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閱讀框架

閱讀框架(英語:Reading Frame)在分子生物學中是指將mRNA的鹼基序列劃分成連續、互不重疊的三元組的方式或這樣的劃分方式在相應DNA上的對應。這樣的三元組稱爲密碼子。每個密碼子可編碼一個氨基酸或作轉譯的終止信號。

三種閱讀框架圖示

通常我們把一條核酸鏈的5'端(磷酸基團端)稱爲首端,將其3'端稱爲尾端。翻譯時核糖體讀取mRNA的方向爲5'端到3'端。閱讀框架一共有三種,劃分各相隔一個鹼基[1][2]

通常來說,一段鹼基序列只採用一種閱讀框架(這種閱讀框架稱爲開放閱讀框(ORF)),而另外兩種讀框則因爲會頻繁出現終止密碼子而被關閉[3]。但在一些病毒內,一段鹼基序列卻可以採用多種重疊的讀框[4]。哺乳動物也有相似的例子:由線粒體DNA中編碼ATP酶的兩個亞基的區域轉錄出的mRNA在同一序列區域有閱讀框架重疊的現象。

開放閱讀框

一個開放閱讀框(ORF)指mRNA採用這種讀框可以翻譯出多肽鏈的閱讀框。在起始密碼子後,會緊跟着一段編碼氨基酸的密碼子,最後,翻譯會停止於終止密碼子處[5]

閱讀框架重疊

同一段鹼基序列採用多種的閱讀框方式使得重疊基因成爲了可能。這種現象在病毒原核生物線粒體中很常見[6]

參考

  1. ^ Rainey S, Repka J. Quantitative sequence and open reading frame analysis based on codon bias (PDF). Systemics, Cybernetics and Informatics: 65–72. [2015-11-13]. (原始内容 (PDF)于2020-08-06). 
  2. ^ Badger JH, Olsen GJ. CRITICA: Coding Region Identification Tool Invoking Comparative Analysis. Mol Biol Evol. April 1999, 16 (4): 512–24 [2015-11-13]. PMID 10331277. doi:10.1093/oxfordjournals.molbev.a026133. (原始内容于2019-12-20). 
  3. ^ Jocelyn E. Krebs; et al. Lewin's Genes XI. JONES&BARTLETT LEARNING. 2014: pp.37. ISBN 978-7-04-039649-2. 
  4. ^ Lander, Eric. MITx 7.00x Biology. [2015-11-13]. (原始内容于2019-12-07). 
  5. ^ Benjamin C. Pierce. Genetics: a conceptual approach. W. H. Freeman. 2012. ISBN 9781429232500. 
  6. ^ Johnson Z, Chisholm S. Properties of overlapping genes are conserved across microbial genomes. Genome Res. 2004, 14 (11): 2268–72. PMC 525685 . PMID 15520290. doi:10.1101/gr.2433104. 

參見

閱讀框架, 英語, reading, frame, 在分子生物學中是指將mrna的鹼基序列劃分成連續, 互不重疊的三元組的方式或這樣的劃分方式在相應dna上的對應, 這樣的三元組稱爲密碼子, 每個密碼子可編碼一個氨基酸或作轉譯的終止信號, 三種圖示, 通常我們把一條核酸鏈的5, 磷酸基團端, 稱爲首端, 將其3, 端稱爲尾端, 翻譯時核糖體讀取mrna的方向爲5, 端到3, 一共有三種, 劃分各相隔一個鹼基, 通常來說, 一段鹼基序列只採用一種, 這種稱爲開放閱讀框, 而另外兩種讀框則因爲會頻繁出現終止密碼子而被關. 閱讀框架 英語 Reading Frame 在分子生物學中是指將mRNA的鹼基序列劃分成連續 互不重疊的三元組的方式或這樣的劃分方式在相應DNA上的對應 這樣的三元組稱爲密碼子 每個密碼子可編碼一個氨基酸或作轉譯的終止信號 三種閱讀框架圖示 通常我們把一條核酸鏈的5 端 磷酸基團端 稱爲首端 將其3 端稱爲尾端 翻譯時核糖體讀取mRNA的方向爲5 端到3 端 閱讀框架一共有三種 劃分各相隔一個鹼基 1 2 通常來說 一段鹼基序列只採用一種閱讀框架 這種閱讀框架稱爲開放閱讀框 ORF 而另外兩種讀框則因爲會頻繁出現終止密碼子而被關閉 3 但在一些病毒內 一段鹼基序列卻可以採用多種重疊的讀框 4 哺乳動物也有相似的例子 由線粒體DNA中編碼ATP酶的兩個亞基的區域轉錄出的mRNA在同一序列區域有閱讀框架重疊的現象 目录 1 開放閱讀框 2 閱讀框架重疊 3 參考 4 參見開放閱讀框 编辑主条目 開放閱讀框 一個開放閱讀框 ORF 指mRNA採用這種讀框可以翻譯出多肽鏈的閱讀框 在起始密碼子後 會緊跟着一段編碼氨基酸的密碼子 最後 翻譯會停止於終止密碼子處 5 閱讀框架重疊 编辑参见 重疊基因 同一段鹼基序列採用多種的閱讀框方式使得重疊基因成爲了可能 這種現象在病毒 原核生物和線粒體中很常見 6 參考 编辑 Rainey S Repka J Quantitative sequence and open reading frame analysis based on codon bias PDF Systemics Cybernetics and Informatics 65 72 2015 11 13 原始内容存档 PDF 于2020 08 06 Badger JH Olsen GJ CRITICA Coding Region Identification Tool Invoking Comparative Analysis Mol Biol Evol April 1999 16 4 512 24 2015 11 13 PMID 10331277 doi 10 1093 oxfordjournals molbev a026133 原始内容存档于2019 12 20 Jocelyn E Krebs et al Lewin s Genes XI JONES amp BARTLETT LEARNING 2014 pp 37 ISBN 978 7 04 039649 2 引文格式1维护 冗余文本 link 引文格式1维护 显式使用等标签 link Lander Eric MITx 7 00x Biology 2015 11 13 原始内容存档于2019 12 07 Benjamin C Pierce Genetics a conceptual approach W H Freeman 2012 ISBN 9781429232500 Johnson Z Chisholm S Properties of overlapping genes are conserved across microbial genomes Genome Res 2004 14 11 2268 72 PMC 525685 PMID 15520290 doi 10 1101 gr 2433104 參見 编辑遺傳密碼 開放閱讀框架 取自 https zh wikipedia org w index php title 閱讀框架 amp oldid 70139119, 维基百科,wiki,书籍,书籍,图书馆,

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