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厭氧甲烷氧化

二月 06, 2023

厭氧甲烷氧化是一種微生物代謝作用，不管是在海洋環境还是在陸域環境，當沉積物呈現缺氧狀態的時候，微生物會利用不同的電子接收者進行氧化還原作用，例如硝酸根、亞硝酸根、硫酸根、金屬離子、腐植酸等等，在厭氧甲烷氧化的過程中，微生物會將有機碳分解所產生的甲烷氧化變成二氧化碳，而電子接收者則進行還原作用，藉此過程產生能量，以維持自身生命所需。

不同電子接收者的耦合

因為厭氧甲烷氧化本身是氧化作用，所以需要不同的電子接收者進行還原作用與之耦合，主要有硝酸根、亞硝酸根、硫酸根、金屬離子、腐植酸等等， 其中又以硫酸根為主要的電子接收者，以下列舉不同電子接收者的化學反應式:

与硫酸根还原偶联

 
甲烷厌氧氧化(AOM)的三种机理。第一种（上）由属于1、2a、2b和2c进化枝的厌氧嗜甲烷古菌（Anaerobic methanotrophic archaea, ANME）和硫酸盐还原细菌（Sulfate reducing bacteria, SRB）参与。在ANME中甲烷被氧化，电子被直接传递给SRB，后者完成硫酸盐还原反应。[1] [2]第二种（中）是由ANME和厌氧氨氧化细菌的共生体所介导的硝酸盐还原型的甲烷氧化。[3]第三种（下）也是甲烷氧化和硝酸根还原的耦合反应，但参与反应的微生物为ANME和NC10细菌。与前两种机理不同，这两种微生物会竞争甲烷。[4]

整体反应如下：

CH4 + SO42− → HCO3− + HS− + H2O

硫酸根驱动的AOM由嗜甲烷古菌和硫酸盐还原细菌（英语：sulfate-reducing bacteria）组成的互养共生体来实现。[5]它们一般形成小的集团，有时也会形成大片的微生物垫。古菌部分名字简称为ANME，意思是“厌氧的嗜甲烷古菌”。ANME和产甲烷古菌亲缘关系很近。近期有研究发现，AOM可能是产甲烷作用的一个逆过程。[6]目前人们还不是很清楚这两种共生体如何相互协作以及它们在古菌和细菌细胞之间交换电子的中间体是什么。研究AOM的一大障碍是参与该反应的具体微生物到目前为止都还没有被成功分离出来。分离失败的原因是相关微生物生长非常缓慢，其种群数目的最小翻倍时间就至少要几个月。很多分离方式都无法应用于分离该种古菌，一个可能的原因是它和SRB形成了绝对共生关系，以至于它们二者不能够被分开。

在有甲烷释放的深海区（如冷泉、泥火山或天然气水合物沉积处），AOM反应非常活跃以至于反应产生的硫化氢就能够养活许多包括丝状硫细菌（如贝日阿托氏菌（英语：Beggiatoa）），带有共生性硫氧化细菌的蛤、管蠕虫等在内的许多生物。AOM产生的碳酸氢根能够导致碳酸钙沉淀。这些自生碳酸盐被认为是地球上13C含量最少的碳酸盐，其δ13C值最低能到-125每毫升PDB。[7]

与硝酸或亚硝酸根还原偶联

整体反应如下：

CH4 + 4NO3− → CO2 + 4NO2− + 2H2O
3CH4 + 8NO2− + 8H+ → 3CO2 + 4N2 + 10H2O

最近，人们发现ANME-2d应该是硝酸盐驱动型AOM的主要参与者。[3]该ANME-2d组微生物的名字为Methanoperedens nitroreducens，它能够在没有其他微生物的情况下，使用从细菌供体处水平转移得到的硝酸盐还原基因，单独完成硝酸盐还原型AOM。这也是人们发现的第一个有mcr和mer基因参与的、利用完整的反向产甲烷过程的AOM反应。

2010年，组学分析发现一种叫做NC10的细菌能够单独完成亚硝酸根还原和甲烷氧化的耦合反应。[8]

