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適體

五月 15, 2024

適體 (源自拉丁文「aptus」表示”適合”的意思,和希臘文「meros」表示”部位”的意思)是指與特定的目標分子結合的寡聚核酸或是 肽鏈。適體常常從大量的隨機序列被挑選出來，但自然的適體依舊存在如核糖开关中。適體可以用在學術研究亦可以當作大分子藥物應用在臨床診斷上。在適體的目標分子存在的情況下，適體能與核酶結合並進行自我剪切的動作，這些複合物能應用在研究、工業與臨床診斷上。

與生物素結合的RNA適體的結構，黃色的是適體的表面與骨架，生物素(圓形)與RNA表面的凹槽結合

有高度專一性的適體能如下分類:

  • DNA or RNA or XNA（英语：Nucleic acid analogue）構成的適體(適體核酸);由寡核酸構成。
  • 肽鏈構成的適體(適體肽鏈);由可變的多肽區域與蛋白質的兩端結合而成。

適體核酸 编辑

適體核酸是一種核酸經由多次的體外選殖，或是經由SELEX(systematic evolution of ligands by exponential enrichment 配體指數增強系統進化技術)來與多種的目標分子，像小分子化合物、蛋白質、核酸，甚至細胞、組織與器官等等結合。適體常應用在生物技術與治療等方面，因為它們能提供”對特定分子辨識”的這種特性，就如同也常被應用的抗體(脊椎動物體內原本就有抗體產生)一般。適體能設計在試管中、能快速的利用化學方法合成、保留好保存的特性與在治療應用上抽出較少或無免疫原性。

在1990年, 兩所實驗室分別發展出了選殖技術: Gold實驗室採用SELEX(配體指數增強系統進化技術)來選殖與T4DNA聚合酶結合的RNA 配體;Szostak實驗室則命名並採用體外選殖來選殖與許多有機染劑結合的RNA配體。 Szostak實驗室也給這些用核酸為原料的配體定義了適體(源自拉丁文apto為適合的意思)這個名詞。兩年之後,Szostak實驗室與另一吉利德科學公司也分別著手研究 使用體外選殖計畫來分別演化與有機染料、與人類凝血因子、與凝血酶結合的單股DNA配體。RNA與DNA適體並沒有任何系統上的差異，相較於RNA，DNA適體依舊有比較高度的化學穩定性。

有趣的是，這種體外進行選殖的方法早在20多年前當索爾施皮格爾曼用Qbeta（英语：Bacteriophage Qβ）複製系統來演化自我複製的分子時已經實現了。[1] 此外，當發表體外選殖與SELEX技術的前一年, 杰拉爾德·喬伊斯 已經用‘直接演化(directed evolution)’技術來改變核酸酵素剪切的活性了。

因為適體的發現，許多的研究學者已經採用適體選殖來進行許多的應用與研究。在2001年, Ellington實驗室將體外選殖在德克薩斯大學奧斯汀分校, 與在SomaLogic（英语：SomaLogic）公司(Boulder, CO)進行自動化大幅地將實驗時間從6星期縮短到3天。

在生物學與生物技術方面，人工的設計核酸配體備受注目，自然界中的適體在2002年前尚未被發現，分別由 羅納德斷路器（英语：Ronald Breaker）領導與Evgeny Nudler領導的兩個研究團隊發現核酸為主的基因調控因子(又名核糖开关)與人工製造的適體有相似的分子識別特性。此外，發現新的基因調控模式，顯示更多支持RNA世界学说的證據。

DNA與RNA構成的適體都對目標分子顯現出很強的親和力，[2][3][4] 而且DNA與RNA構成的適體已經發現某些有共同的目標分子，像是溶酶體,[5] 凝血酶,[6]愛滋病毒反式反應因子(human immunodeficiency virus trans-acting responsive element (HIV TAR)),[7] 高鐵血紅素,[8] 干擾素γ,[9] 血管内皮生长因子 (VEGF),[10] 前列腺抗體 (PSA),[11] [12]and 多巴胺.[13] 在目標分子是溶酶體、 HIV TAR、VEGF與多巴胺，DNA適體與RNA適體有很高的相似度，通常差在DNA是胸腺嘧啶而RNA是尿嘧啶取代;在目標分子是高鐵血紅素, 凝血酶,與干擾素γ的情況下, DNA適體與RNA適體從不相關的選殖系統選殖出，且有各自獨特的序列。並非所有DNA適體與RNA 適體相似顯現出DNA與RNA序列間相互功能的相似與差異，因此在功能與結構上還需更進一步的研究。

