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单倍群

分子演化的研究中,单倍群(Haplogroup)是一组类似的单倍型(Haplotype),它们有一个共同的单核苷酸多态性祖先。因为单倍群由相似的单倍型组成,所以可以从单倍型来预测单倍群。单核苷酸多态性试验被用来确认单倍型。单倍群以字母来标记,并且以数字和一些字母来做补充,例如O3e1. Y染色体和线粒体单倍群有不同的单倍群标记方法。单倍群可用来标记数千年前的祖先来源。[1]

人类遗传学英语human genetics中,最常被拿來研究的单倍群是Y染色体(Y-DNA)单倍群线粒体DNA(mtDNA)单倍群,这两个都可以被用来定义遗传群体。Y染色体脱氧核糖核酸单倍群仅能以父系遗传,同时mtDNA仅能以母系遗传[註 1]

基于遗传标记的人类单倍型分类,特别是借助唯一事件多樣性英语Unique event polymorphism(UEPs),在过去几年中快速发展着。

单倍群群体遗传学

一般被认为对于某个存活到现在的特定单倍型突变自然选择并不存在偏好与否,所以除去突变率(其会根据不同的标记而变化)群体遗传学中主要影响单倍群比例的原因是遗传漂变

人類Y染色體DNA單倍型類群

人類Y染色體DNA(Y-DNA)單倍型類群被命名為A到T,其中部分被更進一步以數字及小寫拉丁字母細分。主Y染色體單倍型類群編號的設計係由Y染色體協會建立。[2]

人类Y染色体DNA单倍型类群进化树

Y染色体最近共同祖先
A
A1b A1a-T
A1a A2-T
A2 A3 BT
B CT
DE CF
D E C F
G H IJK
IJ K
I J LT K(xLT)
L T M NO P S
O N Q R

各族群Y染色体单倍型类群 · 著名的Y染色體單倍型類群人

Y染色體亞當是由研究人員命名,用來指稱人類父系的最近共同祖先。主要的Y染色體單倍群及其在前歐洲殖民地發生狀況的地理分佈如下:

 
全球前殖民地各族群主要的Y染色體單倍群及其依據海岸遷移模型的可能遷移路線

無M168突變族群

有M168突變族群

M168突變發生於約公元前5萬年。

  • 單倍群C(M130):大洋洲、北/中/東亞、北美洲,僅略微存在於南美洲、南亞、西亞及歐洲
  • 單倍群F(M89):大洋洲、歐洲、亞洲、美洲
  • YAP+單倍群
    • 單倍群DE(M1, M145, M203)
      • 單倍群D(M174):西藏、日本及安達曼群島
      • 單倍群E(M96)
        • 單倍群E1b1a(V38):西非及鄰近區域,從前稱為E3a
        • 單倍群E1b1b(M215):東非、北非、中東、地中海地區、巴爾幹地區,從前稱為E3b

有M89突變族群

M89突變發生於約公元前4萬5千年。

  • 單倍群F(P14, M213):南印度、斯里蘭卡、中國、韓國
  • 單倍群G(M201):出現在歐亞大陸的許多族群,但比率不高;最常見於高加索、伊朗高原及安那托利亞;在歐洲主要分佈於希臘、義大利、伊比利、提洛、波希米亞;在北歐則極為罕見
  • 單倍群H(M69):南印度、斯里蘭卡、尼泊爾、巴基斯坦、伊朗、中亞及阿拉伯
  • 單倍群IJK(L15, L16)

有L15及L16突變族群

  • 單倍群IJK(L15, L16)
    • 單倍群IJ(S2, S22)
      • 單倍群I(M170, P19, M258):廣泛分佈於歐洲,少量發現於部份中東地區,其他地區幾乎沒有[3]
        • 單倍群I1(M253, M307, P30, P40):北歐
        • 單倍群I2(S31):中歐、東南歐及薩丁尼亞
      • 單倍群J(M304):中東、土耳其、高加索、義大利、希臘、巴爾幹、北非及東北非
    • 單倍群K(M9, P128, P131, P132)

