fbpx
维基百科

分子识别

分子识别指的是两个或更多个分子,通过非共价键的作用,产生特异性相互作用关系,如氢键[1]、范德华力、金属配位、疏水性[2][3]、π-π重叠、共振等。除了这些直接相互作用外,溶剂还可以在驱动分子识别的过程中起主要的间接作用[4][5]。参与分子识别的宿主和客体表现出分子互补性。

生物系统 编辑

生物系统中,分子识别发挥着重要作用,如抗体对抗原的特异性防御、DNA与蛋白质结合成染色体,细胞膜上糖与蛋白质的结合、核糖核酸与染色体的协同工作等。

作用于肽链的抗生素是一种重要例子。万古霉素与细菌细胞中带有末端 D-丙氨酰-D-丙氨酸的肽链以五个氢键结合,使其无法用于构建细菌的细胞壁,这是其对细菌杀伤性的来源。

纳米识别 编辑

分子识别为合成纳米级元件带来了可能性。仿生聚合物(如拟肽)可用于识别较大的生物靶标(如蛋白质)[6],并且聚合物可与荧光纳米材料共同建立大分子结构,作为用于光学蛋白识别和检测的合成抗体[7]

超分子系统 编辑

化学家已经证明可以设计出许多具有分子识别功能的人工超分子系统。

这种系统的最早例子之一是冠醚,其能够选择性地结合特定的阳离子。

静态与动态 编辑

分子识别可以分为静态分子识别动态分子识别。静态分子识别类似于钥匙和钥匙孔之间的相互作用,它是主体分子和客体分子之间形成主客缔合物的 1:1 型配位反应。为了实现高级的静态分子识别,有必要建立特定于客体分子的识别位点。

在动态分子识别中,第一个客体与主体的结合,会影响第二个客体与第二结合位点的缔合常数,导致这个结合过程存在某种“合作”关系[8] 。 在正变构系统(positive allosteric system)中,第一位客人的结合会增加第二位客人的结合常数。而对于负变构系统(negative allosteric system),第一个客体的结合降低了与第二个客体的缔合常数。这种类型的动态特性特别重要,因为它提供了调节生物系统中缔合方式的机制。动态分子识别可以通过构象校对机制,增强区分数个竞争靶标的能力。动态分子识别是一项研究热点,以用于功能强大的化学传感器和分子设备。

复杂性 编辑

一项基于分子模拟和顺应性常数的研究将分子识别描述为一种组织现象。即使对于像碳水化合物这样的小分子,假设每个氢键的强度都是已知的,也无法预测或设计识别过程[9]。然而,正如 Mobley 等人[10]总结的那样,对分子识别事件的准确预测需要超越客体和主体之间某一时刻的状态信息的静态快照。熵是热力学层面上驱动主客分子结合过程的关键因素,需要加以考虑以便更准确地预测识别过程[11]。在单一缔合结构的静态快照中很少观察到熵。

