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并行退火

并行退火(Parallel tempering),也称作replica exchange MCMC sampling,是一种用于动态改进蒙特卡罗方法的模拟算法。该算法用于模拟物理过程。同时更普遍地应用于蒙特卡罗马可夫链(Markov chain Monte Carlo,MCMC)抽样方法。[1] Sugita和Okamoto数学定义了一种分子动力学描述的并行退火算法:[2]通常被称为replica-exchange molecular dynamics(REMD)。

原理 编辑

一般的蒙特卡洛模拟使用Metropolis抽样,即接受概率 ,相同高度的势垒,温度越低越难以逾越,使得模拟需要相当长的模拟步长才能达到平衡,统计抽样满足各态历经。为了提高性能,采取如下策略:同时模拟一系列仅有温度不同的系统,在某些时刻随机选取相邻两个温度的系统,按如下接受概率置换两系统的温度:

 

其中,Ei和Ej是两个系统的总能量,Ti,Tj是温度,kB是玻尔兹曼因子。温度置换的过程是非物理的,但只要在一步中选择普通Metropolis抽样和温度置换分别以一定概率择其一,此过程仍然遵守细致平衡[3]

推广 编辑

并行退火可以用于温度以外的变量以改进抽样。例如,巨正则系综下蒙特卡罗模拟兰纳-琼斯势粒子的气液相平衡时,如果系统条件远离临界温度,密度的涨落很小,模拟中难以观测相变。而同时模拟多个化学势的系统,并按相似的接受法则置换系统的化学势:

 

其中i,j是两个超额化学势(相对理想气体)分别为 的系统,它们的粒子个数分别为 ,内能分别为 . 此模拟得到的密度概率函数能准确地反映气相和液相两个峰。[4]

神经网络 编辑

并行退火在训练神经网络时也有相似的应用。将一个系统运行在N个不同温度的条件下,并根据Metropolis法则 (页面存档备份,存于互联网档案馆)交换不同温度下的状态,因而可以用高温环境的参数去模拟低温环境,反之亦然。并行退火算法可用于人工神经网络训练,改进MCMC,虽然增加了计算复杂度,但提供了更快的马尔科夫链混合(mixing,指收敛)速度和更高的准确性。神经元之间的参数交换被描述为不同温度下分子状态的交换,随机交换的概率由Metropolis法则给出。尤其用于约束波茨曼机训练。[5]

参考 编辑

  1. ^ David J. Earl and Michael W. Deem (2005) "Parallel tempering: Theory, applications, and new perspectives" (页面存档备份,存于互联网档案馆), Phys. Chem. Chem. Phys., 7, 3910
  2. ^ Y. Sugita and Y. Okamoto. Replica-exchange molecular dynamics method for protein folding. Chemical Physics Letters. 1999, 314: 141–151. doi:10.1016/S0009-2614(99)01123-9. 
  3. ^ Radford M. Neal. Sampling from multimodal distributions using tempered transitions. Statistics and Computing. 1996, 6 (4): 353–366. doi:10.1007/BF00143556. 
  4. ^ Frenkel, D. & Smit, B. Understanding Molecular Simulation. Academic Press. 2010: 395. ISBN 978-981-272509-7. 
  5. ^ Parallel Tempering for Training of Restricted Boltzmann Machine. (页面存档备份,存于互联网档案馆) R.Salakhutdinov, 2009.

