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非共價作用力指數

非共價作用力指數一般來說是根據電子密度英语Electron density(ρ)以及簡化密度梯度(s)來使非共價作用力(NCI)具體化的數值。由實證研究得知非共價作用力在低電子密度下與低簡化密度梯度區域相關聯。量子化學中,非共價作用力指數在三維空間下可以被用來具體化非共價交互作用。[1]

其具體化是藉由不同著色深淺度(強度)來表現簡化密度梯度的等值曲面。其深淺度通常透過電子密度以及各個在等值曲面其黑塞電子密度的第二特徵值 (λH) 來量測,吸引或是排斥的特性則由λH的正負號決定。因此可以直接在三維空間中展現非共價作用力以及其特性,如氫鍵和空間位阻。[2][3]基於電子密度和導出的純量場,非共價作用力指數不會因分子軌域的轉化而改變。此外,一系統的電子密度可以藉由X光繞射實驗以及理論波函數計算來推算。[4]

簡化密度梯度(s)為一電子密度的純量場(ρ),其可表示如下:

密度泛函理論框架中,簡化密度梯度起源於廣義密度梯度近似(GGA)的交換泛函[5],最初的定義為:

kF 在此表示自由電子氣體英语Jellium費米動量[6]

参考资料 编辑

  1. ^ Pastorczak, E. and Corminboeuf, C. (2017) ‘Perspective: Found in translation: Quantum chemical tools for grasping non-covalent interactions’, The Journal of Chemical Physics. AIP Publishing LLC , 146(12), p. 120901. doi: 10.1063/1.4978951.
  2. ^ Contreras-García, J., Yang, W. and Johnson, E. R. (2011) ‘Analysis of Hydrogen-Bond Interaction Potentials from the Electron Density: Integration of Noncovalent Interaction Regions’, The Journal of Physical Chemistry A. American Chemical Society, 115(45), pp. 12983–12990. doi: 10.1021/jp204278k.
  3. ^ Johnson, E. R. et al. (2010) ‘Revealing Noncovalent Interactions’, Journal of the American Chemical Society. American Chemical Society, 132(18), pp. 6498–6506. doi: 10.1021/ja100936w.
  4. ^ Saleh , G. et al. (2012) ‘Revealing Non-covalent Interactions in Molecular Crystals through Their Experimental Electron Densities’, Chemistry - A European Journal, 18(48), pp. 15523–15536. doi: 10.1002/chem.201201290.
  5. ^ Perdew, J. P.; Burke, K.; Ernzerhof, M. Generalized Gradient Approximation Made Simple. Phys. Rev. Lett. 1996, 77. doi:10.1103/PhysRevLett.77.3865. 
  6. ^ Hohenberg, P. and Kohn, W. (1964) ‘Inhomogeneous Electron Gas’, Physical Review. American Physical Society, 136(3B), pp. B864–B871. doi: 10.1103/PhysRev.136.B864.

非共價作用力指數, 一般來說是根據電子密度, 英语, electron, density, 以及簡化密度梯度, 來使非共價作用力, 具體化的數值, 由實證研究得知非共價作用力在低電子密度下與低簡化密度梯度區域相關聯, 量子化學中, 在三維空間下可以被用來具體化非共價交互作用, 其具體化是藉由不同著色深淺度, 強度, 來表現簡化密度梯度的等值曲面, 其深淺度通常透過電子密度以及各個在等值曲面其黑塞電子密度的第二特徵值, 來量測, 吸引或是排斥的特性則由λh的正負號決定, 因此可以直接在三維空間中展現非共價作用力以及其. 非共價作用力指數一般來說是根據電子密度 英语 Electron density r 以及簡化密度梯度 s 來使非共價作用力 NCI 具體化的數值 由實證研究得知非共價作用力在低電子密度下與低簡化密度梯度區域相關聯 量子化學中 非共價作用力指數在三維空間下可以被用來具體化非共價交互作用 1 其具體化是藉由不同著色深淺度 強度 來表現簡化密度梯度的等值曲面 其深淺度通常透過電子密度以及各個在等值曲面其黑塞電子密度的第二特徵值 lH 來量測 吸引或是排斥的特性則由lH的正負號決定 因此可以直接在三維空間中展現非共價作用力以及其特性 如氫鍵和空間位阻 2 3 基於電子密度和導出的純量場 非共價作用力指數不會因分子軌域的轉化而改變 此外 一系統的電子密度可以藉由X光繞射實驗以及理論波函數計算來推算 4 簡化密度梯度 s 為一電子密度的純量場 r 其可表示如下 s r r r 2 3 p 2 1 3 r r 4 3 displaystyle s r mid nabla rho r mid over 2 3 pi 2 frac 1 3 rho r left frac 4 3 right 在密度泛函理論框架中 簡化密度梯度起源於廣義密度梯度近似 GGA 的交換泛函 5 最初的定義為 s r r r 2 k F r r displaystyle s r mid nabla rho r mid over 2k F rho r kF 在此表示自由電子氣體 英语 Jellium 的費米動量 6 参考资料 编辑 Pastorczak E and Corminboeuf C 2017 Perspective Found in translation Quantum chemical tools for grasping non covalent interactions The Journal of Chemical Physics AIP Publishing LLC 146 12 p 120901 doi 10 1063 1 4978951 Contreras Garcia J Yang W and Johnson E R 2011 Analysis of Hydrogen Bond Interaction Potentials from the Electron Density Integration of Noncovalent Interaction Regions The Journal of Physical Chemistry A American Chemical Society 115 45 pp 12983 12990 doi 10 1021 jp204278k Johnson E R et al 2010 Revealing Noncovalent Interactions Journal of the American Chemical Society American Chemical Society 132 18 pp 6498 6506 doi 10 1021 ja100936w Saleh G et al 2012 Revealing Non covalent Interactions in Molecular Crystals through Their Experimental Electron Densities Chemistry A European Journal 18 48 pp 15523 15536 doi 10 1002 chem 201201290 Perdew J P Burke K Ernzerhof M Generalized Gradient Approximation Made Simple Phys Rev Lett 1996 77 doi 10 1103 PhysRevLett 77 3865 Hohenberg P and Kohn W 1964 Inhomogeneous Electron Gas Physical Review American Physical Society 136 3B pp B864 B871 doi 10 1103 PhysRev 136 B864 取自 https zh wikipedia org w index php title 非共價作用力指數 amp oldid 76478696, 维基百科,wiki,书籍,书籍,图书馆,

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