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酶动力学

十二月 06, 2023

酶动力学，又被称为酶催化动力学、酶反应动力学或酵素動力學，是研究酶催化的化学反应速率的学科。酶动力学对于某一特定酶的研究，可以提供许多重要信息。如该种酶的催化机理、在代谢途径中的作用、其在细胞中的活性如何被调控以及相关药物和毒药如何抑制其活性。

来源于大腸桿菌的二氫葉酸還原酶 與它的兩個底物，二氫葉酸（右）與和NADPH（左），两个底物包裹于活性位点之中。蛋白質用带状圖来表示，其中α螺旋用紅色表示，β折叠用黃色表示，而转角用藍色表示。Generated from 7DFR （页面存档备份，存于互联网档案馆）.
反應速率將增加為底物濃度的增加，最終成為飽和在極高濃度的襯底。

当酶结合多个底物，如二氢叶酸还原酶（右图所示）时，酶动力学也可以显示这些底物结合的顺序和释放产物的顺序。

酶的结构的知识有助于解释动力学数据。 例如，结构可以表明底物和产物如何在催化过程中结合; 反应发生什么变化; 甚至特定氨基酸残基的作用机制。机制中有些酶显着改变形态; 在这种情况下，确定具有和不具有不经历酶反应的结合底物类似物的酶结构是有帮助的。

历史 编辑

1902年，维克多·亨利（Victor Henri）提出了对酶动力学进行定量的理论，[1]但是由于忽略了溶液中氢离子浓度的影响，他的实验结果无法验证这一理论。在1909年，Peter Lauritz Sørensen提出了对数的pH尺度并引入“缓冲”这一概念后，[2]德国化学家Leonor Michaelis和他的加拿大博士后Maud Leonora Menten重复了Henri的实验，实验结果肯定了Henri所提出的方程。这一方程被称为Henri-Michaelis-Menten kinetics或Michaelis-Menten kinetics，中文对应名称为米氏方程。[3]这一工作被G. E. Briggs和J. B. S. Haldane所进一步发展，此二人所提出的动力学方程至今仍得到广泛使用。[4]

多層基板的反應 编辑

多層基板的反應，後續複雜的速率方程描述如何襯底的約束，以及以何種順序。

化學機理 编辑

一個很重要的目的測量酶動力學是確定化學機制的一種酶反應，即該序列的化學步驟變換到基板產品。

酶抑制和活化 编辑

主条目：酶抑制剂

酶抑制剂是减少或消除酶活性的分子，而酶活化剂是增加酶的催化速率的分子。这些相互作用可以是可逆的（即取消该抑制剂恢复酶活性）或不可逆的（即抑制剂永久地失活酶）。

参看 编辑

  • 蛋白质动力学（英语：Protein dynamics）

参考文献 编辑

  1. ^ Henri,V. Theorie generale de l'action de quelques diastases. Compt. rend. hebd. Acad. Sci. Paris. 1902, 135: 916–919. 
  2. ^ Sørensen,P.L. Enzymstudien {II}. Über die Messung und Bedeutung der Wasserstoffionenkonzentration bei enzymatischen Prozessen. Biochem. Z. 1909, 21: 131–304. 
  3. ^ Michaelis L., Menten M. Die Kinetik der Invertinwirkung. Biochem. Z. 1913, 49: 333–369.  English translation （页面存档备份，存于互联网档案馆） Accessed 6 April 2007
  4. ^ Briggs G. E., Haldane J. B. S. . Biochem. J. 1925, 19: 339–339 [2007-10-06]. PMID 16743508. （原始内容存档于2015-03-19）. 