并行退火, parallel, tempering, 也称作replica, exchange, mcmc, sampling, 是一种用于动态改进蒙特卡罗方法的模拟算法, 该算法用于模拟物理过程, 同时更普遍地应用于蒙特卡罗马可夫链, markov, chain, monte, carlo, mcmc, 抽样方法, sugita和okamoto数学定义了一种分子动力学描述的算法, 通常被称为replica, exchange, molecular, dynamics, remd, 目录, 原理, 推广, 神经网络. 并行退火 Parallel tempering 也称作replica exchange MCMC sampling 是一种用于动态改进蒙特卡罗方法的模拟算法 该算法用于模拟物理过程 同时更普遍地应用于蒙特卡罗马可夫链 Markov chain Monte Carlo MCMC 抽样方法 1 Sugita和Okamoto数学定义了一种分子动力学描述的并行退火算法 2 通常被称为replica exchange molecular dynamics REMD 目录 1 原理 2 推广 3 神经网络 4 参考原理 编辑一般的蒙特卡洛模拟使用Metropolis抽样 即接受概率P a c c m i n 1 e D U k B T displaystyle P acc min 1 e frac Delta U k B T nbsp 相同高度的势垒 温度越低越难以逾越 使得模拟需要相当长的模拟步长才能达到平衡 统计抽样满足各态历经 为了提高性能 采取如下策略 同时模拟一系列仅有温度不同的系统 在某些时刻随机选取相邻两个温度的系统 按如下接受概率置换两系统的温度 p a c c min 1 exp E j k B T i E i k B T j exp E i k T i E j k T j min 1 e E i E j 1 k T i 1 k T j displaystyle p acc min left 1 frac exp left frac E j k B T i frac E i k B T j right exp left frac E i kT i frac E j kT j right right min left 1 e E i E j left frac 1 kT i frac 1 kT j right right nbsp 其中 Ei和Ej是两个系统的总能量 Ti Tj是温度 kB是玻尔兹曼因子 温度置换的过程是非物理的 但只要在一步中选择普通Metropolis抽样和温度置换分别以一定概率择其一 此过程仍然遵守细致平衡 3 推广 编辑并行退火可以用于温度以外的变量以改进抽样 例如 巨正则系综下蒙特卡罗模拟兰纳 琼斯势粒子的气液相平衡时 如果系统条件远离临界温度 密度的涨落很小 模拟中难以观测相变 而同时模拟多个化学势的系统 并按相似的接受法则置换系统的化学势 p a c c min 1 exp b j m j e x b i m i e x N i N j b j b i U i U j displaystyle p acc min left 1 exp left beta j mu j ex beta i mu i ex N i N j beta j beta i U i U j right right nbsp 其中i j是两个超额化学势 相对理想气体 分别为m i m j displaystyle mu i mu j nbsp 的系统 它们的粒子个数分别为N i N j displaystyle N i N j nbsp 内能分别为U i U j displaystyle U i U j nbsp 此模拟得到的密度概率函数能准确地反映气相和液相两个峰 4 神经网络 编辑并行退火在训练神经网络时也有相似的应用 将一个系统运行在N个不同温度的条件下 并根据Metropolis法则 页面存档备份 存于互联网档案馆 交换不同温度下的状态 因而可以用高温环境的参数去模拟低温环境 反之亦然 并行退火算法可用于人工神经网络训练 改进MCMC 虽然增加了计算复杂度 但提供了更快的马尔科夫链混合 mixing 指收敛 速度和更高的准确性 神经元之间的参数交换被描述为不同温度下分子状态的交换 随机交换的概率由Metropolis法则给出 尤其用于约束波茨曼机训练 5 参考 编辑 David J Earl and Michael W Deem 2005 Parallel tempering Theory applications and new perspectives 页面存档备份 存于互联网档案馆 Phys Chem Chem Phys 7 3910 Y Sugita and Y Okamoto Replica exchange molecular dynamics method for protein folding Chemical Physics Letters 1999 314 141 151 doi 10 1016 S0009 2614 99 01123 9 Radford M Neal Sampling from multimodal distributions using tempered transitions Statistics and Computing 1996 6 4 353 366 doi 10 1007 BF00143556 Frenkel D amp Smit B Understanding Molecular Simulation Academic Press 2010 395 ISBN 978 981 272509 7 Parallel Tempering for Training of Restricted Boltzmann Machine 页面存档备份 存于互联网档案馆 R Salakhutdinov 2009 取自 https zh wikipedia org w index php title 并行退火 amp oldid 78294447, 维基百科,wiki,书籍,书籍,图书馆,

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