被囊动物亚门

被囊动物亚门（學名：Tunicata），舊稱尾索动物亚门（Urochordata^[1][2]），是脊索动物门的一个亚门，全部是海洋动物。被囊动物的脊索和背神经管仅存于幼体尾部，成体退化消失，身体表面披有一层棕褐色植物性纤维质的囊包，裡面再有一層外套膜包裹。常见种类有各种海鞘和住囊虫，营自由生活或固着生活，有些种类有世代交替现象。

被囊动物亚门 化石时期：520–0 Ma PreЄ Є O S D C P T J K Pg N
海鞘（Pyura spinifera）
科学分类
界：	动物界 Animalia
门：	脊索动物门 Chordata
演化支：	嗅球類 Olfactores
亚门：	被囊动物亚门 Tunicata
纲
見內文

分类

被囊动物與有頭類（包括盲鰻、七鰓鰻和有下頜的脊椎動物）的相關，比較與諸如文昌魚、棘皮動物、半索动物（hemichordates）、异涡虫（Xenoturbella）或其他無脊椎動物的相關更密切^[3][4][5]。由於其結構相對簡單，被囊動物曾被認為是脊索動物的早期分支，但近年以分子支序親緣學分析基因組數據，較多研究支持頭索動物才是脊索動物的早期分支，而被囊動物則是脊椎動物的姊妹群。

包括有被囊动物亚门和脊索動物的支序叫做嗅球類（Olfactores）支序^[6][7]。

被囊动物亚门包括約莫三千個已描述的物種^[8]，傳統上分成下列三個綱：

• 海鞘纲（Ascidiacea ：Aplousobranchia、Phlebobranchia及Stolidobranchia）
• 樽海鞘纲（Thaliacea：Pyrosomida、Doliolida及Salpida）
• 尾海鞘纲（Appendicularia：Larvacea）

在2011年，一項有關濾食性海鞘及捕食性海鞘的分子支序親緣學研究將這些海鞘物種的rDNA進行排序，確認這些物種間的關係，原深水海鞘綱（Sorberacea）的成員都被併入到海鞘綱^[9]的Molgulidae（英语：Molgulidae）科中^[10][11]。儘管傳統的分類仍然接受，較新的證據認為海鞘綱其實仍然是一個由並系群組成的人造群組^[12][13]。

以下分支圖基於 Delsuc 及其同事 2018 年的系統基因組學研究^[14]

被囊動物亞門	尾海鞘綱       樽海鞘綱   海樽目     纽鳃樽目         扃鰓目     無管海鞘目          復腮目   皮海鞘科       柄海鞘科      腕海鞘科       海鞘綱

化石物種

有關本分類的化石物種從屬一直以來都有爭議：一來這些化石的年代非常久遠，難以保存；二來化石物種沒有現生種可透過分子生物學手段來分析，並借以釐清當中爭議。

• 山口海鞘綱（Shankouclava ）：只有化石種的一個綱，得名與中國雲南省昆明市澂江县山口村的寒武紀早期澄江動物群（日语：澄江動物群）帽天山頁岩地層^[15]。
• Yarnemia（英语：Yarnemia）?

參考文獻

1. Brusca, R. C.; Brusca, G. J. Invertebrates 2nd Ed. Sunderland, MA (USA): Sinauer. 2002 （英语）.  引文格式1维护：冗余文本 (link)
2. . [2017-10-27]. （原始内容存档于2009-04-21） （英语）. 
3. Delsuc, F.; Brinkmann, H.; Chourrout, D.; Philippe, H. Tunicates and not cephalochordates are the closest living relatives of vertebrates. Nature. 2006, 439 (7079): 965–968. PMID 16495997. doi:10.1038/nature04336. 
4. Delsuc, F.; Tsagkogeorga, G.; Lartillot, N.; Philippe, H. Additional molecular support for the new chordate phylogeny. Genesis. 2008, 46 (11): 592–604. PMID 19003928. doi:10.1002/dvg.20450. 
5. Singh, T. R.; Tsagkogeorga, G.; Delsuc, F.; Blanquart, S.; Shenkar, N.; Loya, Y.; Douzery, E. J.; Huchon, D. Tunicate mitogenomics and phylogenetics: peculiarities of the Herdmania momus mitochondrial genome and support for the new chordate phylogeny. BMC Genomics. 2009, 10: 534. PMC 2785839  . PMID 19922605. doi:10.1186/1471-2164-10-534. 
6. Jefferies, R. P. S. (1991) in Biological Asymmetry and Handedness (eds Bock, G. R.; Marsh, J.) pp. 94-127 (Wiley, Chichester).
7. 本頓, MJ. 古脊椎動物學 第四版. 科學出版社. 2017-05 [2017-10-27]. ISBN 9787030524935 （中文（简体））. 
8. Ruppert, Edward E.; Fox, Richard, S.; Barnes, Robert D. Invertebrate Zoology 7th edition. Cengage Learning. 2004: 940–956. ISBN 81-315-0104-3 （英语）.  引文格式1维护：冗余文本 (link)
9. Tatián, Marcos; Lagger, Cristian; Demarchi, Milagros; Mattoni, Camilo. Molecular phylogeny endorses the relationship between carnivorous and filter-feeding tunicates (Tunicata, Ascidiacea). Zoologica Scripta. 2011, 40 (6): 603–612. doi:10.1111/j.1463-6409.2011.00493.x. 
10. Sanamyan, Karen. Database of extant Ascidiacea. 2007-11-02.  引文格式1维护：日期与年 (link)
11. Molgulidae Lacaze-Duthiers, 1877. WoRMS. 2016-02-17 [2017-10-27] –通过WoRMS. 
12. Zeng, L.; Swalla, B. J. Molecular phylogeny of the protochordates: chordate evolution. Can. J. Zool. 2005, 83: 24–33. doi:10.1139/z05-010. 
13. Tsagkogeorga, G.; Turon, X.; Hopcroft, R. R.; Tilak, M. K.; Feldstein, T.; Shenkar, N.; Loya, Y.; Huchon, D.; Douzery, E. J.; Delsuc, F. An updated 18S rRNA phylogeny of tunicates based on mixture and secondary structure models. BMC Evolutionary Biology. 2009, 9: 187. PMC 2739199  . PMID 19656395. doi:10.1186/1471-2148-9-187. 
14. 引证错误：没有为名为Delsuc2018的参考文献提供内容
15. Chen, Jun-Yuan; Huang, Di-Ying; Peng, Qing-Qing; Chi, Hui-Mei; Wang, Xiu-Qiang; Feng, Man. Michael S. Levine , 编. The first tunicate from the Early Cambrian of South China. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (PNAS): 8314–8318. [2017-10-27]. doi:10.1073/pnas.1431177100. （原始内容于2019-06-12） （英语）.