進階閱讀 编辑

  • Athel Cornish-Bowden, Fundamentals of Enzyme Kinetics. (3rd edition), Portland Press 2004, ISBN 1-85578-158-1.
  • Irwin H. Segel, Enzyme Kinetics : Behavior and Analysis of Rapid Equilibrium and Steady-State Enzyme Systems. Wiley-Interscience; New Ed edition 1993, ISBN 0-471-30309-7.
  • Alan Fersht, Structure and Mechanism in Protein Science : A Guide to Enzyme Catalysis and Protein Folding. W. H. Freeman, 1998. ISBN 0-7167-3268-8
  • Santiago Schnell, Philip K. Maini, A century of enzyme kinetics: Reliability of the KM and vmax estimates, Comments on Theoretical Biology 8, 169–187, 2004 DOI:
  • Chris Walsh, Enzymatic Reaction Mechanisms. W. H. Freeman and Company. 1979. ISBN 0-7167-0070-0
  • Nicholas Price, Lewis Stevens, Fundamentals of Enzymology, Oxford University Press, 1999. ISBN 0-19-850229-X
  • Tim Bugg, An Introduction to Enzyme and Coenzyme Chemistry Blackwell Publishing, 2004 ISBN 1-4051-1452-5

外部連結 编辑

  • Animation of an enzyme assay （页面存档备份，存于互联网档案馆） — Shows effects of manipulating assay conditions
  • MACiE （页面存档备份，存于互联网档案馆） — A database of enzyme reaction mechanisms
  • ENZYME （页面存档备份，存于互联网档案馆） — Expasy enzyme nomenclature database
  • — A database of enzyme catalytic mechanisms
  • — Comprehensive enzyme database, giving substrates, inhibitors and reaction diagrams
  • — A database of reaction kinetics
  • — Animations of several enzyme reaction mechanisms
  • — A comprehensive explanation of concepts and terminology in enzyme kinetics
  • — An accessible set of on-line tutorials on enzyme kinetics
  • Enzyme kinetics animated tutorial （页面存档备份，存于互联网档案馆） — An animated tutorial with audio

