CG抑制

十二月 02, 2023

CG抑制（CG suppression）是指多數脊椎動物基因組中CpG位點的比例低於期望值的現象。人類基因組序列中胞嘧啶（C）與鳥嘌呤（G）各占了約21%，因此CpG位點的比例期望值應為約4%（0.21x0.21），但實際上僅有低於1%^[1]。此現象是胞嘧啶去胺的轉換突變所致，被甲基化的胞嘧啶（5-甲基胞嘧啶）會自發去胺轉為轉為胸腺嘧啶（T），若未及時在DNA複製前修復，該位點即發生C-T的轉換突變，此為人類細胞中最常發生的突變種類^[2]。

胞嘧啶（C）被甲基化後去胺轉為胸腺嘧啶（T）

病毒编辑

許多感染脊椎動物的RNA病毒也有CG抑制的現象^[3]。有研究分析甲型流感病毒的CG位點，發現其CG限制從鳥類跳躍至人類宿主後CG抑制變得更加明顯（即CpG位點比例進一步降低），而人類基因組CG抑制的程度比鳥類還高，因此此現象可能反映這些病毒在宿主體內受到一定的選汰壓力，使其CpG位點的比例改變^[4]。人類免疫缺乏病毒也有CG抑制的現象，有研究發現人類細胞的鋅指抗病毒蛋白（zinc-finger antiviral protein，ZAP）可與RNA中的CpG點結合，並可能以此為區分自我與外來RNA的機制，因人類基因組的CpG位點數量很低，ZAP與與RNA中CpG位點結合以抑制病毒，此機制或對RNA病毒形成選汰壓力，使其基因組也發生CG抑制，降低CpG位點含量以逃避宿主免疫反應^[5]。

參見编辑

CpG島

參考文獻编辑

^ International Human Genome Sequencing Consortium; et al. (PDF). Nature. February 2001, 409 (6822): 860–921 [2021-04-23]. PMID 11237011. doi:10.1038/35057062. （原始内容 (PDF)存档于2020-07-29）.
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十二月 02, 2023

cg抑制, suppression, 是指多數脊椎動物基因組中cpg位點的比例低於期望值的現象, 人類基因組序列中胞嘧啶, 與鳥嘌呤, 各占了約21, 因此cpg位點的比例期望值應為約4, 21x0, 但實際上僅有低於1, 此現象是胞嘧啶去胺的轉換突變所致, 被甲基化的胞嘧啶, 甲基胞嘧啶, 會自發去胺轉為轉為胸腺嘧啶, 若未及時在dna複製前修復, 該位點即發生c, t的轉換突變, 此為人類細胞中最常發生的突變種類, 胞嘧啶, 被甲基化後去胺轉為胸腺嘧啶, 病毒, 编辑許多感染脊椎動物的rna病毒也有的現象, 有. CG抑制 CG suppression 是指多數脊椎動物基因組中CpG位點的比例低於期望值的現象人類基因組序列中胞嘧啶 C 與鳥嘌呤 G 各占了約21 因此CpG位點的比例期望值應為約4 0 21x0 21 但實際上僅有低於1 1 此現象是胞嘧啶去胺的轉換突變所致被甲基化的胞嘧啶 5 甲基胞嘧啶會自發去胺轉為轉為胸腺嘧啶 T 若未及時在DNA複製前修復該位點即發生C T的轉換突變此為人類細胞中最常發生的突變種類 2 胞嘧啶 C 被甲基化後去胺轉為胸腺嘧啶 T 病毒编辑許多感染脊椎動物的RNA病毒也有CG抑制的現象 3 有研究分析甲型流感病毒的CG位點發現其CG限制從鳥類跳躍至人類宿主後CG抑制變得更加明顯即CpG位點比例進一步降低而人類基因組CG抑制的程度比鳥類還高因此此現象可能反映這些病毒在宿主體內受到一定的選汰壓力使其CpG位點的比例改變 4 人類免疫缺乏病毒也有CG抑制的現象有研究發現人類細胞的鋅指抗病毒蛋白 zinc finger antiviral protein ZAP 可與RNA中的CpG點結合並可能以此為區分自我與外來RNA的機制因人類基因組的CpG位點數量很低 ZAP與與RNA中CpG位點結合以抑制病毒此機制或對RNA病毒形成選汰壓力使其基因組也發生CG抑制降低CpG位點含量以逃避宿主免疫反應 5 參見编辑CpG島參考文獻编辑 nbsp 分子与细胞生物学主题 International Human Genome Sequencing Consortium et al Initial sequencing and analysis of the human genome PDF Nature February 2001 409 6822 860 921 2021 04 23 PMID 11237011 doi 10 1038 35057062 原始内容 PDF 存档于2020 07 29 Krokan HE Drablos F Slupphaug G Uracil in DNA occurrence consequences and repair Oncogene 2002 21 58 8935 48 PMID 12483510 doi 10 1038 sj onc 1205996 Cheng X Virk N Chen W Ji S Ji S Sun Y et al CpG usage in RNA viruses data and hypotheses PLoS One 2013 8 9 e74109 PMC 3781069 nbsp PMID 24086312 doi 10 1371 journal pone 0074109 Greenbaum BD Levine AJ Bhanot G Rabadan R Patterns of evolution and host gene mimicry in influenza and other RNA viruses PLoS Pathog 2008 4 6 e1000079 PMC 2390760 nbsp PMID 18535658 doi 10 1371 journal ppat 1000079 Takata MA Goncalves Carneiro D Zang TM Soll SJ York A Blanco Melo D et al CG dinucleotide suppression enables antiviral defence targeting non self RNA Nature 2017 550 7674 124 127 PMC 6592701 nbsp PMID 28953888 doi 10 1038 nature24039 取自 https zh wikipedia org w index php title CG抑制 amp oldid 71574956, 维基百科，wiki，书籍，书籍，图书馆，

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