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深度同源性

二月 12, 2023

在演化发育生物学中，深度同源性被用以形容生物体的生长（英语：Cell growth）和分化过程受控于一类同源基因机制的情况，这一类机制在不同物种之间具有高度保守性。

长期以来被认为是独立进化的昆虫、脊椎动物和头足纲软体动物的眼睛，是被工具組基因中的PAX6来控制的

历史

1822年，法国动物学家艾蒂安·若弗鲁瓦·圣伊莱尔解剖了一只淡水龙虾，发现它的身体结构与脊椎动物相似，但是却有着倒置的背腹朝向（英语：Inversion (evolutionary biology)），从而指出二者之间器官发生的一致性[1]。

 
同源的Hox基因在昆虫和脊椎动物等不同动物中控制胚胎发展，并因此形成成体的形态。这些基因经历了数百万年的进化，存在高度保守性。

杰奥弗罗伊的同源性理论受到当时法国动物学家乔治 · 居维叶的指责[1]。1915年，圣地亚哥·拉蒙·卡哈尔绘制了苍蝇视叶的神经连接图，发现这些神经连接图与脊椎动物的相似[1]。1978年，愛德華·路易斯建立了演化发育生物学，发现同源异型基因调控果蝇的胚胎发育[1]。1997年，深度同源性一词首次出现在一篇论文中，用以描述了基因调控装置中明显的相关性，而这些相关性表明在不同的动物特征中存在进化上的相似性[2]。

同源性与深度同源性

通常而言，同源性可以用来形容显然相关的四肢骨骼在内的解剖结构之模式上，但深度同源性则可适用于解剖结构完全不同的动物群体，如：由骨骼和软骨构成内骨骼的脊椎动物和由甲壳素构成外骨骼的节肢动物的四肢的形成方式是深度同源的[2][3][4][5]。

在后生动物中，同源基因控制着主要体轴方向上的细胞组织分化，而pax基因控制着眼睛和其他感觉器官的发育。深度同源性可以超越族群差异，如：尽管哺乳动物的眼睛和昆虫的复眼形态上完全不同，其发育却是由PAX6来控制的[3]。类似地，Hox基因帮助形成动物的分节（英语：Segmentation (biology)）分节模式。Hoxa和 HoxD调节小鼠手指和脚趾的形成，控制着斑马鱼鳍的发育，但这些结构在此之前一直被认为是非同源的[6]。使用声音通讯的动物之间可能存在深度同源性，比如鸣禽和人类，它们可能共享FOXP2基因的未变异版本[7]。

算法

2010年，爱德华·马科特领导的团队开发了一种算法，该算法基于表型（如特征和发育缺陷）识别单细胞生物、植物和动物中的深度同源遗传模块[8][9]。

参考文献

  1. ^ 1.0 1.1 1.2 1.3 Held, Lewis I. Deep Homology?: Uncanny Similarities of Humans and Flies Uncovered by Evo-Devo. Cambridge University Press. February 2017: 2–5. ISBN 978-1316601211. 
  2. ^ 2.0 2.1 Shubin, Neil; Tabin, Cliff; Carroll, Sean. (PDF). Nature (Springer Nature). 1997, 388 (6643): 639–648 [2019-05-21]. doi:10.1038/41710. （原始内容 (PDF)存档于2018-03-26）.  引用错误：带有name属性“Shubin Tabin Carroll 1997”的<ref>标签用不同内容定义了多次
  3. ^ 3.0 3.1 Carroll, Sean B. Endless Forms Most Beautiful. Weidenfeld & Nicolson. 2006: 28, 66–69. ISBN 0-297-85094-6. 
  4. ^ Gilbert, Scott F. Homologous Pathways of Development. Developmental Biology. 6th edition. 2000 （英语）. 
  5. ^ Held, Lewis I. Deep Homology?: Uncanny Similarities of Humans and Flies Uncovered by Evo-Devo. Cambridge University Press. February 2017: viii and throughout. ISBN 978-1316601211. 
  6. ^ Zimmer, Carl. From Fins Into Hands: Scientists Discover a Deep Evolutionary Link. The New York Times. 2016-08-17 [21 October 2016]. （原始内容于2020-11-08）. 
  7. ^ Scharff, Petri; Constance, Jane. Evo-Devo, Deep Homology and FoxP2: Implications for the Evolution of Speech and Language. Philos. Trans. Royal Soc. B. July 2011, 366 (1574): 2124–2140. PMC 3130369  . doi:10.1098/rstb.2011.0001. 
  8. ^ Zimmer, Carl. The Search for Genes Leads to Unexpected Places. The New York Times. April 26, 2010 [2019-05-21]. （原始内容于2018-01-20）. 
  9. ^ McGary, K. L.; Park, T. J.; Woods, J. O.; Cha, H. J.; Wallingford, J. B.; Marcotte, E. M. Systematic discovery of nonobvious human disease models through orthologous phenotypes (PDF). Proceedings of the National Academy of Sciences. April 2010, 107 (14): 6544–9 [2019-05-21]. PMC 2851946  . PMID 20308572. doi:10.1073/pnas.0910200107. （原始内容 (PDF)于2016-06-01）. 

