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16BO133病毒

16BO133病毒嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒(SARSr-CoV)的一個病毒株,在韓國馬鐵菊頭蝠中發現,於2019年發表,其基因組被完整定序,是首個被完整定序的韓國SARSr-CoV病毒株,在SARSr-CoV中屬於SARS-CoV相關病毒,與其基因組序列相似度為82.8%。

16BO133病毒
病毒分類
–未分级– 病毒 Virus
域: 核糖病毒域 Riboviria
界: 正核糖病毒界 Orthornavirae
门: 小核糖病毒门 Pisuviricota
纲: 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes
目: 網巢病毒目 Nidovirales
科: 冠状病毒科 Coronaviridae
属: 乙型冠狀病毒屬 Betacoronavirus
亚属: SARS乙型冠状病毒亚属 Sarbecovirus
种: 嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒 SARSr-CoV
病毒株 16BO133病毒 16BO133

發現 编辑

16BO133病毒於2016年在韓國馬鐵菊頭蝠的口腔樣本中被發現,此病毒株的基因組長29075nt。在SARSr-CoV中,16BO133和2016年發表、自中國吉林馬鐵菊頭蝠中發現的JTMC15病毒最為接近,基因組核酸序列相似度為98.3%,與其他SARSr-CoV相較之下,這兩個病毒株因爲ORF7b末端的框移突變而喪失了ORF8[1][2]。16BO133病毒和SARS-CoV的基因組核酸序列相似度則為82.8%[3]

過去雖有其他SARSr-CoV病毒株在韓國被發現(B15-21病毒等),但皆無完整序列定序[4],16BO133病毒是首個被完整定序的韓國SARSr-CoV病毒株[1]

演化樹 编辑

截至2021年1月 (2021-01)SARS-CoV與相關病毒株的系統發生樹

16BO133 與SARS-COV相似度82.8 % · 马铁菊头蝠 · 韓國全羅北道 (2016年採集、2019年發表)[1]

Rf1 87.8 % · 马铁菊头蝠 · 中國湖北宜昌 (2004年採集、2005年發表)[5]

BtCoV HKU3 87.9 % · 中华菊头蝠 · 香港、中國廣東 (2004年採集、2005年發表、2010年又發表若干新病毒株)[6]

LYRa11 90.9 % · 中菊头蝠 · 中國雲南保山 (2011年採集、2014年發表)[7]

Rp3 92.6 % · 皮氏菊头蝠 · 中國廣西南寧 (2004年採集、2005年發表)[5]

SL-CoV YNLF_31C 93.5 % · 马铁菊头蝠 · 中國雲南禄丰 (2013年採集、2015年發表)[8]

SL-CoV YNLF_34C 93.5 % · 马铁菊头蝠 · 中國雲南禄丰 (2013年採集、2015年發表)[8]

SHC014 95.4 % · 中華菊頭蝠 · 中國雲南昆明 (2011年採集、2013年發表)[9]

WIV1 95.6 % · 中华菊头蝠 · 中國雲南昆明 (2012年採集、2013年發表)[9]

WIV16 96.0 % · 中华菊头蝠 · 中國雲南昆明 (2013年採集、2016年發表)[10]

果子貍SARS冠狀病毒 99.8 % · 果子狸 · 中國廣東[6]

