语法 编辑
注解：使用“[]”。位于“[”和“]”之间的文字将被软件忽略，作为注解用。
文件采用“块”的方式来组织信息。每一个块的语法结构为：
BEGIN 块的名称；
END;
基本块结构 编辑
DATA 编辑
例如：
begin data;
dimensions ntax=5 nchar=600;
format interleave datatype=DNA missing=N gap=-;
end;
ntax表示分类单位的数量，nchar表示数据的长度，上面这个例子里的含义是DNA有600个碱基长度。数据类型，datatype是DNA。另外可以定义缺失信息和缺口用什么字符表示。
PAUP或软件自定义块 编辑
有些软件可以识别特定的块，供自己特殊使用。例如PAUP block可以用来控制PAUP*。MrBayes也可以有自己的块。常用这些软件自定义块来进行批处理。
树 编辑
Nexus文件里面可以包含种系发生树信息。例如：
tree PAUP_1 = [&U]（((1:0,2:0.001674,3:0.001670):0.001658,4:0.003371):0.012438,(((5:0.003348,6:0.005043):0.001668,7:0.005031):0.003351,8:0):0.009545,9:0.564416);
End;
阅读NEXUS格式的系统进化树文件，可以使用TreeView软件。也可以使用TreeGraph[1]软件将其转换成SVG格式。
外部链接 编辑
注释 编辑
- ^ . [2006-11-17]. （原始内容存档于2007-05-22）.
nexus, 关于与, 標題相近或相同的条目页, 請見, 消歧義, 文件是一种生物信息学中常用的文件格式, 很多软件使用或者识别这种格式, 例如paup, 和macclade, 目录, 语法, 基本块结构, data, paup或软件自定义块, 外部链接, 注释语法, 编辑注解, 使用, 位于, 之间的文字将被软件忽略, 作为注解用, 文件采用, 的方式来组织信息, 每一个块的语法结构为, begin, 块的名称, 基本块结构, 编辑data, 编辑, 例如, begin, data, dimensions, nt. 关于与 Nexus 標題相近或相同的条目页 請見 Nexus 消歧義 Nexus文件是一种生物信息学中常用的文件格式 很多软件使用或者识别这种格式 例如PAUP 和MacClade 目录 1 语法 2 基本块结构 2 1 DATA 2 2 PAUP或软件自定义块 2 3 树 3 外部链接 4 注释语法 编辑注解 使用 位于 和 之间的文字将被软件忽略 作为注解用 文件采用 块 的方式来组织信息 每一个块的语法结构为 BEGIN 块的名称 br END 基本块结构 编辑DATA 编辑 例如 begin data br dimensions ntax 5 nchar 600 br format interleave datatype DNA missing N gap br end br ntax表示分类单位的数量 nchar表示数据的长度 上面这个例子里的含义是DNA有600个碱基长度 数据类型 datatype是DNA 另外可以定义缺失信息和缺口用什么字符表示 PAUP或软件自定义块 编辑 有些软件可以识别特定的块 供自己特殊使用 例如PAUP block可以用来控制PAUP MrBayes也可以有自己的块 常用这些软件自定义块来进行批处理 树 编辑 Nexus文件里面可以包含种系发生树信息 例如 tree PAUP 1 amp U 1 0 2 0 001674 3 0 001670 0 001658 4 0 003371 0 012438 5 0 003348 6 0 005043 0 001668 7 0 005031 0 003351 8 0 0 009545 9 0 564416 br End 阅读NEXUS格式的系统进化树文件 可以使用TreeView软件 也可以使用TreeGraph 1 软件将其转换成SVG格式 外部链接 编辑描述NEXUS文件格式的论文 英文 注释 编辑 存档副本 2006 11 17 原始内容存档于2007 05 22 取自 https zh wikipedia org w index php title Nexus amp oldid 46066702, 维基百科，wiki，书籍，书籍，图书馆，
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