fbpx
维基百科

核蛋白

核蛋白是指與核酸脱氧核醣核酸,DNA或者核糖核酸,RNA)有關的任何蛋白质[1]。譬如,組織蛋白類型的蛋白-染色質。端粒酶,核糖核蛋白和精蛋白都是核蛋白。典型的核蛋白包括核醣體核小體和病毒核衣殼蛋白。

一个核小体DNA + 组蛋白的组合。

结构

 
埃博拉病毒顆粒的橫截面圖,主要蛋白質的結構在右側顯示並貼上標籤。

核蛋白倾向于带正电,促进与带负电的核酸链的相互作用。蛋白质三级结构和许多核蛋白的生物学功能被理解[2][3]。确定核蛋白结构的重要技术包括X射线衍射核磁共振低温电子显微镜

病毒

病毒基因组(DNA或RNA)非常紧密地包装在病毒衣壳中[4][5]。因此,许多病毒只不过是有组织的核蛋白集合,其结合位点向内。 具有结构特征的病毒核蛋白包括甲型流感病毒[6]狂犬病病毒[7]伊波拉病毒Bunyamwera病毒英语Bunyamwera virus[8]施馬倫貝格病毒[8]哈扎拉病毒英语Hazara virus[9]克里米亚-刚果出血热[10],和拉萨病毒英语Lassa virus[11]

脱氧核糖核蛋白

一个脱氧核糖核蛋白(Deoxyribonucleoprotein,缩写:DNP)是DNA和蛋白质的复合物[12]。典型的例子是核小体,其中基因组DNA被包裹在真核细胞核中的八种组蛋白(histone)的簇周围以形成染色质。 在精子发生期间,精蛋白取代组蛋白。

功能

最普遍的脱氧核糖核蛋白是核小体,其中组分是核DNA。 与DNA结合的蛋白质是组蛋白精蛋白; 所得到的核蛋白位于染色体中。 因此,整个染色体,即真核生物中的染色质由这种核蛋白组成[2][13]

真核细胞中,DNA与高度浓缩的称为染色质的核蛋白复合物中的大约相同质量的组蛋白相关[14]。 这种复合物中的脱氧核糖核蛋白相互作用以产生多蛋白调节复合物,其中介入的DNA被环绕或缠绕。 脱氧核糖核蛋白参与调节DNA复制和转录[15]

脱氧核糖核蛋白也参与同源重组,一种似乎是通用的DNA修復的过程。 该过程中的中间中间步骤是将重组酶英语Recombinase蛋白的多个拷贝与单链DNA相互作用以形成DNP丝。 该过程中使用的重组酶由古菌(RadA重组酶)[16]细菌(RecA重组酶)[17]以及从酵母到人类的真核生物(Rad51Dmc1(基因)英语DMC1 (gene)重组酶)产生[18]

核糖核蛋白

一个核糖核蛋白(Ribonucleoprotein,缩写:RNP)是核糖核酸和RNA结合蛋白的复合物。 这些复合物在许多重要的生物功能中起着不可或缺的作用,包括DNA复制,调节基因表达[19]和调节RNA的代谢[20]。核糖核蛋白的一些例子包括核糖体,酶端粒酶穹窿体核糖核蛋白核糖核酸酶P,hnRNP和小核核糖核酸(snRNPs),它们与前信使核糖核酸剪接剪接体)有牵连,并且是核仁的主要成分之一[21]。 一些病毒是简单的核糖核蛋白,仅含有一个RNA分子和许多相同的蛋白质分子。其他核糖核蛋白或脱氧核糖核蛋白复合物含有许多不同的蛋白质,以及特别多的核酸分子。目前,在RCSB蛋白质数据库(PDB)中可以找到超过2000个核糖核蛋白[22]。 此外,基于从PDB获取的数据,蛋白质-RNA界面数据库(PRIDB)拥有关于RNA-蛋白质界面的信息集合[23]

功能

核糖核蛋白起到保护作用。 mRNA在细胞中不会作为游离RNA分子出现。 它们总是与核糖核蛋白结合并作为核糖核蛋白复合物起作用[14]