SARS-CoV 100 %

SARS-CoV-2 79 %

  蝙蝠病毒
  果子狸病毒
  人類病毒


參考文獻 编辑

  1. ^ 1.0 1.1 1.2 Kim, Yongkwan; Son, Kidong; Kim, Young-Sik; Lee, Sook-Young; Jheong, Weonhwa; Oem, Jae-Ku. Complete genome analysis of a SARS-like bat coronavirus identified in the Republic of Korea. Virus Genes. 2019-08, 55 (4). ISSN 0920-8569. PMC 7089380 . PMID 31076983. doi:10.1007/s11262-019-01668-w (英语). 
  2. ^ Xu L, Zhang F, Yang W, Jiang T, Lu G, He B; et al. Detection and characterization of diverse alpha- and betacoronaviruses from bats in China.. Virol Sin. 2016, 31 (1): 69–77. PMC 7090707 . PMID 26847648. doi:10.1007/s12250-016-3727-3. 
  3. ^ Na EJ, Lee SY, Kim HJ, Oem JK. Comparative genetic analyses of Korean bat coronaviruses with SARS-CoV and the newly emerged SARS-CoV-2.. J Vet Sci. 2021, 22 (1): e12. PMC 7850784 . PMID 33522164. doi:10.4142/jvs.2021.22.e12. 
  4. ^ Kim HK, Yoon SW, Kim DJ, Koo BS, Noh JY, Kim JH; et al. Detection of Severe Acute Respiratory Syndrome-Like, Middle East Respiratory Syndrome-Like Bat Coronaviruses and Group H Rotavirus in Faeces of Korean Bats.. Transbound Emerg Dis. 2016, 63 (4): 365–72. PMC 7169817 . PMID 27213718. doi:10.1111/tbed.12515. 
  5. ^ 5.0 5.1 Li, Wendong; Shi, Zhengli; Yu, Meng; Ren, Wuze; Smith, Craig; Epstein, Jonathan H.; Wang, Hanzhong; Crameri, Gary; Hu, Zhihong; Zhang, Huajun; Zhang, Jianhong. Bats Are Natural Reservoirs of SARS-Like Coronaviruses. Science. 2005-10-28, 310 (5748). ISSN 0036-8075. doi:10.1126/science.1118391 (英语). 
  6. ^ 6.0 6.1 Ge, Xing-Yi; Hu, Ben; Shi, Zheng-Li. Bat Coronaviruses. Wang, Lin-Fa (编). Bats and Viruses. Hoboken, NJ: John Wiley & Sons, Inc. 2015-06-26: 127–155. ISBN 978-1-118-81882-4. doi:10.1002/9781118818824.ch5 (英语). 
  7. ^ He, Biao; Zhang, Yuzhen; Xu, Lin; Yang, Weihong; Yang, Fanli; Feng, Yun; Xia, Lele; Zhou, Jihua; Zhen, Weibin; Feng, Ye; Guo, Huancheng. Perlman, S. , 编. Identification of Diverse Alphacoronaviruses and Genomic Characterization of a Novel Severe Acute Respiratory Syndrome-Like Coronavirus from Bats in China. Journal of Virology. 2014-06-15, 88 (12). ISSN 0022-538X. PMC 4054348 . PMID 24719429. doi:10.1128/JVI.00631-14 (英语). 
  8. ^ 8.0 8.1 Lau, Susanna K. P.; Feng, Yun; Chen, Honglin; Luk, Hayes K. H.; Yang, Wei-Hong; Li, Kenneth S. M.; Zhang, Yu-Zhen; Huang, Yi; Song, Zhi-Zhong; Chow, Wang-Ngai; Fan, Rachel Y. Y. Perlman, S. , 编. Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS) Coronavirus ORF8 Protein Is Acquired from SARS-Related Coronavirus from Greater Horseshoe Bats through Recombination. Journal of Virology. 2015-10-15, 89 (20). ISSN 0022-538X. PMC 4580176 . PMID 26269185. doi:10.1128/JVI.01048-15 (英语). 
  9. ^ 9.0 9.1 Ge, Xing-Yi; Li, Jia-Lu; Yang, Xing-Lou; Chmura, Aleksei A.; Zhu, Guangjian; Epstein, Jonathan H.; Mazet, Jonna K.; Hu, Ben; Zhang, Wei; Peng, Cheng; Zhang, Yu-Ji. Isolation and characterization of a bat SARS-like coronavirus that uses the ACE2 receptor. Nature. 2013-11, 503 (7477). Bibcode:2013Natur.503..535G. ISSN 0028-0836. PMC 5389864 . PMID 24172901. doi:10.1038/nature12711 (英语). 
  10. ^ Yang, Xing-Lou; Hu, Ben; Wang, Bo; Wang, Mei-Niang; Zhang, Qian; Zhang, Wei; Wu, Li-Jun; Ge, Xing-Yi; Zhang, Yun-Zhi; Daszak, Peter; Wang, Lin-Fa. Perlman, S. , 编. Isolation and Characterization of a Novel Bat Coronavirus Closely Related to the Direct Progenitor of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus. Journal of Virology. 2016-03-15, 90 (6). ISSN 0022-538X. PMC 4810638 . PMID 26719272. doi:10.1128/JVI.02582-15 (英语). 

