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克罗莫结构域

十一月 05, 2023

克罗莫结构域或染色質結構域（英語：Chromodomain，chromatin organization modifier[2]）是一种由40～50个氨基酸残基组成的蛋白质结构域，往往存在于那些与染色质重塑及操控有关的蛋白质里。此结构域不管在植物及动物之中都高度保守，且在许多基因组（如小鼠）中代表了较大数量的各种蛋白质。许多包含克罗莫结构域的基因有多种可变剪接亚型，有些亚型完全把克罗莫结构域当作内含子切除出去[3]。在哺乳动物中，包含克罗莫结构域的蛋白质主要负责涉及到染色质重塑及形成异染色质区域这两方面的基因调控[4]。包含克罗莫结构域的蛋白质亦会结合到甲基化组蛋白上[5][6]且存在于RNA诱导的转录沉默复合物中[7]。

克罗莫结构域
多梳克罗莫结构域的结构[1]
鑑定
標誌Chromodomain
PfamPF00385（旧版）
InterPro（英语：InterPro）IPR000953
SMART（英语：Simple Modular Architecture Research Tool）SM00298
PROSITE（英语：PROSITE）PS50013
SCOP（英语：Structural Classification of Proteins）1pfb / SUPFAM
CDD（英语：Conserved Domain Database）cd00024
現有可用的蛋白結構：
Pfam結構（旧版） / ECOD
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum（英语：PDBsum）結構概要
PDB1ak5, 1b3o, 1jcn, 1jr1, 1lrt, 1me7, 1me8, 1me9, 1meh, 1mei, 1mew, 1nf7, 1nfb, 1o50, 1pbj, 1pvm, 1pvn, 1vr9, 1vrd, 1xkf, 1y5h, 1yav, 1zfj, 2cu0, 2d4z, 2ef7, 2j9l, 2nyc, 2nye, 2o16, 2oox, 2oux, 2qh1, 2rc3, 2rif, 2rih, 2v8q, 2v92, 2v9j, 2yvx, 2yzi, 2yzq, 3ddj

另见 编辑

参考文献 编辑

  1. ^ Min J, Zhang Y, Xu RM. Structural basis for specific binding of Polycomb chromodomain to histone H3 methylated at Lys 27. Genes Dev. August 2003, 17 (15): 1823–8. PMC 196225  . PMID 12897052. doi:10.1101/gad.269603. 
  2. ^ S Messmer, A Franke, R Paro. Analysis of the functional role of the Polycomb chromo domain in Drosophila melanogaster. Genes Dev. July 1992, 6 (7): 1241–1254. PMID 1628830. doi:10.1101/gad.6.7.1241. 
  3. ^ Tajul-Arifin, K; Teasdale, R; Ravasi, T; Humel, DA; Group, RIKEN GER; Members, GSL; Mattick, JS. Identification and Analysis of Chromodomain-Containing Proteins Encoded in the Mouse Transcriptome. Genome Res. 2003, 13 (6B): 1416–1429. PMC 403676  . PMID 12819141. doi:10.1101/gr.1015703.  已忽略未知参数|author-separator= (帮助)
  4. ^ Jones, DO; Cowell, IG; Singh, PB. Mammalian chromodomain proteins: their role in genome organisation and expression. Bioessays. 2000, 22 (2): 124–37. PMID 10655032. doi:10.1002/(SICI)1521-1878(200002)22:2<124::AID-BIES4>3.0.CO;2-E.  已忽略未知参数|author-separator= (帮助)
  5. ^ Nielsen, PR; Nietlispach, D; Mott, HR; Callaghan, J; Bannister, A; Kouzarides, T; Murzin, AG; Murzina, NV; Laue, ED.; et al. Structure of the HP1 chromodomain bound to histone H3 methylated at lysine 9. Nature. 2002, 416 (6876): 103–7. PMID 11882902. doi:10.1038/nature722.  已忽略未知参数|author-separator= (帮助)
  6. ^ Jacobs, SA; Khorasanizadeh, S. Structure of HP1 chromodomain bound to a lysine 9-methylated histone H3 tail. Science. 2002, 295 (5562): 2080–3. PMID 11859155. doi:10.1126/science.1069473.  已忽略未知参数|author-separator= (帮助)
  7. ^ Verdel, A; Jia, S; Gerber, S; Sugiyama, T; Gygi, S; Grewal, S; Moazed, D. RNAi-Mediated Targeting of Heterochromatin by the RITS Complex. Science. 2004, 303 (5658): 672–6. PMC 3244756  . PMID 14704433. doi:10.1126/science.1093686.  已忽略未知参数|author-separator= (帮助)