最近，聰明適體（英语：smart aptamers）與聰明配體（英语：smart ligands）的概念被引進， 在預先計算適體與目標分子的平衡( )、速率 ( 、常數 )與熱動能參數(ΔH, ΔS)的情況下選殖適體 毛細動力電泳（英语：Kinetic capillary electrophoresis）是用來選殖聰明適體（英语：smart aptamers）的一項技術，經過僅僅幾回的選殖動作就能成功選殖出所需的適體。

現在在應用適體方面的治療歸功於美國的食品藥物管理機構 (FDA)核准第一個適體藥物用來治療老人黃斑部病變 (AMD)稱為治斑劑（英语：Macugen）(Macugen)。此外，NeoVentures生技公司(http://www.neoventures[永久失效連結].) 已經成功的商業化第一個以適體為基礎用來分析穀物黴菌毒素(mycotoxins)的診斷平台。許多家公司紛紛開發適體與適體抗體來取代抗體。

未修飾的適體在血液中會馬上被清除，半生期從幾分鐘到幾小時不等，主要因為腎臟的核酸酶的降解與清除，結果造成適體與生俱來的低分子重。目前未修飾的適體主要應用在治療短暫停留的情況，如血液凝固;或是治療器官，像眼睛這種允許適體的局部傳送。這種快速分解的特性能應用在體內診療上，例如: 與粘蛋白(tenascin)結合的適體藉由先靈公司（英语：Schering AG）應用在癌症治療方面。 許多修飾方法，如 2'端氟取代的嘧啶、聚乙二醇 (PEG)連結等等(兩者皆用在治斑劑（英语：Macugen）(Macugen)方面，與FDA認可的適體)，科學家皆可獲並且能增加適體的半生期到天或者週的程度。 另外一種增加適體抗核酸酵素的方法是發展Spiegelmer（英语：Spiegelmer）(完全以非天然的L形式核酸骨架構成)，相同序列的spiegelmer與相對應的RNA適體有相同的結合特性，除了與目標分子的鏡像異構物結合。

除了發展適體治療技術之外，許多研究學者像是Ellington實驗室與SomaLogic公司(Boulder, CO)已經發展出藉由適體來描繪血漿蛋白的技術稱為適體血漿蛋白診療科技。此項科技將來能夠運用在多生物標記蛋白來幫助診斷生病-健康的狀態區別。人體學上的適體應用在HER2與EGFR膜蛋白，且已經被證明能應用在病理學上，藉由急速冷凍的組織來研究內部調控。[14]

藉由收集從體外選殖與SELEX科技操作出來的數據，Ellington實驗室已經發展出適體數據庫整合了全部已經發表的實驗數據。能由以下網址搜尋 http://aptamer.icmb.utexas.edu/ （页面存档备份，存于互联网档案馆）.

更多关于适配子对手性多肽的检测 可以阅读 http://nanopore.weebly.com/ （页面存档备份，存于互联网档案馆）

適體肽鏈 编辑

適體肽鏈是一種蛋白質被設計用來干擾、阻斷其他在細胞中蛋白質的蛋白質交互作用，適體肽鏈由可變度高的多肽環接在protamersein骨架的兩端上。這種雙重構造限制大大的增加結合時的親和力，與抗體的結合力可相比擬(奈米分子程度)。

多肽環的長度大概有10到20個胺基酸，骨架由好的溶解度與緊密度特性的蛋白質構成。現在，細菌蛋白 硫氧還原蛋白（英语：Thioredoxin）-A是最常用的骨架蛋白，多肽環插進骨架蛋白的還原活性位(野生種的蛋白中是-Cys-Gly-Pro-Cys-環)兩個半胱氨酸側鏈能夠形成雙硫鍵。

適體肽鏈能用別種系統來進行選殖，現今最常用的是酵母菌 雙雜交技術.

配體調控的適體肽鏈(Ligand Regulated Peptide Aptamers (LiRPAs))選殖技術已經被實現。藉由使用三聚 FKBP-雷帕黴素-FRB結構與隨機的多肽和目標分子間的交互作用，且運用雷帕黴素或非免疫抑制相似物來調控，進而從骨架蛋白上取代7個胺基酸肽鏈。 另外可以從肽鏈合併後的集合中選殖出適體肽鏈藉由噬菌體表現 與其他的表面表現技術像是mRNA表現（英语：mRNA display）、核酸表現（英语：ribosome display）、 細菌表現（英语：bacterial display）與酵母菌表現（英语：yeast display），這些實驗程序也被稱為生物掏洗（英语：biopanning）。從生物掏洗得到的肽鏈中，模擬表位（英语：mimotope）可以被視為一種適體肽鏈。這些從肽鏈合併後的集合中掏選出的肽鏈已被儲存在特定的資料庫稱為MimoDB（英语：MimoDB）中。[15] 可以從以下網站中獲得(.)