二月 12, 2023
深度同源性, 在演化发育生物学中, 被用以形容生物体的生长, 英语, cell, growth, 和分化过程受控于一类同源基因机制的情况, 这一类机制在不同物种之间具有高度保守性, 长期以来被认为是独立进化的昆虫, 脊椎动物和头足纲软体动物的眼睛, 是被工具組基因中的pax6来控制的, 目录, 历史, 同源性与, 算法, 参考文献历史, 编辑1822年, 法国动物学家艾蒂安, 若弗鲁瓦, 圣伊莱尔解剖了一只淡水龙虾, 发现它的身体结构与脊椎动物相似, 但是却有着倒置的背腹朝向, 英语, inversion, evo. 在演化发育生物学中 深度同源性被用以形容生物体的生长 英语 Cell growth 和分化过程受控于一类同源基因机制的情况 这一类机制在不同物种之间具有高度保守性 长期以来被认为是独立进化的昆虫 脊椎动物和头足纲软体动物的眼睛 是被工具組基因中的PAX6来控制的 目录 1 历史 2 同源性与深度同源性 3 算法 4 参考文献历史 编辑1822年 法国动物学家艾蒂安 若弗鲁瓦 圣伊莱尔解剖了一只淡水龙虾 发现它的身体结构与脊椎动物相似 但是却有着倒置的背腹朝向 英语 Inversion evolutionary biology 从而指出二者之间器官发生的一致性 1 同源的Hox基因在昆虫和脊椎动物等不同动物中控制胚胎发展 并因此形成成体的形态 这些基因经历了数百万年的进化 存在高度保守性 杰奥弗罗伊的同源性理论受到当时法国动物学家乔治 居维叶的指责 1 1915年 圣地亚哥 拉蒙 卡哈尔绘制了苍蝇视叶的神经连接图 发现这些神经连接图与脊椎动物的相似 1 1978年 愛德華 路易斯建立了演化发育生物学 发现同源异型基因调控果蝇的胚胎发育 1 1997年 深度同源性一词首次出现在一篇论文中 用以描述了基因调控装置中明显的相关性 而这些相关性表明在不同的动物特征中存在进化上的相似性 2 同源性与深度同源性 编辑通常而言 同源性可以用来形容显然相关的四肢骨骼在内的解剖结构之模式上 但深度同源性则可适用于解剖结构完全不同的动物群体 如 由骨骼和软骨构成内骨骼的脊椎动物和由甲壳素构成外骨骼的节肢动物的四肢的形成方式是深度同源的 2 3 4 5 在后生动物中 同源基因控制着主要体轴方向上的细胞组织分化 而pax基因控制着眼睛和其他感觉器官的发育 深度同源性可以超越族群差异 如 尽管哺乳动物的眼睛和昆虫的复眼形态上完全不同 其发育却是由PAX6来控制的 3 类似地 Hox基因帮助形成动物的分节 英语 Segmentation biology 分节模式 Hoxa和 HoxD调节小鼠手指和脚趾的形成 控制着斑马鱼鳍的发育 但这些结构在此之前一直被认为是非同源的 6 使用声音通讯的动物之间可能存在深度同源性 比如鸣禽和人类 它们可能共享FOXP2基因的未变异版本 7 算法 编辑2010年 爱德华 马科特领导的团队开发了一种算法 该算法基于表型 如特征和发育缺陷 识别单细胞生物 植物和动物中的深度同源遗传模块 8 9 参考文献 编辑 1 0 1 1 1 2 1 3 Held Lewis I Deep Homology Uncanny Similarities of Humans and Flies Uncovered by Evo Devo Cambridge University Press February 2017 2 5 ISBN 978 1316601211 2 0 2 1 Shubin Neil Tabin Cliff Carroll Sean Fossils genes and the evolution of animal limbs PDF Nature Springer Nature 1997 388 6643 639 648 2019 05 21 doi 10 1038 41710 原始内容 PDF 存档于2018 03 26 引用错误 带有name属性 Shubin Tabin Carroll 1997 的 lt ref gt 标签用不同内容定义了多次 3 0 3 1 Carroll Sean B Endless Forms Most Beautiful Weidenfeld amp Nicolson 2006 28 66 69 ISBN 0 297 85094 6 Gilbert Scott F Homologous Pathways of Development Developmental Biology 6th edition 2000 英语 Held Lewis I Deep Homology Uncanny Similarities of Humans and Flies Uncovered by Evo Devo Cambridge University Press February 2017 viii and throughout ISBN 978 1316601211 Zimmer Carl From Fins Into Hands Scientists Discover a Deep Evolutionary Link The New York Times 2016 08 17 21 October 2016 原始内容存档于2020 11 08 Scharff Petri Constance Jane Evo Devo Deep Homology and FoxP2 Implications for the Evolution of Speech and Language Philos Trans Royal Soc B July 2011 366 1574 2124 2140 PMC 3130369 doi 10 1098 rstb 2011 0001 Zimmer Carl The Search for Genes Leads to Unexpected Places The New York Times April 26 2010 2019 05 21 原始内容存档于2018 01 20 McGary K L Park T J Woods J O Cha H J Wallingford J B Marcotte E M Systematic discovery of nonobvious human disease models through orthologous phenotypes PDF Proceedings of the National Academy of Sciences April 2010 107 14 6544 9 2019 05 21 PMC 2851946 PMID 20308572 doi 10 1073 pnas 0910200107 原始内容存档 PDF 于2016 06 01 取自 https zh wikipedia org w index php title 深度同源性 amp oldid 73981689, 维基百科，wiki，书籍，书籍，图书馆，

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