遠洋桿菌屬 （Pelagibacter ），目前僅包括遍在遠洋桿菌 （P. ubique ）一個種，可能是地球上數量最多的細菌 （估算數量級有1028 ）。早在1990年，就已在馬尾藻海 中得到屬於α-變形菌 的rRNA 序列，此後在全世界各海區被廣泛發現且有很高豐度，被稱作SAR11群 。但直到2002年，才由Rappé等人通過高通量培養的方法分離得到首批純菌株，並被命名。但此名稱直到目前仍未被根據細菌命名法則的規定有效發表。它可占多达所有微生物浮游生物的细胞的约25％，并在夏季它们可以占存在于温带海洋表层水的细胞的大约一半。遠洋桿菌屬和其亲属的总丰度估计为约2×1028 个微生物。[1]
遍在遠洋桿菌 科学分类 域： 细菌域 Bacteria界： 细菌界 Bacteria门： 變形菌門 Pseudomonadota纲： α-变形菌纲 Alphaproteobacteria目： 立克次體目 Rickettsiales属： 远洋杆菌属 Pelagibacter 种： 遍在遠洋桿菌 P. ubique 二名法 Pelagibacter ubique Rappé et al. , 2002
模式菌株 HTCC, 1062
遠洋桿菌屬在全世界廣泛分佈，屬於海水中自由生活的浮游細菌。它們是已知最小的可以不通過寄生而自我繁殖的生物之一。他們呈小棍狀，長度0.37 - 0.89 µm，直徑只有0.12 - 0.20 µm。細胞的體積的30％是被它的基因組佔用。[2] 革蘭氏陰性菌 。[3] 溶解的有機碳
遍在遠洋桿菌已有兩株的基因組 被完全測序：HTCC1062和HTCC1002。HTCC1062的基因組於2005年被完全測序，測序表明HTCC1062基因組 (1,308,759 bp)有着在任何自由生物體中最小的基因組，只有1354個基因。[4] 垃圾DNA 。這種有效的基因組成表明當它們複製產生後代時需要較少的能量複製DNA。此外，其DNA的鹼基對 中含有較少的氮 元素，因爲氮在遠洋中是較爲稀少的營養元素。遠洋桿菌極高的豐富度表明這些特性使其成爲一種非常高效的生命形式。
參見 ^ "Candidatus Pelagibacter Ubique." European Bioinformatics Institute. European Bioinformatics Institute, 2011. Web. 08 Jan. 2012. 存档副本. [2012-02-02 ] . （原始内容于2008-12-01）. ^ Stephen J. Giovannoni, H. James Tripp, et al. Genome Streamlining in a Cosmopolitan Oceanic Bacterium. Science . 2005, 309 (5738): 1242–1245. PMID 16109880 . doi:10.1126/science.1114057 . ^ (PDF) . [2012-02-02 ] . （原始内容 (PDF) 存档于2006-03-05）. ^ . NCBI. [27 November 2012] . （原始内容存档于2019-01-19）.
參考文獻 Michael S. Rappé, Stephanie A. Connon, Kevin L. Vergin, Stephen J. Giovannoni. Cultivation of the ubiquitous SAR11 marine bacterioplankton clade. Nature . 2002, 418 : 630–633. R. M. Morris; et al. SAR11 clade dominates ocean surface bacterioplankton communities. Nature . 2002, 420 : 806 – 810.
