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蛋白质四级结构


蛋白质四级结构(英語:Protein quaternary structure)是生物化学中用于描述多亚基蛋白质复合物中各个折叠蛋白质亚基的排列组合。

蛋白质1EFN的结构,重点是四级结构。
蛋白质一级结构蛋白质二级结构蛋白质三级结构蛋白质四级结构
蛋白质结构交互式图像,以PCNA为演示。(PDB 1AXC)

描述和示例

许多蛋白质实际上是多个多肽链的组装。 四级结构是指蛋白质亚基相对于彼此的数目和排列[1]。具有四级结构的蛋白质的实例包括血红蛋白DNA聚合酶离子通道

由具有不同功能的亚基组成的有时被称为全酶,其中一些部分可以称为调节亚基,功能核被称为催化亚基。作为多蛋白质复合体的其它组件也具有四级结构。实例包括核小体微管。四级结构的变化可以通过个体亚基内的构象变化或通过亚基相对于彼此的重新取向而发生。 正是通过这种变化,其在“多聚”酶中协同性和别构调节的基础,许多蛋白质经历调节并且执行它们的生理功能。

上述定义遵循生物化学的经典方法,其在蛋白质和功能性蛋白质单元之间的区别难以阐明的时候建立。最近,人们在讨论蛋白质的四级结构时考虑蛋白质 - 蛋白质相互作用,并考虑蛋白质的所有组装作为蛋白质复合体(protein complexes)。

四级结构的命名

具有四级结构的蛋白质复合物通常可以使用以-mer结尾的名称(希腊语为“部分,亚基”)描述寡聚复合物中亚基的数目。 正式和希腊拉丁文名称通常用于前十种类型,可用于多达二十个亚单位,而较高顺序的复合体通常用亚单位的数量描述,随后是-meric。例如,含两个亚基称为二聚体,三个则为三聚体英语Protein trimer,以此类推(只有一个蛋白质多肽链的称为单聚体)。通常情况下,细胞中的蛋白质复合物很少超过八聚体。

  • 1 = 单聚体/亚基
  • 2 = 二聚体
  • 3 = 三聚体英语Protein trimer
  • 4 = 四聚体英语Protein tetramer
  • 5 = 五聚体英语Protein pentamer
  • 6 = hexamer
  • 7 = heptamer
  • 8 = 八聚体英语Protein octamer
  • 9 = nonamer
  • 10 = decamer
  • 11 = undecamer
  • 12 = 十二聚体英语Protein dodecamer
  • 13 = tridecamer
  • 14 = tetradecamer
  • 15 = pentadecamer*
  • 16 = hexadecamer
  • 17 = heptadecamer*
  • 18 = octadecamer
  • 19 = nonadecamer
  • 20 = 二十聚体英语Protein eicosamer
  • 21-mer
  • 22-mer
  • 23-mer*
  • etc.
*“没有已知的例子”

尽管大多数蛋白质都很少被观察到比八聚体更高的复合物,但也有一些重要的例外。病毒衣壳甚至可以为60聚体。在细胞中还发现了几种分子机器,例如,蛋白酶体(四个七聚体环 = 28个亚基),转录复合物和剪接体核糖体可能是最大的分子机器,由许多RNA和蛋白质分子组成。

在一些情况下,蛋白质形成复合物,然后组装成更大的复合物。 在这种情况下,人们使用命名法,例如“二聚体的二聚体”或“三聚体的三聚体”来表明该复合体在解离成单体之前可能解离成较小的亚复合体。

四级结构的测定

复合物质量直接分析方法

复合物大小直接分析方法

复合物大小间接分析方法

蛋白质交互作用

蛋白质能够形成非常紧密的复合物。 例如,核糖核酸酶抑制剂英语Ribonuclease inhibitor以约20fM的解离常数核糖核酸酶A英语Pancreatic ribonuclease结合。 其他蛋白质已经进化成特异性结合另一种蛋白质上的异常部分,例如生物素基团(抗生物素蛋白avidin),磷酸化酪氨酸(SH2结构域)或富含脯氨酸的区段(SH3结构域)。

参见

参考资料

  1. ^ Chou, Kuo-Chen; Cai, Yu-Dong. Predicting protein quaternary structure by pseudo amino acid composition. Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics. 1 November 2003, 53 (2): 282–289. PMID 14517979. doi:10.1002/prot.10500. 