有M9突變族群

M9突變發生於約公元前4萬年。

  • 單倍群K
    • 單倍群LT(L298/P326)
      • 單倍群L(M11, M20, M22, M61, M185, M295):南亞、中亞、西南亞、地中海地區
      • 單倍群T(M70, M184/USP9Y+3178, M193, M272):北非、非洲之角、西南亞、地中海地區、南亞,以往稱為單倍群K2
    • 單倍群K(xLT)(rs2033003/M526)
有M526突變族群
    • 單倍群M(P256):新幾內亞、美拉尼西亞、東印尼
    • 單倍群NO(M214)
      • 單倍群N(M231):歐亞大陸最北部,特別是烏拉爾人
      • 單倍群O(M175):東亞、東南亞、南太平洋、南亞、中亞
        • 單倍群O1(M1354):東亞、東南亞、南太平洋、南亞、中亞
          • 單倍群O1a(MSY2.2)
          • 單倍群O1b(P31, M268)
        • 單倍群O2(M122):東亞、南亞、東南亞、中亞。
    • 單倍群P-M45(M45):M45發生於約公元前3萬5千年
      • 單倍群Q-M242(M242):發生於約15,000-20,000年前。發現於亞洲及美洲
        • 單倍群Q-M3(M3):中美洲、北美洲、南美洲
      • 單倍群R(M207)
        • 單倍群R1(M173)
          • 單倍群R1a(M17):中亞、南亞、中歐、北歐、東歐
          • 單倍群R1b(M343):歐洲、高加索、中亞、北非、中非
        • 單倍群R2(M124):南亞、高加索、中亞
    • 單倍群S(M230, P202, P204):新幾內亞、美拉尼西亞、東印尼

人類粒線體DNA單倍體群

人類粒線體DNA單倍體群被標為不同字母: A, B, C, CZ, D, E, F, G, H, pre-HV, HV, I, J, pre-JT, JT, K, L0, L1, L2, L3, L4, L5, L6, L7, M, N, O, P, Q, R, S, T, U, UK, V, W, X, Y, and Z.

人類粒線體DNA單倍體群

  最近的共同粒線體祖先    
L0   L1  
L2 L3   L4 L5 L6 L7
  M N  
CZ D E G Q   A I O   R   S W X Y
C Z B F pre-HV   pre-JT P  UK
HV JT U K
H V J T

定義群體

 
人類單倍型遷移地圖

單倍群可以用來定義遺傳學群體和地理分佈。例如,以下是mtDNA單倍群一般性區域分佈:

  • 非洲人:L0、L1、L2、L3、L4、L5、L6
  • 西部歐亞人:H、T、U、V、X、K、I、J、W
  • 東部歐亞人:A、B、C、D、E、F、G、Y、Z
  • 美洲原住民:A、B、C、D、X
  • 澳洲-美拉尼西亞人:P、Q、S

線粒體單倍群分為3群,以3個連續的字母L、M、N表示。人類第一次在群內分離成L0和L1-6。L1-6隨後引伸出其他群,其中的L3分離成M和N群。M群組成包括人類第一波由離開非洲,順著南部沿海地區向東的大遷移​​路線。

Y染色體DNA單倍型類群和粒線體DNA單倍體群的相同之處

以下是Y染色體DNA單倍型類群和粒線體DNA單倍體群大約的相同之處:

Y-DNA單倍群 mtDNA單倍 地理分佈/族群
A L0 東非及南非
B L1、L4 東非及中非
E L2、L3 非洲
D、O、N、P、Q、C2 M8a/C/Z, D, G (M型); A, N9/Y (N型); B, F (R型) 東亞、西伯利亞
K、M (M9-正、M45-負) B、P (R型); N; Q (M型) 以及大洋洲的特定M分支 大洋洲
R、I、T、J、E (V13, M81, 及M123型) R0, HV/H/V, JT/J/T, U/K (R型) 南亞、歐洲、西亞、北非、非洲之角
Q、C2 A、X (N型), B(R 型); C、D (M型) 西伯利亞極東端、美洲

參看

註釋

  1. ^ 所謂父系或母系遺傳是指說其後代能夠接受誰的基因。如果是父系遺傳,則他們的子代只會接受父親的基因,反之亦然。

參考文獻

  1. ^ The International Society of Genetic Genealogy see Haplogroup definition in DNA-NEWBIE GLOSSARY [1] (页面存档备份,存于互联网档案馆
  2. ^ . [2008-08-04]. (原始内容存档于2017-01-16). 
  3. ^ (PDF). [2009年7月2日]. (原始内容 (PDF)存档于2009年6月19日). 