16bo133病毒, 是嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒, sarsr, 的一個病毒株, 在韓國的馬鐵菊頭蝠中發現, 於2019年發表, 其基因組被完整定序, 是首個被完整定序的韓國sarsr, cov病毒株, 在sarsr, cov中屬於sars, cov相關病毒, 與其基因組序列相似度為82, 病毒分類, 未分级, 病毒, virus域, 核糖病毒域, riboviria界, 正核糖病毒界, orthornavirae门, 小核糖病毒门, pisuviricota纲, 小南嵌套病毒纲, pisoniviric. 16BO133病毒是嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒 SARSr CoV 的一個病毒株 在韓國的馬鐵菊頭蝠中發現 於2019年發表 其基因組被完整定序 是首個被完整定序的韓國SARSr CoV病毒株 在SARSr CoV中屬於SARS CoV相關病毒 與其基因組序列相似度為82 8 16BO133病毒病毒分類 未分级 病毒 Virus域 核糖病毒域 Riboviria界 正核糖病毒界 Orthornavirae门 小核糖病毒门 Pisuviricota纲 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes目 網巢病毒目 Nidovirales科 冠状病毒科 Coronaviridae属 乙型冠狀病毒屬 Betacoronavirus亚属 SARS乙型冠状病毒亚属 Sarbecovirus种 嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒 SARSr CoV病毒株 16BO133病毒 16BO133發現 编辑16BO133病毒於2016年在韓國馬鐵菊頭蝠的口腔樣本中被發現 此病毒株的基因組長29075nt 在SARSr CoV中 16BO133和2016年發表 自中國吉林馬鐵菊頭蝠中發現的JTMC15病毒最為接近 基因組核酸序列相似度為98 3 與其他SARSr CoV相較之下 這兩個病毒株因爲ORF7b末端的框移突變而喪失了ORF8 1 2 16BO133病毒和SARS CoV的基因組核酸序列相似度則為82 8 3 過去雖有其他SARSr CoV病毒株在韓國被發現 B15 21病毒等 但皆無完整序列定序 4 16BO133病毒是首個被完整定序的韓國SARSr CoV病毒株 1 演化樹 编辑截至2021年1月 2021 01 update SARS CoV與相關病毒株的系統發生樹 16BO133 與SARS COV相似度82 8 马铁菊头蝠 韓國全羅北道 2016年採集 2019年發表 1 Rf1 87 8 马铁菊头蝠 中國湖北宜昌 2004年採集 2005年發表 5 BtCoV HKU3 87 9 中华菊头蝠 香港 中國廣東 2004年採集 2005年發表 2010年又發表若干新病毒株 6 LYRa11 90 9 中菊头蝠 中國雲南保山 2011年採集 2014年發表 7 Rp3 92 6 皮氏菊头蝠 中國廣西南寧 2004年採集 2005年發表 5 SL CoV YNLF 31C 93 5 马铁菊头蝠 中國雲南禄丰 2013年採集 2015年發表 8 SL CoV YNLF 34C 93 5 马铁菊头蝠 中國雲南禄丰 2013年採集 2015年發表 8 SHC014 95 4 中華菊頭蝠 中國雲南昆明 2011年採集 2013年發表 9 WIV1 95 6 中华菊头蝠 中國雲南昆明 2012年採集 2013年發表 9 WIV16 96 0 中华菊头蝠 中國雲南昆明 2013年採集 2016年發表 10 果子貍SARS冠狀病毒 99 8 果子狸 中國廣東 6 SARS CoV 100 SARS CoV 2 79 蝙蝠病毒 果子狸病毒 人類病毒參考文獻 编辑 nbsp 病毒主题 1 0 1 1 1 2 Kim Yongkwan Son Kidong Kim Young Sik Lee Sook Young Jheong Weonhwa Oem Jae Ku Complete genome analysis of a SARS like bat coronavirus identified in the Republic of Korea Virus Genes 2019 08 55 4 ISSN 0920 8569 PMC 7089380 nbsp PMID 31076983 doi 10 1007 s11262 019 01668 w 英语 Xu L Zhang F Yang W Jiang T Lu G He B et al Detection and characterization of diverse alpha and betacoronaviruses from bats in China Virol Sin 2016 31 1 69 77 PMC 7090707 nbsp PMID 26847648 doi 10 1007 s12250 016 3727 3 Na EJ Lee SY Kim HJ Oem JK Comparative genetic analyses of Korean bat coronaviruses with SARS CoV and the newly emerged SARS CoV 2 J Vet Sci 2021 22 1 e12 PMC 7850784 nbsp PMID 33522164 doi 10 4142 jvs 2021 22 e12 Kim HK Yoon SW Kim DJ Koo BS Noh JY