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已测序真核生物基因组列表

四月 04, 2023

已测序真核生物基因组列表包括所有已知的，可以公开获取已组装、注释和发表的细胞核和细胞器基因组序列的真核生物；基因组草图不包括在内，只有细胞器序列的物种也不包括。

酿酒酵母是确定其完整基因组序列的第一个真核生物。

1977年，第一次出现DNA测序。1995年，细菌流感嗜血杆菌第一个完成了全基因组序列。1996年，酿酒酵母是第一个发布的真核生物基因组序列。1998年，发布了第一个多细胞真核生物基因组序列，秀丽隐杆线虫。

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原生生物

以下是最早的5個完成基因組測序的原生生物。更完整的列表，請參閱已測序原生生物基因組列表（英语：List of sequenced protist genomes）。

植物

以下是最早的5个完成基因组测序的植物，更完整的列表，请参阅已测序植物基因组列表

物种学名 类型 意义 基因组大小 预测的基因数 完成机构 完成年份
Arabidopsis thaliana
生态型:哥伦比亚 		拟南芥 模式植物 119 Mb 25,498,[1] 27,400,[2] 31,670 (UniProt) Arabidopsis Genome Initiative[3] 2000[1]
Cyanidioschyzon merolae
Strain:10D 		红藻 单细胞真核生物 16.5 Mb 5,331[4] University of Tokyo, Rikkyo University, Saitama University and Kumamoto University 2004[4]
Oryza sativassp
ssp indica 		大米 Crop and model organism 420 Mb 32-50,000[5] Beijing Genomics Institute、浙江大学、中国科学院 2002[5]
Ostreococcus tauri 绿藻 单细胞真核生物，基因组较小 12.6 Mb 7,969 (UniProt) Laboratoire Arago 2006[6]
Populus trichocarpa Balsam poplar or Black Cottonwood 固碳模式植物，商业木材and comparison to A. thaliana 550 Mb 45,555[7] The International Poplar Genome Consortium 2006[7]

真菌

以下是最早的5个完成基因组测序的真菌，更完整的列表，请参阅已测序真菌基因组列表（英语：List of sequenced fungi genomes）。

物种 纲 意义 基因组大小 预测基因数目 完成机构 完成年份
釀酒酵母
Saccharomyces cerevisiae
品系：S288C 		酵母菌綱 用于酿造啤酒的酵母；常用的模式生物 12.1 Mb 6,294[8] 大规模国际合作项目[9] 1996[8]
家兔脑胞内原虫
Encephalitozoon cuniculi 		微孢子蟲纲 人类病原体 2.9 Mb 1,997[10] Genoscope和Université Blaise Pascal 2001[10]
粟酒裂殖酵母
Schizosaccharomyces pombe
品系：972h- 		裂殖酵母纲 模式生物 14 Mb 4,824[11] 桑格研究所和冷泉港實驗室 2002[11]
粉色麵包黴菌
Neurospora crassa 		糞殼菌綱 模式生物 40 Mb 10,082[12] Broad Institute、俄勒岡健康與科學大學、肯塔基大学和堪萨斯大学 2003[12]
黄孢原毛平革菌
Phanerochaete chrysosporium
品系：RP78 		傘菌綱 木材腐朽真菌；常用于真菌修復 30Mb 11,777[13] Joint Genome Institute 2004[13]