與金屬離子還原偶聯

整体反应如下：

CH4 + 4MnO2+ 7H+ → HCO3− + 4Mn2+ + 5H2O
CH4 + 8Fe(OH)3+ 15H+ → HCO3− + 8Fe2+ + 21H2O

海洋中的厭氧甲烷氧化

厭氧甲烷氧化此一作用最先在海洋沉積環境中被發現，因海水含有大量硫酸根離子，海洋中的厭氧甲烷氧化作用主要以硫酸根為電子接收者，甲烷濃度從沉積物底部向上逐漸減少， 硫酸根離子濃度從沉積物頂部向下遞減，兩者同時減少的某一區間稱為甲烷-硫酸鹽轉換帶(sulfate-methane transition zone, SMTZ)。

參與厭氧甲烷氧化-硫酸根還原作用的微生物為厭氧甲烷氧化古菌(anaerobic methanotrophic archaea, ANME)和硫酸還原細菌(sulfate reducing bacteria, SRB)[5] ，厭氧甲烷氧化古菌生存在厭氧條件下，以甲烷作為營養來源，古菌在中央，硫酸還原細菌在周圍將其包覆形成共生體，在厭氧甲烷氧化作用旺盛地區經常發現此兩種微生物的存在，表示厭氧甲烷氧化作用是在厭氧甲烷氧化古菌和硫酸還原細菌共生體的驅動下完成。

對氣候變遷的影響

厭氧甲烷氧化作用被認為是減少全球甲烷排放的重要生物地球化學過程，在海洋沉積物環境所生成的甲烷，大約80%會在從沉積物向上擴散到海床的過程中被氧化[9]， 而在陸域環境中，天然溼地是溫室氣體甲烷的最大排放來源，每年向大氣中排放110 Tg的甲烷，占全球甲烷排放總量的15%—30%[10]，甲烷產生作用和厭氧甲烷氧化作用之間的消長對於全球甲烷排放量影響重大，身為現今重要溫室氣體的甲烷而言，其溫室效應的能力為二氧化碳的26倍，厭氧甲烷氧化作用提供消耗甲烷的管道，減少甲烷排放到大氣中，對減緩溫室效應所造成的氣候變暖，與研究古今氣候變遷扮演重要的角色。

參考資料

  1. ^ McGlynn SE, Chadwick GL, Kempes CP, Orphan VJ. Single cell activity reveals direct electron transfer in methanotrophic consortia. Nature. 2015, 526 (7574): 531–535. PMID 26375009. doi:10.1038/nature15512. 
  2. ^ Wegener G, Krukenberg V, Riedel D, Tegetmeyer HE, Boetius A. Intercellular wiring enables electron transfer between methanotrophic archaea and bacteria. Nature. 2015, 526 (7574): 587–590. doi:10.1038/nature15733. 
  3. ^ 3.0 3.1 Haroon MF, Hu S, Shi Y, Imelfort M, Keller J, Hugenholtz P, Yuan Z, Tyson GW. Anaerobic oxidation of methane coupled to nitrate reduction in a novel archaeal lineage. Nature. 2013, 500 (7464): 567–70. PMID 23892779. doi:10.1038/nature12375. 
  4. ^ Raghoebarsing, A.A.; Pol, A.; van de Pas-Schoonen, K.T.; Smolders, A.J.P.; Ettwig, K.F.; Rijpstra, W.I.C.; et al. A microbial consortium couples anaerobic methane oxidation to denitrification. Nature. 2006, 440: 918–921. PMID 16612380. doi:10.1038/nature04617. 
  5. ^ 5.0 5.1 Knittel, K.; Boetius, A. Anaerobic oxidation of methane: progress with an unknown process. Annu. Rev. Microbiol. 2009, 63: 311–334. doi:10.1146/annurev.micro.61.080706.093130. 
  6. ^ Scheller S, Goenrich M, Boecher R, Thauer RK, Jaun B. The key nickel enzyme of methanogenesis catalyses the anaerobic oxidation of methane. Nature. 2010, 465 (7298): 606–8. PMID 20520712. doi:10.1038/nature09015. 
  7. ^ Drake, H.; Astrom, M.E.; Heim, C.; Broman, C.; Astrom, J.; Whitehouse, M.; Ivarsson, M.; Siljestrom, S.; Sjovall, P. Extreme 13C depletion of carbonates formed during oxidation of biogenic methane in fractured granite (PDF). Nature Communications. 2015, 6: 7020 [2017-01-05]. PMC 4432592  . PMID 25948095. doi:10.1038/ncomms8020. （原始内容 (PDF)于2015-05-18）. 
  8. ^ Ettwig KF, Butler MK, Le Paslier D, Pelletier E, Mangenot S, Kuypers MM, Schreiber F, Dutilh BE, Zedelius J, de Beer D, Gloerich J, Wessels HJ, van Alen T, Luesken F, Wu ML, van de Pas-Schoonen KT, Op den Camp HJ, Janssen-Megens EM, Francoijs KJ, Stunnenberg H, Weissenbach J, Jetten MS, Strous M. Nitrite-driven anaerobic methane oxidation by oxygenic bacteria. Nature. 2010, 464 (7288): 543–8. PMID 20336137. doi:10.1038/nature08883. 
  9. ^ Reebough, William S. Oceanic Methane Biogeochemistry. Chemical Reviews. 2007, 107 (2): 486–513. doi:10.1021/cr050362v. 
  10. ^ Matthews, Elaine. Methane emission from natural wetlands: global distribution, area and environmental characteristics of sources. Global Biogeochemical Cycles. 1987, 1 (1): 61–86. doi:10.1029/GB001i001p00061. 

