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利文索尔佯谬

利文索尔佯谬(Levinthal's paradox)是指一个思想实验,也是蛋白质折叠理论中的一个自指。在1969年, 美国分子生物学家Cyrus Levinthal指出,由于在未折叠的多链中的非常大量的自由度,该分子具有天文数量的可能构象。在一篇论文中[1],他估计了3 300 或10 143(通常被错误地引用为1968年的论文[2])。例如,一个由100个氨基酸残基组成的多肽,将具有99个肽键,并且因此具有198个不同的phi和psi键角。如果这些键角中的每一个可以是三个稳定构象之一,则蛋白质可错误折叠成最多达到3198种不同构象(包括任何可能的折叠冗余)。因此,如果蛋白质通过连续采样所有可能的构象而获得其正确折叠的构型,则需要比宇宙的年龄更长的时间以达到其正确的天然构象。即使以快速(纳秒皮秒)速率采样构象,这也是真的。 “悖论”是大多数小蛋白质在毫秒或甚至微秒时间尺度上同时折叠。这种悖论的解决方案已经通过蛋白质结构预测的计算方法建立[3]

此佯谬表明蛋白质折叠遵循特异性途径,或者其过程中只尝试有限数目的构象。

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参考资料 编辑

  1. ^ Levinthal, Cyrus. How to Fold Graciously. Mossbauer Spectroscopy in Biological Systems: Proceedings of a meeting held at Allerton House, Monticello, Illinois. 1969: 22–24 [2017-03-17]. (原始内容于2010-10-07). 
  2. ^ Levinthal, Cyrus. Are there pathways for protein folding? (PDF). Journal de Chimie Physique et de Physico-Chimie Biologique. 1968, 65: 44–45 [2009-11-05]. (原始内容 (PDF)于2009-09-02). 
  3. ^ Zwanzig R, Szabo A, Bagchi B. Levinthal's paradox. Proc Natl Acad Sci USA. 1992-01-01, 89 (1): 20–22. PMC 48166 . PMID 1729690. doi:10.1073/pnas.89.1.20. 
  1. 《生物化学原理》,杨荣武主编,高等教育出版社,2006年,页40

利文索尔佯谬, levinthal, paradox, 是指一个思想实验, 也是蛋白质折叠理论中的一个自指, 在1969年, 美国分子生物学家cyrus, levinthal指出, 由于在未折叠的多肽链中的非常大量的自由度, 该分子具有天文数量的可能构象, 在一篇论文中, 他估计了3300或10, 通常被错误地引用为1968年的论文, 例如, 一个由100个氨基酸残基组成的多肽, 将具有99个肽键, 并且因此具有198个不同的phi和psi键角, 如果这些键角中的每一个可以是三个稳定构象之一, 则蛋白质可错误折叠成. 利文索尔佯谬 Levinthal s paradox 是指一个思想实验 也是蛋白质折叠理论中的一个自指 在1969年 美国分子生物学家Cyrus Levinthal指出 由于在未折叠的多肽链中的非常大量的自由度 该分子具有天文数量的可能构象 在一篇论文中 1 他估计了3300或10 143 通常被错误地引用为1968年的论文 2 例如 一个由100个氨基酸残基组成的多肽 将具有99个肽键 并且因此具有198个不同的phi和psi键角 如果这些键角中的每一个可以是三个稳定构象之一 则蛋白质可错误折叠成最多达到3198种不同构象 包括任何可能的折叠冗余 因此 如果蛋白质通过连续采样所有可能的构象而获得其正确折叠的构型 则需要比宇宙的年龄更长的时间以达到其正确的天然构象 即使以快速 纳秒或皮秒 速率采样构象 这也是真的 悖论 是大多数小蛋白质在毫秒或甚至微秒时间尺度上同时折叠 这种悖论的解决方案已经通过蛋白质结构预测的计算方法建立 3 此佯谬表明蛋白质折叠遵循特异性途径 或者其过程中只尝试有限数目的构象 参见 编辑蛋白质结构预测 蛋白质折叠 分子伴侣 安芬森法则 英语 Anfinsen s dogma 参考资料 编辑 Levinthal Cyrus How to Fold Graciously Mossbauer Spectroscopy in Biological Systems Proceedings of a meeting held at Allerton House Monticello Illinois 1969 22 24 2017 03 17 原始内容存档于2010 10 07 Levinthal Cyrus Are there pathways for protein folding PDF Journal de Chimie Physique et de Physico Chimie Biologique 1968 65 44 45 2009 11 05 原始内容存档 PDF 于2009 09 02 Zwanzig R Szabo A Bagchi B Levinthal s paradox Proc Natl Acad Sci USA 1992 01 01 89 1 20 22 PMC 48166 nbsp PMID 1729690 doi 10 1073 pnas 89 1 20 生物化学原理 杨荣武主编 高等教育出版社 2006年 页40 取自 https zh wikipedia org w index php title 利文索尔佯谬 amp oldid 76326111, 维基百科,wiki,书籍,书籍,图书馆,

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