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The ChEMBL-og （页面存档备份，存于互联网档案馆） Open data and drug discovery blog run by the ChEMBL team.
行進 21, 2023
chembl, 或db是具有類藥物特性生物活性分子的化學數據庫, 内容相關信息研究中心歐洲分子生物學實驗室实验室, 英国歐洲生物信息學研究所, 英语, european, bioinformatics, institute, 創始人john, overington, 2008年至2015年的團隊負責人, andrew, leach, 2016年至今的團隊負責人, 发布日期2009访问入口网站下載地址downloads網絡服務地址, webservicessparql終端, platform工具其他许可the, da. ChEMBL或ChEMBLdb是具有類藥物特性生物活性分子的化學數據庫 1 ChEMBL内容相關信息研究中心歐洲分子生物學實驗室实验室 英国歐洲生物信息學研究所 英语 European Bioinformatics Institute 創始人John Overington 2008年至2015年的團隊負責人 Andrew Leach 2016年至今的團隊負責人 发布日期2009访问入口网站ChEMBL下載地址Downloads網絡服務地址ChEMBL WebservicesSparql終端ChEMBL EBI RDF Platform工具其他许可The ChEMBL data is made available on a Creative Commons Attribution Share Alike 3 0 Unported Licence版本ChEMBL 28由英國南劍橋郡辛克斯頓 英语 Hinxton 威康信託基因組園區 英语 Wellcome Trust Genome Campus 歐洲分子生物學實驗室EMBL的歐洲生物信息學研究所EBI 英语 European Bioinformatics Institute 維護 該數據庫由一家名為Inpharmatica Ltd 的生物技術公司開發 被稱為StARlite 後來被Galapagos NV 英语 Galapagos NV 收購 2 隨後在EMBL EBI由John Overington領導ChEMBL化學基因組學 英语 chemogenomics 小組成立 3 4 目录 1 範圍和訪問 2 相關資源 3 參見 4 參考 5 外部鏈接範圍和訪問 编辑ChEMBL數據庫包含針對藥物靶點的化合物生物活性數據 生物活性以Ki Kd IC50 EC50報告 5 可以過濾和分析數據 以開發化合物篩選庫 用於藥物發現過程中的先導鑑定 6 通過對12種藥物化學期刊34 000多篇出版物進行整理 ChEMBL 02於2010年1月推出 涵蓋622 824種化合物2 4萬種天然產物240萬個生物測定測量值 ChEMBL對可用生物活性數據覆蓋範圍已發展成 公共數據庫有史以來最全面 3 2010年10月 ChEMBL 08發布 涵蓋636 269種化合物超過297萬次生物測定測量 7 ChEMBL 10添加了PubChem確認性化驗 英语 assays 以便整合與ChEMBL包含的數據類型和類別相當的數據 8 ChEMBLdb可通過Web界面訪問或通過文件傳輸協議下載 適合計算機化數據挖掘 並試圖以便進行比較分析標準化不同出版物之間的活動 1 ChEMBL還被整合到其它大型化學資源 包括PubChem 英國皇家化學會的ChemSpider系統 相關資源 编辑除了數據庫 ChEMBL小組還開發了用於數據挖掘的工具和資源 9 包括一個專注於激酶的綜合化學基因組學工作台Kinase SARfari 該系統整合併鏈接了序列 結構 化合物 篩選數據 英语 Screening medicine 類似的工作台有GPCR SARfari 專注於GPCR ChEMBL 被忽視的熱帶病 ChEMBL Neglected Tropical Diseases ChEMBL NTD 是開放獲取的初級篩选和藥物化學數據存儲庫 針對非洲 亞洲 美洲發展中地區的地方熱帶病 英语 tropical diseases ChEMBL NTD的主要目的是為存放的數據提供一個可自由訪問的永久存檔分發中心 3 2012年7月發布了新的瘧疾數據服務互联网档案馆的存檔 存档日期2016 07 30 由Medicines for Malaria Venture 页面存档备份 存于互联网档案馆 贊助 面向全球的研究人員 該服務的數據包括來自Malaria Box篩查集的化合物 以及在ChEMBL NTD發現的其他捐贈瘧疾數據 myChEMBL 页面存档备份 存于互联网档案馆 ChEMBL虛擬機於2013年10月發布 允許用戶訪問完整 免費 易於安裝的化學信息學基礎設施 2013年12月 SureChem專利信息數據庫業務移交EMBL EBI SureChem改名SureChEMBL 2014年引入了一種用於預測和比較跨物種的工具ADME目標新資源ADME SARfari 10 參見 编辑ChEMBL Quick Tour on EBI Train OnLine 页面存档备份 存于互联网档案馆 ChEBI DrugBank參考 编辑 1 0 1 1 Gaulton A et al ChEMBL a large scale bioactivity database for drug discovery Nucleic Acids Research 2011 40 Database issue D1100 7 PMC 3245175 PMID 21948594 doi 10 1093 nar gkr777 Open access drug discovery database launches with half a million compounds Wellcome wellcome ac uk 18 January 2010 31 August 2019 3 0 3 1 3 2 Bender A Databases Compound bioactivities go public Nature Chemical Biology 2010 6 5 309 doi 10 1038 nchembio 354 Overington J ChEMBL An interview with John Overington team leader chemogenomics at the European Bioinformatics Institute Outstation of the European Molecular Biology Laboratory EMBL EBI Interview by Wendy A Warr J Comput Aided Mol Des April 2009 23 4 195 8 Bibcode 2009JCAMD 23 195W PMID 19194660 S2CID 2946417 doi 10 1007 s10822 009 9260 9 Mok N Yi Brenk Ruth Mining the ChEMBL Database An Efficient Chemoinformatics Workflow for Assembling an Ion Channel Focused Screening Library J Chem Inf Model Oct 24 2011 51 10 2449 2454 PMC 3200031 PMID 21978256 doi 10 1021 ci200260t Brenk R Schinpani A James D Krasowski A Lessons learnt from assembling screening libraries for drug discovery for neglected diseases ChemMedChem Mar 2008 3 3 435 44 PMC 2628535 PMID 18064617 doi 10 1002 cmdc 200700139 ChEMBL og ChEMBL 08 Released 15 November 2010 2010 11 15 原始内容存档于2011 07 08 ChEMBL og ChEMBL 10 Released 6 June 2011 2011 06 09 原始内容存档于2011 08 13 Bellis L J et al Collation and data mining of literature bioactivity data for drug discovery Biochemical Society Transactions 2011 39 5 1365 1370 PMID 21936816 doi 10 1042 BST0391365 Davies M et al ADME SARfari Comparative Genomics of Drug Metabolising Systems Bioinformatics 2015 31 10 1695 1697 PMC 4426839 PMID 25964657 doi 10 1093 bioinformatics btv010 外部鏈接 编辑维基数据上的相关属性 ChEMBL ID P592 使用情况 ChEMBLdb Kinase SARfari 互联网档案馆的存檔 存档日期2016 05 15 ChEMBL Neglected Tropical Disease Archive GPCR SARfari The ChEMBL og 页面存档备份 存于互联网档案馆 Open data and drug discovery blog run by the ChEMBL team 取自 https zh wikipedia org w index php title ChEMBL amp oldid 76341445, 维基百科，wiki，书籍，书籍，图书馆，