適體促發現生物標記技術(AptaBiD) 编辑

適體促發現生物標記技術(AptaBiD或Aptamer-Facilitated Biomarker Discovery)是一項應用在發現生物標記的技術。[16]適體促發現生物標記技術用使用多回的製造適體或者製造適體堆來與細胞上不同的分子標 記物結合並能促進偵測生物標記。主要分為三個階段: (i)多回的選殖結合目標細胞生物標記的適體; (ii) 藉由適體從目標細胞上分離生物標記; (iii) 應用質譜儀來辨別生物標記。適體促發現生物標記技術的主要特點是製造合成的親和探針(適體)同時發現生物標記。在適體促發現生物標記技術中, 適體被設計與細胞表面的生物標記的原本狀態與構型結合。除了促進辨識生物標記，這些適體還能直接在體內用來分離細胞、顯現細胞、追蹤細胞，甚至還能被用來調整細胞受體與配送不同抗原(例如:siRNA與藥物) 進細胞的活性。

來源 编辑

  1. ^ Mills, DR; Peterson, RL; Spiegelman, S. An extracellular Darwinian experiment with a self-duplicating nucleic acid molecule.. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 1967 Jul, 58 (1): 217–24. PMID 5231602. 
  2. ^ Neves, M.A.D.; O. Reinstein, M.Saad, P.E. Johnson. Defining the secondary structural requirements of a cocaine-binding aptamer by a thermodynamic and mutation study. Biophys Chem. 2010, 153: 9–16. PMID 21035241. doi:10.1016/j.bpc.2010.09.009. 
  3. ^ Baugh, C.; D. Grate, C.Wilson. 2.8 angstrom crystal structure of the malachite green aptamer.. J. Mol. Biol. 2000, 301: 117–128. PMID 10926496. doi:10.1006/jmbi.2000.3951. 
  4. ^ Dieckmann, T.; E. Fujikawa, X. Xhao, J. Szostak, J. Feigon. Structural Investigations of RNA and DNA aptamers in Solution. Journal of Cellular Biochemistry. 1995: 56–56. 
  5. ^ Potty, A.; K. Kourentzi, H. Fang, G. Jackson, X. Zhang, G. Legge, R. Willson. Biophysical Characterization of DNA Aptamer Interactions with Vascular Endothelial Growth Factor.. Biopolymers. 2009, 91: 145–156. PMID 19025993. doi:10.1002/bip.21097. 
  6. ^ Long, S.; M. Long, R. White, B. Sullenger. Crystal structure of an RNA aptamer bound to thrombin. RNA. 2008, 14 (2): 2504–2512. PMID 18971322. 
  7. ^ Darfeuille, F.; S. Reigadas, J. Hansen, H. Orum, C. Di Primo, J. Toulme. Aptamers targeted to an RNA hairpin show improved specificity compared to that of complementary oligonucleotides.. Biochemistry. 2006, 45: 12076–12082. PMID 17002307. doi:10.1021/bi0606344. 
  8. ^ Liu, M.; T. Kagahara, H. Abe, Y. Ito. Direct In Vitro Selection of Hemin-Binding DNA Aptamer with Peroxidase Activity. Bulletin of the Chemical Society of Japan. 2009, 82: 99–104. 
  9. ^ Min, K.; M. Cho, S. Han, Y. Shim, J. Ku, C. Ban. A simple and direct electrochemical detection of interferon-gamma using its RNA and DNA aptamers.. Biosensors & Bioelectronics. 2008, 23: 1819–1824. PMID 18406597. doi:10.1016/j.bios.2008.02.021. 
  10. ^ Ng, E.W.M; D.T. Shima, P. Calias, E.T. Cunningham, D.R. Guyer, A.P. Adamis. Pegaptanib, a targeted anti-VEGF aptamer for ocular vascular disease.. Nature Reviews Drug Discovery. 2006, 5 (2): 123–132. PMID 16518379. doi:10.1038/nrd1955. 
  11. ^ Savory, N.; K. Abe, K. Sode, K. Ikebukuro. Selection of DNA aptamer against prostate specific antigen using a genetic algorithm and application to sensing.. Biosensors & Bioelectronics. 2010, 15: 1386–91. PMID 20692149. doi:10.1016/j.bios.2010.07.057. 
  12. ^ Jeong, S.; S.R. Han, Y.J. Lee, S.W. Lee. Selection of RNA aptamers specific to active prostate-specific antigen.. Biotechnology Letters. 2010, 32: 379–85. PMID 19943183. doi:10.1007/s10529-009-0168-1. 
  13. ^ Walsh, R.; M. DeRosa. Retention of function in the DNA homolog of the RNA dopamine aptamer.. Biochemical and Biophysical Research Communications. 2009, 388: 732–735. PMID 19699181. doi:10.1016/j.bbrc.2009.08.084. 
  14. ^ Gupta S, Thirstrup D, Jarvis TC, Schneider DJ, Wilcox SK, Carter J, Zhang C, Gelinas A, Weiss A, Janjic N, Baird GS. Rapid Histochemistry Using Slow Off-rate Modified Aptamers With Anionic Competition.. Applied Immunohistochemistry & Molecular Morphology. Jan 2011, 19 (1): Epub ahead of print. PMID 21217521. doi:10.1097/PAI.0b013e3182008c29. 
  15. ^ Huang, J; Ru, B, Zhu, P, Nie, F, Yang, J, Wang, X, Dai, P, Lin, H, Guo, FB, Rao, N. MimoDB 2.0: a mimotope database and beyond.. Nucleic Acids Research. 2011-11-03, 40 (1): D271–7. PMC 3245166  . PMID 22053087. doi:10.1093/nar/gkr922. 
  16. ^ Berezovski MV, Lechmann M, Musheev MU, Mak TW, Krylov SN. Aptamer-facilitated biomarker discovery (AptaBiD). J Am Chem Soc. Jul 2008, 130 (28): 9137–43. PMID 18558676. doi:10.1021/ja801951p. 