外部链接 编辑

十一月 05, 2023
克罗莫结构域, 或染色質結構域, 英語, chromodomain, chromatin, organization, modifier, 是一种由40, 50个氨基酸残基组成的蛋白质结构域, 往往存在于那些与染色质重塑及操控有关的蛋白质里, 此结构域不管在植物及动物之中都高度保守, 且在许多基因组, 如小鼠, 中代表了较大数量的各种蛋白质, 许多包含的基因有多种可变剪接亚型, 有些亚型完全把当作内含子切除出去, 在哺乳动物中, 包含的蛋白质主要负责涉及到染色质重塑及形成异染色质区域这两方面的基因调控, 包含的蛋白. 克罗莫结构域或染色質結構域 英語 Chromodomain chromatin organization modifier 2 是一种由40 50个氨基酸残基组成的蛋白质结构域 往往存在于那些与染色质重塑及操控有关的蛋白质里 此结构域不管在植物及动物之中都高度保守 且在许多基因组 如小鼠 中代表了较大数量的各种蛋白质 许多包含克罗莫结构域的基因有多种可变剪接亚型 有些亚型完全把克罗莫结构域当作内含子切除出去 3 在哺乳动物中 包含克罗莫结构域的蛋白质主要负责涉及到染色质重塑及形成异染色质区域这两方面的基因调控 4 包含克罗莫结构域的蛋白质亦会结合到甲基化组蛋白上 5 6 且存在于RNA诱导的转录沉默复合物中 7 克罗莫结构域多梳克罗莫结构域的结构 1 鑑定標誌ChromodomainPfamPF00385 旧版 InterPro 英语 InterPro IPR000953SMART 英语 Simple Modular Architecture Research Tool SM00298PROSITE 英语 PROSITE PS50013SCOP 英语 Structural Classification of Proteins 1pfb SUPFAMCDD 英语 Conserved Domain Database cd00024現有可用的蛋白結構 Pfam結構 旧版 ECODPDBRCSB PDB PDBe PDBjPDBsum 英语 PDBsum 結構概要PDB1ak5 1b3o 1jcn 1jr1 1lrt 1me7 1me8 1me9 1meh 1mei 1mew 1nf7 1nfb 1o50 1pbj 1pvm 1pvn 1vr9 1vrd 1xkf 1y5h 1yav 1zfj 2cu0 2d4z 2ef7 2j9l 2nyc 2nye 2o16 2oox 2oux 2qh1 2rc3 2rif 2rih 2v8q 2v92 2v9j 2yvx 2yzi 2yzq 3ddj另见 编辑布罗莫结构域 克罗莫影结构域参考文献 编辑 Min J Zhang Y Xu RM Structural basis for specific binding of Polycomb chromodomain to histone H3 methylated at Lys 27 Genes Dev August 2003 17 15 1823 8 PMC 196225 nbsp PMID 12897052 doi 10 1101 gad 269603 S Messmer A Franke R Paro Analysis of the functional role of the Polycomb chromo domain in Drosophila melanogaster Genes Dev July 1992 6 7 1241 1254 PMID 1628830 doi 10 1101 gad 6 7 1241 Tajul Arifin K Teasdale R Ravasi T Humel DA Group RIKEN GER Members GSL Mattick JS Identification and Analysis of Chromodomain Containing Proteins Encoded in the Mouse Transcriptome Genome Res 2003 13 6B 1416 1429 PMC 403676 nbsp PMID 12819141 doi 10 1101 gr 1015703 已忽略未知参数 author separator 帮助 Jones DO Cowell IG Singh PB Mammalian chromodomain proteins their role in genome organisation and expression Bioessays 2000 22 2 124 37 PMID 10655032 doi 10 1002 SICI 1521 1878 200002 22 2 lt 124 AID BIES4 gt 3 0 CO 2 E 已忽略未知参数 author separator 帮助 Nielsen PR Nietlispach D Mott HR Callaghan J Bannister A Kouzarides T Murzin AG Murzina NV Laue ED et al Structure of the HP1 chromodomain bound to histone H3 methylated at lysine 9 Nature 2002 416 6876 103 7 PMID 11882902 doi 10 1038 nature722 已忽略未知参数 author separator 帮助 引文格式1维护 显式使用等标签 link Jacobs SA Khorasanizadeh S Structure of HP1 chromodomain bound to a lysine 9 methylated histone H3 tail Science 2002 295 5562 2080 3 PMID 11859155 doi 10 1126 science 1069473 已忽略未知参数 author separator 帮助 Verdel A Jia S Gerber S Sugiyama T Gygi S Grewal S Moazed D RNAi Mediated Targeting of Heterochromatin by the RITS Complex Science 2004 303 5658 672 6 PMC 3244756 nbsp PMID 14704433 doi 10 1126 science 1093686 已忽略未知参数 author separator 帮助 外部链接 编辑Chromatin Remodeling Chromodomains 页面存档备份 存于互联网档案馆 at cellsignal com 页面存档备份 存于互联网档案馆 取自 https zh wikipedia org w index php title 克罗莫结构域 amp oldid 68262421, 维基百科，wiki，书籍，书籍，图书馆，

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