蛋白质四级结构, 英語, protein, quaternary, structure, 是生物化学中用于描述多亚基蛋白质复合物中各个折叠蛋白质亚基的排列组合, 蛋白质1efn的结构, 重点是四级结构, 蛋白质结构的交互式图像, 以pcna为演示, 1axc, 目录, 描述和示例, 四级结构的命名, 四级结构的测定, 复合物质量直接分析方法, 复合物大小直接分析方法, 复合物大小间接分析方法, 蛋白质交互作用, 参见, 参考资料描述和示例, 编辑许多蛋白质实际上是多个多肽链的组装, 四级结构是指蛋白质亚基相对于彼此. 蛋白质四级结构 英語 Protein quaternary structure 是生物化学中用于描述多亚基蛋白质复合物中各个折叠蛋白质亚基的排列组合 蛋白质1EFN的结构 重点是四级结构 蛋白质结构的交互式图像 以PCNA为演示 PDB 1AXC 目录 1 描述和示例 2 四级结构的命名 3 四级结构的测定 3 1 复合物质量直接分析方法 3 2 复合物大小直接分析方法 3 3 复合物大小间接分析方法 4 蛋白质交互作用 5 参见 6 参考资料描述和示例 编辑许多蛋白质实际上是多个多肽链的组装 四级结构是指蛋白质亚基相对于彼此的数目和排列 1 具有四级结构的蛋白质的实例包括血红蛋白 DNA聚合酶和离子通道 由具有不同功能的亚基组成的酶有时被称为全酶 其中一些部分可以称为调节亚基 功能核被称为催化亚基 作为多蛋白质复合体的其它组件也具有四级结构 实例包括核小体和微管 四级结构的变化可以通过个体亚基内的构象变化或通过亚基相对于彼此的重新取向而发生 正是通过这种变化 其在 多聚 酶中协同性和别构调节的基础 许多蛋白质经历调节并且执行它们的生理功能 上述定义遵循生物化学的经典方法 其在蛋白质和功能性蛋白质单元之间的区别难以阐明的时候建立 最近 人们在讨论蛋白质的四级结构时考虑蛋白质 蛋白质相互作用 并考虑蛋白质的所有组装作为蛋白质复合体 protein complexes 四级结构的命名 编辑具有四级结构的蛋白质复合物通常可以使用以 mer结尾的名称 希腊语为 部分 亚基 描述寡聚复合物中亚基的数目 正式和希腊拉丁文名称通常用于前十种类型 可用于多达二十个亚单位 而较高顺序的复合体通常用亚单位的数量描述 随后是 meric 例如 含两个亚基称为二聚体 三个则为三聚体 英语 Protein trimer 以此类推 只有一个蛋白质多肽链的称为单聚体 通常情况下 细胞中的蛋白质复合物很少超过八聚体 1 单聚体 亚基 2 二聚体 3 三聚体 英语 Protein trimer 4 四聚体 英语 Protein tetramer 5 五聚体 英语 Protein pentamer 6 hexamer 7 heptamer 8 八聚体 英语 Protein octamer 9 nonamer 10 decamer 11 undecamer 12 十二聚体 英语 Protein dodecamer 13 tridecamer 14 tetradecamer 15 pentadecamer 16 hexadecamer 17 heptadecamer 18 octadecamer 19 nonadecamer 20 二十聚体 英语 Protein eicosamer 21 mer 22 mer 23 mer etc 没有已知的例子 尽管大多数蛋白质都很少被观察到比八聚体更高的复合物 但也有一些重要的例外 病毒衣壳甚至可以为60聚体 在细胞中还发现了几种分子机器 例如 蛋白酶体 四个七聚体环 28个亚基 转录复合物和剪接体 核糖体可能是最大的分子机器 由许多RNA和蛋白质分子组成 在一些情况下 蛋白质形成复合物 然后组装成更大的复合物 在这种情况下 人们使用命名法 例如 二聚体的二聚体 或 三聚体的三聚体 来表明该复合体在解离成单体之前可能解离成较小的亚复合体 四级结构的测定 编辑复合物质量直接分析方法 编辑 分析型超速离心 质谱复合物大小直接分析方法 编辑 静态光散射 分子排阻色谱复合物大小间接分析方法 编辑 分析型超速离心 动态光散射 荧光各向异性度测量蛋白质交互作用 编辑主条目 蛋白质交互作用 蛋白质能够形成非常紧密的复合物 例如 核糖核酸酶抑制剂 英语 Ribonuclease inhibitor 以约20fM的解离常数与核糖核酸酶A 英语 Pancreatic ribonuclease 结合 其他蛋白质已经进化成特异性结合另一种蛋白质上的异常部分 例如生物素基团 抗生物素蛋白avidin 磷酸化酪氨酸 SH2结构域 或富含脯氨酸的区段 SH3结构域 参见 编辑 分子与细胞生物学主题 蛋白质结构 蛋白质一级结构 蛋白质二级结构 蛋白質三級結構 蛋白质四级结构 结构生物学 蛋白质复合体参考资料 编辑 Chou Kuo Chen Cai Yu Dong Predicting protein quaternary structure by pseudo amino acid composition Proteins Structure Function and Bioinformatics 1 November 2003 53 2 282 289 PMID 14517979 doi 10 1002 prot 10500 取自 https zh wikipedia org w index php title 蛋白质四级结构 amp oldid 63060917, 维基百科,wiki,书籍,书籍,图书馆,

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