延伸閱讀 编辑

  • Ellington AD, Szostak JW. In vitro selection of RNA molecules that bind specific ligands. Nature. Aug 1990, 346 (6287): 818–22. PMID 1697402. doi:10.1038/346818a0. 
  • Bock LC, Griffin LC, Latham JA, Vermaas EH, Toole JJ. Selection of single-stranded DNA molecules that bind and inhibit human thrombin. Nature. Feb 1992, 355 (6360): 564–6. PMID 1741036. doi:10.1038/355564a0. 
  • Hoppe-Seyler F, Butz K. Peptide aptamers: powerful new tools for molecular medicine. J Mol Med. 2000, 78 (8): 426–30. PMID 11097111. doi:10.1007/s001090000140. 
  • Carothers JM, Oestreich SC, Davis JH, Szostak JW. Informational complexity and functional activity of RNA structures. J Am Chem Soc. Apr 2004, 126 (16): 5130–7. PMID 15099096. doi:10.1021/ja031504a. 
  • Cohen BA, Colas P, Brent R. . Proc Natl Acad Sci USA. Nov 1998, 95 (24): 14272–7 [2013-07-01]. PMC 24363  . PMID 9826690. doi:10.1073/pnas.95.24.14272. （原始内容存档于2019-09-24）. 
  • Binkowski BF, Miller RA, Belshaw PJ. Ligand-regulated peptides: a general approach for modulating protein-peptide interactions with small molecules. Chem Biol. Jul 2005, 12 (7): 847–55. PMID 16039531. doi:10.1016/j.chembiol.2005.05.021. 
  • Sullenger BA, Gilboa E. Emerging clinical applications of RNA. Nature. Jul 2002, 418 (6894): 252–8. PMID 12110902. doi:10.1038/418252a. 
  • Ng EW, Shima DT, Calias P, Cunningham ET, Guyer DR, Adamis AP. Pegaptanib, a targeted anti-VEGF aptamer for ocular vascular disease. Nat Rev Drug Discov. Feb 2006, 5 (2): 123–32. PMID 16518379. doi:10.1038/nrd1955. 
  • Drabovich AP, Berezovski M, Okhonin V, Krylov SN. Selection of smart aptamers by methods of kinetic capillary electrophoresis. Anal Chem. May 2006, 78 (9): 3171–8. PMID 16643010. doi:10.1021/ac060144h. 
  • Cho EJ, Lee JW, Ellington, AD. . Annual Review of Analytical Chemistry. 2009, 2 (1): 241–64 [2013-07-01]. PMID 20636061. doi:10.1146/annurev.anchem.1.031207.112851. （原始内容存档于2019-09-24）. 