同样,负链RNA病毒的基因组从不以游离RNA分子的形式存在。 核糖核蛋白保护它们的基因组免受核糖核酸酶的伤害[24]。 核蛋白通常是病毒的主要抗原,因为它们具有菌株特异性和群组特异性抗原决定簇(antigenic determinant)。

参考资料

  1. ^ 醫學主題詞表(MeSH)Nucleoproteins
  2. ^ 2.0 2.1 Graeme K. Hunter G. K. (2000): Vital Forces. The discovery of the molecular basis of life. Academic Press, London 2000, ISBN 0-12-361811-8.
  3. ^ Nelson D. L., Cox M. M. (2013): Lehninger Biochemie. Springer, ISBN 978-3-540-68637-8.
  4. ^ Tzlil, Shelly; Kindt, James T.; Gelbart, William M.; Ben-Shaul, Avinoam. Forces and Pressures in DNA Packaging and Release from Viral Capsids. Biophysical Journal: 1616–1627. [2018-04-15]. doi:10.1016/s0006-3495(03)74971-6. (原始内容于2021-02-07). 
  5. ^ Purohit, Prashant K.; Inamdar, Mandar M.; Grayson, Paul D.; Squires, Todd M.; Kondev, Jané; Phillips, Rob. Forces during Bacteriophage DNA Packaging and Ejection. Biophysical Journal: 851–866. [2018-04-15]. doi:10.1529/biophysj.104.047134. (原始内容于2021-02-07). 
  6. ^ Ng, Andy Ka-Leung; Wang, Jia-Huai; Shaw, Pang-Chui. Structure and sequence analysis of influenza A virus nucleoprotein. Science in China Series C: Life Sciences. 2009-05-27, 52 (5): 439–449 [2018-04-15]. ISSN 1006-9305. doi:10.1007/s11427-009-0064-x. (原始内容于2021-02-07) (英语). 
  7. ^ Albertini, Aurélie A. V.; Wernimont, Amy K.; Muziol, Tadeusz; Ravelli, Raimond B. G.; Clapier, Cedric R.; Schoehn, Guy; Weissenhorn, Winfried; Ruigrok, Rob W. H. Crystal Structure of the Rabies Virus Nucleoprotein-RNA Complex. Science. 2006-07-21, 313 (5785): 360–363 [2018-04-15]. ISSN 0036-8075. PMID 16778023. doi:10.1126/science.1125280. (原始内容于2021-02-27) (英语). 
  8. ^ 8.0 8.1 Ariza, A.; Tanner, S. J.; Walter, C. T.; Dent, K. C.; Shepherd, D. A.; Wu, W.; Matthews, S. V.; Hiscox, J. A.; Green, T. J. Nucleocapsid protein structures from orthobunyaviruses reveal insight into ribonucleoprotein architecture and RNA polymerization. Nucleic Acids Research. 2013-06-01, 41 (11): 5912–5926. ISSN 0305-1048. PMC 3675483 . PMID 23595147. doi:10.1093/nar/gkt268. 
  9. ^ Surtees, Rebecca; Ariza, Antonio; Punch, Emma K.; Trinh, Chi H.; Dowall, Stuart D.; Hewson, Roger; Hiscox, Julian A.; Barr, John N.; Edwards, Thomas A. The crystal structure of the Hazara virus nucleocapsid protein. BMC Structural Biology. 2015-01-01, 15: 24. ISSN 1472-6807. PMC 4696240 . PMID 26715309. doi:10.1186/s12900-015-0051-3. 
  10. ^ Carter, Stephen D.; Surtees, Rebecca; Walter, Cheryl T.; Ariza, Antonio; Bergeron, Éric; Nichol, Stuart T.; Hiscox, Julian A.; Edwards, Thomas A.; Barr, John N. Structure, Function, and Evolution of the Crimean-Congo Hemorrhagic Fever Virus Nucleocapsid Protein. Journal of Virology. 2012-10-15, 86 (20): 10914–10923 [2018-04-15]. ISSN 0022-538X. PMC 3457148 . PMID 22875964. doi:10.1128/JVI.01555-12. (原始内容于2017-09-10) (英语). 
