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希尔方程 (生物化学)

生物化学中,若已经有配体分子结合在一个高分子上,那么新的配体分子与这个高分子的结合作用就常常会被增强(亦被称作协同结合)。以阿奇博爾德·希爾命名的希尔系数Hill coefficient)提供了量化这种效应的方法。

Biochemical binding curves showing the characteristically sigmoidal curves generated by using the Hill equation to model cooperative binding. Each curve corresponds to a different Hill coefficient, labeled to the curve's right. The vertical axis displays the fraction of occupied ligand-binding sites on a protein receptor (), equal to ratio of the concentration of ligand-bound protein ([) to the total concentration of protein receptor (). The horizontal axis is the ratio of the ligand concentration producing half occupation () to the free ligand concentration ().

希尔方程(英語:Hill equation)描述了高分子被配体饱和的分数,是一个关于配体浓度的函数;被用于确定受体结合到酶或受体上的合同性程度。此方程首次于1910年由阿奇博爾德·希爾阐释出来以表述为何血红蛋白的氧气结合曲线会呈现S型[1]

当系数为1时,表明结合作用是完全独立的,而不取决于已经有多少配体已经结合上去。大于一的数表示正协同,而小于一的数表示负协同。希尔系数最初被设计出来是用于解释氧气协同地结合到血红蛋白上的过程(此系统的希尔系数为2.8~3)。

希尔方程:

- 占用位点的分数,在占用位点处配体可以结合到受体蛋白的活性位点

- 游离的(未结合的)配体浓度

- 表观解离常数来源于质量作用定律(对于解离的平衡常数)

- 产生半数占用时的配体浓度(配体浓度足以占用结合位点的一半数目),亦为微观的解离常数

- 希尔系数,描述了协同性(或亦可能是其他生物化学性质,取决于使用希尔方程时的讨论背景)

对两边同时取倒数,重整,再取倒数,接下来对等式两边取对数,导出一个与希尔方程等价的方程:

在适当的情况下,希尔常数的值描述了配体以下列几种方式结合时的协同性:

  • - 正协同反应:一旦一个配体分子结合到酶上,酶对其他配体的亲和力就会增加。
  • - 负协同反应:一旦一个配体分子结合到酶上,酶对其他配体的亲和力就会减小。
  • - 非协同反应:酶对于一个配体分子的亲和力并不取决于是否有配体分子已结合到其上。

希尔方程(作为描述吸附到结合位点上的化合物浓度与结合位点的被占分数之间的关系式)是等价于朗谬尔方程的。

另见

希尔方程与逻辑斯谛函数相关,且在某些方面是它的对数变换,例如在对数标尺上作出希尔函数时,它看起来就等于逻辑斯谛函数。如果达到饱和状态时的浓度变化范围未达到数量级时,这就显得尤其重要。在这种情况下,逻辑斯谛函数将会变成一个跟可靠的描述该生化行为的模型。

参考文献

  1. ^ Hill, A. V. . J. Physiol. 1910-01-22, 40 (Suppl): iv–vii [2009-03-18]. (原始内容 (PDF)存档于2008-12-01). 