十二月 06, 2023
酶动力学, 此條目需要擴充, 2017年11月25日, 请協助改善这篇條目, 更進一步的信息可能會在討論頁或扩充请求中找到, 请在擴充條目後將此模板移除, 此條目需要精通或熟悉相关主题的编者参与及协助编辑, 2017年11月25日, 請邀請適合的人士改善本条目, 更多的細節與詳情請參见討論頁, 又被称为酶催化动力学, 酶反应动力学或酵素動力學, 是研究酶催化的化学反应速率的学科, 对于某一特定酶的研究, 可以提供许多重要信息, 如该种酶的催化机理, 在代谢途径中的作用, 其在细胞中的活性如何被调控以及相关药物和毒药. 此條目需要擴充 2017年11月25日 请協助改善这篇條目 更進一步的信息可能會在討論頁或扩充请求中找到 请在擴充條目後將此模板移除 此條目需要精通或熟悉相关主题的编者参与及协助编辑 2017年11月25日 請邀請適合的人士改善本条目 更多的細節與詳情請參见討論頁 酶动力学 又被称为酶催化动力学 酶反应动力学或酵素動力學 是研究酶催化的化学反应速率的学科 酶动力学对于某一特定酶的研究 可以提供许多重要信息 如该种酶的催化机理 在代谢途径中的作用 其在细胞中的活性如何被调控以及相关药物和毒药如何抑制其活性 来源于大腸桿菌的二氫葉酸還原酶 與它的兩個底物 二氫葉酸 右 與和NADPH 左 两个底物包裹于活性位点之中 蛋白質用带状圖来表示 其中a螺旋用紅色表示 b折叠用黃色表示 而转角用藍色表示 Generated from 7DFR 页面存档备份 存于互联网档案馆 反應速率將增加為底物濃度的增加 最終成為飽和在極高濃度的襯底 当酶结合多个底物 如二氢叶酸还原酶 右图所示 时 酶动力学也可以显示这些底物结合的顺序和释放产物的顺序 酶的结构的知识有助于解释动力学数据 例如 结构可以表明底物和产物如何在催化过程中结合 反应发生什么变化 甚至特定氨基酸残基的作用机制 机制中有些酶显着改变形态 在这种情况下 确定具有和不具有不经历酶反应的结合底物类似物的酶结构是有帮助的 目录 1 历史 2 多層基板的反應 3 化學機理 4 酶抑制和活化 5 参看 6 参考文献 7 進階閱讀 8 外部連結历史 编辑1902年 维克多 亨利 Victor Henri 提出了对酶动力学进行定量的理论 1 但是由于忽略了溶液中氢离子浓度的影响 他的实验结果无法验证这一理论 在1909年 Peter Lauritz Sorensen提出了对数的pH尺度并引入 缓冲 这一概念后 2 德国化学家Leonor Michaelis和他的加拿大博士后Maud Leonora Menten重复了Henri的实验 实验结果肯定了Henri所提出的方程 这一方程被称为Henri Michaelis Menten kinetics或Michaelis Menten kinetics 中文对应名称为米氏方程 3 这一工作被G E Briggs和J B S Haldane所进一步发展 此二人所提出的动力学方程至今仍得到广泛使用 4 多層基板的反應 编辑多層基板的反應 後續複雜的速率方程描述如何襯底的約束 以及以何種順序 化學機理 编辑一個很重要的目的測量酶動力學是確定化學機制的一種酶反應 即該序列的化學步驟變換到基板產品 酶抑制和活化 编辑主条目 酶抑制剂 酶抑制剂是减少或消除酶活性的分子 而酶活化剂是增加酶的催化速率的分子 这些相互作用可以是可逆的 即取消该抑制剂恢复酶活性 或不可逆的 即抑制剂永久地失活酶 参看 编辑 nbsp 分子与细胞生物学主题 蛋白质动力学 英语 Protein dynamics 参考文献 编辑 Henri V Theorie generale de l action de quelques diastases Compt rend hebd Acad Sci Paris 1902 135 916 919 Sorensen P L Enzymstudien II Uber die Messung und Bedeutung der Wasserstoffionenkonzentration bei enzymatischen Prozessen Biochem Z 1909 21 131 304 Michaelis L Menten M Die Kinetik der Invertinwirkung Biochem Z 1913 49 333 369 English translation 页面存档备份 存于互联网档案馆 Accessed 6 April 2007 Briggs G E Haldane J B S A note on the kinetics of enzyme action Biochem J 1925 19 339 339 2007 10 06 PMID 16743508 原始内容存档于2015 03 19 進階閱讀 编辑Athel Cornish Bowden Fundamentals of Enzyme Kinetics 3rd edition Portland Press 2004 ISBN 1 85578 158 1 Irwin H Segel Enzyme Kinetics Behavior and Analysis of Rapid Equilibrium and Steady State Enzyme Systems Wiley Interscience New Ed edition 1993 ISBN 0 471 30309 7 Alan Fersht Structure and Mechanism in Protein Science A Guide to Enzyme Catalysis and Protein Folding W H Freeman 1998 ISBN 0 7167 3268 8 Santiago Schnell Philip K Maini A century of enzyme kinetics Reliability of the KM and vmax estimates Comments on Theoretical Biology 8 169 187 2004 DOI 10 1080 08948550390206768 Chris Walsh Enzymatic Reaction Mechanisms W H Freeman and Company 1979 ISBN 0 7167 0070 0 Nicholas Price Lewis Stevens Fundamentals of Enzymology Oxford University Press 1999 ISBN 0 19 850229 X Tim Bugg An Introduction to Enzyme and Coenzyme Chemistry Blackwell Publishing 2004 ISBN 1 4051 1452 5外部連結 编辑Animation of an enzyme assay 页面存档备份 存于互联网档案馆 Shows effects of manipulating assay conditions MACiE 页面存档备份 存于互联网档案馆 A database of enzyme reaction mechanisms ENZYME 页面存档备份 存于互联网档案馆 Expasy enzyme nomenclature database ExCatDB A database of enzyme catalytic mechanisms BRENDA Comprehensive enzyme database giving substrates inhibitors and reaction diagrams SABIO RK A database of reaction kinetics Joseph Kraut s Research Group University of California San Diego Animations of several enzyme reaction mechanisms Symbolism and Terminology in Enzyme Kinetics A comprehensive explanation of concepts and terminology in enzyme kinetics An introduction to enzyme kinetics An accessible set of on line tutorials on enzyme kinetics Enzyme kinetics animated tutorial 页面存档备份 存于互联网档案馆 An animated tutorial with audio 取自 https zh wikipedia org w index php title 酶动力学 amp oldid 72898942, 维基百科，wiki，书籍，书籍，图书馆，

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