  11. ^ Qi, Xiaoxuan; Lan, Shuiyun; Wang, Wenjian; Schelde, Lisa McLay; Dong, Haohao; Wallat, Gregor D.; Ly, Hinh; Liang, Yuying; Dong, Changjiang. Cap binding and immune evasion revealed by Lassa nucleoprotein structure. Nature: 779–783. PMC 3057469 . PMID 21085117. doi:10.1038/nature09605. 
  12. ^ 醫學主題詞表(MeSH)Deoxyribonucleoproteins
  13. ^ Nelson D. L., Michael M. Cox M. M. (2013): Lehninger Principles of Biochemistry. W. H. Freeman, ISBN 978-1-4641-0962-1.
  14. ^ 14.0 14.1 Lodish, Harvey. Molecular Cell Biology. 2000. 
  15. ^ Echols, Harrison. Nucleoprotein structures initiating DNA replication, transcription, and site-specific recombination. The Journal of Biological Chemistry. 1990, 265: 14697–700. PMID 2203758. 
  16. ^ Seitz EM, Brockman JP, Sandler SJ, Clark AJ, Kowalczykowski SC. RadA protein is an archaeal RecA protein homolog that catalyzes DNA strand exchange. Genes Dev. 1998, 12 (9): 1248–53. PMC 316774 . PMID 9573041. 
  17. ^ Cox MM, Goodman MF, Kreuzer KN, Sherratt DJ, Sandler SJ, Marians KJ. The importance of repairing stalled replication forks. Nature. 2000, 404 (6773): 37–41. PMID 10716434. doi:10.1038/35003501. 
  18. ^ Crickard JB, Kaniecki K, Kwon Y, Sung P, Greene EC. Spontaneous self-segregation of Rad51 and Dmc1 DNA recombinases within mixed recombinase filaments. J. Biol. Chem. 2018. PMID 29382724. doi:10.1074/jbc.RA117.001143. 
  19. ^ Hogan, Daniel J; Riordan, Daniel P; Gerber, André P; Herschlag, Daniel; Brown, Patrick O. Diverse RNA-Binding Proteins Interact with Functionally Related Sets of RNAs, Suggesting an Extensive Regulatory System. PLoS Biology. 2016-11-07, 6 (10): e255. ISSN 1544-9173. PMC 2573929 . PMID 18959479. doi:10.1371/journal.pbio.0060255. 
  20. ^ Lukong, Kiven E.; Chang, Kai-wei; Khandjian, Edouard W.; Richard, Stéphane. RNA-binding proteins in human genetic disease. Trends in genetics: TIG. 2008-08-01, 24 (8): 416–425. ISSN 0168-9525. PMID 18597886. doi:10.1016/j.tig.2008.05.004. 
  21. ^ Ribonucleoprotein. www.uniprot.org. [2016-11-07]. (原始内容于2021-02-07). 
  22. ^ Bank, RCSB Protein Data. RCSB Protein Data Bank - RCSB PDB. (原始内容存档于2012年12月27日). 
  23. ^ Lewis, Benjamin A.; Walia, Rasna R.; Terribilini, Michael; Ferguson, Jeff; Zheng, Charles; Honavar, Vasant; Dobbs, Drena. PRIDB: a protein–RNA interface database. Nucleic Acids Research. 2016-11-07, 39 (Database issue): D277–D282. ISSN 0305-1048. PMC 3013700 . PMID 21071426. doi:10.1093/nar/gkq1108. 
  24. ^ Ruigrok, Rob WH; Crépin, Thibaut; Kolakofsky, Dan. Nucleoproteins and nucleocapsids of negative-strand RNA viruses. Current Opinion in Microbiology: 504–510. [2018-04-15]. doi:10.1016/j.mib.2011.07.011. (原始内容于2021-02-07). 