外部連結

一般資料

    新聞

    • 印地安人的母系基因池[永久失效連結]Journal of Human Genetics
    • Dienekes' Anthropology Blog (页面存档备份,存于互联网档案馆) frequent highlights of new results.

    所有單倍體群

      Y染色體DNA單倍型類群

      • ISOGG Y-DNA Haplogroup Tree 2006(页面存档备份,存于互联网档案馆
      • The Y Chromosome Consortium (2002), A Nomenclature System for the Tree of Human Y-Chromosomal Binary Haplogroups(页面存档备份,存于互联网档案馆), Genome Research, Vol. 12(2), 339-348, February 2002. (Detailed hierarchical chart(页面存档备份,存于互联网档案馆) has conversions from previous naming schemes)
      • DNA Consulting's Conversion Chart for Male Haplogroups (页面存档备份,存于互联网档案馆) (PDF)
      • Semino et al (2000), , Science, Vol 290 (paper which introduced the "Eu" haplogroups).

      粒線體DNA單倍體群

      单倍群, 此條目需要精通或熟悉遗传学的编者参与及协助编辑, 2022年7月13日, 請邀請適合的人士改善本条目, 更多的細節與詳情請參见討論頁, 另見其他需要遗传学專家關注的頁面, 在分子演化的研究中, haplogroup, 是一组类似的单倍型, haplotype, 它们有一个共同的单核苷酸多态性祖先, 因为由相似的单倍型组成, 所以可以从单倍型来预测, 单核苷酸多态性试验被用来确认单倍型, 以字母来标记, 并且以数字和一些字母来做补充, 例如o3e1, y染色体和线粒体有不同的标记方法, 可用来标记数千年前的. 此條目需要精通或熟悉遗传学的编者参与及协助编辑 2022年7月13日 請邀請適合的人士改善本条目 更多的細節與詳情請參见討論頁 另見其他需要遗传学專家關注的頁面 在分子演化的研究中 单倍群 Haplogroup 是一组类似的单倍型 Haplotype 它们有一个共同的单核苷酸多态性祖先 因为单倍群由相似的单倍型组成 所以可以从单倍型来预测单倍群 单核苷酸多态性试验被用来确认单倍型 单倍群以字母来标记 并且以数字和一些字母来做补充 例如O3e1 Y染色体和线粒体单倍群有不同的单倍群标记方法 单倍群可用来标记数千年前的祖先来源 1 在人类遗传学 英语 human genetics 中 最常被拿來研究的单倍群是Y染色体 Y DNA 单倍群和线粒体DNA mtDNA 单倍群 这两个都可以被用来定义遗传群体 Y染色体脱氧核糖核酸单倍群仅能以父系遗传 同时mtDNA仅能以母系遗传 註 1 基于遗传标记的人类单倍型分类 特别是借助唯一事件多樣性 英语 Unique event polymorphism UEPs 在过去几年中快速发展着 目录 1 单倍群群体遗传学 1 1 人類Y染色體DNA單倍型類群 1 1 1 無M168突變族群 1 1 2 有M168突變族群 1 1 3 有M89突變族群 1 1 4 有L15及L16突變族群 1 1 5 有M9突變族群 1 1 5 1 有M526突變族群 1 2 人類粒線體DNA單倍體群 2 定義群體 3 Y染色體DNA單倍型類群和粒線體DNA單倍體群的相同之處 4 參看 5 註釋 6 參考文獻 7 外部連結 7 1 一般資料 7 2 新聞 7 3 所有單倍體群 7 4 Y染色體DNA單倍型類群 7 5 粒線體DNA單倍體群单倍群群体遗传学 编辑一般被认为对于某个存活到现在的特定单倍型突变 自然选择并不存在偏好与否 所以除去突变率 其会根据不同的标记而变化 群体遗传学中主要影响单倍群比例的原因是遗传漂变 人類Y染色體DNA單倍型類群 编辑 主条目 人類Y染色體DNA單倍型類群 人類Y染色體DNA Y DNA 單倍型類群被命名為A到T 其中部分被更進一步以數字及小寫拉丁字母細分 主Y染色體單倍型類群編號的設計係由Y染色體協會建立 2 人类Y染色体DNA单倍型类群进化树Y染色体最近共同祖先AA1b A1a TA1a A2 TA2 A3 BTB CTDE CFD E