二月 06, 2023
厭氧甲烷氧化, 此條目需要补充更多来源, 2016年6月12日, 请协助補充多方面可靠来源以改善这篇条目, 无法查证的内容可能會因為异议提出而移除, 致使用者, 请搜索一下条目的标题, 来源搜索, 网页, 新闻, 书籍, 学术, 图像, 以检查网络上是否存在该主题的更多可靠来源, 判定指引, 是一種微生物代謝作用, 不管是在海洋環境还是在陸域環境, 當沉積物呈現缺氧狀態的時候, 微生物會利用不同的電子接收者進行氧化還原作用, 例如硝酸根, 亞硝酸根, 硫酸根, 金屬離子, 腐植酸等等, 在的過程中, 微生物會將有機. 此條目需要补充更多来源 2016年6月12日 请协助補充多方面可靠来源以改善这篇条目 无法查证的内容可能會因為异议提出而移除 致使用者 请搜索一下条目的标题 来源搜索 厭氧甲烷氧化 网页 新闻 书籍 学术 图像 以检查网络上是否存在该主题的更多可靠来源 判定指引 厭氧甲烷氧化是一種微生物代謝作用 不管是在海洋環境还是在陸域環境 當沉積物呈現缺氧狀態的時候 微生物會利用不同的電子接收者進行氧化還原作用 例如硝酸根 亞硝酸根 硫酸根 金屬離子 腐植酸等等 在厭氧甲烷氧化的過程中 微生物會將有機碳分解所產生的甲烷氧化變成二氧化碳 而電子接收者則進行還原作用 藉此過程產生能量 以維持自身生命所需 目录 1 不同電子接收者的耦合 1 1 与硫酸根还原偶联 1 2 与硝酸或亚硝酸根还原偶联 1 3 與金屬離子還原偶聯 2 海洋中的厭氧甲烷氧化 3 對氣候變遷的影響 4 參考資料不同電子接收者的耦合 编辑因為厭氧甲烷氧化本身是氧化作用 所以需要不同的電子接收者進行還原作用與之耦合 主要有硝酸根 亞硝酸根 硫酸根 金屬離子 腐植酸等等 其中又以硫酸根為主要的電子接收者 以下列舉不同電子接收者的化學反應式 与硫酸根还原偶联 编辑 甲烷厌氧氧化 AOM 的三种机理 第一种 上 由属于1 2a 2b和2c进化枝的厌氧嗜甲烷古菌 Anaerobic methanotrophic archaea ANME 和硫酸盐还原细菌 Sulfate reducing bacteria SRB 参与 在ANME中甲烷被氧化 电子被直接传递给SRB 后者完成硫酸盐还原反应 1 2 第二种 中 是由ANME和厌氧氨氧化细菌的共生体所介导的硝酸盐还原型的甲烷氧化 3 第三种 下 也是甲烷氧化和硝酸根还原的耦合反应 但参与反应的微生物为ANME和NC10细菌 与前两种机理不同 这两种微生物会竞争甲烷 4 整体反应如下 CH4 SO42 HCO3 HS H2O硫酸根驱动的AOM由嗜甲烷古菌和硫酸盐还原细菌 英语 sulfate reducing bacteria 组成的互养共生体来实现 5 它们一般形成小的集团 有时也会形成大片的微生物垫 古菌部分名字简称为ANME 意思是 厌氧的嗜甲烷古菌 ANME和产甲烷古菌亲缘关系很近 近期有研究发现 AOM可能是产甲烷作用的一个逆过程 6 目前人们还不是很清楚这两种共生体如何相互协作以及它们在古菌和细菌细胞之间交换电子的中间体是什么 研究AOM的一大障碍是参与该反应的具体微生物到目前为止都还没有被成功分离出来 分离失败的原因是相关微生物生长非常缓慢 其种群数目的最小翻倍时间就至少要几个月 很多分离方式都无法应用于分离该种古菌 一个可能的原因是它和SRB形成了绝对共生关系 以至于它们二者不能够被分开 在有甲烷释放的深海区 如冷泉 泥火山或天然气水合物沉积处 AOM反应非常活跃以至于反应产生的硫化氢就能够养活许多包括丝状硫细菌 如贝日阿托氏菌 英语 Beggiatoa 带有共生性硫氧化细菌的蛤 管蠕虫等在内的许多生物 AOM产生的碳酸氢根能够导致碳酸钙沉淀 这些自生碳酸盐被认为是地球上13C含量最少的碳酸盐 其d13C值最低能到 125每毫升PDB 7 与硝酸或亚硝酸根还原偶联 编辑 整体反应如下 CH4 4NO3 CO2 4NO2 2H2O 3CH4 8NO2 8H 3CO2 4N2 10H2O最近 