外部連結 （英文） MicrobeWiki entry （页面存档备份，存于互联网档案馆 ）（英文） BBC News: Ocean bug has 'smallest genome' （页面存档备份，存于互联网档案馆 ）警告： 默认排序关键字“Pelagibacter Ubique”覆盖了之前的默认排序关键字“Pelagibacter ubique”。
遍在遠洋桿菌, 遠洋桿菌屬, pelagibacter, 目前僅包括, ubique, 一個種, 可能是地球上數量最多的細菌, 估算數量級有1028, 早在1990年, 就已在馬尾藻海中得到屬於α, 變形菌的rrna序列, 此後在全世界各海區被廣泛發現且有很高豐度, 被稱作sar11群, 但直到2002年, 才由rappé等人通過高通量培養的方法分離得到首批純菌株, 並被命名, 但此名稱直到目前仍未被根據細菌命名法則的規定有效發表, 它可占多达所有微生物浮游生物的细胞的约25, 并在夏季它们可以占存在于温带海洋表层. 遠洋桿菌屬 Pelagibacter 目前僅包括遍在遠洋桿菌 P ubique 一個種 可能是地球上數量最多的細菌 估算數量級有1028 早在1990年 就已在馬尾藻海中得到屬於a 變形菌的rRNA序列 此後在全世界各海區被廣泛發現且有很高豐度 被稱作SAR11群 但直到2002年 才由Rappe等人通過高通量培養的方法分離得到首批純菌株 並被命名 但此名稱直到目前仍未被根據細菌命名法則的規定有效發表 它可占多达所有微生物浮游生物的细胞的约25 并在夏季它们可以占存在于温带海洋表层水的细胞的大约一半 遠洋桿菌屬和其亲属的总丰度估计为约2 1028个微生物 1 遍在遠洋桿菌科学分类域 细菌域 Bacteria界 细菌界 Bacteria门 變形菌門 Pseudomonadota纲 a 变形菌纲 Alphaproteobacteria目 立克次體目 Rickettsiales属 远洋杆菌属 Pelagibacter种 遍在遠洋桿菌 P ubique二名法Pelagibacter ubiqueRappe et al 2002模式菌株HTCC 1062遠洋桿菌屬在全世界廣泛分佈 屬於海水中自由生活的浮游細菌 它們是已知最小的可以不通過寄生而自我繁殖的生物之一 他們呈小棍狀 長度0 37 0 89 µm 直徑只有0 12 0 20 µm 細胞的體積的30 是被它的基因組佔用 2 它是革蘭氏陰性菌 3 它回收溶解的有機碳 英语 Dissolved organic carbon 遍在遠洋桿菌已有兩株的基因組被完全測序 HTCC1062和HTCC1002 HTCC1062的基因組於2005年被完全測序 測序表明HTCC1062基因組 1 308 759 bp 有着在任何自由生物體中最小的基因組 只有1354個基因 4 對比 人類約有3万個基因 它的基因組中缺乏很多其它基因組常有的隨時閒積累的冗餘成分 無重複的基因拷貝 無病毒基因 也無垃圾DNA 這種有效的基因組成表明當它們複製產生後代時需要較少的能量複製DNA 此外 其DNA的鹼基對中含有較少的氮元素 因爲氮在遠洋中是較爲稀少的營養元素 遠洋桿菌極高的豐富度表明這些特性使其成爲一種非常高效的生命形式 參見 编辑 Candidatus Pelagibacter Ubique European Bioinformatics Institute European Bioinformatics Institute 2011 Web 08 Jan 2012 存档副本 2012 02 02 原始内容存档于2008 12 01 Stephen J Giovannoni H James Tripp et al Genome Streamlining in a Cosmopolitan Oceanic Bacterium Science 2005 309 5738 1242 1245 PMID 16109880 doi 10 1126 science 1114057 存档副本 PDF 2012 02 02 原始内容 PDF 存档于2006 03 05 Gauthier Nicholas Zinman Guy D Antonio Matteo Abraham Michael Comparative Microbial Genomics DTU course 2005 Pelagibacter ubique genome NCBI 27 November 2012 原始内容存档于2019 01 19 參考文獻 编辑Michael S Rappe Stephanie A Connon Kevin L Vergin Stephen J Giovannoni Cultivation of the ubiquitous SAR11 marine bacterioplankton clade Nature 2002 418 630 633 R M Morris et al SAR11 clade dominates ocean surface bacterioplankton communities Nature 2002 420 806 810 引文格式1维护 显式使用等标签 link 外部連結 编辑 英文 MicrobeWiki entry 页面存档备份 存于互联网档案馆 英文 BBC News Ocean bug has smallest genome 页面存档备份 存于互联网档案馆 警告 默认排序关键字 Pelagibacter Ubique 覆盖了之前的默认排序关键字 Pelagibacter ubique 取自 https zh wikipedia org w index php title 遍在遠洋桿菌 amp oldid 72892248, 维基百科，wiki ，书籍，书籍，图书馆，
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