WIV16病毒

WIV16病毒（SL-CoV-WIV6）是嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒（SARSr-CoV）的一個病毒株，與造成SARS事件的SARS-CoV全基因組序列相似度為96%，同使用ACE2為受體感染細胞，是迄今發現和SARS-CoV序列相似度最高的蝙蝠病毒，於2016年發表。

WIV16病毒
病毒分類
–未分级–：	病毒 Virus
域：	核糖病毒域 Riboviria
界：	正核糖病毒界 Orthornavirae
门：	小核糖病毒门 Pisuviricota
纲：	小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes
目：	網巢病毒目 Nidovirales
科：	冠状病毒科 Coronaviridae
属：	乙型冠狀病毒屬 Betacoronavirus
亚属：	SARS乙型冠状病毒亚属 Sarbecovirus
种：	SARSr-CoV
病毒株：	WIV16病毒 SL-CoV WIV16

發現

WIV16病毒於2013年在雲南昆明的中華菊頭蝠糞便樣本中發現並成功分離，其基因組長度為30290nt，與SARS-CoV的序列相似度為為96%，略高於WIV1病毒的95.6%和SHC014病毒的95.4%，是迄今發現和SARS-CoV序列相似度最高的蝙蝠病毒。另外此病毒刺突蛋白胺基酸序列和SARS-CoV的相似度為97%，也高於其他蝙蝠病毒與SARS-CoV的相似度，負責與宿主細胞受體ACE2結合的受體結合結構域（RBD）之胺基酸相似度則為95%，與WIV1相似；但其ORF8和SARS-CoV的相似度則較低，胺基酸序列相似度只有約40%^[1]。WIV16病毒和WIV病毒在ORF6和ORF7之間皆有另一開放閱讀框ORFX編碼一輔助蛋白，為這兩個病毒株所特有，可能可以抑制宿主細胞的干擾素β，並刺激NF-κB表現，進而調節宿主的免疫反應^[2]。

SARS相關蝙蝠病毒中，僅有WIV16病毒與WIV1病毒被成功從樣本中分離，並於體外細胞培養^[1][2]。

演化樹

截至2021年1月 (2021-01)^[update]，SARS-CoV與相關病毒株的系統發生樹：

	16BO133 與SARS-COV相似度82.8 % · 马铁菊头蝠 · 韓國全羅北道 （2016年採集、2019年發表）^[3]         Rf1 87.8 % · 马铁菊头蝠 · 中國湖北宜昌 （2004年採集、2005年發表）^[4]     BtCoV HKU3 87.9 % · 中华菊头蝠 · 香港、中國廣東 （2004年採集、2005年發表、2010年又發表若干新病毒株）^[5]         LYRa11 90.9 % · 中菊头蝠 · 中國雲南保山 （2011年採集、2014年發表）^[6]       Rp3 92.6 % · 皮氏菊头蝠 · 中國廣西南寧 （2004年採集、2005年發表）^[4]       SL-CoV YNLF_31C 93.5 % · 马铁菊头蝠 · 中國雲南禄丰 （2013年採集、2015年發表）^[7]     SL-CoV YNLF_34C 93.5 % · 马铁菊头蝠 · 中國雲南禄丰 （2013年採集、2015年發表）^[7]             SHC014 95.4 % · 中華菊頭蝠 · 中國雲南昆明 （2011年採集、2013年發表）^[8]     WIV1 95.6 % · 中华菊头蝠 · 中國雲南昆明 （2012年採集、2013年發表）^[8]       WIV16 96.0 % · 中华菊头蝠 · 中國雲南昆明 （2013年採集、2016年發表）^[1]         果子貍SARS冠狀病毒 99.8 % · 果子狸 · 中國廣東^[5]     SARS-CoV 100 %
	SARS-CoV-2 79 %