延伸閱讀

 
Endrenyi
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外部連結

希尔方程, 生物化学, 在生物化学中, 若已经有配体分子结合在一个高分子上, 那么新的配体分子与这个高分子的结合作用就常常会被增强, 亦被称作协同结合, 以阿奇博爾德, 希爾命名的希尔系数, hill, coefficient, 提供了量化这种效应的方法, biochemical, binding, curves, showing, characteristically, sigmoidal, curves, generated, using, hill, equation, model, cooperative,. 在生物化学中 若已经有配体分子结合在一个高分子上 那么新的配体分子与这个高分子的结合作用就常常会被增强 亦被称作协同结合 以阿奇博爾德 希爾命名的希尔系数 Hill coefficient 提供了量化这种效应的方法 Biochemical binding curves showing the characteristically sigmoidal curves generated by using the Hill equation to model cooperative binding Each curve corresponds to a different Hill coefficient labeled to the curve s right The vertical axis displays the fraction of occupied ligand binding sites on a protein receptor 8 displaystyle theta equal to ratio of the concentration of ligand bound protein P L n displaystyle left PL n right to the total concentration of protein receptor P Total displaystyle left P text Total right The horizontal axis is the ratio of the ligand concentration producing half occupation K A displaystyle K A to the free ligand concentration L displaystyle left L right 希尔方程 英語 Hill equation 描述了高分子被配体饱和的分数 是一个关于配体浓度的函数 被用于确定受体结合到酶或受体上的合同性程度 此方程首次于1910年由阿奇博爾德 希爾阐释出来以表述为何血红蛋白的氧气结合曲线会呈现S型 1 当系数为1时 表明结合作用是完全独立的 而不取决于已经有多少配体已经结合上去 大于一的数表示正协同 而小于一的数表示负协同 希尔系数最初被设计出来是用于解释氧气协同地结合到血红蛋白上的过程 此系统的希尔系数为2 8 3 希尔方程 8 L n K d L n L n K A n L n displaystyle theta L n over K d L n L n over K A n L n 8 displaystyle theta 占用位点的分数 在占用位点处配体可以结合到受体蛋白的活性位点 L displaystyle L 游离的 未结合的 配体浓度K d displaystyle K d 表观解离常数来源于质量作用定律 对于解离的平衡常数 K A displaystyle K A 产生半数占用时的配体浓度 配体浓度足以占用结合位点的一半数目 亦为微观的解离常数 n displaystyle n 希尔系数 描述了协同性 或亦可能是其他生物化学性质 取决于使用希尔方程时的讨论背景 对两边同时取倒数 重整 再取倒数 接下来对等式两边取对数 导出一个与希尔方程等价的方程 log 8 1 8 n log L log K d displaystyle log left theta over 1 theta right n log L log K d 在适当的情况下 希尔常数的值描述了配体以下列几种方式结合时的协同性 n gt 1 displaystyle n gt 1 正协同反应 一旦一个配体分子结合到酶上 酶对其他配体的亲和力就会增加 n lt 1 displaystyle n lt 1 负协同反应 一旦一个配体分子结合到酶上 酶对其他配体的亲和力就会减小 n 1 displaystyle n 1 非协同反应 酶对于一个配体分子的亲和力并不取决于是否有配体分子已结合到其上 希尔方程 作为描述吸附到结合位点上的化合物浓度与结合位点的被占分数之间的关系式 是等价于朗谬尔方程的 目录 1 另见 2 参考文献 3 延伸閱讀 4 外部連結另见 编辑希尔方程与逻辑斯谛函数相关 且在某些方面是它的对数变换 例如在对数标尺上作出希尔函数时 它看起来就等于逻辑斯谛函数 如果达到饱和状态时的浓度变化范围未达到数量级时 这就显得尤其重要 在这种情况下 逻辑斯谛函数将会变成一个跟可靠的描述该生化行为的模型 逻辑斯谛函数 冈波茨曲线 S型函数参考文献 编辑 Hill A V The possible effects of the aggregation of the molecules of haemoglobin on its dissociation curves J Physiol 1910 01 22 40 Suppl iv vii 2009 03 18 原始内容 PDF 存档于2008 12 01 延伸閱讀 编辑 Endrenyi Dorland s Illustrated Medical Dictionary Coval ML Analysis of Hill interaction coefficients and the invalidity of the Kwon and Brown equation J Biol Chem December 1970 245 23 6335 6 PMID 5484812 d A Heck Henry Statistical theory of cooperative binding to proteins Hill equation and the binding potential J Am Chem Soc 1971 93 1 23 29 doi 10 1021 ja00730a004 Atkins Gordon L A simple digital computer program for estimating the parameter of the Hill Equation Eur J Biochem 1973 33 1 175 180 doi 10 1111 j 1432 1033 1973 tb02667 x Endrenyi Laszlo Kwong F H F Fajszi Csaba Evaluation of Hill slopes and Hill coefficients when the saturation binding or velocity is not known Eur J Biochem 1975 51 2 317 328 doi 10 1111 j 1432 1033 1975 tb03931 x Voet Donald Voet Judith G Biochemistry 1990 Weiss J N The Hill equation revisited uses and misuses FASEB Journal 1997 11 11 835 841 2018 02 09 PMID 9285481 原始内容存档于2017 12 18 Kurganov B I Lobanov A V Criterion for Hill equation validity for description of biosensor calibration curves Anal Chim Acta 2001 427 1 11 19 doi 10 1016 S0003 2670 00 01167 3 Goutelle Sylvain Maurin Michel Rougier Florent Barbaut Xavier Bourguignon Laurent Ducher Michel Maire Pascal The Hill equation a review of its capabilities in pharmacological modelling Fund Clinic Pharmac 2008 22 633 648 doi 10 1111 j 1472 8206 2008 00633 x Mitavskiy B Chu D Zabet Radu Models of transcription factor binding Sensitivity of activation functions to model assumptions Journal of Theoretical Biology 2009 257 3 419 429 PMID 19121637 doi 10 1016 j jtbi 2008 11 026 Gesztelyi R Zsuga J Kemeny Beke A Varga B Juhasz B Tosaki A The Hill equation and the origin of quantitative pharmacology Archive for History of Exact Sciences 2012 66 427 38 doi 10 1007 s00407 012 0098 5 Colquhoun D The quantitative analysis of drug receptor interactions a short history Trends Pharmacol Sci 2006 27 3 149 57 PMID 16483674 doi 10 1016 j tips 2006 01 008 Rang HP The receptor concept pharmacology s big idea Br J Pharmacol 2006 147 S9 16 PMC 1760743 PMID 16402126 doi 10 1038 sj bjp 0706457 Neubig RR Spedding M Kenakin T Christopoulos A International Union of Pharmacology Committee on Receptor Nomenclature and Drug Classification XXXVIII update on terms and symbols in quantitative pharmacology Pharmacol Rev 2003 55 597 606 PMID 14657418 doi 10 1124 pr 55 4 4 外部連結 编辑Hill equation calculator 页面存档备份 存于互联网档案馆 取自 https zh wikipedia org w index php title 希尔方程 生物化学 amp oldid 77497505, 维基百科,wiki,书籍,书籍,图书馆,

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