外部链接

  • (英文)

核蛋白, 是指與核酸, 脱氧核醣核酸, dna或者核糖核酸, 有關的任何蛋白质, 譬如, 組織蛋白類型的蛋白, 染色質, 端粒酶, 核糖和精蛋白都是, 典型的包括核醣體, 核小體和病毒核衣殼蛋白, 一个核小体是dna, 组蛋白的组合, 目录, 结构, 病毒, 脱氧核糖, 功能, 核糖, 功能, 参考资料, 外部链接结构, 编辑, 埃博拉病毒顆粒的橫截面圖, 主要蛋白質的結構在右側顯示並貼上標籤, 倾向于带正电, 促进与带负电的核酸链的相互作用, 蛋白质三级结构和许多的生物学功能被理解, 确定结构的重要技术包括x射线. 核蛋白是指與核酸 脱氧核醣核酸 DNA或者核糖核酸 RNA 有關的任何蛋白质 1 譬如 組織蛋白類型的蛋白 染色質 端粒酶 核糖核蛋白和精蛋白都是核蛋白 典型的核蛋白包括核醣體 核小體和病毒核衣殼蛋白 一个核小体是DNA 组蛋白的组合 目录 1 结构 1 1 病毒 2 脱氧核糖核蛋白 2 1 功能 3 核糖核蛋白 3 1 功能 4 参考资料 5 外部链接结构 编辑 埃博拉病毒顆粒的橫截面圖 主要蛋白質的結構在右側顯示並貼上標籤 核蛋白倾向于带正电 促进与带负电的核酸链的相互作用 蛋白质三级结构和许多核蛋白的生物学功能被理解 2 3 确定核蛋白结构的重要技术包括X射线衍射 核磁共振和低温电子显微镜 病毒 编辑 病毒基因组 DNA或RNA 非常紧密地包装在病毒衣壳中 4 5 因此 许多病毒只不过是有组织的核蛋白集合 其结合位点向内 具有结构特征的病毒核蛋白包括甲型流感病毒 6 狂犬病病毒 7 伊波拉病毒 Bunyamwera病毒 英语 Bunyamwera virus 8 施馬倫貝格病毒 8 哈扎拉病毒 英语 Hazara virus 9 克里米亚 刚果出血热 10 和拉萨病毒 英语 Lassa virus 11 脱氧核糖核蛋白 编辑一个脱氧核糖核蛋白 Deoxyribonucleoprotein 缩写 DNP 是DNA和蛋白质的复合物 12 典型的例子是核小体 其中基因组DNA被包裹在真核细胞核中的八种组蛋白 histone 的簇周围以形成染色质 在精子发生期间 精蛋白取代组蛋白 功能 编辑 最普遍的脱氧核糖核蛋白是核小体 其中组分是核DNA 与DNA结合的蛋白质是组蛋白和精蛋白 所得到的核蛋白位于染色体中 因此 整个染色体 即真核生物中的染色质由这种核蛋白组成 2 13 在真核细胞中 DNA与高度浓缩的称为染色质的核蛋白复合物中的大约相同质量的组蛋白相关 14 这种复合物中的脱氧核糖核蛋白相互作用以产生多蛋白调节复合物 其中介入的DNA被环绕或缠绕 脱氧核糖核蛋白参与调节DNA复制和转录 15 脱氧核糖核蛋白也参与同源重组 一种似乎是通用的DNA修復的过程 该过程中的中间中间步骤是将重组酶 英语 Recombinase 蛋白的多个拷贝与单链DNA相互作用以形成DNP丝 该过程中使用的重组酶由古菌 RadA重组酶 16 细菌 RecA重组酶 17 以及从酵母到人类的真核生物 Rad51和Dmc1 基因 英语 DMC1 gene 重组酶 产生 18 核糖核蛋白 编辑一个核糖核蛋白 Ribonucleoprotein 缩写 RNP 是核糖核酸和RNA结合蛋白的复合物 这些复合物在许多重要的生物功能中起着不可或缺的作用 包括DNA复制 调节基因表达 19 和调节RNA的代谢 20 核糖核蛋白的一些例子包括核糖体 酶端粒酶 穹窿体核糖核蛋白 核糖核酸酶P hnRNP和小核核糖核酸 snRNPs 它们与前信使核糖核酸剪接 剪接体 有牵连 并且是核仁的主要成分之一 21 一些病毒是简单的核糖核蛋白 仅含有一个RNA分子和许多相同的蛋白质分子 其他核糖核蛋白或脱氧核糖核蛋白复合物含有许多不同的蛋白质 以及特别多的核酸分子 目前 在RCSB蛋白质数据库 PDB 中可以找到超过2000个核糖核蛋白 22 此外 基于从PDB获取的数据 蛋白质 RNA界面数据库 PRIDB 拥有关于RNA 蛋白质界面的信息集合 23 功能 编辑 核糖核蛋白起到保护作用 mRNA在细胞中不会作为游离RNA分子出现 它们总是与核糖核蛋白结合并作为核糖核蛋白复合物起作用 14 同样 负链RNA病毒的基因组从不以游离RNA分子的形式存在 核糖核蛋白保护它们的基因组免受核糖核酸酶的伤害 24 核蛋白通常是病毒的主要抗原 因为它们具有菌株特异性和群组特异性抗原决定簇 antigenic determinant 参考资料 编辑 醫學主題詞表 MeSH Nucleoproteins 2 0 2 1 Graeme K Hunter G K 2000 Vital Forces The discovery of the molecular basis of life Academic Press London 2000 ISBN 0 12 361811 8 Nelson D L Cox M M 2013 Lehninger Biochemie Springer ISBN 978 3 540 68637 8 Tzlil Shelly Kindt James T Gelbart William M Ben Shaul Avinoam Forces and Pressures in DNA Packaging and Release from