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開放閱讀框

開放閱讀框(英語:Open reading frame;縮寫:ORF;其他譯名:開放閱讀框架開放讀架等)是指在給定的閱讀框架中,不包含终止密碼子的一串序列。這段序列是生物個體的基因組中,可能作為蛋白質編碼序列的部分。基因中的ORF包含並位於開始編碼與終止編碼之間。由於一段DNARNA序列有多種不同讀取方式,因此可能同時存在許多不同的開放閱讀框架。有一些電腦程式可分析出最有可能编码蛋白质的序列。

样品序列显示三种不同的可能的阅读框。 起始密码子以紫色突出显示,而终止密码子以红色突出显示。

例子 编辑

一段5'-UCUAAAGGUCCA-3'序列。此序列共有3種讀取法:

  1. UCU AAA GGU CCA
  2. CUA AAG GUC
  3. UAA AGG UCC

由於UAA為終止密码子,因此第三種讀取法不具編譯出蛋白質的潛力,故只有前兩者為開放閱讀框架。

找ORF的软件 编辑

在线寻找ORF的软件:ORF Finder (页面存档备份,存于互联网档案馆

功能 编辑

ORF Finder 被用来预测已存在的编码区的小基因序列。也可用于大规模的开放式阅读框寻找。

參見 编辑

外部連結 编辑

  • Translation and Open Reading Frames (页面存档备份,存于互联网档案馆) - A Site explaining Open Reading Frames
  • NCBI ORF finder (页面存档备份,存于互联网档案馆) - A web based interactive tool for predicting and analysing ORFs from nucleotide sequences.
  • ORF finder (页面存档备份,存于互联网档案馆) - A web based interactive tool for predicting and analysing ORFs from nucleotide sequences - hosted at bioinformatics.org
  • Sequerome - A Sequence profiling tool that links each BLAST record to the NCBI ORF enabling complete ORF analysis of a BLAST report
  • StarORF (页面存档备份,存于互联网档案馆) - 多平台, Java根据,为预言和分析ORFs和得到反向补全序列的GUI工具

開放閱讀框, 英語, open, reading, frame, 縮寫, 其他譯名, 開放讀架等, 是指在給定的閱讀框架中, 不包含终止密碼子的一串序列, 這段序列是生物個體的基因組中, 可能作為蛋白質編碼序列的部分, 基因中的orf包含並位於開始編碼與終止編碼之間, 由於一段dna或rna序列有多種不同讀取方式, 因此可能同時存在許多不同的架, 有一些電腦程式可分析出最有可能编码蛋白质的序列, 样品序列显示三种不同的可能的阅读框, 起始密码子以紫色突出显示, 而终止密码子以红色突出显示, 目录, 例子, 找orf. 開放閱讀框 英語 Open reading frame 縮寫 ORF 其他譯名 開放閱讀框架 開放讀架等 是指在給定的閱讀框架中 不包含终止密碼子的一串序列 這段序列是生物個體的基因組中 可能作為蛋白質編碼序列的部分 基因中的ORF包含並位於開始編碼與終止編碼之間 由於一段DNA或RNA序列有多種不同讀取方式 因此可能同時存在許多不同的開放閱讀框架 有一些電腦程式可分析出最有可能编码蛋白质的序列 样品序列显示三种不同的可能的阅读框 起始密码子以紫色突出显示 而终止密码子以红色突出显示 目录 1 例子 2 找ORF的软件 2 1 功能 3 參見 4 外部連結例子 编辑一段5 UCUAAAGGUCCA 3 序列 此序列共有3種讀取法 UCU AAA GGU CCA CUA AAG GUC UAA AGG UCC由於UAA為終止密码子 因此第三種讀取法不具編譯出蛋白質的潛力 故只有前兩者為開放閱讀框架 找ORF的软件 编辑在线寻找ORF的软件 ORF Finder 页面存档备份 存于互联网档案馆 功能 编辑 ORF Finder 被用来预测已存在的编码区的小基因序列 也可用于大规模的开放式阅读框寻找 參見 编辑编码区 閱讀框架外部連結 编辑Translation and Open Reading Frames 页面存档备份 存于互联网档案馆 A Site explaining Open Reading Frames NCBI ORF finder 页面存档备份 存于互联网档案馆 A web based interactive tool for predicting and analysing ORFs from nucleotide sequences ORF finder 页面存档备份 存于互联网档案馆 A web based interactive tool for predicting and analysing ORFs from nucleotide sequences hosted at bioinformatics org Sequerome A Sequence profiling tool that links each BLAST record to the NCBI ORF enabling complete ORF analysis of a BLAST report StarORF 页面存档备份 存于互联网档案馆 多平台 Java根据 为预言和分析ORFs和得到反向补全序列的GUI工具 取自 https zh wikipedia org w index php title 開放閱讀框 amp oldid 70137680, 维基百科,wiki,书籍,书籍,图书馆,

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