人们发现ANME 2d应该是硝酸盐驱动型AOM的主要参与者 3 该ANME 2d组微生物的名字为Methanoperedens nitroreducens 它能够在没有其他微生物的情况下 使用从细菌供体处水平转移得到的硝酸盐还原基因 单独完成硝酸盐还原型AOM 这也是人们发现的第一个有mcr和mer基因参与的 利用完整的反向产甲烷过程的AOM反应 2010年 组学分析发现一种叫做NC10的细菌能够单独完成亚硝酸根还原和甲烷氧化的耦合反应 8 與金屬離子還原偶聯 编辑 整体反应如下 CH4 4MnO2 7H HCO3 4Mn2 5H2O CH4 8Fe OH 3 15H HCO3 8Fe2 21H2O海洋中的厭氧甲烷氧化 编辑厭氧甲烷氧化此一作用最先在海洋沉積環境中被發現 因海水含有大量硫酸根離子 海洋中的厭氧甲烷氧化作用主要以硫酸根為電子接收者 甲烷濃度從沉積物底部向上逐漸減少 硫酸根離子濃度從沉積物頂部向下遞減 兩者同時減少的某一區間稱為甲烷 硫酸鹽轉換帶 sulfate methane transition zone SMTZ 參與厭氧甲烷氧化 硫酸根還原作用的微生物為厭氧甲烷氧化古菌 anaerobic methanotrophic archaea ANME 和硫酸還原細菌 sulfate reducing bacteria SRB 5 厭氧甲烷氧化古菌生存在厭氧條件下 以甲烷作為營養來源 古菌在中央 硫酸還原細菌在周圍將其包覆形成共生體 在厭氧甲烷氧化作用旺盛地區經常發現此兩種微生物的存在 表示厭氧甲烷氧化作用是在厭氧甲烷氧化古菌和硫酸還原細菌共生體的驅動下完成 對氣候變遷的影響 编辑厭氧甲烷氧化作用被認為是減少全球甲烷排放的重要生物地球化學過程 在海洋沉積物環境所生成的甲烷 大約80 會在從沉積物向上擴散到海床的過程中被氧化 9 而在陸域環境中 天然溼地是溫室氣體甲烷的最大排放來源 每年向大氣中排放110 Tg的甲烷 占全球甲烷排放總量的15 30 10 甲烷產生作用和厭氧甲烷氧化作用之間的消長對於全球甲烷排放量影響重大 身為現今重要溫室氣體的甲烷而言 其溫室效應的能力為二氧化碳的26倍 厭氧甲烷氧化作用提供消耗甲烷的管道 減少甲烷排放到大氣中 對減緩溫室效應所造成的氣候變暖 與研究古今氣候變遷扮演重要的角色 參考資料 编辑 McGlynn SE Chadwick GL Kempes CP Orphan VJ Single cell activity reveals direct electron transfer in methanotrophic consortia Nature 2015 526 7574 531 535 PMID 26375009 doi 10 1038 nature15512 Wegener G Krukenberg V Riedel D Tegetmeyer HE Boetius A Intercellular wiring enables electron transfer between methanotrophic archaea and bacteria Nature 2015 526 7574 587 590 doi 10 1038 nature15733 3 0 3 1 Haroon MF Hu S Shi Y Imelfort M Keller J Hugenholtz P Yuan Z Tyson GW Anaerobic oxidation of methane coupled to nitrate reduction in a novel archaeal lineage Nature 2013 500 7464 567 70 PMID 23892779 doi 10 1038 nature12375 Raghoebarsing A A Pol A van de Pas Schoonen K T Smolders A J P Ettwig K F Rijpstra