C FG H IJKIJ KI J LT K xLT L T M NO P SO N Q R各族群Y染色体单倍型类群 著名的Y染色體單倍型類群人Y染色體亞當是由研究人員命名 用來指稱人類父系的最近共同祖先 主要的Y染色體單倍群及其在前歐洲殖民地發生狀況的地理分佈如下 全球前殖民地各族群主要的Y染色體單倍群及其依據海岸遷移模型的可能遷移路線 無M168突變族群 编辑 單倍群A M91 非洲 特別是科伊桑人 衣索比亞人及尼羅人 單倍群B M60 非洲 特別是玻里尼西亞人及哈扎人有M168突變族群 编辑 M168突變發生於約公元前5萬年 單倍群C M130 大洋洲 北 中 東亞 北美洲 僅略微存在於南美洲 南亞 西亞及歐洲 單倍群F M89 大洋洲 歐洲 亞洲 美洲 YAP 單倍群 單倍群DE M1 M145 M203 單倍群D M174 西藏 日本及安達曼群島 單倍群E M96 單倍群E1b1a V38 西非及鄰近區域 從前稱為E3a 單倍群E1b1b M215 東非 北非 中東 地中海地區 巴爾幹地區 從前稱為E3b有M89突變族群 编辑 M89突變發生於約公元前4萬5千年 單倍群F P14 M213 南印度 斯里蘭卡 中國 韓國單倍群G M201 出現在歐亞大陸的許多族群 但比率不高 最常見於高加索 伊朗高原及安那托利亞 在歐洲主要分佈於希臘 義大利 伊比利 提洛 波希米亞 在北歐則極為罕見單倍群H M69 南印度 斯里蘭卡 尼泊爾 巴基斯坦 伊朗 中亞及阿拉伯單倍群IJK L15 L16 有L15及L16突變族群 编辑 單倍群IJK L15 L16 單倍群IJ S2 S22 單倍群I M170 P19 M258 廣泛分佈於歐洲 少量發現於部份中東地區 其他地區幾乎沒有 3 單倍群I1 M253 M307 P30 P40 北歐 單倍群I2 S31 中歐 東南歐及薩丁尼亞 單倍群J M304 中東 土耳其 高加索 義大利 希臘 巴爾幹 北非及東北非 單倍群J 主要發現於索科特拉島 少量發現於巴基斯坦 安曼 希臘 捷克及突厥人 單倍群J1 M267 主要分佈於中東 衣索匹亞及北非的閃米人地區 伊朗 巴基斯坦 印度 以及達吉斯坦的東北高加索人 具有DYS388 13的J1則與東安那托利亞有關 單倍群J2 M172 主要發現於西亞 中亞 南歐及北非 單倍群K M9 P128 P131 P132 有M9突變族群 编辑 M9突變發生於約公元前4萬年 單倍群K 單倍群LT L298 P326 單倍群L M11 M20 M22 M61 M185 M295 南亞 中亞 西南亞 地中海地區 單倍群T M70 M184 USP9Y 3178 M193 M272 北非 非洲之角 西南亞 地中海地區 南亞 以往稱為單倍群K2 單倍群K xLT rs2033003 M526 有M526突變族群 编辑 單倍群M P256 新幾內亞 美拉尼西亞 東印尼 單倍群NO M214 單倍群N M231 歐亞大陸最北部 特別是烏拉爾人 單倍群O M175 東亞 東南亞 南太平洋 南亞 中亞 單倍群O1 M1354 東亞 東南亞 南太平洋 南亞 中亞 單倍群O1a MSY2 2 單倍群O1b P31 M268 單倍群O2 M122 東亞 南亞 東南亞 中亞 單倍群P M45 M45 M45發生於約公元前3萬5千年 單倍群Q M242 M242 發生於約15 000 20 000年前 發現於亞洲及美洲 單倍群Q M3 M3 中美洲 北美洲 南美洲 單倍群R M207 單倍群R1 M173 單倍群R1a M17 中亞 南亞 中歐 北歐 東歐 單倍群R1b M343 歐洲 高加索 中亞 北非 中非 單倍群R2 M124 南亞 高加索 中亞 單倍群S M230 P202 P204 新幾內亞 美拉尼西亞 東印尼人類粒線體DNA單倍體群 编辑 主条目 人類粒線體DNA單倍體群 人類粒線體DNA單倍體群被標為不同字母 A B C CZ D E F G H pre HV HV I J pre JT JT K L0 L1 L2 L3 L4 L5 L6 L7 M N O P Q R S T U UK V W X Y and Z 人類粒線體DNA單倍體群 最近的共同粒線體祖先 L0 L1 L2 L3 L4 L5 L6 L7 M N CZ D E G Q A I O R S W X YC Z B F pre HV pre JT P UKHV JT U KH V J T定義群體 编辑 人類單倍型遷移地圖 單倍群可以用來定義遺傳學群體和地理分佈 例如 以下是mtDNA單倍群一般性區域分佈 非洲人 L0 L1 L2 L3 L4 L5 L6 西部歐亞人 H T U V X K I J W 東部歐亞人 A B C D E