1567年，黑森伯爵腓力一世去世，他的四子格奧爾格继承了黑森伯国境内前卡策内尔恩博根伯爵领（英语：County of Katzenelnbogen）的土地，是为黑森-达姆施塔特伯国。格奧爾格的长兄威廉四世继承了黑森-卡塞尔伯国，二哥路德維希四世得到黑森-马尔堡伯国（英语：Hesse-Marburg），三哥腓力二世（英语：Philip II, Landgrave of Hesse-Rheinfels）则成为黑森-莱茵菲尔斯（英语：Hesse-Rheinfels）的领主。
黑森战争
1583年，菲利普二世无嗣而终，黑森-莱茵菲尔斯支绝嗣。1604年，路易四世也于马尔堡城堡无嗣而终。加尔文主义与路德宗之间的信仰之争伴随着黑森-卡塞尔与黑森-达姆施塔特之间对兄弟领地的继承争议，并导致了长达数十年的对立。为了对抗黑森-卡塞尔伯爵莫里茨（英语：Maurice, Landgrave of Hesse-Kassel）所建立的加尔文宗马尔堡大学，莫里茨的表兄，即黑森-达姆斯塔特伯爵路易五世（英语：Louis V, Landgrave of Hesse-Darmstadt）在1607年建立了路德宗吉森大学。
三十年战争期间，黑森的继承争议愈发激烈。黑森-卡塞尔选择站在新教联盟一边，而黑森-达姆施塔特选择支持哈布斯堡皇帝。黑森-霍姆堡伯国和黑森-罗滕堡伯国（英语：Landgraviate of Hesse-Rotenburg）分别在1622年和1627年脱离了黑森-达姆施塔特。尽管黑森-达姆施塔特和黑森-卡塞尔在1627达成协议，但冲突很快再燃，并导致了一系列战斗在1645年爆发，特别是帝国军围攻多斯滕（英语：Siege of Dorsten），和黑森-卡塞尔女摄政阿玛丽·伊丽莎白（英语：Countess Amalie Elisabeth of Hanau-Münzenberg）对马尔堡的围攻。黑森-卡塞尔与黑森-达姆施塔特的冲突最终于1648年威斯特伐利亚和约签订前夕得到解决。这离黑森伯国一分为四已经过去八十多年了。大部分有争议的上黑森领土（包括马尔堡）被划给了黑森-卡塞尔，而黑森-达姆施塔特则保留了吉森和比登科普夫。
18世纪
1736年，黑森-达姆施塔特继承了绝嗣的哈瑙-利希滕贝格伯爵领，再次引发了与长支黑森-卡塞尔之间的争议。1803年，黑森-达姆施塔特透过德意志教会的世俗化运动获得了大量领土，其中最引人注目的是前属威斯特法伦公国的科隆大主教领、美因茨大主教领和沃尔姆斯主教领（英语：Bishopric of Worms）。
