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位點特異性重組

十月 20, 2023

位點特異性重組（Site-specific recombination）是生物基因重組的一種機制，即兩段具有一定同源序列的DNA發生重組[1][2][3]，此過程中兩段DNA序列會發先發生聯會，位點特異性重組酶（英语：Recombinase）（SSR）會與DNA結合，切割兩段DNA後促進酯交換反應，使一段DNA與另一段DNA連接-而形成霍利迪交叉，再進行第二次切割而得到重組過的兩段DNA[4][5]。重組酶可分為酪胺酸重組酶（如Cre重組酶（英语：Cre recombinase）與FLP重組酶（英语：FLP-FRT recombination））與絲胺酸重組酶（如γδ解離酶與Tn3解離酶（英语：Tn3 transposon））兩大類，兩者結構與詳細反應機理均不同[6][7]，前者僅分別切割兩段DNA的一股，後者則將兩段共4股DNA都切割[8]。

酪胺酸重組酶催化位點特異性重組的機制，上方為傳統觀點，下方為較新研究的觀點
絲胺酸重組酶催化位點特異性重組的機制，四股DNA均被切割

位點特異性重組的特異性很高[9]，在DNA複製與可動遺傳因子插入等過程中會發生[10]，也被用作基因工程的一項技術[11]。此重組依重複片段的排列狀況可能有整合、切除與倒位三種結果，兩段不同DNA間的位點特異性重組可造成一段DNA被整合進另一段DNA中，同DNA中兩段同向序列的位點特異性重組可造成中間的序列被移除，而兩段反向序列的位點特異性重組則可造成中間序列倒位[12]。

參見 编辑

  • 位點特異性重組技術（英语：Site-specific recombinase technology）
  • Cre-Lox重組
  • FLP-FRT重組（英语：FLP-FRT recombination）
  • 重组酶介导的盒式交换（英语：recombinase-mediated cassette exchange）（RMCE）