相關連結 编辑

五月 15, 2024
適體, 源自拉丁文, aptus, 表示, 適合, 的意思, 和希臘文, meros, 表示, 部位, 的意思, 是指與特定的目標分子結合的寡聚核酸或是, 肽鏈, 常常從大量的隨機序列被挑選出來, 但自然的依舊存在如核糖开关中, 可以用在學術研究亦可以當作大分子藥物應用在臨床診斷上, 在的目標分子存在的情況下, 能與核酶結合並進行自我剪切的動作, 這些複合物能應用在研究, 工業與臨床診斷上, 與生物素結合的rna的結構, 黃色的是的表面與骨架, 生物素, 圓形, 與rna表面的凹槽結合, 有高度專一性的能如下分類,. 適體 源自拉丁文 aptus 表示 適合 的意思 和希臘文 meros 表示 部位 的意思 是指與特定的目標分子結合的寡聚核酸或是 肽鏈 適體常常從大量的隨機序列被挑選出來 但自然的適體依舊存在如核糖开关中 適體可以用在學術研究亦可以當作大分子藥物應用在臨床診斷上 在適體的目標分子存在的情況下 適體能與核酶結合並進行自我剪切的動作 這些複合物能應用在研究 工業與臨床診斷上 與生物素結合的RNA適體的結構 黃色的是適體的表面與骨架 生物素 圓形 與RNA表面的凹槽結合 有高度專一性的適體能如下分類 DNA or RNA or XNA 英语 Nucleic acid analogue 構成的適體 適體核酸 由寡核酸構成 肽鏈構成的適體 適體肽鏈 由可變的多肽區域與蛋白質的兩端結合而成 目录 1 適體核酸 2 適體肽鏈 3 適體促發現生物標記技術 AptaBiD 4 來源 5 延伸閱讀 6 相關連結適體核酸 编辑適體核酸是一種核酸經由多次的體外選殖 或是經由SELEX systematic evolution of ligands by exponential enrichment 配體指數增強系統進化技術 來與多種的目標分子 像小分子化合物 蛋白質 核酸 甚至細胞 組織與器官等等結合 適體常應用在生物技術與治療等方面 因為它們能提供 對特定分子辨識 的這種特性 就如同也常被應用的抗體 脊椎動物體內原本就有抗體產生 一般 適體能設計在試管中 能快速的利用化學方法合成 保留好保存的特性與在治療應用上抽出較少或無免疫原性 在1990年 兩所實驗室分別發展出了選殖技術 Gold實驗室採用SELEX 配體指數增強系統進化技術 來選殖與T4DNA聚合酶結合的RNA 配體 Szostak實驗室則命名並採用體外選殖來選殖與許多有機染劑結合的RNA配體 Szostak實驗室也給這些用核酸為原料的配體定義了適體 源自拉丁文apto為適合的意思 這個名詞 兩年之後 Szostak實驗室與另一吉利德科學公司也分別著手研究 使用體外選殖計畫來分別演化與有機染料 與人類凝血因子 與凝血酶結合的單股DNA配體 RNA與DNA適體並沒有任何系統上的差異 相較於RNA DNA適體依舊有比較高度的化學穩定性 有趣的是 這種體外進行選殖的方法早在20多年前當索爾施皮格爾曼用Qbeta 英语 Bacteriophage Qb 複製系統來演化自我複製的分子時已經實現了 1 此外 當發表體外選殖與SELEX技術的前一年 杰拉爾德 喬伊斯 已經用 直接演化 directed evolution 技術來改變核酸酵素剪切的活性了 因為適體的發現 許多的研究學者已經採用適體選殖來進行許多的應用與研究 在2001年 Ellington實驗室將體外選殖在德克薩斯大學奧斯汀分校 與在SomaLogic 英语 SomaLogic 公司 Boulder CO 進行自動化大幅地將實驗時間從6星期縮短到3天 在生物學與生物技術方面 人工的設計核酸配體備受注目 自然界中的適體在2002年前尚未被發現 分別由 羅納德斷路器 英语 Ronald Breaker 領導與Evgeny Nudler領導的兩個研究團隊發現核酸為主的基因調控因子 又名核糖开关 與人工製造的適體有相似的分子識別特性 此外 發現新的基因調控模式 顯示更多支持RNA世界学说的證據 DNA與RNA構成的適體都對目標分子顯現出很強的親和力 2 3 4 而且DNA與RNA構成的適體已經發現某些有共同的目標分子 像是溶酶體 5 凝血酶 6 愛滋病毒反式反應因子 human immunodeficiency virus trans acting responsive element HIV TAR 7 高鐵血紅素 8 干擾素g 9 血管内皮生长因子 VEGF 10 前列腺抗體 PSA 11 12 and 多巴胺 13 在目標分子是溶酶體 HIV TAR VEGF與多巴胺 DNA適體與RNA適體有很高的相似度 通常差在DNA是胸腺嘧啶而RNA是尿嘧啶取代 在目標分子是高鐵血紅素 凝血酶 與干擾素g的情況下 DNA適體與RNA適體從不相關的選殖系統選殖出 且有各自獨特的序列 並非所有DNA適體與RNA 適體相似顯現出DNA與RNA序列間相互功能的相似與差異 因此在功能與結構上還需更進一步的研究 最近 聰明適體 英语 smart aptamers 與聰明配體 英语 smart ligands 的概念被引進 在預先計算適體與目標分子的平衡 K d displaystyle K d nbsp 速率 k o f f displaystyle k off nbsp 常數k o n displaystyle k on nbsp 與熱動能參數 DH DS 的情況下選殖適體 毛細動力電泳 英语 Kinetic capillary electrophoresis 是用來選殖聰明適體 英语 smart aptamers 的一項技術 經過僅僅幾回的選殖動作就能成功選殖出所需的適體 現在在應用適體方面的治療歸功於美國的食品藥物管理機構 FDA 核准第一個適體藥物用來治療老人黃斑部病變 AMD 稱為治斑劑 英语 Macugen Macugen 此外 NeoVentures生技公司 http www neoventures 永久失效連結 已經成功的商業化第一個以適體為基礎用來分析穀物黴菌毒素 