與mRNA降解 但與siRNA結合後可啟動DNA甲基化等表觀遺傳調控而抑制目標基因表現 5 應用 编辑2016年 河北科技大學的韓春雨在 自然 生物技術 期刊發表名為NgAgo 英语 NgAgo 的基因編輯技術 使用格氏嗜盐碱杆菌 Natronobacterium gregoryi 的Argonaute蛋白切割DNA 但結果備受質疑 原論文於隔年被期刊撤回 6 2017年 伊利諾大學厄巴納 香檳分校團隊使用古菌激烈火球菌 英语 Pyrococcus furiosus 的Argonaute蛋白 PfAgo 為人工限制酶 於體外切割DNA 7 參考文獻 编辑 分子与细胞生物学主题 Jonas S Izaurralde E Towards a molecular understanding of microRNA mediated gene silencing Nature Reviews Genetics 2015 16 7 421 433 PMID 26077373 S2CID 24892348 doi 10 1038 nrg3965 Bohmert K Camus I Bellini C Bouchez D Caboche M Benning C AGO1 defines a novel locus of Arabidopsis controlling leaf development The EMBO Journal January 1998 17 1 170 180 PMC 1170368 PMID 9427751 doi 10 1093 emboj 17 1 170 Hutvagner G Simard MJ Argonaute proteins key players in RNA silencing Nature Reviews Molecular Cell Biology 2008 9 1 22 32 PMID 18073770 S2CID 8822503 doi 10 1038 nrm2321 hdl 10453 15429 Meister G Landthaler M Patkaniowska A Dorsett Y Teng G Tuschl T Human Argonaute2 mediates RNA cleavage targeted by miRNAs and siRNAs Molecular Cell 2004 15 2 185 197 PMID 15260970 doi 10 1016 j molcel 2004 07 007 Meins F Si Ammour A Blevins T RNA silencing systems and their relevance to plant development Annual Review of Cell and Developmental Biology 2005 21 1 297 318 PMID 16212497 doi 10 1146 annurev cellbio 21 122303 114706 Cyranoski D Authors retract controversial NgAgo gene editing study Nature 2017 doi 10 1038 nature 2017 22412 Enghiad B Zhao H Programmable DNA Guided Artificial Restriction Enzymes ACS Synthetic Biology May 2017 6 5 752 757 PMID 28165224 S2CID 3833124 doi 10 1021 acssynbio 6b00324 取自 https zh wikipedia org w index php title Argonaute amp oldid 73492727, 维基百科,wiki,书籍,书籍,图书馆,

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