Viral Capsids Biophysical Journal 1616 1627 2018 04 15 doi 10 1016 s0006 3495 03 74971 6 原始内容存档于2021 02 07 Purohit Prashant K Inamdar Mandar M Grayson Paul D Squires Todd M Kondev Jane Phillips Rob Forces during Bacteriophage DNA Packaging and Ejection Biophysical Journal 851 866 2018 04 15 doi 10 1529 biophysj 104 047134 原始内容存档于2021 02 07 Ng Andy Ka Leung Wang Jia Huai Shaw Pang Chui Structure and sequence analysis of influenza A virus nucleoprotein Science in China Series C Life Sciences 2009 05 27 52 5 439 449 2018 04 15 ISSN 1006 9305 doi 10 1007 s11427 009 0064 x 原始内容存档于2021 02 07 英语 Albertini Aurelie A V Wernimont Amy K Muziol Tadeusz Ravelli Raimond B G Clapier Cedric R Schoehn Guy Weissenhorn Winfried Ruigrok Rob W H Crystal Structure of the Rabies Virus Nucleoprotein RNA Complex Science 2006 07 21 313 5785 360 363 2018 04 15 ISSN 0036 8075 PMID 16778023 doi 10 1126 science 1125280 原始内容存档于2021 02 27 英语 8 0 8 1 Ariza A Tanner S J Walter C T Dent K C Shepherd D A Wu W Matthews S V Hiscox J A Green T J Nucleocapsid protein structures from orthobunyaviruses reveal insight into ribonucleoprotein architecture and RNA polymerization Nucleic Acids Research 2013 06 01 41 11 5912 5926 ISSN 0305 1048 PMC 3675483 PMID 23595147 doi 10 1093 nar gkt268 Surtees Rebecca Ariza Antonio Punch Emma K Trinh Chi H Dowall Stuart D Hewson Roger Hiscox Julian A Barr John N Edwards Thomas A The crystal structure of the Hazara virus nucleocapsid protein BMC Structural Biology 2015 01 01 15 24 ISSN 1472 6807 PMC 4696240 PMID 26715309 doi 10 1186 s12900 015 0051 3 Carter Stephen D Surtees Rebecca Walter Cheryl T Ariza Antonio Bergeron Eric Nichol Stuart T Hiscox Julian A Edwards Thomas A Barr John N Structure Function and Evolution of the Crimean Congo Hemorrhagic Fever Virus Nucleocapsid Protein Journal of Virology 2012 10 15 86 20 10914 10923 2018 04 15 ISSN 0022 538X PMC 3457148 PMID 22875964 doi 10 1128 JVI 01555 12 原始内容存档于2017 09 10 英语 Qi Xiaoxuan Lan Shuiyun Wang Wenjian Schelde Lisa McLay Dong Haohao Wallat Gregor D Ly Hinh Liang Yuying Dong Changjiang Cap binding and immune evasion revealed by Lassa nucleoprotein structure Nature 779 783 PMC 3057469 PMID 21085117 doi 10 1038 nature09605 醫學主題詞表 MeSH Deoxyribonucleoproteins