  蝙蝠病毒

  果子狸病毒

  人類病毒

參考文獻

•  病毒主题

1. Yang, Xing-Lou; Hu, Ben; Wang, Bo; Wang, Mei-Niang; Zhang, Qian; Zhang, Wei; Wu, Li-Jun; Ge, Xing-Yi; Zhang, Yun-Zhi; Daszak, Peter; Wang, Lin-Fa. Perlman, S. , 编. Isolation and Characterization of a Novel Bat Coronavirus Closely Related to the Direct Progenitor of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus. Journal of Virology. 2016-03-15, 90 (6). ISSN 0022-538X. PMC 4810638  . PMID 26719272. doi:10.1128/JVI.02582-15 （英语）.  引文格式1维护：PMC格式 (link)
2. Zeng LP, Gao YT, Ge XY, Zhang Q, Peng C, Yang XL; et al. Bat Severe Acute Respiratory Syndrome-Like Coronavirus WIV1 Encodes an Extra Accessory Protein, ORFX, Involved in Modulation of the Host Immune Response.. J Virol. 2016, 90 (14): 6573–6582. PMC 4936131  . PMID 27170748. doi:10.1128/JVI.03079-15. 
3. Kim, Yongkwan; Son, Kidong; Kim, Young-Sik; Lee, Sook-Young; Jheong, Weonhwa; Oem, Jae-Ku. Complete genome analysis of a SARS-like bat coronavirus identified in the Republic of Korea. Virus Genes. 2019-08, 55 (4). ISSN 0920-8569. PMC 7089380  . PMID 31076983. doi:10.1007/s11262-019-01668-w （英语）.  引文格式1维护：PMC格式 (link)
4. Li, Wendong; Shi, Zhengli; Yu, Meng; Ren, Wuze; Smith, Craig; Epstein, Jonathan H.; Wang, Hanzhong; Crameri, Gary; Hu, Zhihong; Zhang, Huajun; Zhang, Jianhong. Bats Are Natural Reservoirs of SARS-Like Coronaviruses. Science. 2005-10-28, 310 (5748). ISSN 0036-8075. doi:10.1126/science.1118391 （英语）. 
5. Ge, Xing-Yi; Hu, Ben; Shi, Zheng-Li. Bat Coronaviruses. Wang, Lin-Fa (编). Bats and Viruses. Hoboken, NJ: John Wiley & Sons, Inc. 2015-06-26: 127–155. ISBN 978-1-118-81882-4. doi:10.1002/9781118818824.ch5 （英语）. 
6. He, Biao; Zhang, Yuzhen; Xu, Lin; Yang, Weihong; Yang, Fanli; Feng, Yun; Xia, Lele; Zhou, Jihua; Zhen, Weibin; Feng, Ye; Guo, Huancheng. Perlman, S. , 编. Identification of Diverse Alphacoronaviruses and Genomic Characterization of a Novel Severe Acute Respiratory Syndrome-Like Coronavirus from Bats in China. Journal of Virology. 2014-06-15, 88 (12). ISSN 0022-538X. PMC 4054348  . PMID 24719429. doi:10.1128/JVI.00631-14 （英语）.  引文格式1维护：PMC格式 (link)
7. Lau, Susanna K. P.; Feng, Yun; Chen, Honglin; Luk, Hayes K. H.; Yang, Wei-Hong; Li, Kenneth S. M.; Zhang, Yu-Zhen; Huang, Yi; Song, Zhi-Zhong; Chow, Wang-Ngai; Fan, Rachel Y. Y. Perlman, S. , 编. Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS) Coronavirus ORF8 Protein Is Acquired from SARS-Related Coronavirus from Greater Horseshoe Bats through Recombination. Journal of Virology. 2015-10-15, 89 (20). ISSN 0022-538X. PMC 4580176  . PMID 26269185. doi:10.1128/JVI.01048-15 （英语）.  引文格式1维护：PMC格式 (link)
8. Ge, Xing-Yi; Li, Jia-Lu; Yang, Xing-Lou; Chmura, Aleksei A.; Zhu, Guangjian; Epstein, Jonathan H.; Mazet, Jonna K.; Hu, Ben; Zhang, Wei; Peng, Cheng; Zhang, Yu-Ji. Isolation and characterization of a bat SARS-like coronavirus that uses the ACE2 receptor. Nature. 2013-11, 503 (7477). Bibcode:2013Natur.503..535G. ISSN 0028-0836. PMC 5389864  . PMID 24172901. doi:10.1038/nature12711 （英语）.  引文格式1维护：PMC格式 (link)