mycotoxins 的診斷平台 許多家公司紛紛開發適體與適體抗體來取代抗體 未修飾的適體在血液中會馬上被清除 半生期從幾分鐘到幾小時不等 主要因為腎臟的核酸酶的降解與清除 結果造成適體與生俱來的低分子重 目前未修飾的適體主要應用在治療短暫停留的情況 如血液凝固 或是治療器官 像眼睛這種允許適體的局部傳送 這種快速分解的特性能應用在體內診療上 例如 與粘蛋白 tenascin 結合的適體藉由先靈公司 英语 Schering AG 應用在癌症治療方面 許多修飾方法 如 2 端氟取代的嘧啶 聚乙二醇 PEG 連結等等 兩者皆用在治斑劑 英语 Macugen Macugen 方面 與FDA認可的適體 科學家皆可獲並且能增加適體的半生期到天或者週的程度 另外一種增加適體抗核酸酵素的方法是發展Spiegelmer 英语 Spiegelmer 完全以非天然的L形式核酸骨架構成 相同序列的spiegelmer與相對應的RNA適體有相同的結合特性 除了與目標分子的鏡像異構物結合 除了發展適體治療技術之外 許多研究學者像是Ellington實驗室與SomaLogic公司 Boulder CO 已經發展出藉由適體來描繪血漿蛋白的技術稱為適體血漿蛋白診療科技 此項科技將來能夠運用在多生物標記蛋白來幫助診斷生病 健康的狀態區別 人體學上的適體應用在HER2與EGFR膜蛋白 且已經被證明能應用在病理學上 藉由急速冷凍的組織來研究內部調控 14 藉由收集從體外選殖與SELEX科技操作出來的數據 Ellington實驗室已經發展出適體數據庫整合了全部已經發表的實驗數據 能由以下網址搜尋 http aptamer icmb utexas edu 页面存档备份 存于互联网档案馆 更多关于适配子对手性多肽的检测 可以阅读 http nanopore weebly com 页面存档备份 存于互联网档案馆 適體肽鏈 编辑適體肽鏈是一種蛋白質被設計用來干擾 阻斷其他在細胞中蛋白質的蛋白質交互作用 適體肽鏈由可變度高的多肽環接在protamersein骨架的兩端上 這種雙重構造限制大大的增加結合時的親和力 與抗體的結合力可相比擬 奈米分子程度 多肽環的長度大概有10到20個胺基酸 骨架由好的溶解度與緊密度特性的蛋白質構成 現在 細菌蛋白 硫氧還原蛋白 英语 Thioredoxin A是最常用的骨架蛋白 多肽環插進骨架蛋白的還原活性位 野生種的蛋白中是 Cys Gly Pro Cys 環 兩個半胱氨酸側鏈能夠形成雙硫鍵 適體肽鏈能用別種系統來進行選殖 現今最常用的是酵母菌 雙雜交技術 配體調控的適體肽鏈 Ligand Regulated Peptide Aptamers LiRPAs 選殖技術已經被實現 藉由使用三聚 FKBP 雷帕黴素 FRB結構與隨機的多肽和目標分子間的交互作用 且運用雷帕黴素或非免疫抑制相似物來調控 進而從骨架蛋白上取代7個胺基酸肽鏈 另外可以從肽鏈合併後的集合中選殖出適體肽鏈藉由噬菌體表現 與其他的表面表現技術像是mRNA表現 英语 mRNA display 核酸表現 英语 ribosome display 細菌表現 英语 bacterial display 與酵母菌表現 英语 yeast display 這些實驗程序也被稱為生物掏洗 英语 biopanning 從生物掏洗得到的肽鏈中 模擬表位 英语 mimotope 可以被視為一種適體肽鏈 這些從肽鏈合併後的集合中掏選出的肽鏈已被儲存在特定的資料庫稱為MimoDB 英语 MimoDB 中 15 可以從以下網站中獲得 https web archive org web 20121116054757 http immunet cn mimodb 適體促發現生物標記技術 AptaBiD 编辑適體促發現生物標記技術 AptaBiD或Aptamer Facilitated Biomarker Discovery 是一項應用在發現生物標記的技術 16 適體促發現生物標記技術用使用多回的製造適體或者製造適體堆來與細胞上不同的分子標 記物結合並能促進偵測生物標記 主要分為三個階段 i 多回的選殖結合目標細胞生物標記的適體 ii 藉由適體從目標細胞上分離生物標記 iii 應用質譜儀來辨別生物標記 適體促發現生物標記技術的主要特點是製造合成的親和探針 適體 同時發現生物標記 在適體促發現生物標記技術中 適體被設計與細胞表面的生物標記的原本狀態與構型結合 除了促進辨識生物標記 這些適體還能直接在體內用來分離細胞 顯現細胞 追蹤細胞 甚至還能被用來調整細胞受體與配送不同抗原 例如 siRNA與藥物 進細胞的活性 來源 编辑 Mills DR Peterson RL Spiegelman S An extracellular Darwinian experiment with a self duplicating nucleic acid molecule Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 1967 Jul 58 1 217 24 PMID 5231602 引文使用过时参数coauthors 帮助 请检查 date 中的日期值 帮助 Neves M A D O Reinstein M Saad P E Johnson Defining the secondary structural requirements of a cocaine binding aptamer by a thermodynamic and mutation study Biophys Chem 2010 153 9 16 PMID 21035241 doi 10 1016 j bpc 2010 09 009 引文使用过时参数coauthors 帮助 Baugh C D Grate C Wilson 2 8 angstrom crystal structure of the malachite green aptamer