F G Y Z 美洲原住民 A B C D X 澳洲 美拉尼西亞人 P Q S線粒體單倍群分為3群 以3個連續的字母L M N表示 人類第一次在群內分離成L0和L1 6 L1 6隨後引伸出其他群 其中的L3分離成M和N群 M群組成包括人類第一波由離開非洲 順著南部沿海地區向東的大遷移 路線 Y染色體DNA單倍型類群和粒線體DNA單倍體群的相同之處 编辑以下是Y染色體DNA單倍型類群和粒線體DNA單倍體群大約的相同之處 Y DNA單倍群 mtDNA單倍 地理分佈 族群A L0 東非及南非B L1 L4 東非及中非E L2 L3 非洲D O N P Q C2 M8a C Z D G M型 A N9 Y N型 B F R型 東亞 西伯利亞K M M9 正 M45 負 B P R型 N Q M型 以及大洋洲的特定M分支 大洋洲R I T J E V13 M81 及M123型 R0 HV H V JT J T U K R型 南亞 歐洲 西亞 北非 非洲之角Q C2 A X N型 B R 型 C D M型 西伯利亞極東端 美洲參看 编辑国际人类基因组单体型图计划 遺傳系譜學 遺傳學註釋 编辑 所謂父系或母系遺傳是指說其後代能夠接受誰的基因 如果是父系遺傳 則他們的子代只會接受父親的基因 反之亦然 參考文獻 编辑 The International Society of Genetic Genealogy see Haplogroup definition in DNA NEWBIE GLOSSARY 1 页面存档备份 存于互联网档案馆 Y Chromosome Consortium 2008 08 04 原始内容存档于2017 01 16 存档副本 PDF 2009年7月2日 原始内容 PDF 存档于2009年6月19日 2 页面存档备份 存于互联网档案馆 外部連結 编辑一般資料 编辑 World Families Network新聞 编辑 印地安人的母系基因池 永久失效連結 Journal of Human Genetics Dienekes Anthropology Blog 页面存档备份 存于互联网档案馆 frequent highlights of new results 所有單倍體群 编辑 https web archive org web 20040728005528 http www scs uiuc edu mcdonald WorldHaplogroupsMaps pdfY染色體DNA單倍型類群 编辑 Y Chromosome Consortium ISOGG Y DNA Haplogroup Tree 2006 页面存档备份 存于互联网档案馆 DNA Heritage s Y haplogroup map Haplogroup Predictor The Y Chromosome Consortium 2002 A Nomenclature System for the Tree of Human Y Chromosomal Binary Haplogroups 页面存档备份 存于互联网档案馆 Genome Research Vol 12 2 339 348 February 2002 Detailed hierarchical chart 页面存档备份 存于互联网档案馆 has conversions from previous naming schemes DNA Consulting s Conversion Chart for Male Haplogroups 页面存档备份 存于互联网档案馆 PDF Semino et al 2000 The Genetic Legacy of Paleolithic Homo sapiens sapiens in Extant Europeans Science Vol 290 paper which introduced the Eu haplogroups 粒線體DNA單倍體群 编辑 graphical mtDNA haplogroup skeleton 页面存档备份 存于互联网档案馆 The Making of the African mtDNA Landscape Do the Four Clades of the mtDNA Haplogroup L2 Evolve at Different Rates 取自 https zh wikipedia org w index php title 单倍群 amp oldid 72712688, 维基百科,wiki,书籍,书籍,图书馆,

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