SOX基因家族

SOX基因家族（英語：SOX gene family，即SRY相关HMG盒基因家族，SRY-related HMG-box genes）是一类高速泳动族转录因子^[1]。

SOXB subfamily, C-terminal next to HMG box
鑑定
標誌	SOXp
Pfam	PF12336（旧版）
InterPro（英语：InterPro）	IPR022097
現有可用的蛋白結構： Pfam 結構（旧版） / ECOD PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj PDBsum（英语：PDBsum） 結構概要

SOXE, N-terminal
鑑定
標誌	Sox_N
Pfam	PF12444（旧版）
InterPro（英语：InterPro）	IPR022151
現有可用的蛋白結構： Pfam 結構（旧版） / ECOD PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj PDBsum（英语：PDBsum） 結構概要

SOXF, C-terminal, 9aaTAD
鑑定
標誌	SOX_C
InterPro（英语：InterPro）	IPR021934
PROSITE（英语：PROSITE）	PS51516

SOXF, central
鑑定
標誌	Sox17_18_mid
Pfam	PF12067（旧版）
InterPro（英语：InterPro）	IPR033392
現有可用的蛋白結構： Pfam 結構（旧版） / ECOD PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj PDBsum（英语：PDBsum） 結構概要

人类基因组拥有SRY等20个SOX家族成员，如下^[2]：

• SoxA: SRY
• SoxB1: SOX1, Sox2, SOX3
• SoxB2: SOX14, SOX21
• SoxC: SOX4, SOX11, SOX12
• SoxD: SOX5, SOX6, SOX13
• SoxE: SOX8, SOX9, SOX10
• SoxF: SOX7, SOX17, SOX18
• SoxG: SOX15
• SoxH: SOX30

参考文献

1. Bowles, J; Schepers G; Koopman P. Phylogeny of the SOX family of developmental transcription factors based on sequence and structural indicators.. Dev. Biol. November 2000, 227 (2): 239–55. PMID 11071752. doi:10.1006/dbio.2000.9883  . 
2. Guth SI, Wegner M. Having it both ways: Sox protein function between conservation and innovation. Cell. Mol. Life Sci. October 2008, 65 (19): 3000–18. PMID 18516494. S2CID 8943181. doi:10.1007/s00018-008-8138-7. 

外部链接

• NCBI CDD: cd01388 （页面存档备份，存于互联网档案馆） (SOX-TCF_HMG-box); human proteins （页面存档备份，存于互联网档案馆）