W I C et al A microbial consortium couples anaerobic methane oxidation to denitrification Nature 2006 440 918 921 PMID 16612380 doi 10 1038 nature04617 5 0 5 1 Knittel K Boetius A Anaerobic oxidation of methane progress with an unknown process Annu Rev Microbiol 2009 63 311 334 doi 10 1146 annurev micro 61 080706 093130 Scheller S Goenrich M Boecher R Thauer RK Jaun B The key nickel enzyme of methanogenesis catalyses the anaerobic oxidation of methane Nature 2010 465 7298 606 8 PMID 20520712 doi 10 1038 nature09015 Drake H Astrom M E Heim C Broman C Astrom J Whitehouse M Ivarsson M Siljestrom S Sjovall P Extreme 13C depletion of carbonates formed during oxidation of biogenic methane in fractured granite PDF Nature Communications 2015 6 7020 2017 01 05 PMC 4432592 PMID 25948095 doi 10 1038 ncomms8020 原始内容存档 PDF 于2015 05 18 Ettwig KF Butler MK Le Paslier D Pelletier E Mangenot S Kuypers MM Schreiber F Dutilh BE Zedelius J de Beer D Gloerich J Wessels HJ van Alen T Luesken F Wu ML van de Pas Schoonen KT Op den Camp HJ Janssen Megens EM Francoijs KJ Stunnenberg H Weissenbach J Jetten MS Strous M Nitrite driven anaerobic methane oxidation by oxygenic bacteria Nature 2010 464 7288 543 8 PMID 20336137 doi 10 1038 nature08883 Reebough William S Oceanic Methane Biogeochemistry Chemical Reviews 2007 107 2 486 513 doi 10 1021 cr050362v Matthews Elaine Methane emission from natural wetlands global distribution area and environmental characteristics of sources Global Biogeochemical Cycles 1987 1 1 61 86 doi 10 1029 GB001i001p00061 取自 https zh wikipedia org w index php title 厭氧甲烷氧化 amp oldid 72299805, 维基百科，wiki，书籍，书籍，图书馆，

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