动物

以下是最早的5个完成基因组测序的动物，更完整的列表，请参阅已测序动物基因组列表。

物种 类型 意义 基因组大小 预测的基因数目 完成机构 完成年份
秀麗隱桿線蟲
Caenorhabditis elegans
品系：Bristol N2 		线虫动物门 模式动物 100 Mb 19,000[14] 华盛顿大学和维康桑格研究所 1998[14]
黑腹果蝇
Drosophila melanogaster 		果蝇 模式动物 165 Mb 13,600[15] 塞雷拉基因組公司、加利福尼亞大學柏克萊分校、貝勒醫學院、欧洲DGP 2000[15]
甘比亞瘧蚊
Anopheles gambiae
品系：PEST 		蚊子 疟疾的载体 278 Mb 13,683[16] 塞雷拉基因組公司和法国国家基因测序中心 2002[16]
红鳍东方鲀
Takifugu rubripes 		四齒魨科 脊椎动物中的最小基因组 390 Mb 22–29,000[17] 国际河豚基因体协会[18] 2002[19]
智人
Homo sapiens 		哺乳动物 3.2 Gb[20] 18,826（CCDS估计） 人类基因组计划委员会和塞雷拉基因組公司 草图：2001[21][22]
完成：2006[23]

参见

参考资料

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  3. ^ Arabidopsis Genome Initiative 互联网档案馆的，存档日期2006-02-07.
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外部链接

  • Diark - a resource for eukaryotic genome research （页面存档备份，存于互联网档案馆）
  • UCSC Genome Browser （页面存档备份，存于互联网档案馆）
  • International Sequencing Consortium - Large-scale Sequencing Project Database （页面存档备份，存于互联网档案馆）
  • Ensembl （页面存档备份，存于互联网档案馆） The Ensembl Genome Browser (includes draft and low coverage genomes)
  • Fungal Genome Initiative （页面存档备份，存于互联网档案馆） (includes draft genomes)
  • GOLD:Genomes OnLine Database v 3.0 （页面存档备份，存于互联网档案馆）
  • SUPERFAMILY comparative genomics database （页面存档备份，存于互联网档案馆） Includes genomes of all completely sequenced eukaryotes, and sophisticated datamining plus visualisation tools for analysis
  • Rat Genome Database （页面存档备份，存于互联网档案馆）