Nelson D L Michael M Cox M M 2013 Lehninger Principles of Biochemistry W H Freeman ISBN 978 1 4641 0962 1 14 0 14 1 Lodish Harvey Molecular Cell Biology 2000 Echols Harrison Nucleoprotein structures initiating DNA replication transcription and site specific recombination The Journal of Biological Chemistry 1990 265 14697 700 PMID 2203758 Seitz EM Brockman JP Sandler SJ Clark AJ Kowalczykowski SC RadA protein is an archaeal RecA protein homolog that catalyzes DNA strand exchange Genes Dev 1998 12 9 1248 53 PMC 316774 PMID 9573041 Cox MM Goodman MF Kreuzer KN Sherratt DJ Sandler SJ Marians KJ The importance of repairing stalled replication forks Nature 2000 404 6773 37 41 PMID 10716434 doi 10 1038 35003501 Crickard JB Kaniecki K Kwon Y Sung P Greene EC Spontaneous self segregation of Rad51 and Dmc1 DNA recombinases within mixed recombinase filaments J Biol Chem 2018 PMID 29382724 doi 10 1074 jbc RA117 001143 Hogan Daniel J Riordan Daniel P Gerber Andre P Herschlag Daniel Brown Patrick O Diverse RNA Binding Proteins Interact with Functionally Related Sets of RNAs Suggesting an Extensive Regulatory System PLoS Biology 2016 11 07 6 10 e255 ISSN 1544 9173 PMC 2573929 PMID 18959479 doi 10 1371 journal pbio 0060255 Lukong Kiven E Chang Kai wei Khandjian Edouard W Richard Stephane RNA binding proteins in human genetic disease Trends in genetics TIG 2008 08 01 24 8 416 425 ISSN 0168 9525 PMID 18597886 doi 10 1016 j tig 2008 05 004 Ribonucleoprotein www uniprot org 2016 11 07 原始内容存档于2021 02 07 Bank RCSB Protein Data RCSB Protein Data Bank RCSB PDB 原始内容存档于2012年12月27日 Lewis Benjamin A Walia Rasna R Terribilini Michael Ferguson Jeff Zheng Charles Honavar Vasant Dobbs Drena PRIDB a protein RNA interface database Nucleic Acids Research 2016 11 07 39 Database issue D277 D282 ISSN 0305 1048 PMC 3013700 PMID 21071426 doi 10 1093 nar gkq1108 Ruigrok Rob WH Crepin Thibaut Kolakofsky Dan Nucleoproteins and nucleocapsids of negative strand RNA viruses Current Opinion in Microbiology 504 510 2018 04 15 doi 10 1016 j mib 2011 07 011 原始内容存档于2021 02 07 外部链接 编辑 英文 PRIDB 蛋白质 RNA界面数据库 取自 https zh wikipedia org w index php title 核蛋白 amp oldid 72278545, 维基百科,wiki,书籍,书籍,图书馆,

文章

,阅读,下载,免费,免费下载,mp3,视频,mp4,3gp, jpg,jpeg,gif,png,图片,音乐,歌曲,电影,书籍,游戏,游戏。