参考文献 编辑

  1. ^ Knox, James R.; Pratt, R. F. Different modes of vancomycin and D-alanyl-D-alanine peptidase binding to cell wall peptide and a possible role for the vancomycin resistance protein (Free full text). Antimicrobial Agents and Chemotherapy. July 1990, 34 (7): 1342–7. PMC 175978 . PMID 2386365. doi:10.1128/AAC.34.7.1342. 
  2. ^ Lockett, M. R.; Lange, H.; Breiten, B.; Heroux, A.; Sherman, W.; Rappoport, D.; Yau, P. O.; Snyder, P. W.; Whitesides, G. M. The Binding of Benzoarylsulfonamide Ligands to Human Carbonic Anhydrase is Insensitive to Formal Fluorination of the Ligand. Angew. Chem. Int. Ed. 2003, 52 (30): 7714–7717. PMID 23788494. doi:10.1002/anie.201301813. 
  3. ^ Breiten, B.; Lockett, M. R.; Sherman, W.; Fujita, S.; Al-Sayah, M.; Lange, H.; Bowers, C. M.; Heroux, A.; Krilov, G.; Whitesides, G. M. Water Networks Contribute to Enthalpy/Entropy Compensation in Protein–Ligand Binding. J. Am. Chem. Soc. 2013, 135 (41): 15579–15584. PMID 24044696. doi:10.1021/ja4075776. 
  4. ^ Baron, Riccardo; Setny, Piotr; McCammon, J. Andrew. Water in Cavity-Ligand Recognition. Journal of the American Chemical Society. 2010, 132 (34): 12091–12097. PMC 2933114 . PMID 20695475. doi:10.1021/ja1050082. 
  5. ^ Baron, Riccardo; McCammon, J. Andrew. Molecular Recognition and Ligand Binding. Annual Review of Physical Chemistry. 2013, 64: 151–175. Bibcode:2013ARPC...64..151B. PMID 23473376. doi:10.1146/annurev-physchem-040412-110047. 
  6. ^ Zhang, Jingqing; et al. Molecular recognition using corona phase complexes made of synthetic polymers adsorbed on carbon nanotubes. Nature Nanotechnology. 2013, 8 (12): 959–968. Bibcode:2013NatNa...8..959Z. PMC 5051352 . PMID 24270641. doi:10.1038/nnano.2013.236. 
  7. ^ Beyene, Abraham G.; Demirer, Gozde S.; Landry, Markita P. Nanoparticle‐Templated Molecular Recognition Platforms for Detection of Biological Analytes 8. John Wiley & Sons, Inc. 2009-01-01: 197–223 [2021-05-30]. ISBN 9780470559277. PMID 27622569. doi:10.1002/cpch.10. (原始内容于2021-06-03) (英语).  |journal=被忽略 (帮助); |issue=被忽略 (帮助)
  8. ^ Shinkai, Seiji; Ikeda, Masato; Sugasaki, Atsushi; Takeuchi, Masayuki. Positive allosteric systems designed on dynamic supramolecular scaffolds: toward switching and amplification of guest affinity and selectivity. Accounts of Chemical Research. 2001, 34 (6): 494–503. PMID 11412086. doi:10.1021/ar000177y. 
  9. ^ Grunenberg, Jörg. Complexity in molecular recognition. Physical Chemistry Chemical Physics. 2011, 13 (21): 10136–46. Bibcode:2011PCCP...1310136G. PMID 21503359. doi:10.1039/C1CP20097F. 
  10. ^ Mobley, D. L.; Dill, K. A. Binding of small-molecule ligands to proteins: "what you see" is not always "what you get". Structure. 2009, 17 (4): 489–98. PMC 2756098 . PMID 19368882. doi:10.1016/j.str.2009.02.010. 
  11. ^ Schmidtchen, Franz P. Hosting anions. The energetic perspective. Chemical Society Reviews. 2010, 39 (10): 3916–35. PMID 20820595. doi:10.1039/C0CS00038H. 

