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核糖体DNA

十二月 23, 2023

核糖体DNA（Ribosomal DNA，rDNA）是一种DNA序列，该序列用于rRNA编码。核糖体是蛋白质和rRNA分子的组合，翻译mRNA分子以产生蛋白质的组件。如该图所示，真核生物的rDNA包括一个单元段，一个操纵子，以及由NTS（英语：Non-transcribed spacer）、ETS（英语：ETS transcription factor family）、18S（英语：18S ribosomal RNA）、ITS1（英语：ITS1）、5.8S（英语：5.8S ribosomal RNA）、ITS2（英语：ITS2）和28S（英语：28S ribosomal RNA）束组成的串联重复序列。rDNA的还有另一个基因，由5S rRNA基因编码，位于大多数真核生物的基因组中[1]。5S rDNA序列也存在于果蝇的串联重复序列[1]。

真核rDNA序列的基因片段包含18S，5.8S和28S束，形成一个串联重复集群；NTS、非转录间隔、ETS、外部转录间隔、ITS、内转录间隔1和2，从5'末端编号。

重复单元的序列同质性 编辑

在大型的rDNA序列，rDNA的重复单元（英语：Repeat unit）之间的多态性非常低，这表明rDNA的串联阵列通过协同进化演变[1]。在对9种果蝇的5S串联重复序列区域彼此进行比较后得出的结果表明，因这一区域插入和删除较为频繁，在5'端以及3'端两侧发现有保守序列[2]。他们可能在DNA复制或通过基因转换（英语：Gene conversion）的过程中发生新合成链的滑移（英语：Replication slippage）[2]。

序列趋异对系统发生学的解释 编辑

ITS序列因為變異不影響核糖體的生成，所以远端物种如人类和青蛙之间进行ITS束序列的比较是不恰当的[3]，但這特性卻很適合在近親之間比較差異。當然反過來說，rDNA编码区域的保守序列则允许远端物种甚至在酵母和人类之间进行比较。人类的5.8S rRNA与酵母的5.8S rRNA具有75％的同一性[4]。在姊妹种（英语：Sibling species）情况下比较包括在物种和系统发生学中的ITS束则比较顺利[5][6]。rDNA序列的不同编码区重复序列通常表现出不同的进化速率。其结果是，这种DNA可以提供属于全系统级别的物种的系统发生学信息[7]。

相关条目 编辑

参考资料 编辑

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十二月 23, 2023
核糖体dna, ribosomal, rdna, 是一种dna序列, 该序列用于rrna编码, 核糖体是蛋白质和rrna分子的组合, 翻译mrna分子以产生蛋白质的组件, 如该图所示, 真核生物的rdna包括一个单元段, 一个操纵子, 以及由nts, 英语, transcribed, spacer, 英语, transcription, factor, family, 英语, ribosomal, its1, 英语, its1, 英语, ribosomal, its2, 英语, its2, 和28s, 英语, ri. 核糖体DNA Ribosomal DNA rDNA 是一种DNA序列 该序列用于rRNA编码 核糖体是蛋白质和rRNA分子的组合 翻译mRNA分子以产生蛋白质的组件 如该图所示 真核生物的rDNA包括一个单元段 一个操纵子 以及由NTS 英语 Non transcribed spacer ETS 英语 ETS transcription factor family 18S 英语 18S ribosomal RNA ITS1 英语 ITS1 5 8S 英语 5 8S ribosomal RNA ITS2 英语 ITS2 和28S 英语 28S ribosomal RNA 束组成的串联重复序列 rDNA的还有另一个基因 由5S rRNA基因编码 位于大多数真核生物的基因组中 1 5S rDNA序列也存在于果蝇的串联重复序列 1 真核rDNA序列的基因片段包含18S 5 8S和28S束 形成一个串联重复集群 NTS 非转录间隔 ETS 外部转录间隔 ITS 内转录间隔1和2 从5 末端编号 目录 1 重复单元的序列同质性 2 序列趋异对系统发生学的解释 3 相关条目 4 参考资料重复单元的序列同质性 编辑在大型的rDNA序列 rDNA的重复单元 英语 Repeat unit 之间的多态性非常低 这表明rDNA的串联阵列通过协同进化演变 1 在对9种果蝇的5S串联重复序列区域彼此进行比较后得出的结果表明 因这一区域插入和删除较为频繁 在5 端以及3 端两侧发现有保守序列 2 他们可能在DNA复制或通过基因转换 英语 Gene conversion 的过程中发生新合成链的滑移 英语 Replication slippage 2 序列趋异对系统发生学的解释 编辑ITS序列因為變異不影響核糖體的生成 所以远端物种如人类和青蛙之间进行ITS束序列的比较是不恰当的 3 但這特性卻很適合在近親之間比較差異 當然反過來說 rDNA编码区域的保守序列则允许远端物种甚至在酵母和人类之间进行比较 人类的5 8S rRNA与酵母的5 8S rRNA具有75 的同一性 4 在姊妹种 英语 Sibling species 情况下比较包括在物种和系统发生学中的ITS束则比较顺利 5 6 rDNA序列的不同编码区重复序列通常表现出不同的进化速率 其结果是 这种DNA可以提供属于全系统级别的物种的系统发生学信息 7 相关条目 编辑核糖体 核糖体RNA参考资料 编辑 1 0 1 1 1 2 Guy Franck Richard Alix Kerrest Bernard Dujon Comparative Genomics and Molecular Dynamics of DNA Repeats in Eukaryotes Microbiology and Molecular Biology Reviews 2008 12 01 72 4 686 727 2018 04 03 ISSN 1092 2172 doi 10 1128 mmbr 00011 08 原始内容存档于2021 03 15 英语 2 0 2 1 Paques F Samson ML Jordan P Wegnez M Structural evolution of the Drosophila 5S ribosomal genes Journal of molecular evolution 1995 11 41 5 615 21 PMID 7490776 doi 10 1007 BF00175820 Sumida M Kato Y Kurabayashi A Sequencing and analysis of the internal transcribed spacers ITSs and coding regions in the EcoR I fragment of the ribosomal DNA of the Japanese pond frog Rana nigromaculata Genes amp genetic systems 2004 04 79 2 105 18 PMID 15215676 doi 10 1266 ggs 79 105 Nazar RN Sitz TO Busch H Sequence homologies in mammalian 5 8S ribosomal RNA Biochemistry 1976 02 10 15 3 505 8 PMID 1252408 doi 10 1021 bi00648a008 使用 accessdate 需要含有 url 帮助 Ma YJ Qu FY Xu JJ 1998 Sequence differences of rDNA ITS2 and species diagnostic PCR assay of Anopheles sinensis and Anopheles anthropophagus from China J Med Coll PLA 13 123 128 PDF 页面存档备份 存于互联网档案馆 Li C Lee JS Groebner JL Kim HC Klein TA O Guinn ML Wilkerson RC 2005 A newly recognized species in the Anopheles hyrcanus group and molecular identification of related species from the Republic of South Korea Diptera Culicidae Zootaxa 939 1 8 PDF 页面存档备份 存于互联网档案馆 Hillis DM Dixon MT Ribosomal DNA molecular evolution and phylogenetic inference The Quarterly review of biology 1991 12 66 4 411 53 2021 09 11 PMID 1784710 doi 10 1086 417338 取自 https zh wikipedia org w index php title 核糖体DNA amp oldid 69402021, 维基百科，wiki，书籍，书籍，图书馆，

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