四月 04, 2023
已测序真核生物基因组列表, 包括所有已知的, 可以公开获取已组装, 注释和发表的细胞核和细胞器基因组序列的真核生物, 基因组草图不包括在内, 只有细胞器序列的物种也不包括, 酿酒酵母是确定其完整基因组序列的第一个真核生物, 1977年, 第一次出现dna测序, 1995年, 细菌流感嗜血杆菌第一个完成了全基因组序列, 1996年, 酿酒酵母是第一个发布的真核生物基因组序列, 1998年, 发布了第一个多细胞真核生物基因组序列, 秀丽隐杆线虫, 此列表不完整, 欢迎您扩充内容, 目录, 原生生物, 植物, 真菌, 动. 已测序真核生物基因组列表包括所有已知的 可以公开获取已组装 注释和发表的细胞核和细胞器基因组序列的真核生物 基因组草图不包括在内 只有细胞器序列的物种也不包括 酿酒酵母是确定其完整基因组序列的第一个真核生物 1977年 第一次出现DNA测序 1995年 细菌流感嗜血杆菌第一个完成了全基因组序列 1996年 酿酒酵母是第一个发布的真核生物基因组序列 1998年 发布了第一个多细胞真核生物基因组序列 秀丽隐杆线虫 此列表不完整 欢迎您扩充内容 目录 1 原生生物 2 植物 3 真菌 4 动物 5 参见 6 参考资料 7 外部链接原生生物 编辑以下是最早的5個完成基因組測序的原生生物 更完整的列表 請參閱已測序原生生物基因組列表 英语 List of sequenced protist genomes 植物 编辑以下是最早的5个完成基因组测序的植物 更完整的列表 请参阅已测序植物基因组列表 物种学名 类型 意义 基因组大小 预测的基因数 完成机构 完成年份Arabidopsis thaliana生态型 哥伦比亚 拟南芥 模式植物 119 Mb 25 498 1 27 400 2 31 670 UniProt Arabidopsis Genome Initiative 3 2000 1 Cyanidioschyzon merolaeStrain 10D 红藻 单细胞真核生物 16 5 Mb 5 331 4 University of Tokyo Rikkyo University Saitama University and Kumamoto University 2004 4 Oryza sativasspssp indica 大米 Crop and model organism 420 Mb 32 50 000 5 Beijing Genomics Institute 浙江大学 中国科学院 2002 5 Ostreococcus tauri 绿藻 单细胞真核生物 基因组较小 12 6 Mb 7 969 UniProt Laboratoire Arago 2006 6 Populus trichocarpa Balsam poplar or Black Cottonwood 固碳模式植物 商业木材and comparison to A thaliana 550 Mb 45 555 7 The International Poplar Genome Consortium 2006 7 真菌 编辑以下是最早的5个完成基因组测序的真菌 更完整的列表 请参阅已测序真菌基因组列表 英语 List of sequenced fungi genomes 物种 纲 意义 基因组大小 预测基因数目 完成机构 完成年份釀酒酵母Saccharomyces cerevisiae品系 S288C 酵母菌綱 用于酿造啤酒的酵母 常用的模式生物 12 1 Mb 6 294 8 大规模国际合作项目 9 1996 8 家兔脑胞内原虫Encephalitozoon cuniculi 微孢子蟲纲 人类病原体 2 9 Mb 1 997 10 Genoscope和Universite Blaise Pascal 2001 10 粟酒裂殖酵母Schizosaccharomyces pombe品系 972h 裂殖酵母纲 模式生物 14 Mb 4 824 11 桑格研究所和冷泉港實驗室 2002 11 粉色麵包黴菌Neurospora crassa 糞殼菌綱 模式生物 40 Mb 10 082 12 Broad Institute 俄勒岡健康與科學大學 肯塔基大学和堪萨斯大学 2003 12 黄孢原毛平革菌Phanerochaete chrysosporium品系 RP78 傘菌綱 木材腐朽真菌 常用于真菌修復 30Mb 11 777 13 Joint Genome Institute 2004 13 动物 编辑以下是最早的5个完成基因组测序的动物 更完整的列表 请参阅已测序动物基因组列表 物种 类型 意义 基因组大小 预测的基因数目 完成机构 完成年份秀麗隱桿線蟲Caenorhabditis elegans品系 Bristol N2 线虫动物门 模式动物 100 Mb 19 000 14 华盛顿大学和维康桑格研究所 1998 14 黑腹果蝇Drosophila melanogaster 果蝇 模式动物 165 Mb 13 600 15 塞雷拉基因組公司 加利福尼亞大學柏克萊分校 貝勒醫學院 欧洲DGP 2000 15 甘比亞瘧蚊Anopheles gambiae品系 PEST 蚊子 疟疾的载体 278 Mb 13 683 16 塞雷拉基因組公司和法国国家基因测序中心 2002 16 红鳍东方鲀Takifugu rubripes 四齒魨科 脊椎动物中的最小基因组 390 Mb 22 29 000 17 国际河豚基因体协会 18 2002 19 智人Homo sapiens 哺乳动物 3 2 Gb 20 18 826 CCDS估计 人类基因组计划委员会和塞雷拉基因組公司 草图 2001 21 22 完成 2006 23 参见 编辑 分子与细胞生物学主题 生物学主题 遗传学主题 基因组 人类基因组计划 遗传学 已测序的生物 已测序古菌基因组列表 已测序细菌基因组列表 英语 List of sequenced bacterial genomes 已测序质体基因组列表参考资料 编辑 1 0 1 1 The Arabidopsis Genome Initiative Analysis of the genome sequence of the flowering plant Arabidopsis thaliana Nature December 2000 408 6814 796 815 PMID 11130711 doi 10 1038 35048692 Ensembl entry 2012 03 08 原始内容存档于2020 07 24 Arabidopsis Genome Initiative 互联网档案馆的存檔 存档日期2006 02 07 4 0 4 1 Matsuzaki M Misumi O Shin I T et al Genome sequence of the ultrasmall unicellular red alga Cyanidioschyzon merolae 10D Nature 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