分子识别, 指的是两个或更多个分子, 通过非共价键的作用, 产生特异性相互作用关系, 如氢键, 范德华力, 金属配位, 疏水性, π重叠, 共振等, 除了这些直接相互作用外, 溶剂还可以在驱动的过程中起主要的间接作用, 参与的宿主和客体表现出分子互补性, 目录, 生物系统, 纳米识别, 超分子系统, 静态与动态, 复杂性, 参考文献生物系统, 编辑生物系统中, 发挥着重要作用, 如抗体对抗原的特异性防御, dna与蛋白质结合成染色体, 细胞膜上糖与蛋白质的结合, 核糖核酸与染色体的协同工作等, 作用于肽链的抗生素是. 分子识别指的是两个或更多个分子 通过非共价键的作用 产生特异性相互作用关系 如氢键 1 范德华力 金属配位 疏水性 2 3 p p重叠 共振等 除了这些直接相互作用外 溶剂还可以在驱动分子识别的过程中起主要的间接作用 4 5 参与分子识别的宿主和客体表现出分子互补性 目录 1 生物系统 2 纳米识别 3 超分子系统 4 静态与动态 5 复杂性 6 参考文献生物系统 编辑生物系统中 分子识别发挥着重要作用 如抗体对抗原的特异性防御 DNA与蛋白质结合成染色体 细胞膜上糖与蛋白质的结合 核糖核酸与染色体的协同工作等 作用于肽链的抗生素是一种重要例子 万古霉素与细菌细胞中带有末端 D 丙氨酰 D 丙氨酸的肽链以五个氢键结合 使其无法用于构建细菌的细胞壁 这是其对细菌杀伤性的来源 纳米识别 编辑分子识别为合成纳米级元件带来了可能性 仿生聚合物 如拟肽 可用于识别较大的生物靶标 如蛋白质 6 并且聚合物可与荧光纳米材料共同建立大分子结构 作为用于光学蛋白识别和检测的合成抗体 7 超分子系统 编辑化学家已经证明可以设计出许多具有分子识别功能的人工超分子系统 这种系统的最早例子之一是冠醚 其能够选择性地结合特定的阳离子 静态与动态 编辑分子识别可以分为静态分子识别和动态分子识别 静态分子识别类似于钥匙和钥匙孔之间的相互作用 它是主体分子和客体分子之间形成主客缔合物的 1 1 型配位反应 为了实现高级的静态分子识别 有必要建立特定于客体分子的识别位点 在动态分子识别中 第一个客体与主体的结合 会影响第二个客体与第二结合位点的缔合常数 导致这个结合过程存在某种 合作 关系 8 在正变构系统 positive allosteric system 中 第一位客人的结合会增加第二位客人的结合常数 而对于负变构系统 negative allosteric system 第一个客体的结合降低了与第二个客体的缔合常数 这种类型的动态特性特别重要 因为它提供了调节生物系统中缔合方式的机制 动态分子识别可以通过构象校对机制 增强区分数个竞争靶标的能力 动态分子识别是一项研究热点 以用于功能强大的化学传感器和分子设备 复杂性 编辑一项基于分子模拟和顺应性常数的研究将分子识别描述为一种组织现象 即使对于像碳水化合物这样的小分子 假设每个氢键的强度都是已知的 也无法预测或设计识别过程 9 然而 正如 Mobley 等人 10 总结的那样 对分子识别事件的准确预测需要超越客体和主体之间某一时刻的状态信息的静态快照 熵是热力学层面上驱动主客分子结合过程的关键因素 需要加以考虑以便更准确地预测识别过程 11 在单一缔合结构的静态快照中很少观察到熵 参考文献 编辑 Knox James R Pratt R F Different modes of vancomycin and D alanyl D alanine peptidase binding to cell wall peptide and a possible role for the vancomycin resistance protein Free full text Antimicrobial Agents and Chemotherapy July 1990 34 7 1342 7 PMC 175978 nbsp PMID 2386365 doi 10 1128 AAC 34 7 1342 Lockett M R Lange H Breiten B Heroux A Sherman W Rappoport D Yau P O Snyder P W Whitesides G M The Binding of Benzoarylsulfonamide Ligands to Human Carbonic Anhydrase is Insensitive to Formal Fluorination of the Ligand Angew Chem Int Ed 2003 52 30 7714 7717 PMID 23788494 doi 10 1002 anie 201301813 Breiten B Lockett M R Sherman W Fujita S Al Sayah M Lange H Bowers C M Heroux A Krilov G Whitesides G M Water Networks Contribute to Enthalpy Entropy Compensation in Protein Ligand Binding J Am Chem Soc 2013 135 41 15579 15584 PMID 24044696 doi 10 1021 ja4075776 Baron Riccardo Setny Piotr McCammon J Andrew Water in Cavity Ligand Recognition Journal of the American Chemical Society 2010 132 34 12091 12097 PMC 2933114 nbsp PMID 20695475 doi 10 1021 ja1050082 Baron Riccardo McCammon J Andrew Molecular Recognition and Ligand Binding Annual Review of Physical Chemistry 2013 64 151 175 Bibcode 2013ARPC 64 151B PMID 23473376 doi 10 1146 annurev physchem 040412 110047 Zhang Jingqing et al Molecular recognition using corona phase complexes made of synthetic polymers adsorbed on carbon nanotubes Nature Nanotechnology 2013 8 12 959 968 Bibcode 2013NatNa 8 959Z PMC 5051352 nbsp PMID 24270641 doi 10 1038 nnano 2013 236 Beyene Abraham G Demirer Gozde S Landry Markita P Nanoparticle Templated Molecular Recognition Platforms for Detection of Biological Analytes 8 John Wiley amp Sons Inc 2009 01 01 197 223 2021 05 30 ISBN 9780470559277 PMID 27622569 doi 10 1002 cpch 10 原始内容存档于2021 06 03 英语 journal 被忽略 帮助 issue 被忽略 帮助 Shinkai Seiji Ikeda Masato Sugasaki Atsushi Takeuchi Masayuki Positive allosteric systems designed on dynamic supramolecular scaffolds toward switching and amplification of guest affinity and selectivity Accounts of Chemical Research 2001 34 6 494 503 PMID 11412086 doi 10 1021 ar000177y Grunenberg Jorg Complexity in molecular recognition Physical Chemistry Chemical Physics 2011 13 21 10136 46 Bibcode 2011PCCP 1310136G PMID 21503359 doi 10 1039 C1CP20097F Mobley D L Dill K A Binding of small molecule ligands to proteins what you see is not always what you get Structure 2009 17 4 489 98 PMC 2756098 nbsp PMID 19368882 doi 10 1016 j str 2009 02 010 Schmidtchen Franz P Hosting anions The energetic perspective Chemical Society Reviews 2010 39 10 3916 35 PMID 20820595 doi 10 1039 C0CS00038H 取自 https zh wikipedia org w index php title 分子识别 amp oldid 71753960, 维基百科,wiki,书籍,书籍,图书馆,

文章

,阅读,下载,免费,免费下载,mp3,视频,mp4,3gp, jpg,jpeg,gif,png,图片,音乐,歌曲,电影,书籍,游戏,游戏。