J Mol Biol 2000 301 117 128 PMID 10926496 doi 10 1006 jmbi 2000 3951 引文使用过时参数coauthors 帮助 Dieckmann T E Fujikawa X Xhao J Szostak J Feigon Structural Investigations of RNA and DNA aptamers in Solution Journal of Cellular Biochemistry 1995 56 56 引文使用过时参数coauthors 帮助 Potty A K Kourentzi H Fang G Jackson X Zhang G Legge R Willson Biophysical Characterization of DNA Aptamer Interactions with Vascular Endothelial Growth Factor Biopolymers 2009 91 145 156 PMID 19025993 doi 10 1002 bip 21097 引文使用过时参数coauthors 帮助 Long S M Long R White B Sullenger Crystal structure of an RNA aptamer bound to thrombin RNA 2008 14 2 2504 2512 PMID 18971322 引文使用过时参数coauthors 帮助 Darfeuille F S Reigadas J Hansen H Orum C Di Primo J Toulme Aptamers targeted to an RNA hairpin show improved specificity compared to that of complementary oligonucleotides Biochemistry 2006 45 12076 12082 PMID 17002307 doi 10 1021 bi0606344 引文使用过时参数coauthors 帮助 Liu M T Kagahara H Abe Y Ito Direct In Vitro Selection of Hemin Binding DNA Aptamer with Peroxidase Activity Bulletin of the Chemical Society of Japan 2009 82 99 104 引文使用过时参数coauthors 帮助 Min K M Cho S Han Y Shim J Ku C Ban A simple and direct electrochemical detection of interferon gamma using its RNA and DNA aptamers Biosensors amp Bioelectronics 2008 23 1819 1824 PMID 18406597 doi 10 1016 j bios 2008 02 021 引文使用过时参数coauthors 帮助 Ng E W M D T Shima P Calias E T Cunningham D R Guyer A P Adamis Pegaptanib a targeted anti VEGF aptamer for ocular vascular disease Nature Reviews Drug Discovery 2006 5 2 123 132 PMID 16518379 doi 10 1038 nrd1955 引文使用过时参数coauthors 帮助 Savory N K Abe K Sode K Ikebukuro Selection of DNA aptamer against prostate specific antigen using a genetic algorithm and application to sensing Biosensors amp Bioelectronics 2010 15 1386 91 PMID 20692149 doi 10 1016 j bios 2010 07 057 引文使用过时参数coauthors 帮助 Jeong S S R Han Y J Lee S W Lee Selection of RNA aptamers specific to active prostate specific antigen Biotechnology Letters 2010 32 379 85 PMID 19943183 doi 10 1007 s10529 009 0168 1 引文使用过时参数coauthors 帮助 Walsh R M DeRosa Retention of function in the DNA homolog of the RNA dopamine aptamer Biochemical and Biophysical Research Communications 2009 388 732 735 PMID 19699181 doi 10 1016 j bbrc 2009 08 084 引文使用过时参数coauthors 帮助 Gupta S Thirstrup D Jarvis TC Schneider DJ Wilcox SK Carter J Zhang C Gelinas A Weiss A Janjic N Baird GS Rapid Histochemistry Using Slow Off rate Modified Aptamers With Anionic Competition Applied Immunohistochemistry amp Molecular Morphology Jan 2011 19 1 Epub ahead