Kim JH et al Detection of Severe Acute Respiratory Syndrome Like Middle East Respiratory Syndrome Like Bat Coronaviruses and Group H Rotavirus in Faeces of Korean Bats Transbound Emerg Dis 2016 63 4 365 72 PMC 7169817 nbsp PMID 27213718 doi 10 1111 tbed 12515 5 0 5 1 Li Wendong Shi Zhengli Yu Meng Ren Wuze Smith Craig Epstein Jonathan H Wang Hanzhong Crameri Gary Hu Zhihong Zhang Huajun Zhang Jianhong Bats Are Natural Reservoirs of SARS Like Coronaviruses Science 2005 10 28 310 5748 ISSN 0036 8075 doi 10 1126 science 1118391 英语 6 0 6 1 Ge Xing Yi Hu Ben Shi Zheng Li Bat Coronaviruses Wang Lin Fa 编 Bats and Viruses Hoboken NJ John Wiley amp Sons Inc 2015 06 26 127 155 ISBN 978 1 118 81882 4 doi 10 1002 9781118818824 ch5 英语 He Biao Zhang Yuzhen Xu Lin Yang Weihong Yang Fanli Feng Yun Xia Lele Zhou Jihua Zhen Weibin Feng Ye Guo Huancheng Perlman S 编 Identification of Diverse Alphacoronaviruses and Genomic Characterization of a Novel Severe Acute Respiratory Syndrome Like Coronavirus from Bats in China Journal of Virology 2014 06 15 88 12 ISSN 0022 538X PMC 4054348 nbsp PMID 24719429 doi 10 1128 JVI 00631 14 英语 8 0 8 1 Lau Susanna K P Feng Yun Chen Honglin Luk Hayes K H Yang Wei Hong Li Kenneth S M Zhang Yu Zhen Huang Yi Song Zhi Zhong Chow Wang Ngai Fan Rachel Y Y Perlman S 编 Severe Acute Respiratory Syndrome SARS Coronavirus ORF8 Protein Is Acquired from SARS Related Coronavirus from Greater Horseshoe Bats through Recombination Journal of Virology 2015 10 15 89 20 ISSN 0022 538X PMC 4580176 nbsp PMID 26269185 doi 10 1128 JVI 01048 15 英语 9 0 9 1 Ge Xing Yi Li Jia Lu Yang Xing Lou Chmura Aleksei A Zhu Guangjian Epstein Jonathan H Mazet Jonna K Hu Ben Zhang Wei Peng Cheng Zhang Yu Ji Isolation and characterization of a bat SARS like coronavirus that uses the ACE2 receptor Nature 2013 11 503 7477 Bibcode 2013Natur 503 535G ISSN 0028 0836 PMC 5389864 nbsp PMID 24172901 doi 10 1038 nature12711 英语 Yang Xing Lou Hu Ben Wang Bo Wang Mei Niang Zhang Qian Zhang Wei Wu Li Jun Ge Xing Yi Zhang Yun Zhi Daszak Peter Wang Lin Fa Perlman S 编 Isolation and Characterization of a Novel Bat Coronavirus Closely Related to the Direct Progenitor of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus Journal of Virology 2016 03 15 90 6 ISSN 0022 538X PMC 4810638 nbsp PMID 26719272 doi 10 1128 JVI 02582 15 英语 取自 https zh wikipedia org w index php title 16BO133病毒 amp oldid 74180476, 维基百科,wiki,书籍,书籍,图书馆,

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