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CRISPR/Cpf1

CRISPR/Cpf1 是一种DNA编辑的技术,其原理CRISPR/Cas 系统类似。CRISPR/Cpf1 也藉由細菌古菌噬菌体获得性免疫机制来进行基因编辑。由于 Cpf1 蛋白是一种比 Cas9 蛋白更小而且更简单的核酸内切酶,这样把CRISPR/Cpf1系统植入待修改基因的细胞就相对更容易,CRISPR/Cpf1可能是一种比CRISPR/Cas9更好的基因编辑工具。[1]

作用机理

基于核酸内切酶的基因编辑系统是由一个分子“剪刀”(如Cpf1)和一个由DNA构成的引导序列组成的。由DNA构成的引导序列会引领分子“剪刀”与靶向序列的DNA结合,使得靶向序列被切除。

由于原核生物需要保护自己免受噬菌体的侵袭,现有一种猜想认为每种噬菌体都有对应的分子“剪刀”免疫系统,所以还有大量的这样的系统等待人们去发现。[1]

Cas9需要2条RNA分子来做DNA的剪切,然而,Cpf1只需要1条。Cas9蛋白在切割DNA双链时,两条链上的切口在两链的相同位置上,所以留下的末端是平末端(非粘性末端)。Cpf1蛋白则不同,其在DNA两条链上的切割位点不在同一位置上,因此会产生粘性末端。由于粘性末端的缘故,在Cpf1酶切末端上插入新序列比Cas9的酶切末端上更容易。[2]

Cpf1只需要1个RNA序列来导引,并且不需要tracrRNA英语tracrRNA(tracrRNA在别的CRISPR/Cas系统中起到了促进引导RNA形成的作用)。Cpf1蛋白还使用了富含T碱基的PAM序列。

发现过程

Cpf1是在细菌的基因组数据库中搜索出来的,而且Cpf1基因在很多物种的基因组中都出现了[1] 最终用于基因编辑的Cpf1蛋白是从16种含有Cpf1的细菌中的2种(Acidaminococcus英语Acidaminococcus和Lachnospiraceae )中提取出来的。[2]

从Acidaminococcus和Lachnospiraceae 中找到的Cas1蛋白能够有效地在人体细胞中发挥基因编辑的作用。[3]

相关阅读

参考文献

  1. ^ 1.0 1.1 1.2 . The Economist. October 3, 2015 [2015-10-24]. ISSN 0013-0613. (原始内容存档于2016-05-31).  引用错误:带有name属性“econ”的<ref>标签用不同内容定义了多次 引用错误:带有name属性“econ”的<ref>标签用不同内容定义了多次
  2. ^ 2.0 2.1 Ledford, Heidi. Alternative CRISPR system could improve genome editing. Nature: 17–17. doi:10.1038/nature.2015.18432. 
  3. ^ Zetsche, Bernd; Gootenberg, Jonathan S.; Abudayyeh, Omar O.; Slaymaker, Ian M.; Makarova, Kira S.; Essletzbichler, Patrick; Volz, Sara E.; Joung, Julia; van der Oost, John; Regev, Aviv; Koonin, Eugene V.; Zhang, Feng. Cpf1 Is a Single RNA-Guided Endonuclease of a Class 2 CRISPR-Cas System. Cell. October 2015, 163 (3): 759–771. doi:10.1016/j.cell.2015.09.038. 

crispr, cpf1, 是一种dna编辑的技术, 其原理, crispr, 系统类似, 也藉由細菌或古菌对噬菌体的获得性免疫机制来进行基因编辑, 由于, cpf1, 蛋白是一种比, cas9, 蛋白更小而且更简单的核酸内切酶, 这样把系统植入待修改基因的细胞就相对更容易, 可能是一种比crispr, cas9更好的基因编辑工具, 目录, 作用机理, 发现过程, 相关阅读, 参考文献作用机理, 编辑基于核酸内切酶的基因编辑系统是由一个分子, 剪刀, 如cpf1, 和一个由dna构成的引导序列组成的, 由dna构成. CRISPR Cpf1 是一种DNA编辑的技术 其原理 与 CRISPR Cas 系统类似 CRISPR Cpf1 也藉由細菌或古菌对噬菌体的获得性免疫机制来进行基因编辑 由于 Cpf1 蛋白是一种比 Cas9 蛋白更小而且更简单的核酸内切酶 这样把CRISPR Cpf1系统植入待修改基因的细胞就相对更容易 CRISPR Cpf1可能是一种比CRISPR Cas9更好的基因编辑工具 1 目录 1 作用机理 2 发现过程 3 相关阅读 4 参考文献作用机理 编辑基于核酸内切酶的基因编辑系统是由一个分子 剪刀 如Cpf1 和一个由DNA构成的引导序列组成的 由DNA构成的引导序列会引领分子 剪刀 与靶向序列的DNA结合 使得靶向序列被切除 由于原核生物需要保护自己免受噬菌体的侵袭 现有一种猜想认为每种噬菌体都有对应的分子 剪刀 免疫系统 所以还有大量的这样的系统等待人们去发现 1 Cas9需要2条RNA分子来做DNA的剪切 然而 Cpf1只需要1条 Cas9蛋白在切割DNA双链时 两条链上的切口在两链的相同位置上 所以留下的末端是平末端 非粘性末端 Cpf1蛋白则不同 其在DNA两条链上的切割位点不在同一位置上 因此会产生粘性末端 由于粘性末端的缘故 在Cpf1酶切末端上插入新序列比Cas9的酶切末端上更容易 2 Cpf1只需要1个RNA序列来导引 并且不需要tracrRNA 英语 tracrRNA tracrRNA在别的CRISPR Cas系统中起到了促进引导RNA形成的作用 Cpf1蛋白还使用了富含T碱基的PAM序列 发现过程 编辑Cpf1是在细菌的基因组数据库中搜索出来的 而且Cpf1基因在很多物种的基因组中都出现了 1 最终用于基因编辑的Cpf1蛋白是从16种含有Cpf1的细菌中的2种 Acidaminococcus 英语 Acidaminococcus 和Lachnospiraceae 中提取出来的 2 从Acidaminococcus和Lachnospiraceae 中找到的Cas1蛋白能够有效地在人体细胞中发挥基因编辑的作用 3 相关阅读 编辑CRISPR参考文献 编辑 1 0 1 1 1 2 Even CRISPR The Economist October 3 2015 2015 10 24 ISSN 0013 0613 原始内容存档于2016 05 31 引用错误 带有name属性 econ 的 lt ref gt 标签用不同内容定义了多次 引用错误 带有name属性 econ 的 lt ref gt 标签用不同内容定义了多次 2 0 2 1 Ledford Heidi Alternative CRISPR system could improve genome editing Nature 17 17 doi 10 1038 nature 2015 18432 Zetsche Bernd Gootenberg Jonathan S Abudayyeh Omar O Slaymaker Ian M Makarova Kira S Essletzbichler Patrick Volz Sara E Joung Julia van der Oost John Regev Aviv Koonin Eugene V Zhang Feng Cpf1 Is a Single RNA Guided Endonuclease of a Class 2 CRISPR Cas System Cell October 2015 163 3 759 771 doi 10 1016 j cell 2015 09 038 取自 https zh wikipedia org w index php title CRISPR Cpf1 amp oldid 71576708, 维基百科,wiki,书籍,书籍,图书馆,

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