of print PMID 21217521 doi 10 1097 PAI 0b013e3182008c29 Huang J Ru B Zhu P Nie F Yang J Wang X Dai P Lin H Guo FB Rao N MimoDB 2 0 a mimotope database and beyond Nucleic Acids Research 2011 11 03 40 1 D271 7 PMC 3245166 nbsp PMID 22053087 doi 10 1093 nar gkr922 引文使用过时参数coauthors 帮助 Berezovski MV Lechmann M Musheev MU Mak TW Krylov SN Aptamer facilitated biomarker discovery AptaBiD J Am Chem Soc Jul 2008 130 28 9137 43 PMID 18558676 doi 10 1021 ja801951p 延伸閱讀 编辑Ellington AD Szostak JW In vitro selection of RNA molecules that bind specific ligands Nature Aug 1990 346 6287 818 22 PMID 1697402 doi 10 1038 346818a0 Bock LC Griffin LC Latham JA Vermaas EH Toole JJ Selection of single stranded DNA molecules that bind and inhibit human thrombin Nature Feb 1992 355 6360 564 6 PMID 1741036 doi 10 1038 355564a0 Hoppe Seyler F Butz K Peptide aptamers powerful new tools for molecular medicine J Mol Med 2000 78 8 426 30 PMID 11097111 doi 10 1007 s001090000140 Carothers JM Oestreich SC Davis JH Szostak JW Informational complexity and functional activity of RNA structures J Am Chem Soc Apr 2004 126 16 5130 7 PMID 15099096 doi 10 1021 ja031504a Cohen BA Colas P Brent R An artificial cell cycle inhibitor isolated from a combinatorial library Proc Natl Acad Sci USA Nov 1998 95 24 14272 7 2013 07 01 PMC 24363 nbsp PMID 9826690 doi 10 1073 pnas 95 24 14272 原始内容存档于2019 09 24 Binkowski BF Miller RA Belshaw PJ Ligand regulated peptides a general approach for modulating protein peptide interactions with small molecules Chem Biol Jul 2005 12 7 847 55 PMID 16039531 doi 10 1016 j chembiol 2005 05 021 Sullenger BA Gilboa E Emerging clinical applications of RNA Nature Jul 2002 418 6894 252 8 PMID 12110902 doi 10 1038 418252a Ng EW Shima DT Calias P Cunningham ET Guyer DR Adamis AP Pegaptanib a targeted anti VEGF aptamer for ocular vascular disease Nat Rev Drug Discov Feb 2006 5 2 123 32 PMID 16518379 doi 10 1038 nrd1955 Drabovich AP Berezovski M Okhonin V Krylov SN Selection of smart aptamers by methods of kinetic capillary electrophoresis Anal Chem May 2006 78 9 3171 8 PMID 16643010 doi 10 1021 ac060144h Cho EJ Lee JW Ellington AD Applications of Aptamers as Sensors Annual Review of Analytical Chemistry 2009 2 1 241 64 2013 07 01 PMID 20636061 doi 10 1146 annurev anchem 1 031207 112851 原始内容存档于2019 09 24 相關連結 编辑Aptamer biosensor group 页面存档备份 存于互联网档案馆 Aptamer Base The MimoDB database 取自 https zh wikipedia org w index php title 適體 amp oldid 72894711, 维基百科，wiki，书籍，书籍，图书馆，

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