參考文獻 编辑

  1. ^ Bode, J; Schlake, T; asadasasada Iber, M; Schuebeler, D; Seibler, J; Snezhkov, E; Nikolaev, L. The transgeneticist's toolbox: novel methods for the targeted modification of eukaryotic genomes. Biol. Chem. 2000, 381 (9–10): 801–813. PMID 11076013. doi:10.1515/BC.2000.103. 
  2. ^ Kolb, A.F. Genome Engineering Using Site-Specific Recombinases. Cloning & Stem Cells. 2002, 4 (1): 65–80. PMID 12006158. doi:10.1089/153623002753632066. 
  3. ^ Coates, C.J.; Kaminski, JM; Summers, JB; Segal, DJ; Miller, AD; Kolb, AF. (PDF). Trends in Biotechnology. 2005, 23 (8): 407–19. PMID 15993503. doi:10.1016/j.tibtech.2005.06.009. （原始内容 (PDF)存档于2006-08-29）. 
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  5. ^ Holliday, R. A mechanism for gene conversion in fungi (PDF). Genetics Research. 1964, 5 (2): 282–304 [2021-05-07]. doi:10.1017/S0016672300001233. （原始内容 (PDF)于2011-05-21）. 
  6. ^ Abdel-Meguid, S.S.; Grindley, N.D.; Templeton, N.S.; Steitz, T.A. Cleavage of the site-specific recombination protein gamma delta resolvase: the smaller of two fragments binds DNA specifically. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. April 1984, 81 (7): 2001–5. Bibcode:1984PNAS...81.2001A. PMC 345424  . PMID 6326096. doi:10.1073/pnas.81.7.2001. 
  7. ^ Yang, W.; Steitz, T.A. Crystal structure of the site-specific recombinase gamma delta resolvase complexed with a 34 bp cleavage site. Cell. 1995, 82 (2): 193–207. PMID 7628011. doi:10.1016/0092-8674(95)90307-0. 
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  9. ^ Sauer, B. (PDF). Methods. 1998, 14 (4): 381–92. PMID 9608509. doi:10.1006/meth.1998.0593. （原始内容 (PDF)存档于2011-06-11）. 
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十月 20, 2023
位點特異性重組, site, specific, recombination, 是生物基因重組的一種機制, 即兩段具有一定同源序列的dna發生重組, 此過程中兩段dna序列會發先發生聯會, 英语, recombinase, 會與dna結合, 切割兩段dna後促進酯交換反應, 使一段dna與另一段dna連接, 而形成霍利迪交叉, 再進行第二次切割而得到重組過的兩段dna, 重組酶可分為酪胺酸重組酶, 如cre重組酶, 英语, recombinase, 與flp重組酶, 英语, recombination, 與絲胺酸重. 位點特異性重組 Site specific recombination 是生物基因重組的一種機制 即兩段具有一定同源序列的DNA發生重組 1 2 3 此過程中兩段DNA序列會發先發生聯會 位點特異性重組酶 英语 Recombinase SSR 會與DNA結合 切割兩段DNA後促進酯交換反應 使一段DNA與另一段DNA連接 而形成霍利迪交叉 再進行第二次切割而得到重組過的兩段DNA 4 5 重組酶可分為酪胺酸重組酶 如Cre重組酶 英语 Cre recombinase 與FLP重組酶 英语 FLP FRT recombination 與絲胺酸重組酶 如gd解離酶與Tn3解離酶 英语 Tn3 transposon 兩大類 兩者結構與詳細反應機理均不同 6 7 前者僅分別切割兩段DNA的一股 後者則將兩段共4股DNA都切割 8 酪胺酸重組酶催化位點特異性重組的機制 上方為傳統觀點 下方為較新研究的觀點絲胺酸重組酶催化位點特異性重組的機制 四股DNA均被切割位點特異性重組的特異性很高 9 在DNA複製與可動遺傳因子插入等過程中會發生 10 也被用作基因工程的一項技術 11 此重組依重複片段的排列狀況可能有整合 切除與倒位三種結果 兩段不同DNA間的位點特異性重組可造成一段DNA被整合進另一段DNA中 同DNA中兩段同向序列的位點特異性重組可造成中間的序列被移除 而兩段反向序列的位點特異性重組則可造成中間序列倒位 12 參見 编辑位點特異性重組技術 英语 Site specific recombinase technology Cre Lox重組 FLP FRT重組 英语 FLP FRT recombination 重组酶介导的盒式交换 英语 recombinase mediated cassette exchange RMCE 參考文獻 编辑 nbsp 分子与细胞生物学主题 Bode J Schlake T asadasasada Iber M Schuebeler D Seibler J Snezhkov E Nikolaev L The transgeneticist s toolbox novel methods for the targeted modification of eukaryotic genomes Biol Chem 2000 381 9 10 801 813 PMID 11076013 doi 10 1515 BC 2000 103 Kolb A F Genome Engineering Using Site Specific Recombinases Cloning amp Stem Cells 2002 4 1 65 80 PMID 12006158 doi 10 1089 153623002753632066 Coates C J Kaminski JM Summers JB Segal DJ Miller AD Kolb AF Site directed genome modification derivatives of BAL modifying enzymes as targeting tools PDF Trends in Biotechnology 2005 23 8 407 19 PMID 15993503 doi 10 1016 j tibtech 2005 06 009 原始内容 PDF 存档于2006 08 29 Van Duyne G D A structural view of tyrosine recombinase site specific recombination Mobile DNA II ASM Press 2002 93 117 Holliday R A mechanism for gene conversion in fungi PDF Genetics Research 1964 5 2 282 304 2021 05 07 doi 10 1017 S0016672300001233 原始内容存档 PDF 于2011 05 21 Abdel Meguid S S Grindley N D Templeton N S Steitz T A Cleavage of the site specific recombination protein gamma delta resolvase the smaller of two fragments binds DNA specifically Proc Natl Acad Sci U S A April 1984 81 7 2001 5 Bibcode 1984PNAS 81 2001A PMC 345424 nbsp PMID 6326096 doi 10 1073 pnas 81 7 2001 Yang W Steitz T A Crystal structure of the site specific recombinase gamma delta resolvase complexed with a 34 bp cleavage site Cell 1995 82 2 193 207 PMID 7628011 doi 10 1016 0092 8674 95 90307 0 Stark W M Boocock M R Sherratt DJ Catalysis by site specific recombinases Trends in Genetics 1992 8 12 432 9 PMID 1337225 doi 10 1016 0168 9525 92 90327 Z Sauer B Inducible Gene Targeting in Mice Using the Cre loxSystem PDF Methods 1998 14 4 381 92 PMID 9608509 doi 10 1006 meth 1998 0593 原始内容 PDF 存档于2011 06 11 Nash H A 1996 Site specific recombination integration excision resolution and inversion of defined DNA segments Escherichia coli and Salmonella cellular and molecular biology 2 pp 2363 2376 Akopian A Stark W M Site Specific DNA Recombinases as Instruments for Genomic Surgery Advances in Genetics 55 2005 1 23 ISBN 978 0 12 017655 7 PMID 16291210 doi 10 1016 S0065 2660 05 55001 6 Grindley ND Whiteson KL Rice PA Mechanisms of site specific recombination Annu Rev Biochem 2006 75 567 605 PMID 16756503 doi 10 1146 annurev biochem 73 011303 073908 取自 https zh wikipedia org w index php title 位點特異性重組 amp oldid 73215435, 维基百科，wiki，书籍，书籍，图书馆，

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